More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3527 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_3527  CBS domain-containing protein  100 
 
 
159 aa  315  2e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.215012  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2710  CBS domain-containing membrane protein  52.6 
 
 
157 aa  149  1e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.828048  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0990  acetoin utilization protein AcuB, putative  35.51 
 
 
140 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0383  putative signal transduction protein with CBS domains  37.41 
 
 
149 aa  68.6  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0412615  normal  0.799719 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3209  CBS domain-containing protein  35.42 
 
 
143 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.549448  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1158  CBS domain containing protein  35.42 
 
 
143 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3209  CBS domain-containing protein  35.42 
 
 
143 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3348  CBS domain-containing protein  35.42 
 
 
143 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0657  signal transduction protein  29.69 
 
 
309 aa  61.6  0.000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00784458  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1386  CBS domain-containing protein  27.34 
 
 
211 aa  61.2  0.000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1962  CBS domain-containing protein  31.85 
 
 
136 aa  60.8  0.000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.946  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2811  CBS domain-containing protein  34.72 
 
 
143 aa  59.7  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1059  CBS domain-containing protein  34.31 
 
 
143 aa  59.3  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1234  CBS domain containing membrane protein  31.45 
 
 
380 aa  58.9  0.00000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2844  CBS domain-containing protein  34.9 
 
 
428 aa  58.9  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1308  putative signal transduction protein with CBS domains  23.12 
 
 
161 aa  58.2  0.00000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4053  CBS domain-containing protein  35.06 
 
 
400 aa  58.5  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.250275  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3486  CBS domain-containing protein  34.11 
 
 
221 aa  58.2  0.00000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000172668 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1055  CBS domain-containing protein  33.58 
 
 
143 aa  57.8  0.00000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.53863  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6852  putative signal transduction protein with CBS domains  31.47 
 
 
141 aa  57.4  0.00000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0925593 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1237  acetoin utilization protein AcuB, putative  31.25 
 
 
143 aa  57.4  0.00000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2675  CBS:HPP  30.4 
 
 
379 aa  57.4  0.00000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0535  CBS domain-containing protein  26.25 
 
 
256 aa  57.4  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.483194 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1085  putative signal transduction protein with CBS domains  29.84 
 
 
300 aa  57  0.0000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.971141  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1429  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  29.27 
 
 
321 aa  56.6  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2115  signal transduction protein  29.84 
 
 
300 aa  57  0.0000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.548765 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1475  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  29.27 
 
 
321 aa  56.6  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1120  CBS domain-containing protein  32.85 
 
 
143 aa  56.2  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1147  CBS domain containing membrane protein  32.68 
 
 
404 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1843  CBS domain-containing protein  30.08 
 
 
181 aa  56.2  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2437  signal transduction protein  32.8 
 
 
166 aa  55.5  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.188385 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0552  putative signal transduction protein with CBS domains  26.87 
 
 
250 aa  55.1  0.0000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.168262  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2950  signal transduction protein  34.75 
 
 
141 aa  55.1  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.211508 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0920  CBS domain-containing protein  45.71 
 
 
149 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1330  signal transduction protein  34.92 
 
 
146 aa  54.3  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2529  CBS domain containing protein  34.92 
 
 
146 aa  54.3  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.48063  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2625  CBS domain containing protein  34.92 
 
 
146 aa  54.3  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0949  CBS domain-containing protein  35.43 
 
 
132 aa  53.9  0.0000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.125704  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0798  homoserine O-acetyltransferase  26.61 
 
 
488 aa  53.9  0.0000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2848  CBS domain containing membrane protein  27.97 
 
 
223 aa  53.9  0.0000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2015  CBS domain containing membrane protein  33.59 
 
 
368 aa  53.9  0.0000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00292892  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0019  hypothetical protein  32 
 
 
503 aa  53.9  0.0000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5583  CBS domain-containing protein  31.47 
 
 
392 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.849861  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3522  CBS domain-containing protein  32.62 
 
 
134 aa  53.1  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0164  CBS domain-containing protein  21.74 
 
 
139 aa  53.1  0.000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00289218  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0211  CBS domain-containing protein  30.92 
 
 
401 aa  53.5  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3313  CBS domain-containing protein  25.95 
 
 
141 aa  53.1  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0640  CBS domain-containing protein  25.95 
 
 
141 aa  53.1  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2268  signal transduction protein  29.08 
 
 
152 aa  53.5  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.220391  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3483  CBS domain-containing protein  25.95 
 
