More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_6212 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_6212  transcriptional regulator, DeoR family  100 
 
 		 261 aa  523  1e-147  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.464717  normal  0.761019 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0289  DeoR family transcriptional regulator  70.5 
 
 		 261 aa  352  4e-96  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.228369 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0248  DeoR family transcriptional regulator  69.73 
 
 		 261 aa  350  1e-95  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.974288  normal  0.128196 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1167  transcriptional regulator, DeoR family  62.07 
 
 		 256 aa  330  2e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0893  transcriptional regulator, DeoR family  57.47 
 
 		 261 aa  312  2.9999999999999996e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151374  normal  0.226851 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2362  transcriptional regulator, DeoR family  52.87 
 
 		 261 aa  255  4e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.12916  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16690  transcriptional regulator, DeoR family  55.77 
 
 		 261 aa  244  9.999999999999999e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2162  transcriptional regulator, DeoR family  48.26 
 
 		 261 aa  229  2e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1357  transcriptional regulator, DeoR family  45.98 
 
 		 263 aa  228  1e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000403585 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01920  transcriptional regulator of sugar metabolism  46.34 
 
 		 261 aa  228  1e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5910  transcriptional regulator, DeoR family  46.33 
 
 		 254 aa  210  2e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.874866 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5798  transcriptional regulator, DeoR family  45.35 
 
 		 252 aa  199  3.9999999999999996e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.159529 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24390  transcriptional regulator of sugar metabolism  38.85 
 
 		 284 aa  189  4e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0280165  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4698  transcriptional regulator, DeoR family  43.46 
 
 		 258 aa  185  5e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00604276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2435  transcriptional regulator, DeoR family  41.15 
 
 		 253 aa  166  4e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0079946  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3908  DeoR family transcriptional regulator  39.61 
 
 		 267 aa  156  3e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00814425  normal  0.0123745 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2536  DeoR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 261 aa  156  4e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2603  DeoR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 261 aa  156  4e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.252662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1193  GlpR family transcriptional regulator  33.46 
 
 		 260 aa  156  4e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.604361 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0656  DeoR family transcriptional regulator  36.02 
 
 		 284 aa  154  1e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.936277  normal  0.637392 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2702  DeoR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 261 aa  154  1e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0608  GntR family transcriptional regulator  37.6 
 
 		 254 aa  151  1e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0568  regulatory protein DeoR  31.89 
 
 		 254 aa  149  4e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.250668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3849  DeoR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 257 aa  148  9e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.697136 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0146  transcriptional regulator, DeoR family  32.94 
 
 		 250 aa  147  1.0000000000000001e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000230525  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2807  DeoR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 260 aa  147  1.0000000000000001e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.807975  normal  0.355136 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2577  DeoR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 256 aa  146  4.0000000000000006e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0659  DeoR family transcriptional regulator  32.55 
 
 		 288 aa  144  1e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0255217  normal  0.62024 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2390  transcriptional regulator, DeoR family  36.61 
 
 		 258 aa  144  1e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.248992  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3053  transcriptional regulator, DeoR family  35.56 
 
 		 257 aa  143  2e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.538096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0698  DeoR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 266 aa  143  2e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000315133  hitchhiker  0.0000015046 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2155  transcriptional regulator, DeoR family  34.63 
 
 		 278 aa  144  2e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3507  regulatory protein DeoR  31.91 
 
 		 254 aa  141  9e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5399  DeoR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 242 aa  141  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.054992  normal  0.41602 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2613  transcriptional regulator, DeoR family  35.27 
 
 		 257 aa  140  3e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000333133  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3128  transcriptional regulator, DeoR family  30.74 
 
 		 255 aa  139  6e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2392  transcriptional regulator, DeoR family  30.71 
 
 		 253 aa  136  3.0000000000000003e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4889  transcriptional regulator, DeoR family  37.39 
 
 		 264 aa  135  7.000000000000001e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.585335  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1880  transcriptional regulator, DeoR family  32.16 
 
 		 254 aa  134  9.999999999999999e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0890  transcriptional regulator, DeoR family  35.17 
 
 		 260 aa  134  9.999999999999999e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.390832  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0575  DeoR family transcriptional regulator  32.13 
 
 		 274 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000140104  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0478  DeoR family transcriptional regulator  34 
 
 		 254 aa  133  1.9999999999999998e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3818  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  33.2 
 
 		 258 aa  133  1.9999999999999998e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.892973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3377  DeoR-family regulatory protein  33.06 
 
 		 258 aa  133  3e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.365901 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0943  transcriptional repressor AgaR  33.06 
 
