More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_0403 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_0403  peptidase M23B  100 
 
 		 170 aa  343  8e-94  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00242182  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0300  peptidase M23B  86.47 
 
 		 170 aa  281  3.0000000000000004e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0390881  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0293  peptidase M23B  86.47 
 
 		 170 aa  280  6.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000339642  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0305  Peptidase M23  86.47 
 
 		 170 aa  280  7.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0170038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0301  peptidase M23B  86.47 
 
 		 170 aa  279  1e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.11703  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4420  M24/M37 family peptidase  76.47 
 
 		 170 aa  277  4e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0288  peptidase M23B  74.12 
 
 		 170 aa  271  2.0000000000000002e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000254683  hitchhiker  0.00000000102715 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3731  peptidase M23B  72.94 
 
 		 170 aa  272  2.0000000000000002e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0375329  unclonable  0.0000231943 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0288  peptidase M23B  72.94 
 
 		 170 aa  269  1e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00195161  decreased coverage  0.00000000176689 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73200  hypothetical protein  56.96 
 
 		 169 aa  189  2e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0435  Peptidase M23  51.25 
 
 		 178 aa  182  2.0000000000000003e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3990  peptidase M23B  47.85 
 
 		 181 aa  166  2e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2227  peptidase M23B  41.58 
 
 		 172 aa  80.5  0.00000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0489  peptidase M23B  40 
 
 		 194 aa  77.4  0.00000000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00171109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2214  peptidase M23B  42 
 
 		 198 aa  73.9  0.0000000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.250038 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01485  peptidase  42.98 
 
 		 377 aa  73.2  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.3705  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01987  peptidase  43.75 
 
 		 204 aa  72  0.000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.517846  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3409  Peptidase M23  40 
 
 		 183 aa  71.2  0.000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.703965 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1921  metallopeptidase peptidase  41 
 
 		 196 aa  70.9  0.000000000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00318807 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6353  hypothetical protein  51.67 
 
 		 169 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4508  Peptidase M23  37.93 
 
 		 392 aa  62.8  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.487012 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3804  peptidase M23B  36.89 
 
 		 199 aa  61.2  0.000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.019155 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0146  Peptidase M23  33.33 
 
 		 230 aa  61.2  0.000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.518136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6234  Peptidase M23  36.28 
 
 		 446 aa  60.1  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3617  Peptidase M23  34.78 
 
 		 322 aa  57.8  0.00000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2044  Peptidase M23  36.78 
 
 		 272 aa  57.4  0.00000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1342  peptidase M23B  31.67 
 
 		 296 aa  57.4  0.00000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.339231 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0097  peptidase M23B  34.45 
 
 		 291 aa  56.6  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3584  peptidase M23B  32.65 
 
 		 174 aa  56.6  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2472  peptidase M23B  30.25 
 
 		 446 aa  56.2  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000997494  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3071  peptidase M23B  39.08 
 
 		 374 aa  56.2  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000167566  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2924  Peptidase M23  34.74 
 
 		 314 aa  55.8  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3453  peptidase M23B  38.64 
 
 		 271 aa  54.3  0.0000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0287  Peptidase M23  33.33 
 
 		 297 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1995  peptidase M23B  30.89 
 
 		 309 aa  53.1  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2447  M23/M37 familypeptidase  37.36 
 
 		 499 aa  52.8  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.372819  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3491  peptidase M23B  33.04 
 
 		 280 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.172269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3011  Peptidase M23  34.69 
 
 		 223 aa  52  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0127254 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2717  Peptidase M23  31.01 
 
 		 272 aa  52.4  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000153286  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0778  peptidase M23B  30.4 
 
 		 305 aa  52.4  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.484929  normal  0.385643 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1684  peptidase M23B  32.95 
 
 		 277 aa  52.4  0.000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2119  Peptidase M23  33.33 
 
 		 323 aa  52  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2941  peptidase M23B  36.84 
 
 		 454 aa  52  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.324447 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3564  Peptidase M23  35.23 
 
 		 290 aa  52  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0822552  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0789  NlpD  32.12 
 
 		 295 aa  52  0.000004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.278455  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4526  peptidase M23B  32.98 
 
 		 299 aa  52  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000111133  unclonable  0.0000000250462 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2484  peptidase M23B  27.34 
 
 		 313 aa  52  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0539  Peptidase M23  36.36 
 
 		 308 aa  51.6  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1868  peptidase M23B  34.78 
 
 		 460 aa  51.6  0.000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0785648  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1347  peptidase M23B  32.63 
 
 		 243 aa  51.2  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0523113  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4779  peptidase M23B  34.69 
 
 		 289 aa  51.2  0.000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.155717 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0417  peptidase M23B  34.04 
 
