More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5480 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_5480  50S ribosomal protein L21  100 
 
 		 104 aa  206  9e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0264938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3860  50S ribosomal protein L21  75 
 
 		 104 aa  154  4e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.494597  hitchhiker  0.00226444 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3481  50S ribosomal protein L21  75 
 
 		 104 aa  154  5.0000000000000005e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0592403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1503  50S ribosomal protein L21  73.79 
 
 		 103 aa  150  4e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0308225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12500  LSU ribosomal protein L21P  72 
 
 		 104 aa  149  1e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.621889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3946  50S ribosomal protein L21  72.73 
 
 		 107 aa  146  9e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.664531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1187  ribosomal protein L21  70.59 
 
 		 103 aa  146  1.0000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2635  50S ribosomal protein L21  71.72 
 
 		 107 aa  145  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.159083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2059  ribosomal protein L21  69.7 
 
 		 103 aa  145  2.0000000000000003e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12469  50S ribosomal protein L21  71 
 
 		 104 aa  142  2e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0103879  normal  0.999566 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1220  50S ribosomal protein L21  66.35 
 
 		 105 aa  139  9.999999999999999e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.61221 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3550  50S ribosomal protein L21  68.69 
 
 		 103 aa  138  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1473  ribosomal protein L21  67 
 
 		 103 aa  139  1.9999999999999998e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.447954  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3555  50S ribosomal protein L21  68.69 
 
 		 103 aa  138  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.786701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3623  50S ribosomal protein L21  68.69 
 
 		 103 aa  138  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5260  50S ribosomal protein L21  66.35 
 
 		 105 aa  137  3.9999999999999997e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15095  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1588  ribosomal protein L21  66.02 
 
 		 103 aa  135  2e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00538788  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2460  50S ribosomal protein L21  60.58 
 
 		 104 aa  128  3e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.179823 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2283  ribosomal protein L21  67 
 
 		 106 aa  120  9e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.293262  hitchhiker  0.000417137 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2260  ribosomal protein L21  62 
 
 		 102 aa  117  3.9999999999999996e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.486233  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2145  50S ribosomal protein L21  57 
 
 		 102 aa  117  6e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.69528e-18 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2391  50S ribosomal protein L21  56 
 
 		 102 aa  114  5e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0526513  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7271  50S ribosomal protein L21P  57.43 
 
 		 100 aa  114  6e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.60592  normal  0.0840523 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11400  LSU ribosomal protein L21P  63 
 
 		 106 aa  112  1.0000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.103652  hitchhiker  0.00107397 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3451  50S ribosomal protein L21  56.44 
 
 		 102 aa  111  4.0000000000000004e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.147626  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1652  ribosomal protein L21  60 
 
 		 102 aa  110  7.000000000000001e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000324409 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1622  ribosomal protein L21  58.42 
 
 		 101 aa  109  1.0000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.823278  normal  0.700415 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18270  LSU ribosomal protein L21P  52.48 
 
 		 102 aa  110  1.0000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0755051  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0756  50S ribosomal protein L21P  56.73 
 
 		 136 aa  109  1.0000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.984095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11540  LSU ribosomal protein L21P  51.96 
 
 		 102 aa  107  4.0000000000000004e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.536091  normal  0.231527 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1547  ribosomal protein L21  53.85 
 
 		 104 aa  107  6e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00649345  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3380  ribosomal protein L21  51.96 
 
 		 112 aa  105  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7272  50S ribosomal protein L21  53.85 
 
 		 110 aa  105  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2182  50S ribosomal protein L21  49.02 
 
 		 103 aa  103  6e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.107967  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0845  50S ribosomal protein L21  52.88 
 
 		 104 aa  102  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0678  ribosomal protein L21  47.12 
 
 		 116 aa  101  3e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000153253  normal  0.209425 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1616  50S ribosomal protein L21  54.9 
 
 		 102 aa  101  3e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00000151262  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10110  LSU ribosomal protein L21P  49.5 
 
 		 101 aa  99  2e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.56595  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1525  50S ribosomal protein L21P  46 
 
 		 95 aa  98.6  3e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.434446  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2551  50S ribosomal protein L21  44.12 
 
 		 102 aa  98.2  4e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000316052  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3457  ribosomal protein L21  57 
 
 		 103 aa  98.2  4e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.543673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2664  ribosomal protein L21  51 
 
 		 114 aa  96.7  9e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.341315 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1817  ribosomal protein L21  50.98 
 
 		 104 aa  94.7  4e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0474  50S ribosomal protein L21P  47.57 
 
 		 103 aa  92.8  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.030685  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0418  50S ribosomal protein L21  44.66 
 
 		 103 aa  92  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.217833 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2117  50S ribosomal protein L21  46.08 
 
 		 104 aa  92.8  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000135569  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1848  50S ribosomal protein L21  45.19 
 
