198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_0743 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_0743  dienelactone hydrolase  100 
 
 
245 aa  513  1e-144  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.774494  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0826  dienelactone hydrolase  82.45 
 
 
245 aa  438  9.999999999999999e-123  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.390994 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0924  dienelactone hydrolase  80 
 
 
245 aa  427  1e-119  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0519  dienelactone hydrolase  80.82 
 
 
245 aa  421  1e-117  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3507  dienelactone hydrolase  76.73 
 
 
245 aa  407  1e-113  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0806  dienelactone hydrolase  76.73 
 
 
245 aa  407  1e-113  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.248795 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0857  dienelactone hydrolase  76.73 
 
 
245 aa  407  1e-113  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3630  dienelactone hydrolase  76.73 
 
 
245 aa  407  1e-113  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3217  dienelactone hydrolase  75.92 
 
 
245 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.445635 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3320  dienelactone hydrolase  76.33 
 
 
245 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3435  dienelactone hydrolase  77.05 
 
 
245 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0903  dienelactone hydrolase  77.05 
 
 
245 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.833449  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0788  dienelactone hydrolase  77.14 
 
 
245 aa  403  1e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.237009  normal  0.0587871 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3046  dienelactone hydrolase  72.24 
 
 
245 aa  373  1e-102  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.715018  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2467  dienelactone hydrolase  68.03 
 
 
247 aa  360  1e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4005  carboxymethylenebutenolidase family protein  67.62 
 
 
245 aa  354  7.999999999999999e-97  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1544  threonyl-tRNA synthetase, class IIA  65.16 
 
 
245 aa  348  3e-95  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1546  dienelactone hydrolase  65.57 
 
 
245 aa  346  2e-94  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.770426  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0613  dienelactone hydrolase  67.21 
 
 
244 aa  346  2e-94  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.679739 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0967  dienelactone hydrolase family protein  81.87 
 
 
172 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2602  carboxymethylenebutenolidase  53.28 
 
 
244 aa  286  2e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3109  Carboxymethylenebutenolidase  50.42 
 
 
248 aa  249  3e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0092  carboxymethylenebutenolidase  40.24 
 
 
248 aa  206  3e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0019242 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_78962  carboxymethylenebutenolidase  39.92 
 
 
269 aa  199  3e-50  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0108419 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1279  Carboxymethylenebutenolidase  41.06 
 
 
245 aa  193  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10652  dienelactone hydrolase family protein (AFU_orthologue; AFUA_1G07130)  40.66 
 
 
289 aa  191  1e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06410  carboxymethylenebutenolidase, putative  40.62 
 
 
275 aa  191  1e-47  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3192  Carboxymethylenebutenolidase  40.71 
 
 
246 aa  183  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2927  dienelactone hydrolase  41.15 
 
 
246 aa  183  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0392  carboxymethylenebutenolidase  37.25 
 
 
250 aa  177  2e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0533  dienelactone hydrolase  36.18 
 
 
246 aa  172  5e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0964  hypothetical protein  70.59 
 
 
68 aa  105  9e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3405  Carboxymethylenebutenolidase  29.96 
 
 
246 aa  93.6  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3733  dienelactone hydrolase  28.45 
 
 
248 aa  86.7  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000974999  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4152  dienelactone hydrolase  28.1 
 
 
251 aa  85.9  5e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000773807  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0089  carboxymethylenebutenolidase  25.93 
 
 
244 aa  83.6  0.000000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1212  Carboxymethylenebutenolidase  28.21 
 
 
248 aa  82  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7177  carboxymethylenebutenolidase  28.15 
 
 
415 aa  82  0.000000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.103513 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0431  dienelactone hydrolase  26.29 
 
 
247 aa  80.9  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.850934 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6013  carboxymethylenebutenolidase  27.87 
 
 
409 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0420  Carboxymethylenebutenolidase  26.36 
 
 
247 aa  78.2  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7069  carboxymethylenebutenolidase  27.6 
 
 
408 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.599928  normal  0.137084 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1266  carboxymethylenebutenolidase  27.57 
 
 
231 aa  77  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5380  Carboxymethylenebutenolidase  26.25 
 
 
420 aa  76.6  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.204007  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2503  carboxymethylenebutenolidase  24.9 
 
 
245 aa  75.9  0.0000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29420  hypothetical protein  27.87 
 
 
413 aa  75.1  0.0000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3180  carboxymethylenebutenolidase  26.89 
 
 
433 aa  75.1  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000051009  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6309  carboxymethylenebutenolidase  27.46 
 
 
409 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.301282  normal  0.405511 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7175  putative carboxymethylenebutenolidase (dienelactone hydrolase)(DLH)  26.05 
 
 
410 aa  73.9  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.887651  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3321  dienelactone hydrolase  26.38 
 
