More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7192 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_7192  Lipoprotein-like protein  100 
 
 
257 aa  500  1e-141  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0272359 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0084  rare lipoprotein A  58.06 
 
 
213 aa  146  4.0000000000000006e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.332012  normal  0.0350309 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0087  rare lipoprotein A  65.26 
 
 
241 aa  139  4.999999999999999e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4765  rare lipoprotein A  69.15 
 
 
179 aa  139  6e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2181  rare lipoprotein A  65.96 
 
 
239 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.0000000683407  decreased coverage  0.000000439992 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1527  rare lipoprotein A  61.29 
 
 
233 aa  113  3e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0105659  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0638  rare lipoprotein A  61.11 
 
 
127 aa  112  4.0000000000000004e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00262012 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4388  rare lipoprotein A  61.63 
 
 
119 aa  112  6e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4283  rare lipoprotein A  51.89 
 
 
367 aa  111  1.0000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2925  rare lipoprotein A  55.06 
 
 
131 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.542762  normal  0.960084 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3104  rare lipoprotein A  55.06 
 
 
131 aa  107  1e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2475  hypothetical protein  54.46 
 
 
153 aa  107  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1475  rare lipoprotein A  62.22 
 
 
124 aa  106  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.140201  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0709  rare lipoprotein A  66.67 
 
 
124 aa  106  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.416345  normal  0.119045 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0337  rare lipoprotein A  54.08 
 
 
144 aa  107  3e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4924  rare lipoprotein A  63.86 
 
 
121 aa  105  6e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0220  rare lipoprotein A  59.09 
 
 
163 aa  105  9e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.602975  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1087  rare lipoprotein A  55.06 
 
 
137 aa  104  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.198857  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3007  rare lipoprotein A  53.93 
 
 
147 aa  104  1e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0729065  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4317  rare lipoprotein A  56.32 
 
 
120 aa  103  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0965  rare lipoprotein A  57.61 
 
 
371 aa  104  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1159  rare lipoprotein A  55.06 
 
 
137 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2800  rare lipoprotein A  42.18 
 
 
342 aa  103  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.472757  normal  0.158248 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0611  rare lipoprotein A  52.81 
 
 
167 aa  104  2e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4952  rare lipoprotein A  61.9 
 
 
121 aa  103  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.464519  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3199  rare lipoprotein A  55.06 
 
 
137 aa  103  3e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.476215 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1099  rare lipoprotein A  55.06 
 
 
137 aa  103  3e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3377  rare lipoprotein A  64 
 
 
115 aa  103  3e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.437587  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01087  hypothetical protein  55.06 
 
 
181 aa  102  4e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3182  rare lipoprotein A  60.53 
 
 
115 aa  102  4e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3506  rare lipoprotein A  60.53 
 
 
115 aa  102  4e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.898762 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1773  rare lipoprotein A  53.93 
 
 
127 aa  102  4e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.662489 
 
 
-
 
NC_004310  BR2135  rare lipoprotein A family protein  55.91 
 
 
118 aa  102  6e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2050  rare lipoprotein A family protein  55.91 
 
 
118 aa  102  6e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0189793  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1191  rare lipoprotein A  53.93 
 
 
137 aa  102  7e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0103428  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4580  rare lipoprotein A  54.44 
 
 
120 aa  101  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0743429 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2837  rare lipoprotein A  60.71 
 
 
121 aa  100  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0135  rare lipoprotein A  61.18 
 
 
122 aa  100  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3637  rare lipoprotein A  56.18 
 
 
163 aa  100  2e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0117902  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0060  rare lipoprotein A  55.06 
 
 
129 aa  100  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0775  rare lipoprotein A  55.56 
 
 
118 aa  100  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.384839  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1079  rare lipoprotein A  51.52 
 
 
360 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1108  rare lipoprotein A  51.52 
 
 
360 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1357  rare lipoprotein A  50.47 
 
 
199 aa  99.8  4e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0221081  normal  0.24818 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5339  rare lipoprotein A  46.34 
 
 
324 aa  99.4  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2019  rare lipoprotein A  57.3 
 
 
165 aa  98.2  1e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.202137  normal  0.287448 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0252  rare lipoprotein A  55.68 
 
 
170 aa  97.8  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1489  rare lipoprotein A  57.65 
 
 
122 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2298  rare lipoprotein A  54.44 
 
 
238 aa  97.1  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3399  rare lipoprotein A family protein  57.3 
 
