More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5172 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_5172  Phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 191 aa  379  1e-104  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.23568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2379  phosphoglycerate mutase  60.73 
 
 		 203 aa  222  3e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.60758  hitchhiker  0.00228115 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2260  phosphoglycerate mutase  59.69 
 
 		 200 aa  219  1.9999999999999999e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0173578  normal  0.0323998 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1570  Phosphoglycerate mutase  53.85 
 
 		 198 aa  190  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.638728 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1372  Phosphoglycerate mutase  55.21 
 
 		 193 aa  189  2e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7078  phosphoglycerate mutase  53.33 
 
 		 223 aa  188  5e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2516  phosphoglycerate mutase  52.6 
 
 		 193 aa  184  5e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0328326  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0541  Phosphoglycerate mutase  53.23 
 
 		 193 aa  184  8e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0350967  normal  0.247092 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2994  phosphoglycerate mutase  50.27 
 
 		 189 aa  183  1.0000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.386627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1416  Phosphoglycerate mutase  49.47 
 
 		 200 aa  183  1.0000000000000001e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.818067  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0586  Phosphoglycerate mutase  52.15 
 
 		 193 aa  182  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.427529  normal  0.250428 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3132  Phosphoglycerate mutase  51.56 
 
 		 195 aa  182  3e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0140691  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09371  putative phosphoglycerate mutase family protein  48.35 
 
 		 196 aa  179  1e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.161361 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0598  phosphoglycerate mutase  53.48 
 
 		 194 aa  179  2e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1462  phosphoglycerate mutase  54.14 
 
 		 190 aa  178  4.999999999999999e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5629  phosphoglycerate mutase  44.54 
 
 		 238 aa  174  8e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0516888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0743  putative phosphoglycerate mutase family protein  48.13 
 
 		 210 aa  173  9.999999999999999e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.84347  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2126  phosphoglycerate mutase  54.01 
 
 		 193 aa  169  3e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.557455 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4718  Phosphoglycerate mutase  50.55 
 
 		 198 aa  156  2e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14910  fructose-2,6-bisphosphatase  46.63 
 
 		 240 aa  155  3e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.023343  normal  0.355644 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1113  Phosphoglycerate mutase  47.34 
 
 		 206 aa  154  8e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.28293  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0155  phosphoglycerate mutase family protein  46.39 
 
 		 201 aa  153  1e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0847237  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0334  Phosphoglycerate mutase  46.39 
 
 		 201 aa  153  1e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.382121 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6284  Phosphoglycerate mutase  46.03 
 
 		 202 aa  153  1e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.109151  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1028  Phosphoglycerate mutase  47.21 
 
 		 200 aa  150  8e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.15665  normal  0.688481 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4679  acid phosphatase  46.29 
 
 		 227 aa  149  2e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.468834  normal  0.128486 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1422  acid phosphatase  49.71 
 
 		 203 aa  149  3e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.592625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1388  acid phosphatase  49.71 
 
 		 203 aa  148  4e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3923  Phosphoglycerate mutase  43.41 
 
 		 194 aa  148  4e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1406  acid phosphatase  49.71 
 
 		 203 aa  148  4e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.537444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1788  acid phosphatase  44.57 
 
 		 203 aa  147  8e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.498768  normal  0.567504 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13240  acid phosphatase  43.16 
 
 		 228 aa  145  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.550625 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4156  phosphoglycerate mutase  40.66 
 
 		 194 aa  142  2e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30660  fructose-2,6-bisphosphatase  43.65 
 
 		 195 aa  138  3.9999999999999997e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.243141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89865  phosphoglycerate mutase  38.16 
 
 		 244 aa  135  5e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.889408  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00810  conserved hypothetical protein  36.06 
 
 		 234 aa  134  7.000000000000001e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2609  Phosphoglycerate mutase  52.14 
 
 		 178 aa  132  3.9999999999999996e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.120451 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1642  Phosphoglycerate mutase  42.94 
 
 		 206 aa  125  3e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0155  Phosphoglycerate mutase  41.09 
 
 		 212 aa  125  3e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08720  phosphoglycerate mutase family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G02600)  35.84 
 
 		 239 aa  124  1e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1307  phosphoglycerate mutase family protein  36.7 
 
 		 236 aa  120  9.999999999999999e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1504  broad specificity phosphatase  39.45 
 
 		 237 aa  120  9.999999999999999e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1016  Phosphoglycerate mutase  41.29 
 
 		 215 aa  119  3e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0419238 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4366  hypothetical protein  47.62 
 
 		 159 aa  90.5  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  34.44 
 
 		 214 aa  86.7  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  29.38 
 
 		 200 aa  85.5  4e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0628  phosphoglycerate mutase  27.98 
 