 
409 aa  72  0.000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3956  hypothetical protein  26.64 
 
 
413 aa  72  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6359  carboxymethylenebutenolidase  26.18 
 
 
415 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0274  carboxymethylenebutenolidase  24.14 
 
 
407 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7160  Carboxymethylenebutenolidase  26.27 
 
 
407 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.115938  normal  0.549117 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5485  carboxymethylenebutenolidase  26.18 
 
 
415 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.463594  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6771  carboxymethylenebutenolidase  26.18 
 
 
415 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0190  carboxymethylenebutenolidase  32.45 
 
 
230 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2055  dienelactone hydrolase  23.77 
 
 
251 aa  67.4  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.731615  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1576  dienelactone hydrolase  23.74 
 
 
247 aa  67.4  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4124  dienelactone hydrolase  26.23 
 
 
248 aa  66.6  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.232733  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0203  carboxymethylenebutenolidase  31.79 
 
 
230 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.19899  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0373  carboxymethylenebutenolidase  27.51 
 
 
230 aa  65.9  0.0000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2697  carboxymethylenebutenolidase  30.57 
 
 
236 aa  65.5  0.0000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0084  carboxymethylenebutenolidase  28.43 
 
 
275 aa  65.5  0.0000000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0258  carboxymethylenebutenolidase  31.79 
 
 
230 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5021  carboxymethylenebutenolidase  25.93 
 
 
235 aa  64.7  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.0018188  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2831  carboxymethylenebutenolidase  31.79 
 
 
230 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0276  carboxymethylenebutenolidase  31.79 
 
 
230 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0391  Carboxymethylenebutenolidase  26.46 
 
 
232 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1487  Carboxymethylenebutenolidase  26.27 
 
 
295 aa  62.4  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.108387  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3379  carboxymethylenebutenolidase  31.13 
 
 
230 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0184  carboxymethylenebutenolidase  28.73 
 
 
230 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.604168  hitchhiker  0.00492976 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0468  Carboxymethylenebutenolidase  26.6 
 
 
234 aa  60.5  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4562  Carboxymethylenebutenolidase  24.79 
 
 
297 aa  60.8  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.546274  normal  0.125824 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4136  carboxymethylenebutenolidase  24.79 
 
 
324 aa  61.2  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2600  Carboxymethylenebutenolidase  25.12 
 
 
264 aa  59.7  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9126  Carboxymethylenebutenolidase  23.95 
 
 
232 aa  58.9  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.970272  normal  0.684027 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0243  carboxymethylenebutenolidase  22.73 
 
 
278 aa  58.5  0.00000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.110111 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3354  Carboxymethylenebutenolidase  24.28 
 
 
295 aa  58.2  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000150508  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4330  carboxymethylenebutenolidase  25.89 
 
 
232 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5771  carboxymethylenebutenolidase  26.78 
 
 
248 aa  57.4  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5412  Carboxymethylenebutenolidase  23.74 
 
 
233 aa  57  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3130  Carboxymethylenebutenolidase  26.16 
 
 
296 aa  56.2  0.0000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37970  Dienelactone hydrolase-like protein  26.58 
 
 
295 aa  56.6  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1793  carboxymethylenebutenolidase  25.11 
 
 
411 aa  56.2  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.383832 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3951  carboxymethylenebutenolidase  24.4 
 
 
290 aa  55.8  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0265  dienelactone hydrolase family protein  24.4 
 
 
290 aa  55.8  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3647  dienelactone hydrolase family protein  24.12 
 
 
290 aa  55.8  0.0000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4137  carboxymethylenebutenolidase  24.49 
 
 
298 aa  55.8  0.0000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.597321  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2950  Carboxymethylenebutenolidase  24.04 
 
 
295 aa  55.8  0.0000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2851  carboxymethylenebutenolidase  27.32 
 
 
232 aa  55.5  0.0000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0128923 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1987  twin-arginine translocation pathway signal  24.18 
 
 
291 aa  55.1  0.0000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0139  carboxymethylenebutenolidase  27.92 
 
 
232 aa  54.7  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3645  carboxymethylenebutenolidase (dienelactone) hydrolase (DLH)  32.89 
 
 
236 aa  54.7  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3963  carboxymethylenebutenolidase  24.9 
 
 
268 aa  54.7  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.141261 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4149  Carboxymethylenebutenolidase  25.51 
 
 
271 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4175  dienelactone hydrolase  24 
 
 
291 aa  53.9  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4294  dienelactone hydrolase  24 
 
 
291 aa  53.9  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4198  dienelactone hydrolase  24 
 
 
291 aa  53.9  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3409  carboxymethylenebutenolidase  22.53 
 
 
295 aa  54.3  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>