261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0907 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_1377  L-lactate permease  83.55 
 
 		 547 aa  910    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0525284  normal  0.518687 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1340  L-lactate permease  83.55 
 
 		 547 aa  910    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.210524  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0907  L-lactate permease  100 
 
 		 547 aa  1073    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.425278  decreased coverage  0.000000225287 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1522  L-lactate permease, putative  82.27 
 
 		 547 aa  897    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3007  L-lactate permease  83.55 
 
 		 547 aa  911    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0831108  hitchhiker  0.000000523615 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2994  L-lactate permease  85.74 
 
 		 547 aa  925    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.576445  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3135  L-lactate permease  85.74 
 
 		 547 aa  924    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.770152  normal  0.436399 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2574  L-lactate permease  70.74 
 
 		 557 aa  760    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.231573  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2734  L-lactate permease  84.85 
 
 		 548 aa  919    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.718337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2807  L-lactate permease  84.85 
 
 		 548 aa  919    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2793  L-lactate permease  80.91 
 
 		 550 aa  883    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.956098  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1272  L-lactate permease  82.63 
 
 		 547 aa  902    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0565099  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2904  L-lactate permease  83 
 
 		 547 aa  904    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0676147  normal  0.129872 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2439  L-lactate permease, putative  81.54 
 
 		 547 aa  887    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.947271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1354  L-lactate permease  83.55 
 
 		 547 aa  910    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00178054  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2067  L-lactate transport  43.3 
 
 		 574 aa  440  9.999999999999999e-123  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.554646  hitchhiker  0.00175436 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4690  L-lactate permease  44.38 
 
 		 564 aa  435  1e-121  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1588  L-lactate transport  43.48 
 
 		 575 aa  436  1e-121  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3390  L-lactate transport  43.88 
 
 		 601 aa  420  1e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.736321  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3634  L-lactate transport  44.06 
 
 		 564 aa  421  1e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1422  L-lactate transport  44.16 
 
 		 568 aa  419  1e-116  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0363  L-lactate transport  44.46 
 
 		 563 aa  419  1e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001224  L-lactate permease  43.64 
 
 		 563 aa  415  9.999999999999999e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.57325  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2927  L-lactate transport  42.86 
 
 		 588 aa  410  1e-113  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.166776  normal  0.708084 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0255  putative L-lactate permease  43.53 
 
 		 582 aa  410  1e-113  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1714  L-lactate permease  44.59 
 
 		 566 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2865  Elongator protein 3/MiaB/NifB  46.61 
 
 		 538 aa  406  1.0000000000000001e-112  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.689167  normal  0.783414 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2686  L-lactate transport  42.09 
 
 		 564 aa  406  1.0000000000000001e-112  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05091  L-lactate permease Psort location  44.51 
 
 		 620 aa  407  1.0000000000000001e-112  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0198  L-lactate permease  43.84 
 
 		 566 aa  404  1e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.732675 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1653  glycolate/L-lactate:H+ symporter  42.68 
 
 		 585 aa  400  9.999999999999999e-111  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.112262 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1888  L-lactate transport  43.01 
 
 		 585 aa  401  9.999999999999999e-111  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0178654 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0322  L-lactate transport  42.02 
 
 		 610 aa  389  1e-107  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0964076 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1076  L-lactate permease  41.54 
 
 		 567 aa  391  1e-107  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.304031  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2279  L-lactate transport  41.45 
 
 		 611 aa  385  1e-106  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1681  L-lactate transport  41.94 
 
 		 585 aa  384  1e-105  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000226861  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33840  L-lactate transport  44.97 
 
 		 592 aa  379  1e-104  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3174  L-lactate transport  43.12 
 
 		 586 aa  371  1e-101  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3391  L-lactate permease  41.48 
 
 		 623 aa  366  1e-100  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3238  L-lactate transport  40 
 
 		 570 aa  350  3e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.265406  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1039  L-lactate transport  38.64 
 
 		 568 aa  339  5.9999999999999996e-92  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.302493  normal  0.540207 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1861  L-lactate permease  39.67 
 
 		 569 aa  338  1.9999999999999998e-91  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1045  L-lactate transport  37.99 
 
 		 570 aa  337  2.9999999999999997e-91  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0725199  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2205  L-lactate transport  39.09 
 
 		 553 aa  336  5e-91  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0347  L-lactate transport  38.27 
 
 		 570 aa  332  2e-89  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.054106  normal  0.809759 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0784  L-lactate transport  38.5 
 
 		 570 aa  331  2e-89  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.939606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2169  L-lactate transport  38.41 
 
 		 562 aa  331  2e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0208  L-lactate permease  36.64 
 
 		 590 aa  328  2.0000000000000001e-88  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.454514 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4689  L-lactate permease  34.31 
 
