121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2681 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_2681  putative transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 
95 aa  190  6e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.82034 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1299  AsnC family transcriptional regulator  77.89 
 
 
95 aa  154  5.0000000000000005e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.882741 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3066  transcriptional regulator, AsnC family  68.82 
 
 
94 aa  134  6.0000000000000005e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0051918  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0967  AsnC family transcriptional regulator  66.67 
 
 
95 aa  133  8e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.201819 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1025  AsnC family transcriptional regulator  68.13 
 
 
91 aa  130  7.999999999999999e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.190582  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3139  transcriptional regulator, AsnC family  67.03 
 
 
91 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3337  transcriptional regulator, AsnC family  65.26 
 
 
95 aa  127  4.0000000000000003e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3129  AsnC family transcriptional regulator  64.84 
 
 
92 aa  125  3e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6098  transcriptional regulator, AsnC family  64.84 
 
 
92 aa  122  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0740219 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3522  AsnC family transcriptional regulator  61.05 
 
 
95 aa  120  5e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.527103  hitchhiker  0.0052934 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3290  AsnC/Lrp family regulatory protein  58.95 
 
 
95 aa  120  7e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.717659 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2072  transcriptional regulator, AsnC family  61.54 
 
 
93 aa  117  4.9999999999999996e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1895  transcriptional regulator, AsnC family  60.22 
 
 
93 aa  117  7e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0969365  decreased coverage  0.000000883258 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1944  transcriptional regulator, AsnC family  58.06 
 
 
93 aa  116  9e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000102103 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10710  transcriptional regulator, AsnC family  61.54 
 
 
94 aa  115  1.9999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.500225 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4124  transcriptional regulator, AsnC family  60.64 
 
 
94 aa  114  3.9999999999999997e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1377  transcriptional regulator, AsnC family  60.44 
 
 
93 aa  114  5e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3248  putative transcriptional regulator, AsnC family  57.14 
 
 
92 aa  111  4.0000000000000004e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.537577  normal  0.0672811 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2207  AsnC family transcriptional regulator  52.69 
 
 
93 aa  109  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00384601  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2687  transcriptional regulator, AsnC family  57.78 
 
 
91 aa  109  1.0000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.948592  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0029  AsnC family transcriptional regulator  52.69 
 
 
94 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2005  transcriptional regulator, AsnC family  60.44 
 
 
93 aa  108  3e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.174457  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3052  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  55.56 
 
 
92 aa  107  8.000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14210  transcriptional regulator, AsnC family  58.24 
 
 
93 aa  106  1e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.325136  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16160  transcriptional regulator, AsnC family  58.24 
 
 
93 aa  103  8e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0330214  normal  0.554236 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1443  transcriptional regulator, AsnC family  56.04 
 
 
93 aa  103  1e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.228364  normal  0.156541 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2286  AsnC family transcriptional regulator  48.94 
 
 
97 aa  102  2e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15740  transcriptional regulator, AsnC family  57.14 
 
 
93 aa  101  3e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.229331  normal  0.978576 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3945  AsnC family transcriptional regulator  47.83 
 
 
92 aa  100  5e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.292927 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12100  transcriptional regulator, AsnC family  51.65 
 
 
93 aa  100  9e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0479216  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3244  transcriptional regulator, AsnC family  61.54 
 
 
93 aa  100  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0032026  hitchhiker  0.0000772239 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2704  transcriptional regulator, AsnC family  51.65 
 
 
92 aa  98.6  3e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1107  AsnC family transcriptional regulator  45.65 
 
 
92 aa  96.3  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.394074  normal  0.101145 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1686  transcriptional regulator, AsnC family  45.56 
 
 
95 aa  92  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.253834  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1458  transcriptional regulator, AsnC family  43.96 
 
 
92 aa  91.7  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3195  AsnC family transcriptional regulator  42.86 
 
 
92 aa  89.7  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0002664  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0222  AsnC family transcriptional regulator  41.76 
 
 
91 aa  89  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5226  transcriptional regulator, AsnC family  42.22 
 
 
91 aa  87.8  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1507  AsnC family transcriptional regulator  42.22 
 
 
94 aa  84  6e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0935679 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0884  AsnC family transcriptional regulator  41.11 
 
 
91 aa  81.3  0.000000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.218469  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0784  AsnC family transcriptional regulator  46.84 
 
 
82 aa  78.2  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.268379 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0739  AsnC family transcriptional regulator  43.04 
 
 
82 aa  71.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0383278  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0776  transcriptional regulator, AsnC family  43.04 
 
 
82 aa  71.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.221352  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0776  transcriptional regulator, AsnC family  43.04 
 
 
82 aa  71.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0061  AsnC family transcriptional regulator  34.83 
 
 
90 aa  67.4  0.00000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.492726 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0646  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 
121 aa  61.6  0.000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3613  AsnC family transcriptional regulator  36.49 
 
 
162 aa  53.1  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.656319  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3705  AsnC family transcriptional regulator  36.49 
 
