More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5624 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_5624  HAD family hydrolase  100 
 
 
228 aa  444  1.0000000000000001e-124  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.147818  normal  0.407625 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3310  HAD family hydrolase  63.39 
 
 
232 aa  272  3e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0160  HAD family hydrolase  62.1 
 
 
224 aa  265  5.999999999999999e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.300128  normal  0.21286 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5294  HAD family hydrolase  61.47 
 
 
224 aa  264  7e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.08015 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4275  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase family protein  63.13 
 
 
224 aa  262  4e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0625662 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4249  HAD family hydrolase  60.27 
 
 
224 aa  257  8e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5583  HAD family hydrolase  60.55 
 
 
224 aa  253  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6309  HAD family hydrolase  60.55 
 
 
224 aa  253  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.403057 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0513  HAD family hydrolase  59.36 
 
 
225 aa  251  9.000000000000001e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7037  HAD family hydrolase  60.09 
 
 
224 aa  249  2e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.927677 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1317  HAD family hydrolase  59.63 
 
 
224 aa  249  3e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.716581  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6512  HAD family hydrolase  59.63 
 
 
224 aa  249  3e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6102  HAD family hydrolase  59.63 
 
 
224 aa  248  5e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.524869  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4503  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  60.09 
 
 
224 aa  248  6e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0822  HAD family hydrolase  59.63 
 
 
224 aa  244  6.999999999999999e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.923988 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2426  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  63.59 
 
 
224 aa  238  4e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0132517 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2484  HAD family hydrolase  59.63 
 
 
233 aa  238  5e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4411  HAD family hydrolase  56.42 
 
 
224 aa  236  2e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.981308  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2149  HAD family hydrolase  63.13 
 
 
224 aa  235  4e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.376936  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2109  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  61.93 
 
 
224 aa  231  6e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.546495 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0276  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  51.79 
 
 
327 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.731129  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0131  HAD family hydrolase  51.13 
 
 
224 aa  218  5e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1937  HAD family hydrolase  40.83 
 
 
234 aa  137  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.67763  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4417  HAD family hydrolase  40.47 
 
 
232 aa  132  5e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.155896  normal  0.156136 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4850  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  39.07 
 
 
229 aa  131  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0298674  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2746  HAD family hydrolase  37.79 
 
 
240 aa  122  5e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.906764  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2790  HAD family hydrolase  37.79 
 
 
240 aa  122  5e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2776  HAD family hydrolase  37.79 
 
 
240 aa  122  5e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.223588  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0220  HAD family hydrolase  39.17 
 
 
238 aa  122  7e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.208784 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0228  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  35.51 
 
 
220 aa  118  6e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.424895  hitchhiker  0.00464716 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1750  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.65 
 
 
237 aa  117  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00428028  normal  0.0347073 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3218  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.6 
 
 
234 aa  113  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4680  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.96 
 
 
223 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1880  HAD family hydrolase  36.45 
 
 
230 aa  107  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.615565  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1516  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  37.06 
 
 
222 aa  106  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.122032  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0647  HAD family hydrolase  33.18 
 
 
221 aa  106  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.496334  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4472  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.96 
 
 
223 aa  102  4e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3439  HAD family hydrolase  33.81 
 
 
233 aa  102  5e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3991  HAD family hydrolase  35.35 
 
 
223 aa  101  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0589691  normal  0.286342 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3959  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35 
 
 
229 aa  100  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3915  HAD family hydrolase  31.19 
 
 
238 aa  96.7  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0174  HAD family hydrolase  30.92 
 
 
215 aa  95.5  6e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4360  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.4 
 
 
223 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1284  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.94 
 
 
227 aa  94.4  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.153215  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0033  HAD family hydrolase  31.16 
 
 
228 aa  85.9  4e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.144848  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0181  HAD superfamily hydrolase  32.86 
 
 
214 aa  85.5  6e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05080  predicted phosphatase/phosphohexomutase  27.57 
 
 
227 aa  85.1  8e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.071348  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1330  HAD family hydrolase  35.84 
 
 
230 aa  85.1  8e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0545  HAD-superfamily hydrolase  29.23 
 
 
246 aa  84.7  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0822  HAD family hydrolase  30.3 
 
 
396 aa  84.7  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0141  beta-phosphoglucomutase  28.72 
 
 
214 aa  84.7  0.000000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2837  putative phosphatase  34.83 
 
