More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3701 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_3701  copper-translocating P-type ATPase  100 
 
 
70 aa  132  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.754516  normal  0.0828081 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0018  copper-translocating P-type ATPase  74.29 
 
 
70 aa  97.4  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0091  Heavy metal transport/detoxification protein  70.31 
 
 
68 aa  89  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3354  heavy metal transport/detoxification protein  75 
 
 
66 aa  86.7  9e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.702383 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3603  Heavy metal transport/detoxification protein  68.18 
 
 
69 aa  84.3  6e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.245307  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10610  copper chaperone  64.18 
 
 
69 aa  83.2  0.000000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.201144  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0014  copper ion binding protein  74.24 
 
 
75 aa  80.5  0.000000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4422  Heavy metal transport/detoxification protein  61.54 
 
 
71 aa  79.7  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.687181  normal  0.662919 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0951  putative metal-binding protein  59.7 
 
 
68 aa  80.1  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2601  Heavy metal transport/detoxification protein  60.94 
 
 
68 aa  79.7  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.854669  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0446  heavy metal transport/detoxification protein  58.21 
 
 
78 aa  79.3  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.478739  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0534  copper ion binding protein  54.41 
 
 
69 aa  78.6  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0184287  normal  0.0350309 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4238  Heavy metal transport/detoxification protein  56.25 
 
 
68 aa  77.8  0.00000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19780  copper chaperone  62.12 
 
 
71 aa  77.8  0.00000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0208404  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5882  Heavy metal transport/detoxification protein  56.25 
 
 
69 aa  76.3  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2847  heavy metal transport/detoxification protein  61.19 
 
 
115 aa  76.3  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.179669 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4497  heavy metal transport/detoxification protein  58.21 
 
 
69 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.499051 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1450  heavy metal transport/detoxification protein  59.7 
 
 
113 aa  75.5  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1468  heavy metal transport/detoxification protein  59.7 
 
 
70 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3444  Heavy metal transport/detoxification protein  57.53 
 
 
76 aa  74.7  0.0000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.129819  hitchhiker  0.00605646 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4552  heavy metal transport/detoxification protein  59.7 
 
 
70 aa  74.7  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.939957  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0910  heavy metal transport/detoxification protein  61.19 
 
 
70 aa  73.9  0.0000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0015  hypothetical protein  71.19 
 
 
93 aa  73.9  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3704  hypothetical protein  64.62 
 
 
99 aa  73.6  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.660005  normal  0.139636 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3891  Heavy metal transport/detoxification protein  56.92 
 
 
77 aa  73.2  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1695  Heavy metal transport/detoxification protein  72.73 
 
 
69 aa  73.2  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.583772  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9003  hypothetical protein  71.21 
 
 
67 aa  73.2  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.961553  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0783  Heavy metal transport/detoxification protein  55.22 
 
 
69 aa  72.4  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.591809  normal  0.0129962 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4448  heavy metal transport/detoxification protein  53.23 
 
 
67 aa  70.1  0.000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.866926  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2471  Heavy metal transport/detoxification protein  55.22 
 
 
108 aa  69.7  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4548  Heavy metal transport/detoxification protein  60 
 
 
70 aa  69.3  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4020  Heavy metal transport/detoxification protein  57.81 
 
 
76 aa  67.4  0.00000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.343869 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0674  Heavy metal transport/detoxification protein  52.46 
 
 
68 aa  64.7  0.0000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1741  Heavy metal transport/detoxification protein  49.32 
 
 
73 aa  64.3  0.0000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.246039  decreased coverage  0.0020488 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6797  Heavy metal transport/detoxification protein  53.73 
 
 
70 aa  63.9  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0467  Heavy metal transport/detoxification protein  57.97 
 
 
70 aa  63.5  0.0000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.242045 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36750  copper chaperone  51.56 
 
 
68 aa  63.5  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.241771 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3668  Heavy metal transport/detoxification protein  52.86 
 
 
74 aa  62.4  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3412  copper ion binding protein  44.93 
 
 
74 aa  62  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0277616 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3224  heavy metal transport/detoxification protein  43.75 
 
 
65 aa  62  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2500  Heavy metal transport/detoxification protein  50 
 
 
117 aa  60.8  0.000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.711261 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1163  Heavy metal transport/detoxification protein  55.07 
 
 
70 aa  60.8  0.000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3747  heavy metal transport/detoxification protein  50.72 
 
 
69 aa  60.5  0.000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.37932  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5838  Heavy metal transport/detoxification protein  51.61 
 
 
69 aa  60.1  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4327  heavy metal transport/detoxification protein  39.39 
 
 
76 aa  59.7  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000196109  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21360  copper chaperone  57.14 
 
 
72 aa  58.9  0.00000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.883325  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7843  heavy metal translocating P-type ATPase  45.31 
 
 
835 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5304  heavy metal transport/detoxification protein  48.39 
 
 
80 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.562582  normal  0.337627 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5705  heavy metal transport/detoxification protein  48.39 
 