 
242 aa  97.1  3e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0569835  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2911  rare lipoprotein A family protein  57.3 
 
 
230 aa  96.7  3e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.339601  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1631  rare lipoprotein A family protein  57.3 
 
 
242 aa  97.1  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3821  rare lipoprotein A family protein  57.3 
 
 
230 aa  97.1  3e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577854  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3960  rare lipoprotein A  56.82 
 
 
118 aa  97.1  3e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3902  rare lipoprotein A family protein  57.3 
 
 
211 aa  96.7  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0043  rare lipoprotein A family protein  57.3 
 
 
211 aa  96.7  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3150  rare lipoprotein A family protein  57.3 
 
 
211 aa  96.3  4e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2970  rare lipoprotein A family protein  57.3 
 
 
211 aa  96.7  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0403  rare lipoprotein A  57.3 
 
 
200 aa  96.3  5e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3340  rare lipoprotein A  53.93 
 
 
358 aa  95.9  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0929  rare lipoprotein A  57.3 
 
 
124 aa  95.1  8e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.352567 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2973  rare lipoprotein A  57.3 
 
 
134 aa  95.5  8e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0691329 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58210  hypothetical protein  56.84 
 
 
125 aa  95.5  8e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0852  rare lipoprotein A  53.93 
 
 
140 aa  95.1  9e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4287  rare lipoprotein A  56.32 
 
 
94 aa  95.1  9e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.7858 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0114  rare lipoprotein A  58.43 
 
 
142 aa  94.7  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0428  rare lipoprotein A  57.95 
 
 
168 aa  94.7  1e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.480759  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5099  hypothetical protein  56.38 
 
 
125 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.637831  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0121  rare lipoprotein A  56.18 
 
 
199 aa  94  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0720  rare lipoprotein A  58.67 
 
 
116 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0969  rare lipoprotein A  56.18 
 
 
124 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.629172  normal  0.144178 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0534  rare lipoprotein A  56.82 
 
 
169 aa  93.6  3e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3870  putative RlpA family protein  53.49 
 
 
238 aa  92.8  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.174905 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0676  rare lipoprotein A  58.44 
 
 
117 aa  93.2  4e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.558128 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4315  rare lipoprotein A  55.06 
 
 
200 aa  92.4  6e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0834  rare lipoprotein A  52.81 
 
 
124 aa  92.4  7e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0578704  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1152  rare lipoprotein A  47.96 
 
 
335 aa  92  7e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4286  rare lipoprotein A  55.06 
 
 
155 aa  92  8e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3531  rare lipoprotein A  50.57 
 
 
124 aa  92  8e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0195  rare lipoprotein A  53.93 
 
 
202 aa  91.7  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489761  hitchhiker  0.00000000287556 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1705  rare lipoprotein A  42.74 
 
 
367 aa  91.3  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1190  rare lipoprotein a rlpa  53.33 
 
 
239 aa  91.3  1e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0936  rare lipoprotein A  55.06 
 
 
124 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5674  rare lipoprotein A  55.17 
 
 
110 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.417848  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3389  rare lipoprotein A  53.93 
 
 
214 aa  90.5  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1915  rare lipoprotein A  40.6 
 
 
196 aa  91.3  2e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1684  rare lipoprotein A  46.79 
 
 
150 aa  91.3  2e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2537  rare lipoprotein A  50 
 
 
243 aa  90.9  2e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.18015 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0269  rare lipoprotein A  56.82 
 
 
160 aa  90.9  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.586864 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0201  rare lipoprotein A  50 
 
 
133 aa  90.1  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2030  RlpA family lipoprotein  54.35 
 
 
261 aa  89.7  4e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000777021  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5916  rare lipoprotein A  49.44 
 
 
303 aa  89.7  4e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2772  rare lipoprotein A  51.65 
 
 
171 aa  89.7  4e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0214  rare lipoprotein A  52.81 
 
 
203 aa  89.7  4e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.104099 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0200  rare lipoprotein A  52.81 
 
 
203 aa  89.7  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3653  rare lipoprotein A  51.72 
 
 
175 aa  89.4  5e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.582784  normal  0.812873 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0286  rare lipoprotein A  52.81 
 
 
213 aa  89  6e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.838824  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0268  rare lipoprotein A  52.81 
 
 
203 aa  89  7e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.170156 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0738  rare lipoprotein A  52.22 
 
 
163 aa  89  7e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0175  rare lipoprotein A  56.82 
 
 
156 aa  88.6  9e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>