 
219 aa  84.3  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.390104  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3307  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  37.02 
 
 
735 aa  83.2  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.081208  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2562  putative phosphatase  34.43 
 
 
219 aa  82  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.166759  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2474  putative phosphatase  34.43 
 
 
219 aa  82  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.764335  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2519  putative phosphatase  34.43 
 
 
219 aa  82  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0435339  normal  0.279321 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2574  putative phosphatase  34.43 
 
 
219 aa  82  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2682  putative phosphatase  34.43 
 
 
219 aa  82  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02312  putative unknown enzyme  33.16 
 
 
224 aa  81.6  0.000000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00322256  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10160  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.52 
 
 
217 aa  80.5  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.64096  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3242  beta-phosphoglucomutase  31.94 
 
 
219 aa  79.7  0.00000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2757  beta-phosphoglucomutase  31.18 
 
 
216 aa  79.7  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.273253 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02218  predicted hydrolase or phosphatase  33.33 
 
 
216 aa  79  0.00000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1363  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.33 
 
 
216 aa  79  0.00000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0110117  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2198  beta-phosphoglucomutase  26.09 
 
 
215 aa  79  0.00000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.102511  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02178  hypothetical protein  33.33 
 
 
216 aa  79  0.00000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2442  putative phosphatase  33.33 
 
 
216 aa  79  0.00000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.647489  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1359  putative phosphatase  33.33 
 
 
216 aa  79  0.00000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.348521 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3432  putative phosphatase  33.33 
 
 
216 aa  79  0.00000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.166368  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2448  putative phosphatase  33.33 
 
 
216 aa  79  0.00000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.745831  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2877  beta-phosphoglucomutase  29.41 
 
 
219 aa  78.6  0.00000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0767657  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3540  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  39.08 
 
 
209 aa  78.6  0.00000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.983537  normal  0.491386 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2586  putative phosphatase  33.33 
 
 
216 aa  78.6  0.00000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.118565  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0452  HAD family hydrolase  30.81 
 
 
221 aa  78.2  0.00000000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1516  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.45 
 
 
227 aa  77.4  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1478  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.61 
 
 
220 aa  77.4  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0104021  normal  0.265718 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1824  HAD family hydrolase  35.12 
 
 
222 aa  77  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23210  phosphoglycolate phosphatase  30.73 
 
 
226 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0343323  hitchhiker  0.00416895 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0767  beta-phosphoglucomutase  27.27 
 
 
220 aa  76.6  0.0000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.180027  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1446  putative phosphatase  34.59 
 
 
218 aa  76.6  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1822  putative phosphatase  34.59 
 
 
218 aa  76.6  0.0000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1554  putative phosphatase  34.59 
 
 
218 aa  76.6  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2669  putative phosphatase  32.79 
 
 
216 aa  76.3  0.0000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.91748  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3313  putative phosphatase  33.69 
 
 
218 aa  75.9  0.0000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00109043  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1461  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.74 
 
 
211 aa  75.5  0.0000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0537  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.44 
 
 
260 aa  75.5  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3783  HAD family hydrolase  30.88 
 
 
242 aa  75.5  0.0000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0711244  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2043  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.17 
 
 
208 aa  75.5  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1957  phosphoglycolate phosphatase  30.17 
 
 
223 aa  75.1  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0996  HAD family hydrolase  30.99 
 
 
219 aa  74.7  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0106068 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3787  HAD family hydrolase  31.07 
 
 
238 aa  74.7  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.85061  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5088  beta-phosphoglucomutase  28.34 
 
 
219 aa  74.7  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00016924  normal  0.408522 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1388  putative phosphatase  33.15 
 
 
218 aa  74.7  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00329661  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00430  beta-phosphoglucomutase  28.65 
 
 
216 aa  73.9  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2237  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  26.64 
 
 
254 aa  73.9  0.000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.202357  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0403  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.41 
 
 
215 aa  73.9  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0670  beta-phosphoglucomutase  29.19 
 
 
207 aa  73.9  0.000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.922957  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0904  HAD family hydrolase  32.79 
 
 
197 aa  73.9  0.000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1402  beta-phosphoglucomutase  31.41 
 
 
219 aa  73.2  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.340542  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1089  phosphoglycolate phosphatase  31.03 
 
 
227 aa  73.2  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.396739  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>