 		 299 aa  51.2  0.000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000018485  hitchhiker  0.000198891 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0286  peptidase M23B  34.31 
 
 		 374 aa  51.2  0.000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0494  peptidase M23B  29.79 
 
 		 299 aa  50.8  0.000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000148053  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4988  peptidase M23B  37.89 
 
 		 457 aa  50.8  0.000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.333903  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3172  peptidase M23B  37.89 
 
 		 457 aa  50.8  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.054891 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4182  peptidase M23  29.69 
 
 		 306 aa  50.8  0.000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1026  M24/M37 family peptidase  28.57 
 
 		 275 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.748867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1024  peptidase M23B  28.57 
 
 		 275 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1864  Peptidase M23  32.76 
 
 		 293 aa  50.1  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.475918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3446  peptidase M23B  30.85 
 
 		 299 aa  50.8  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000175079  unclonable  0.00000226335 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0243  M24/M37 family peptidase  30.43 
 
 		 300 aa  50.4  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0734  peptidase M23B  30.4 
 
 		 305 aa  50.4  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.258531  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0953  Peptidase M23  31.37 
 
 		 336 aa  50.1  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1900  M24/M37 family peptidase  36.26 
 
 		 471 aa  49.7  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0520216  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2410  peptidoglycan-binding LysM  31.68 
 
 		 295 aa  49.7  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000688679  unclonable  0.000000112748 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0771  Peptidase M23  29.6 
 
 		 305 aa  49.7  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0771  Peptidase M23  29.6 
 
 		 305 aa  49.7  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00995  hypothetical protein  26.77 
 
 		 333 aa  49.7  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1066  peptidase M23B  28.57 
 
 		 275 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0830638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1887  M24/M37 family peptidase  36.26 
 
 		 472 aa  49.7  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0768301  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0616  peptidase M23B  31.67 
 
 		 319 aa  50.1  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00137898  hitchhiker  0.00000225062 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2565  metalloendopeptidase-like membrane protein  35.87 
 
 		 304 aa  49.3  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.966222  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15100  hypothetical protein  31.25 
 
 		 282 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.132292  hitchhiker  0.000839665 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0305  peptidase M23  35.23 
 
 		 294 aa  49.7  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0127827  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2406  Peptidase M23  38.46 
 
 		 517 aa  50.1  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.00000297595  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0361  peptidase M23B  32.98 
 
 		 299 aa  50.1  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000166445  unclonable  0.00000779697 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0321  metallopeptidase  36.26 
 
 		 509 aa  48.9  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.255107  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4212  M24/M37 family peptidase  29.79 
 
 		 299 aa  49.3  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3052  Peptidase M23  34 
 
 		 329 aa  49.3  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1258  peptidase M23B  30.09 
 
 		 274 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4198  peptidase M23B  27.68 
 
 		 275 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.663221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2055  peptidase  36.26 
 
 		 512 aa  49.3  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.485622  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4673  Peptidase M23  38.82 
 
 		 446 aa  48.9  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0273  peptidase M23  31.3 
 
 		 285 aa  48.9  0.00003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02339  M23 peptidase domain protein  31.71 
 
 		 238 aa  48.9  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.213861  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0246  peptidase M23B  37.36 
 
 		 377 aa  49.3  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1328  hypothetical protein  30.36 
 
 		 282 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3563  peptidase M23B  29.79 
 
 		 299 aa  48.9  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000153251  hitchhiker  0.0000000453788 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0393  peptidase M23B  29.79 
 
 		 299 aa  48.9  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000111959  unclonable  0.0000262337 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2270  Peptidase M23  31.3 
 
 		 727 aa  49.3  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000539525  unclonable  0.00000000807187 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2207  Peptidase M23  31.3 
 
 		 727 aa  48.9  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3736  peptidase M23B  29.79 
 
 		 299 aa  48.9  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000766225  hitchhiker  0.000000231142 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1665  peptidase  36.26 
 
 		 470 aa  49.3  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.175912  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4455  M23/M37 peptidase domain-containing protein  29.79 
 
 		 298 aa  48.5  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0236  Peptidase M23  35.79 
 
 		 285 aa  48.9  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.668099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2324  metalloendopeptidase-like membrane protein  31.82 
 
 		 321 aa  48.5  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.37146e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2288  peptidase M23B  33.33 
 
 		 141 aa  48.5  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.509215  hitchhiker  0.000223736 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4308  peptidase M23B  36.84 
 
 		 457 aa  48.5  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000552586  decreased coverage  0.0000000100746 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0362  peptidase M23B  29.79 
 
 		 299 aa  48.5  0.00005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000004833  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>