 		 258 aa  133  3e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0995  DeoR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 258 aa  133  3e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.775359  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0642  DeoR family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 256 aa  132  6.999999999999999e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000291189  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1034  DeoR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 268 aa  132  7.999999999999999e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.631262  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0408  transcriptional regulator, DeoR family  31.4 
 
 		 257 aa  131  9e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.237553  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2460  transcriptional regulator, DeoR family  35.47 
 
 		 264 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.18963  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3449  galactitol utilization operon repressor  29.96 
 
 		 257 aa  129  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6471  transcriptional regulator, DeoR family  34.84 
 
 		 257 aa  129  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.845321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1714  transcriptional regulator, DeoR family  33.47 
 
 		 256 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0085463  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5984  transcriptional regulator, DeoR family  34.43 
 
 		 257 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3617  galactitol utilization operon repressor  29.59 
 
 		 257 aa  129  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0720  DeoR family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 253 aa  129  7.000000000000001e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.528248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3451  galactitol utilization operon repressor  29.59 
 
 		 257 aa  128  8.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.717131  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3520  galactitol utilization operon repressor  29.59 
 
 		 257 aa  128  8.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1101  transcriptional regulator, DeoR family  33.33 
 
 		 257 aa  128  8.000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4896  transcriptional regulator, DeoR family  34.75 
 
 		 265 aa  128  8.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.302168  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3557  galactitol utilization operon repressor  29.59 
 
 		 257 aa  128  8.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0011  DeoR family transcriptional regulator  33.46 
 
 		 258 aa  128  9.000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000425621  unclonable  0.00000000668451 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4218  DeoR family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 284 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.271905 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2220  DeoR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 277 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0244246 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02996  DNA-binding transcriptional dual regulator  30.35 
 
 		 269 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0574  transcriptional regulator, DeoR family  30.35 
 
 		 269 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3428  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  30.35 
 
 		 269 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0729  transcriptional regulator, DeoR family  32.28 
 
 		 256 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000103564 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0569  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  30.35 
 
 		 269 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1716  transcriptional regulator, DeoR family  28.63 
 
 		 252 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.467325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3321  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  30.35 
 
 		 269 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02947  hypothetical protein  30.35 
 
 		 269 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4445  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  30.35 
 
 		 269 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0380  transcriptional regulator, DeoR family  31.85 
 
 		 254 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4070  DeoR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 266 aa  126  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3377  transcriptional regulator, DeoR family  31.67 
 
 		 257 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5129  transcriptional regulator, DeoR family  31.27 
 
 		 254 aa  125  5e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0092  transcriptional regulator DeoR family  33.19 
 
 		 256 aa  125  6e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0042  transcriptional regulator, DeoR family  32.28 
 
 		 252 aa  125  6e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3571  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  29.96 
 
 		 269 aa  125  6e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.557659 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0377  DeoR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 261 aa  125  9e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3457  DeoR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 265 aa  124  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0252866 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3309  transcriptional regulator, DeoR family  34.78 
 
 		 260 aa  123  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.006875  hitchhiker  0.00121126 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2177  transcriptional regulator, DeoR family  33.47 
 
 		 253 aa  124  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0975605  hitchhiker  0.00125188 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3191  transcriptional regulator, DeoR family  31.12 
 
 		 252 aa  123  4e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.932095  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2385  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  29.18 
 
 		 269 aa  122  5e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1360  DeoR family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 274 aa  122  5e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.019749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3611  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  29.57 
 
 		 269 aa  122  5e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14330  transcriptional regulator, DeoR family  35.66 
 
 		 282 aa  122  5e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0673  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  29.2 
 
 		 269 aa  122  8e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3057  regulatory protein, DeoR  31.12 
 
 		 278 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.111728  normal  0.668147 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0268  DeoR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 263 aa  121  9.999999999999999e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3957  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  31.25 
 
 		 257 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0623  DeoR family transcriptional regulator  31.89 
 
 		 294 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2071  DeoR family transcriptional regulator  31.23 
 
 		 254 aa  120  1.9999999999999998e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.128442  normal  0.332572 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2323  transcriptional regulator, DeoR family  31.91 
 
 		 266 aa  120  3e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2563  transcriptional regulator, DeoR family  33.59 
 
 		 254 aa  120  3e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.488958  normal  0.0207401 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2599  DeoR family transcriptional regulator  31.89 
 
 		 259 aa  120  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.509382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2727  DeoR family transcriptional regulator  31.89 
 
 		 290 aa  120  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.463345  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1079  DeoR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 251 aa  120  3e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>