 		 578 aa  305  2.0000000000000002e-81  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1396  L-lactate permease  33.02 
 
 		 511 aa  259  1e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.226842  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2669  L-lactate permease  33.81 
 
 		 570 aa  252  1e-65  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0331  L-lactate permease  31.26 
 
 		 563 aa  243  7.999999999999999e-63  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1837  L-lactate permease  30.97 
 
 		 530 aa  219  7e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3854  L-lactate transport  31.83 
 
 		 526 aa  209  8e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0261983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0575  L-lactate transport  29.41 
 
 		 534 aa  204  5e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0708  L-lactate permease  28.62 
 
 		 559 aa  191  4e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000370423  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00856  putative L-lactate permease, LctP  30.95 
 
 		 544 aa  191  4e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0302  L-lactate permease  28.9 
 
 		 507 aa  189  9e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0307  L-lactate permease  28.63 
 
 		 510 aa  187  3e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.284912  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5610  L-lactate permease  29.48 
 
 		 553 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000380023  hitchhiker  2.4648700000000003e-18 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3763  L-lactate permease  29.61 
 
 		 553 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0623058  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0381  L-lactate transport  28.94 
 
 		 506 aa  180  4.999999999999999e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0849809 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5400  L-lactate permease  29.18 
 
 		 552 aa  178  3e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000507113  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3327  hypothetical protein  32.21 
 
 		 446 aa  177  4e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.219182 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5349  L-lactate permease  29.72 
 
 		 553 aa  177  4e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000100445  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5019  L-lactate transport  29.1 
 
 		 553 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000505988  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5342  L-lactate permease  28.65 
 
 		 552 aa  172  1e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000594028  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2258  L-lactate permease  31.96 
 
 		 494 aa  172  1e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.185279  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0072  L-lactate permease  27.4 
 
 		 565 aa  172  2e-41  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5077  L-lactate permease  28.87 
 
 		 552 aa  172  2e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000746346  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4909  L-lactate permease  28.87 
 
 		 552 aa  172  2e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000494573  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4924  L-lactate permease  28.87 
 
 		 552 aa  172  2e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000193163  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5317  L-lactate permease  28.87 
 
 		 552 aa  172  2e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.99986e-40 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5464  L-lactate permease  28.87 
 
 		 552 aa  172  2e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000341601  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0970  L-lactate transport  28.44 
 
 		 506 aa  172  2e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.486731  normal  0.0114366 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0113  L-lactate permease  27.4 
 
 		 560 aa  172  2e-41  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.610577  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4736  L-lactate transport  27.27 
 
 		 556 aa  169  1e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4735  L-lactate transport  27.41 
 
 		 556 aa  169  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.168353  hitchhiker  0.00377155 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4601  L-lactate transport  27.41 
 
 		 556 aa  169  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0523719  normal  0.0421821 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0696  L-lactate transport  27.92 
 
 		 556 aa  168  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.91775  hitchhiker  0.00000653044 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1719  L-lactate permease  28.44 
 
 		 507 aa  167  5e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.533287 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1074  L-lactate transport  29.17 
 
 		 506 aa  164  3e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3971  L-lactate permease  27.05 
 
 		 551 aa  163  7e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.737729 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4078  L-lactate permease  27.05 
 
 		 551 aa  163  8.000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0527  L-lactate permease  26.17 
 
 		 539 aa  162  1e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000130016  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0087  L-lactate permease  26.51 
 
 		 560 aa  162  1e-38  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5225  L-lactate transport  27.45 
 
 		 563 aa  161  2e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4016  L-lactate permease  26.88 
 
 		 551 aa  162  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3893  L-lactate permease  26.7 
 
 		 551 aa  162  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1035  L-lactate transport  27.27 
 
 		 563 aa  161  3e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3564  L-lactate transport  27.42 
 
 		 566 aa  161  3e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.033099  hitchhiker  0.00660955 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2994  L-lactate permease  30.36 
 
 		 548 aa  159  1e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.528271  normal  0.115704 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02843  glycolate transporter  28.6 
 
 		 560 aa  158  2e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0149329  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02793  hypothetical protein  28.6 
 
 		 560 aa  158  2e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0141341  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3434  glycolate transporter  28.6 
 
 		 560 aa  159  2e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3147  glycolate transporter  28.6 
 
 		 560 aa  158  2e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0726  glycolate transporter  28.6 
 
 		 560 aa  158  2e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3252  glycolate transporter  28.6 
 
 		 560 aa  158  2e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4693  L-lactate transport  27.86 
 
 		 589 aa  157  5.0000000000000005e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.880222  normal  0.0242756 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0753  L-lactate permease  27.09 
 
 		 564 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226744 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>