More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0470 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_0470  transposase  100 
 
 		 269 aa  560  1.0000000000000001e-159  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6034  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  42.7 
 
 		 288 aa  204  1e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2753  transposase  40.07 
 
 		 286 aa  203  3e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.403453  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2905  integrase catalytic region  39.85 
 
 		 286 aa  200  1.9999999999999998e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2168  Integrase catalytic region  39.33 
 
 		 280 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0614321  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4709  integrase catalytic region  40.74 
 
 		 283 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.704343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3327  Integrase catalytic region  39.33 
 
 		 280 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1844  integrase catalytic subunit  40.45 
 
 		 274 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5455  transposase catalytic site ISRme11  40.07 
 
 		 283 aa  196  3e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.361338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5497  transposase catalytic site ISRme11  40.07 
 
 		 283 aa  196  3e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1533  Integrase catalytic region  39.7 
 
 		 291 aa  195  7e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2220  Integrase catalytic region  39.7 
 
 		 291 aa  195  7e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3179  Integrase catalytic region  39.7 
 
 		 291 aa  195  7e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1347  IS3 putative transposase  39.62 
 
 		 290 aa  195  8.000000000000001e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13740  Integrase catalytic region  42.28 
 
 		 277 aa  192  4e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000154434  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3406  integrase catalytic region  40.15 
 
 		 269 aa  192  5e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0732  integrase catalytic region  40.15 
 
 		 267 aa  192  6e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3806  integrase catalytic region  39.26 
 
 		 293 aa  192  6e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0157  integrase catalytic region  40.15 
 
 		 267 aa  192  6e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1614  integrase catalytic region  39.26 
 
 		 293 aa  192  6e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.670062 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2971  integrase catalytic region  39.26 
 
 		 293 aa  192  6e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.43279 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5425  integrase catalytic region  39.26 
 
 		 277 aa  192  7e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.257494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2872  transposase-like  40.3 
 
 		 279 aa  191  9e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.274716  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1397  transposase-like  40.3 
 
 		 279 aa  191  1e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.102463  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1744  transposase-like  40.3 
 
 		 279 aa  191  1e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.71737  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00290  Integrase catalytic region  42.11 
 
 		 291 aa  191  1e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41860  Integrase, catalytic domain-containing protein  38.52 
 
 		 286 aa  190  2e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16550  Integrase, catalytic domain-containing protein  38.52 
 
 		 286 aa  190  2e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20540  Integrase, catalytic domain-containing protein  38.52 
 
 		 286 aa  190  2e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09750  Integrase, catalytic domain-containing protein  38.52 
 
 		 286 aa  190  2e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40520  Integrase, catalytic domain-containing protein  38.52 
 
 		 286 aa  190  2e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0387  integrase catalytic region  38.97 
 
 		 283 aa  187  2e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3135  integrase catalytic region  38.97 
 
 		 283 aa  187  2e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2267  integrase catalytic region  38.97 
 
 		 283 aa  187  2e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.21514  hitchhiker  0.00902868 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4159  integrase catalytic region  38.97 
 
 		 283 aa  187  2e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0610  integrase catalytic region  38.97 
 
 		 283 aa  187  2e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2030  integrase catalytic region  38.97 
 
 		 283 aa  187  2e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0158715  normal  0.0307665 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1559  Integrase catalytic region  39.71 
 
 		 270 aa  186  3e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1823  Integrase catalytic region  39.71 
 
 		 270 aa  186  3e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.484824  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4525  integrase catalytic subunit  38.6 
 
 		 282 aa  184  1.0000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4257  Integrase catalytic region  38.72 
 
 		 271 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4683  integrase catalytic subunit  38.6 
 
 		 282 aa  183  2.0000000000000003e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4709  integrase catalytic subunit  38.6 
 
 		 282 aa  183  2.0000000000000003e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.240732 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2765  integrase catalytic subunit  38.6 
 
 		 282 aa  183  3e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.189225  normal  0.0315769 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2526  integrase catalytic subunit  37.64 
 
 		 282 aa  183  3e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2199  Integrase catalytic region  39.78 
 
 		 270 aa  181  8.000000000000001e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1829  Integrase catalytic region  39.78 
 
 		 270 aa  181  8.000000000000001e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2011  Integrase catalytic region  39.78 
 
 		 270 aa  181  8.000000000000001e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.130464  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2949  Integrase catalytic region  39.78 
 
 		 270 aa  181  8.000000000000001e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1484  Integrase catalytic region  39.78 
 
 		 270 aa  181  8.000000000000001e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.370825  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2644  integrase catalytic subunit  40.07 
 