 
162 aa  53.1  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0688  AsnC family transcriptional regulator  38.16 
 
 
155 aa  52.4  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000313702  unclonable  0.000000226618 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0018  AsnC family transcriptional regulator  40.68 
 
 
170 aa  51.2  0.000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.443064  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2838  AsnC family transcriptional regulator  30.77 
 
 
162 aa  50.4  0.000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00258755 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1164  AsnC family transcriptional regulator  36.84 
 
 
77 aa  49.7  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000232378 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4041  transcriptional regulator, AsnC family  35.21 
 
 
77 aa  49.3  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0794181  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2790  AsnC family transcriptional regulator  36.62 
 
 
77 aa  49.7  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.258633  normal  0.188192 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1770  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 
161 aa  49.3  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000758756  normal  0.619113 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0642  AsnC family transcriptional regulator  33.8 
 
 
79 aa  48.5  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2110  transcriptional regulator, AsnC family  33.8 
 
 
77 aa  48.5  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.311997 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1128  AsnC family transcriptional regulator  32.39 
 
 
77 aa  47.4  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.27533 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1981  AsnC family transcriptional regulator  32.05 
 
 
78 aa  47  0.00009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.254256 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3788  transcriptional regulator, AsnC family  29.49 
 
 
78 aa  46.2  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3611  AsnC family transcriptional regulator  32.39 
 
 
77 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0162  AsnC family transcriptional regulator  35.9 
 
 
142 aa  45.8  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1274  AsnC/Lrp family regulatory protein  34.21 
 
 
77 aa  46.2  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.228348  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4117  transcriptional regulator, AsnC family  28.21 
 
 
78 aa  45.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1277  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 
76 aa  45.8  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0938724  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0159  transcriptional regulator, AsnC family  32.14 
 
 
153 aa  45.4  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.288383  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1081  transcriptional regulator  30.77 
 
 
81 aa  45.1  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.276105 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0958  AsnC family transcriptional regulator  30.77 
 
 
78 aa  45.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2618  AsnC family transcriptional regulator  30.77 
 
 
78 aa  45.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.484016  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5930  AsnC family transcriptional regulator  30.77 
 
 
79 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.681612  normal  0.0101093 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3444  transcriptional regulator, AsnC family  35.21 
 
 
77 aa  45.4  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.838195  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1135  transcriptional regulator, AsnC family  38.1 
 
 
142 aa  44.7  0.0004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.118615  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4494  transcriptional regulator, AsnC family  30.77 
 
 
81 aa  45.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.860054  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2862  transcriptional regulator, AsnC family  30.95 
 
 
166 aa  44.7  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3008  transcriptional regulator, AsnC family  32.14 
 
 
178 aa  44.7  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3011  AsnC family transcriptional regulator  29.49 
 
 
78 aa  44.7  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.1526  normal  0.546304 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0203  transcriptional regulator, AsnC family  33.8 
 
 
77 aa  44.7  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1587  AsnC family transcriptional regulator  24.05 
 
 
124 aa  44.3  0.0006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1309  AsnC family transcriptional regulator  29.49 
 
 
81 aa  43.9  0.0007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1082  AsnC family transcriptional regulator  30.56 
 
 
76 aa  43.9  0.0007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6009  transcriptional regulator Lrp family  30.77 
 
 
78 aa  43.9  0.0008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0103  transcriptional regulator, putative  26.92 
 
 
78 aa  43.5  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.196316  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3463  AsnC family transcriptional regulator  32.91 
 
 
95 aa  43.1  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0632  transcriptional regulator, AsnC family  32 
 
 
76 aa  43.5  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0100  putative transcriptional regulator  26.92 
 
 
100 aa  43.5  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0186  AsnC family transcriptional regulator  36.51 
 
 
162 aa  43.1  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000683645  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2826  transcriptional regulator, AsnC family  31.71 
 
 
148 aa  43.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1442  AsnC family transcriptional regulator  28.21 
 
 
81 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.572218  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1585  AsnC family transcriptional regulator  31.43 
 
 
82 aa  42.7  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0255561 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1185  AsnC family transcriptional regulator  29.87 
 
 
81 aa  42.4  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0166  AsnC family transcriptional regulator  36.51 
 
 
141 aa  42.4  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000165238  normal  0.103345 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0115  AsnC family transcriptional regulator  25.64 
 
 
78 aa  42.7  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.175282  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4452  AsnC family transcriptional regulator  29.49 
 
 
86 aa  42.4  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.683872  normal  0.325432 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0212  AsnC family transcriptional regulator  32.39 
 
 
78 aa  42.7  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0149  AsnC family transcriptional regulator  24.71 
 
 
160 aa  42.4  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0710  AsnC/Lrp family regulatory protein  28.77 
 
 
77 aa  42.4  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1935  transcriptional regulator, AsnC family  34.67 
 
 
78 aa  42.7  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.2155  normal  0.401562 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0663  transcriptional regulator, AsnC family  29.87 
 
 
153 aa  42.4  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2259  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 
76 aa  42  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1446  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 
142 aa  41.6  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>