More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5371 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_5371  transcriptional regulator, TrmB  100 
 
 		 129 aa  263  5e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2650  regulatory protein ArsR  69.3 
 
 		 125 aa  140  7e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3967  ArsR family transcriptional regulator  47.12 
 
 		 116 aa  92  3e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.45892  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1770  ArsR family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 125 aa  89.7  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.83595  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4431  ArsR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 128 aa  88.2  4e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.653801  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2077  transcriptional regulator, ArsR family  37.6 
 
 		 122 aa  85.9  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1155  ArsR family transcriptional regulator  42.27 
 
 		 122 aa  83.6  0.000000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2463  transcriptional regulator, TrmB  42.45 
 
 		 110 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.473489  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1439  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 125 aa  82.4  0.000000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1372  ArsR family transcriptional regulator  42.27 
 
 		 109 aa  81.6  0.000000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.792915 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3282  transcriptional regulator, TrmB  46.94 
 
 		 114 aa  81.3  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4475  ArsR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 124 aa  81.3  0.000000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4306  ArsR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 124 aa  81.3  0.000000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4206  ArsR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 124 aa  81.3  0.000000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.938952  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2928  transcriptional regulator, TrmB  38.53 
 
 		 130 aa  79  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5370  regulatory protein, ArsR  40.45 
 
 		 127 aa  77.4  0.00000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.56529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2331  ArsR family transcriptional regulator  40.87 
 
 		 133 aa  77.4  0.00000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5742  ArsR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 136 aa  77  0.00000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3640  regulatory protein, ArsR  34.78 
 
 		 134 aa  76.3  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5293  ArsR family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 127 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19620  transcriptional regulator, ArsR family  38.78 
 
 		 127 aa  76.6  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00139009  normal  0.0620554 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2865  regulatory protein, ArsR  37.76 
 
 		 138 aa  74.3  0.0000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3243  regulatory protein, ArsR  34.92 
 
 		 135 aa  74.3  0.0000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5393  transcriptional regulator, ArsR family  38.04 
 
 		 120 aa  73.6  0.0000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.497989 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0470  transcriptional regulator, ArsR family  46.58 
 
 		 134 aa  72.4  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1940  transcriptional regulator, ArsR family  43.68 
 
 		 111 aa  71.2  0.000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000629196  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3896  ArsR family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 118 aa  71.2  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3904  ArsR family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 118 aa  71.2  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.53534 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1730  transcriptional regulator, ArsR family  36.96 
 
 		 113 aa  70.5  0.000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5055  transcriptional regulator, ArsR family  45.56 
 
 		 124 aa  70.5  0.000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14670  transcriptional regulator, ArsR family  41.41 
 
 		 132 aa  70.1  0.000000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.475992  normal  0.15189 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2653  regulatory protein ArsR  39.81 
 
 		 129 aa  70.1  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.696132  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0270  transcriptional regulator, TrmB  44.44 
 
 		 102 aa  68.6  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0363  regulatory protein, ArsR  44.57 
 
 		 111 aa  67.8  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000621973 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2209  ArsR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 130 aa  67.8  0.00000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0444  ArsR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 126 aa  67.4  0.00000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.450624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1667  ArsR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 117 aa  67  0.00000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.214813  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0502  transcriptional regulator, ArsR family  41.1 
 
 		 115 aa  66.2  0.0000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3751  transcriptional regulator, ArsR family  33.01 
 
 		 110 aa  65.9  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0605  regulatory protein, ArsR  37.5 
 
 		 129 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.208863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25840  transcriptional regulator, ArsR family  34.23 
 
 		 142 aa  65.9  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3178  regulatory protein, ArsR  37.5 
 
 		 129 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.150405  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2639  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 98 aa  65.1  0.0000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0866  ArsR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 111 aa  64.7  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.799603  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2041  transcriptional regulator, ArsR family  39 
 
 		 115 aa  64.7  0.0000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.965187  normal  0.400743 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2609  regulatory protein ArsR  42.86 
 
 		 127 aa  64.3  0.0000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2195  ArsR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 100 aa  63.9  0.0000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000138755  normal  0.370986 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0757  transcriptional regulator, ArsR family  40.79 
 
 		 129 aa  63.9  0.0000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.164852 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3497  transcriptional regulator, ArsR family  36.84 
 
