More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5255 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_5255  NYC1; chlorophyll b reductase  100 
 
 
264 aa  523  1e-147  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0552539  normal  0.178037 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0951  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.82 
 
 
276 aa  180  2e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6613  NYC1; chlorophyll b reductase  44.59 
 
 
254 aa  174  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0625441 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0274  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.27 
 
 
258 aa  170  2e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0189  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.46 
 
 
257 aa  167  2e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2740  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.06 
 
 
257 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44908  predicted protein  34.73 
 
 
877 aa  111  1.0000000000000001e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0602  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.83 
 
 
256 aa  107  1e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2333  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.32 
 
 
274 aa  108  1e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00168385  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0413  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  36.61 
 
 
274 aa  107  2e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.642509  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39837  predicted protein  29.43 
 
 
309 aa  103  4e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.169011  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1639  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  32.61 
 
 
274 aa  101  1e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1969  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38 
 
 
294 aa  100  3e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000507932  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7045  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
250 aa  98.6  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2006  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.58 
 
 
274 aa  98.2  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.157395 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1599  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.17 
 
 
252 aa  97.4  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.166139  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1351  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.14 
 
 
282 aa  96.7  4e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1800  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.08 
 
 
275 aa  95.1  9e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.454392 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3982  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.54 
 
 
279 aa  95.1  9e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4281  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.76 
 
 
333 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1153  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.16 
 
 
279 aa  95.1  1e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.509477 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3722  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.87 
 
 
267 aa  94  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.848764  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5919  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.83 
 
 
295 aa  92.4  7e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11893  short chain dehydrogenase  33.87 
 
 
286 aa  92.4  7e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.361469 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0383  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.44 
 
 
306 aa  92  9e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0161  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.41 
 
 
333 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.264514  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3782  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.38 
 
 
269 aa  90.9  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17920  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  35.18 
 
 
251 aa  90.9  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.328183  normal  0.355358 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4623  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.29 
 
 
265 aa  90.5  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1096  glucose dehydrogenase  31.3 
 
 
244 aa  89.7  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0163868 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1055  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.05 
 
 
258 aa  89.7  4e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2990  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.62 
 
 
336 aa  89.7  4e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.753592 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0616  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.22 
 
 
266 aa  90.1  4e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6198  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.97 
 
 
260 aa  89.4  5e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3792  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.16 
 
 
290 aa  89.4  6e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0079  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.57 
 
 
246 aa  89.4  6e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.596846  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3779  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.9 
 
 
266 aa  89.4  6e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00111461  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3218  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.51 
 
 
252 aa  89  7e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.672369  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2362  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.22 
 
 
249 aa  88.6  9e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.876035 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2000  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.8 
 
 
274 aa  88.2  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000578748  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2049  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  27.54 
 
 
230 aa  87.4  2e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3758  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.74 
 
 
299 aa  87.4  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.297651  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0517  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.47 
 
 
247 aa  87.4  2e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1331  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.1 
 
 
332 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.261589  normal  0.281891 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5078  short chain dehydrogenase  34.15 
 
 
337 aa  87  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3318  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.42 
 
 
334 aa  87  3e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.496064  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3968  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.42 
 
 
334 aa  87  3e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.223195 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5059  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.5 
 
 
266 aa  87  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2655  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.38 
 
 
266 aa  86.7  4e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1877  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.58 
 
 
246 aa  85.9  6e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.627616  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3453  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.22 
 
 
267 aa  85.9  6e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.282255  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2052  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.96 
 
 
248 aa  85.9  7e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2906  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.97 
 
 
258 aa  85.5  7e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4659  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.83 
 
 
277 aa  85.9  7e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3367  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.74 
 
 
244 aa  85.5  8e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2505  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.65 
 
 
231 aa  85.1  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2036  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.03 
 
 
258 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2555  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.65 
 
 
231 aa  85.1  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.459049  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0808  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.84 
 
 
252 aa  84.7  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1086  Short-chain alcohol dehydrogenase of unknown specificity  31 
 
 
247 aa  84.7  0.000000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.144372  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5858  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
244 aa  84.7  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1489  short chain dehydrogenase  32.2 
 
 
296 aa  84.3  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1019  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.65 
 
 
330 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0961773  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1156  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  28.57 
 
 
248 aa  84.3  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536759  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1138  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.09 
 
 
246 aa  84  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.697899  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5141  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.12 
 
 
337 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.460239  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4845  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.28 
 
 
252 aa  84.3  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1137  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.75 
 
 
255 aa  83.6  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.420878 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2186  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.37 
 
 
248 aa  83.6  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0361624 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1326  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30 
 
 
246 aa  84  0.000000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2893  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.24 
 
 
255 aa  83.6  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5867  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.99 
 
 
244 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3095  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  28.64 
 
 
246 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.025547 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3460  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.96 
 
 
229 aa  83.2  0.000000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0481676 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1151  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  34.78 
 
 
234 aa  83.2  0.000000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.256582 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2742  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.46 
 
 
246 aa  83.2  0.000000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8757  short chain dehydrogenase  35.91 
 
 
256 aa  83.2  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.215149  normal  0.0548986 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0169  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.98 
 
 
273 aa  82.4  0.000000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.476438 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3782  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.19 
 
 
282 aa  82.4  0.000000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.25135  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2766  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.75 
 
 
244 aa  82.4  0.000000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.240645  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0767  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.9 
 
 
330 aa  82.4  0.000000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.415615 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1503  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.35 
 
 
248 aa  82.4  0.000000000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3770  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.57 
 
 
282 aa  82  0.000000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.694275  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1571  Short-chain alcohol dehydrogenase of unknown specificity  29.57 
 
 
243 aa  82  0.000000000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3843  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.57 
 
 
282 aa  82  0.000000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1271  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.18 
 
 
269 aa  82  0.000000000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2503  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase, putative  31.94 
 
 
243 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6050  short chain dehydrogenase  31.56 
 
 
342 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.057993 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1872  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.89 
 
 
241 aa  81.3  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.105262 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5539  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.81 
 
 
244 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.101629  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4775  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.02 
 
 
249 aa  81.6  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4446  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.44 
 
 
254 aa  81.6  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.287432  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0471  short chain dehydrogenase  29.63 
 
 
258 aa  81.3  0.00000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3335  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  32.11 
 
 
260 aa  81.6  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.175664  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4482  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.36 
 
 
244 aa  81.6  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000123251 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0105  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.47 
 
 
248 aa  81.6  0.00000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6423  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.33 
 
 
244 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3592  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.45 
 
 
286 aa  80.9  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.894525 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1371  short chain dehydrogenase  31.56 
 
 
342 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.103888  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7667  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.11 
 
 
332 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.755346  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>