 		 104 aa  91.7  3e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2219  50S ribosomal protein L21P  46.6 
 
 		 104 aa  91.7  3e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000152954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0528  LSU ribosomal protein L21P  46.53 
 
 		 105 aa  91.3  5e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000314721  normal  0.0648097 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0194  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 		 171 aa  90.9  5e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.472355 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0270  ribosomal protein L21  45.63 
 
 		 103 aa  90.9  5e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0160  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 		 103 aa  90.5  7e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00136073  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2250  50S ribosomal protein L21  44.12 
 
 		 102 aa  90.5  7e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00445864  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0488  ribosomal protein L21  47.52 
 
 		 103 aa  90.5  7e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4238  ribosomal protein L21  48.04 
 
 		 102 aa  89  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000144419  hitchhiker  0.000000201625 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0864  50S ribosomal protein L21P  43.69 
 
 		 103 aa  89  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0835554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1242  50S ribosomal protein L21P  42.16 
 
 		 100 aa  89.4  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.526712  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1483  ribosomal protein L21  42.72 
 
 		 103 aa  89  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1683  50S ribosomal protein L21  47.62 
 
 		 115 aa  87.8  4e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000196723  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0496  50S ribosomal protein L21  46.67 
 
 		 115 aa  87.8  5e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  3.70473e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4860  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 		 103 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.6007 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0926  ribosomal protein L21  47.52 
 
 		 102 aa  86.3  1e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000000598947  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0361  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 		 103 aa  85.9  2e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000287252  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2583  50S ribosomal protein L21  43.56 
 
 		 102 aa  85.5  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.5903200000000002e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2182  ribosomal protein L21  46.67 
 
 		 103 aa  85.5  2e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.035762  normal  0.921653 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1584  50S ribosomal protein L21  44.12 
 
 		 108 aa  85.5  2e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0688  50S ribosomal protein L21  44.12 
 
 		 104 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.468756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2005  ribosomal protein L21  43.69 
 
 		 103 aa  85.1  3e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2576  50S ribosomal protein L21  45.54 
 
 		 103 aa  85.1  3e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4497  50S ribosomal protein L21  44.12 
 
 		 104 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.200456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2238  ribosomal protein L21  40.59 
 
 		 104 aa  85.1  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0929508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0720  50S ribosomal protein L21  44.12 
 
 		 104 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.7553  normal  0.901329 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0720  50S ribosomal protein L21  44.12 
 
 		 104 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.456821  normal  0.0127169 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2228  50S ribosomal protein L21  47 
 
 		 101 aa  85.1  3e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0036789  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05960  LSU ribosomal protein L21P  47.52 
 
 		 101 aa  84.7  4e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000000829272  hitchhiker  0.000000000000252573 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3612  50S ribosomal protein L21  40.78 
 
 		 103 aa  84.3  5e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  5.09393e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3974  50S ribosomal protein L21  40.78 
 
 		 103 aa  84.3  5e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000270537  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3206  ribosomal protein L21  45.63 
 
 		 103 aa  84.3  5e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.78407  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2216  50S ribosomal protein L21  43.56 
 
 		 99 aa  84.3  5e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.824746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3757  50S ribosomal protein L21  40.78 
 
 		 103 aa  84.3  5e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000620592  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3682  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 		 103 aa  84  6e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.885821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1460  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  47.06 
 
 		 221 aa  84  6e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0369658 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1118  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 		 146 aa  84  6e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00565538  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0855  50S ribosomal protein L21  44.66 
 
 		 103 aa  84  7e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3470  50S ribosomal protein L21  42.72 
 
 		 103 aa  83.6  8e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00235402  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0484  ribosomal protein L21  41.75 
 
 		 105 aa  83.6  9e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.239256  normal  0.0811402 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2704  50S ribosomal protein L21  44.55 
 
 		 103 aa  83.6  9e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2535  ribosomal protein L21  46.6 
 
 		 114 aa  82.8  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00752962  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0701  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 		 103 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.60997 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4338  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 		 103 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  2.9959e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3799  50S ribosomal protein L21  45.1 
 
 		 136 aa  82.8  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1527  50S ribosomal protein L21  43.14 
 
 		 108 aa  82.8  0.000000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0521  ribosomal protein L21  41.75 
 
 		 103 aa  82  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000111872  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0797  ribosomal protein L21  42.72 
 
 		 103 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3482  50S ribosomal protein L21  41.75 
 
 		 103 aa  82  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000216305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3584  50S ribosomal protein L21  41.75 
 
 		 103 aa  82  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  6.68689e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0514  50S ribosomal protein L21  41.75 
 
 		 103 aa  82  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000928168  normal  0.0169565 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4508  50S ribosomal protein L21  41.75 
 
 		 103 aa  82  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.000000000766256  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1320  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 		 103 aa  82  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0375246  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0841  50S ribosomal protein L21  39.81 
 
 		 103 aa  82.8  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.498603 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>