 
80 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2554  heavy metal transport/detoxification protein  50.79 
 
 
67 aa  58.2  0.00000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.185355  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1651  heavy metal transport/detoxification protein  58.82 
 
 
67 aa  58.2  0.00000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0287  heavy metal translocating P-type ATPase  47.37 
 
 
827 aa  57.4  0.00000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4588  heavy metal transport/detoxification protein  43.75 
 
 
73 aa  57.8  0.00000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4777  heavy metal translocating P-type ATPase  50 
 
 
1013 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.701128 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3947  heavy metal transport/detoxification protein  50.85 
 
 
67 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4021  heavy metal transport/detoxification protein  50.85 
 
 
67 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18432  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3961  heavy metal transport/detoxification protein  50.85 
 
 
67 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0422606 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0489  heavy metal transport/detoxification protein  51.67 
 
 
74 aa  57.4  0.00000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.158876  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3893  heavy metal translocating P-type ATPase  45.16 
 
 
855 aa  57.4  0.00000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0676601  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1770  heavy metal translocating P-type ATPase  44.62 
 
 
833 aa  57.4  0.00000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.466884 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5745  heavy metal transport/detoxification protein  59.7 
 
 
68 aa  57  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1572  heavy metal translocating P-type ATPase  46.03 
 
 
856 aa  57  0.00000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0738  copper ion binding protein  43.75 
 
 
70 aa  57  0.00000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0741164  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3299  heavy metal translocating P-type ATPase  46.88 
 
 
1182 aa  57  0.00000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.741237  normal  0.115962 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36140  copper chaperone  51.56 
 
 
100 aa  56.6  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.237573  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3258  Heavy metal transport/detoxification protein  46.27 
 
 
160 aa  56.2  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1640  P1 ATPase/HMA domain-containing protein  45.9 
 
 
817 aa  56.2  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0650256 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2168  copper-translocating P-type ATPase  46.03 
 
 
971 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5366  heavy metal translocating P-type ATPase  48.28 
 
 
1021 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.475647  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5494  heavy metal translocating P-type ATPase  48.28 
 
 
1021 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0117323  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3669  heavy metal transport/detoxification protein  45.71 
 
 
80 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.792064  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0131  Heavy metal transport/detoxification protein  43.55 
 
 
67 aa  55.5  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2266  heavy metal translocating P-type ATPase  46.03 
 
 
790 aa  55.1  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.123408  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0162  copper-translocating P-type ATPase  44.93 
 
 
1040 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.311692 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4098  heavy metal transport/detoxification protein  48.53 
 
 
76 aa  54.7  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1467  heavy metal transport/detoxification protein  43.75 
 
 
97 aa  54.3  0.0000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3872  Heavy metal transport/detoxification protein  47.83 
 
 
79 aa  54.3  0.0000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00330902 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5373  heavy metal translocating P-type ATPase  42.86 
 
 
937 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.698068 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4897  heavy metal translocating P-type ATPase  41.67 
 
 
827 aa  53.9  0.0000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.248025  normal  0.348601 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0995  Heavy metal transport/detoxification protein  41.38 
 
 
65 aa  53.9  0.0000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.330421  hitchhiker  0.00334247 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2657  copper ion binding protein  50 
 
 
67 aa  53.5  0.0000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.024328  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4827  heavy metal translocating P-type ATPase  44.83 
 
 
946 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0294  Heavy metal transport/detoxification protein  45.9 
 
 
65 aa  53.5  0.0000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13170  putative metal transporting P-type ATPase  41.27 
 
 
792 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0405  cation-transporting ATPase membrane protein  51.61 
 
 
1061 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0316  cation-transporting ATPase membrane protein  51.61 
 
 
1063 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.707407  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3169  Heavy metal transport/detoxification protein  45.16 
 
 
65 aa  53.5  0.0000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.145614 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1187  putative metal transporting P-type ATPase  42.86 
 
 
792 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1835  heavy metal translocating P-type ATPase  47.69 
 
 
804 aa  53.1  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1851  copper-translocating P-type ATPase  51.61 
 
 
1061 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.845444  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1888  mercury ion binding protein  44.62 
 
 
68 aa  53.1  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.399491 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1755  copper-translocating P-type ATPase  51.61 
 
 
1061 aa  53.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.55306  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2279  copper ion binding protein  39.39 
 
 
69 aa  53.1  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0854  copper-translocating P-type ATPase  51.61 
 
 
1061 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1144  copper-translocating P-type ATPase  51.61 
 
 
1063 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1715  copper ion binding protein  45.31 
 
 
77 aa  52.4  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0879446  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0220  copper-translocating P-type ATPase  47.46 
 
 
826 aa  52.4  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4022  Heavy metal transport/detoxification protein  48.48 
 
 
132 aa  52  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.375951 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4520  heavy metal transport/detoxification protein  43.75 
 
 
97 aa  52.4  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.212796  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1492  heavy metal transport/detoxification protein  43.08 
 
 
102 aa  52.4  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>