 		 121 aa  63.5  0.0000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.545017 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2205  ArsR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 115 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.273096  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0349  transcriptional regulator, ArsR family  42.67 
 
 		 119 aa  63.5  0.0000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1544  transcriptional regulator, ArsR family  39.51 
 
 		 109 aa  63.5  0.0000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.411749  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3211  hypothetical protein  37.04 
 
 		 112 aa  63.2  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147206 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3436  hypothetical protein  37.04 
 
 		 112 aa  63.2  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.547561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0777  transcriptional regulator, ArsR family  43.01 
 
 		 119 aa  62.4  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0623  ArsR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 129 aa  62  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1675  regulatory protein, ArsR  40.45 
 
 		 117 aa  62.8  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.432997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0756  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 221 aa  62.8  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2721  regulatory protein ArsR  39.33 
 
 		 132 aa  62.4  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1102  ArsR family transcriptional regulator  41.11 
 
 		 228 aa  62  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.780057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0894  transcriptional regulator, ArsR family  45 
 
 		 141 aa  61.6  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.360757  normal  0.426386 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2101  ArsR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 317 aa  62  0.000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3434  regulatory protein ArsR  37.76 
 
 		 118 aa  61.6  0.000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0763  transcriptional regulator, ArsR family  38.16 
 
 		 132 aa  61.2  0.000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0422  transcriptional regulator, ArsR family  39.13 
 
 		 121 aa  61.2  0.000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0539  transcriptional regulator, ArsR family  42.47 
 
 		 124 aa  61.2  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2302  transcriptional regulator, ArsR family  46.77 
 
 		 309 aa  61.2  0.000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25780  transcriptional regulator, ArsR family  35.96 
 
 		 119 aa  60.8  0.000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4577  regulatory protein ArsR  41.11 
 
 		 141 aa  60.5  0.000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07760  predicted transcriptional regulator  37.76 
 
 		 120 aa  60.8  0.000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.853788  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1704  transcriptional regulator, ArsR family  39.47 
 
 		 125 aa  60.5  0.000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.809199  hitchhiker  0.000421597 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1568  ArsR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 143 aa  60.5  0.000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00153678  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22920  transcriptional regulator, ArsR family  41.33 
 
 		 119 aa  60.5  0.000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1363  ArsR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 227 aa  60.5  0.000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3225  regulatory protein ArsR  37.93 
 
 		 104 aa  60.5  0.000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.151023  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1421  regulatory protein, ArsR  41.11 
 
 		 113 aa  60.1  0.000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.116907  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0872  ArsR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 114 aa  59.7  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1925  SAM-dependent methyltransferase  43.08 
 
 		 306 aa  59.7  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000216904  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1782  ArsR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 102 aa  60.1  0.00000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1942  ArsR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 129 aa  59.7  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10586  ArsR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 437 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.4131599999999997e-27  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25700  transcriptional regulator, ArsR family  39.33 
 
 		 119 aa  58.9  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4133  regulatory protein ArsR  39.56 
 
 		 106 aa  58.9  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3135  ArsR family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 106 aa  59.3  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.254389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12026  transcriptional regulator  44.93 
 
 		 118 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000227381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2395  ArsR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 109 aa  59.3  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3748  ArsR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 118 aa  58.9  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0333  ArsR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 104 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2151  ArsR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 109 aa  59.3  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4442  ArsR family transcriptional regulator  45.21 
 
 		 107 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.550147  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3603  ArsR family transcriptional regulator  45.21 
 
 		 107 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0649  transcriptional regulator, ArsR family  42.03 
 
 		 117 aa  59.3  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4445  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 125 aa  59.3  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.586673  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3925  ArsR family transcriptional regulator  45.21 
 
 		 107 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.725948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3742  ArsR family transcriptional regulator  42.68 
 
 		 116 aa  59.3  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.102941  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2040  transcriptional regulator, ArsR family  39.24 
 
 		 120 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2154  transcriptional regulator, ArsR family  31.96 
 
 		 129 aa  59.3  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11840  transcriptional regulator, ArsR family  38.55 
 
 		 119 aa  59.3  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2299  ArsR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 115 aa  58.5  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4381  ArsR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 110 aa  58.5  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.606402  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>