 
141 aa  53.1  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0178  CBS domain-containing protein  31.62 
 
 
145 aa  53.5  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0839  CBS domain containing membrane protein  27.74 
 
 
388 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0058  CBS domain containing membrane protein  29.77 
 
 
140 aa  52.8  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1119  signal transduction protein  31.71 
 
 
295 aa  52.8  0.000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.700202 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2494  CBS domain-containing protein  32.93 
 
 
427 aa  52.4  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00627763  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2240  signal transduction protein  28.48 
 
 
153 aa  52.4  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0305  signal-transduction protein  30.87 
 
 
185 aa  53.1  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0743786  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2695  putative signal transduction protein with CBS and DRTGG domains  27.34 
 
 
438 aa  52.4  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51100  HPP domain and CBS domain pair-containing protein  32.61 
 
 
374 aa  51.6  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.299574  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1632  CBS domain-containing protein  30.77 
 
 
211 aa  52  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4051  signal-transduction protein  30.56 
 
 
242 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0317  CBS domain-containing protein  32.62 
 
 
394 aa  51.2  0.000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1533  CBS domain containing membrane protein  25.36 
 
 
223 aa  51.2  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.279871  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0304  signal transduction protein  31.82 
 
 
261 aa  51.2  0.000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.123702  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0413  putative signal transduction protein with CBS domains  29.58 
 
 
142 aa  50.8  0.000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0401079 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0937  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 
232 aa  50.8  0.000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.447969  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2859  signal transduction protein  29.46 
 
 
143 aa  50.8  0.000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.206571  hitchhiker  0.00464967 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0937  putative signal transduction protein with CBS domains  28 
 
 
214 aa  50.8  0.000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000079186  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0707  CBS domain containing membrane protein  27.61 
 
 
221 aa  50.4  0.000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0628  signal transduction protein  29.37 
 
 
307 aa  50.8  0.000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0774  CBS  33.33 
 
 
157 aa  50.4  0.000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2906  signal transduction protein  31.34 
 
 
291 aa  50.4  0.000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0768  CBS domain containing membrane protein  27.07 
 
 
138 aa  50.4  0.000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.838909  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2229  CBS domain-containing protein  28.17 
 
 
313 aa  50.1  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5919  signal-transduction protein  43.33 
 
 
162 aa  50.1  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.512609  normal  0.346148 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0615  protein of unknown function DUF190  25.52 
 
 
426 aa  50.1  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0898  CBS domain-containing protein  23.62 
 
 
266 aa  50.1  0.00001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0381  CBS domain-containing protein  30 
 
 
688 aa  50.1  0.00001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0243844 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0673  signal-transduction protein  24.64 
 
 
165 aa  50.1  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0019  CBS domain-containing protein  29.08 
 
 
410 aa  50.1  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1762  CBS domain-containing protein  24.82 
 
 
258 aa  50.1  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0911451  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0537  glycine betaine/L-proline transport, ATP-binding protein  27.87 
 
 
378 aa  49.7  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.418471  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2202  CBS domain-containing protein  26.53 
 
 
152 aa  50.1  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000112787  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0650  CBS domain-containing protein  25.69 
 
 
141 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4877  putative acetoin utilization protein AcuB  18.44 
 
 
141 aa  49.3  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.492044  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0031  CBS domain containing membrane protein  31.62 
 
 
382 aa  49.7  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.668358 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0847  signal transduction protein  32.52 
 
 
287 aa  49.7  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.766257  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3588  CBS domain containing membrane protein  25.69 
 
 
141 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2548  HPP family protein?  33.33 
 
 
391 aa  49.3  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.709048 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1299  CBS domain-containing protein  20.42 
 
 
264 aa  49.3  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1395  CBS domain-containing protein  23.31 
 
 
137 aa  49.7  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2342  CBS domain-containing protein  34.81 
 
 
145 aa  48.5  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3778  CBS domain-containing protein  25.69 
 
 
141 aa  48.9  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1796  CBS domain-containing protein  27.66 
 
 
315 aa  48.9  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.507937  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2520  putative signal transduction protein with CBS domains  31.16 
 
 
143 aa  48.9  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0521  glycine betaine/carnitine/choline transport ATP-binding protein  25.41 
 
 
378 aa  48.5  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.691197  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3655  CBS domain-containing protein  25.69 
 
 
141 aa  48.9  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1908  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  30.63 
 
 
401 aa  48.5  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1879  CBS  30.77 
 
 
157 aa  48.5  0.00004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0765  CBS  23.7 
 
 
224 aa  48.1  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>