 		 289 aa  181  9.000000000000001e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0116112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3074  transposase IS3/IS911 family protein  37.45 
 
 		 378 aa  181  1e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.404952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0928  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  41.45 
 
 		 239 aa  181  1e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.394905  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0402  Integrase catalytic region  40.53 
 
 		 281 aa  181  1e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.992853 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1579  transposase IS3/IS911 family protein  37.45 
 
 		 378 aa  181  1e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.17333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2798  transposase IS3/IS911 family protein  37.45 
 
 		 378 aa  181  1e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0913073  normal  0.317716 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2802  transposase IS3/IS911 family protein  37.45 
 
 		 378 aa  181  1e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.261752 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6260  integrase catalytic region  38.43 
 
 		 291 aa  180  2e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1878  IS3 family transposase  37.92 
 
 		 279 aa  180  2e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00866146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0953  transposase IS3/IS911 family protein  38.38 
 
 		 393 aa  179  2.9999999999999997e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1444  transposase IS3/IS911 family protein  38.38 
 
 		 390 aa  179  4e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3934  transposase IS3/IS911 family protein  38.38 
 
 		 390 aa  179  4e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000580476  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2848  integrase catalytic subunit  40.36 
 
 		 302 aa  179  4e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.419389  normal  0.679584 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3173  transposase IS3/IS911 family protein  38.38 
 
 		 390 aa  179  4e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1672  transposase IS3/IS911 family protein  39.85 
 
 		 383 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1127  integrase catalytic subunit  39.85 
 
 		 289 aa  179  5.999999999999999e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.70947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1989  integrase catalytic subunit  39.85 
 
 		 289 aa  178  7e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.866629  normal  0.746727 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0578  ISRSO8-transposase orfB protein  38.11 
 
 		 296 aa  176  5e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1549  ISRSO8-transposase orfB protein  38.11 
 
 		 296 aa  176  5e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.797187 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2267  ISRSO8-transposase orfB protein  38.11 
 
 		 296 aa  176  5e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.748248  normal  0.318024 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0548  ISRSO8-transposase orfB protein  38.11 
 
 		 296 aa  176  5e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3664  Integrase catalytic region  35.82 
 
 		 294 aa  176  5e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.11217  normal  0.13781 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0741  integrase catalytic subunit  37.22 
 
 		 270 aa  175  6e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0141  ISEhe3, transposase orfB  37.31 
 
 		 270 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000861887  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0435  ISEhe3, transposase orfB  37.31 
 
 		 270 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1260  ISEhe3, transposase orfB  37.31 
 
 		 270 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0300091  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0281  ISEhe3, transposase orfB  37.31 
 
 		 270 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0347  ISEhe3, transposase orfB  37.31 
 
 		 270 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0715002  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2788  ISEhe3, transposase orfB  37.31 
 
 		 270 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00739758  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2066  ISEhe3, transposase orfB  37.31 
 
 		 270 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000480211  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0326  ISEhe3, transposase orfB  37.31 
 
 		 270 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.148326  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0624  putative transposase B  37.31 
 
 		 272 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5316  Integrase catalytic region  37.64 
 
 		 297 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.955701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4529  ISEhe3, transposase orfB  37.31 
 
 		 270 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.313406  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5973  transposase catalytic site ISRme3  37.64 
 
 		 297 aa  174  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.291095  normal  0.0449823 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6074  transposase catalytic site ISRme3  37.64 
 
 		 297 aa  174  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.428813 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0031  integrase catalytic subunit  37.64 
 
 		 297 aa  174  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1612  integrase catalytic subunit  37.64 
 
 		 297 aa  174  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.853443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3348  integrase catalytic subunit  37.64 
 
 		 297 aa  174  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3771  transposase catalytic site ISRme3  37.64 
 
 		 297 aa  174  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3942  transposase catalytic site ISRme3  37.64 
 
 		 297 aa  174  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.383486 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4659  transposase catalytic site ISRme3  37.64 
 
 		 297 aa  174  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.936352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5452  transposase catalytic site ISRme3  37.64 
 
 		 297 aa  174  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5679  transposase catalytic site ISRme3  37.64 
 
 		 297 aa  174  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4892  integrase catalytic region  37.59 
 
 		 296 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.96486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4961  integrase catalytic region  37.59 
 
 		 296 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.764431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3815  Integrase catalytic region  37.64 
 
 		 297 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.382453 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1991  ISEhe3, transposase orfB  37.31 
 
 		 270 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000291495  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3021  ISEhe3, transposase orfB  37.31 
 
 		 270 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000678494  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3970  ISEhe3, transposase orfB  37.31 
 
 		 270 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000757878  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>