 		 200 aa  82.4  0.000000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021297  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  33.16 
 
 		 202 aa  82  0.000000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000059372  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  28.87 
 
 		 200 aa  81.6  0.000000000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  28.87 
 
 		 200 aa  81.6  0.000000000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  25.63 
 
 		 211 aa  81.3  0.000000000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1230  phosphoglycerate mutase  30.3 
 
 		 207 aa  80.9  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1422  phosphoglycerate mutase family protein  30.3 
 
 		 207 aa  79.7  0.00000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.314707  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  25.64 
 
 		 206 aa  79.3  0.00000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3502  Phosphoglycerate mutase  31.32 
 
 		 200 aa  79.3  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0234  Phosphoglycerate mutase  38.2 
 
 		 181 aa  78.6  0.00000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.953882 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18180  fructose-2,6-bisphosphatase  36.31 
 
 		 210 aa  78.6  0.00000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.13343  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1900  phosphoglycerate mutase  28.26 
 
 		 188 aa  77.8  0.00000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4586  phosphoglycerate mutase  33.5 
 
 		 253 aa  77  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.616156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  32.04 
 
 		 213 aa  77.4  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2451  phosphoglycerate mutase  36.93 
 
 		 207 aa  76.3  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.590939  normal  0.0803681 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1556  Phosphoglycerate mutase  37.91 
 
 		 228 aa  76.6  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.063536  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3133  Phosphoglycerate mutase  32.61 
 
 		 200 aa  77  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  30.1 
 
 		 205 aa  77  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0968  Phosphoglycerate mutase  27.64 
 
 		 212 aa  75.1  0.0000000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.667484  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1204  phosphoglycerate mutase  29.29 
 
 		 207 aa  75.1  0.0000000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  35.06 
 
 		 222 aa  74.7  0.0000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  35.06 
 
 		 222 aa  74.7  0.0000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2250  phosphoglycerate mutase  31.32 
 
 		 213 aa  74.7  0.0000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0293006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0300  Phosphoglycerate mutase  36.84 
 
 		 197 aa  73.9  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05711  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  28.21 
 
 		 442 aa  73.2  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0488  fructose-2,6-bisphosphatase-like protein  27.98 
 
 		 207 aa  72.8  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5074  bifunctional RNase H/acid phosphatase  34.9 
 
 		 378 aa  72.4  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0171562  normal  0.0167384 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  27.69 
 
 		 208 aa  72.4  0.000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05791  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  29.69 
 
 		 442 aa  71.6  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.840151  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0499  putative phosphoglycerate mutase 2 protein  37.91 
 
 		 227 aa  71.6  0.000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725562  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2253  Phosphoglycerate mutase  33.97 
 
 		 203 aa  71.2  0.000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00114118  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5474  Phosphoglycerate mutase  34.97 
 
 		 198 aa  71.2  0.000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05411  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  27.8 
 
 		 442 aa  70.9  0.000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  32.69 
 
 		 214 aa  70.5  0.00000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2249  Phosphoglycerate mutase  35.03 
 
 		 234 aa  70.5  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  25.63 
 
 		 209 aa  70.5  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1438  bifunctional RNase H/acid phosphatase  33.33 
 
 		 378 aa  69.7  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.246631  normal  0.0428381 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  37.91 
 
 		 226 aa  70.1  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4252  phosphoglycerate mutase  30.61 
 
 		 245 aa  69.7  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0369  phosphoglycerate mutase  26.37 
 
 		 200 aa  69.7  0.00000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  37.25 
 
 		 226 aa  68.9  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0171  phosphoglycerate mutase  30.57 
 
 		 205 aa  68.6  0.00000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.693324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0008  phosphoglycerate mutase  30.1 
 
 		 241 aa  68.6  0.00000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0357979 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1455  phosphoglycerate mutase  29.73 
 
 		 201 aa  68.2  0.00000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05721  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  28.04 
 
 		 442 aa  68.2  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.169271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1409  phosphoglycerate mutase  29.73 
 
 		 201 aa  68.2  0.00000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.650422  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  35.71 
 
 		 440 aa  68.2  0.00000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  29.78 
 
 		 209 aa  68.2  0.00000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1553  Phosphoglycerate mutase  30.43 
 
 		 200 aa  67.8  0.00000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233017  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0515  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  27.23 
 
 		 442 aa  67.8  0.00000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.85164  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1152  phosphoglycerate mutase 1 family  28.93 
 
 		 201 aa  67.8  0.00000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  32.58 
 
 		 237 aa  67.4  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0069  broad-specificity phosphatase PhoE  34.81 
 
 		 197 aa  67.4  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3153  alpha-ribazole phosphatase  26.8 
 
 		 196 aa  67.8  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000015335  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>