62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4205 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_4205  hypothetical protein  100 
 
 		 185 aa  369  1e-101  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.520104  normal  0.0181669 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7213  hypothetical protein  41.08 
 
 		 180 aa  126  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.117419 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1401  hypothetical protein  38.33 
 
 		 194 aa  112  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.136211  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1069  hypothetical protein  37.57 
 
 		 191 aa  109  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4394  hypothetical protein  40.46 
 
 		 186 aa  109  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.487067  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4956  hypothetical protein  35.84 
 
 		 207 aa  107  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.56336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5694  hypothetical protein  34.07 
 
 		 190 aa  105  3e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195445 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3764  hypothetical protein  40.32 
 
 		 194 aa  104  8e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.343176  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1118  hypothetical protein  32.64 
 
 		 190 aa  102  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.581554 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5441  hypothetical protein  34.74 
 
 		 194 aa  102  4e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5150  hypothetical protein  34.21 
 
 		 189 aa  101  8e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2648  hypothetical protein  37.13 
 
 		 191 aa  97.4  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0118253  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4018  hypothetical protein  33.33 
 
 		 196 aa  94.7  6e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.483907  normal  0.202254 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5062  hypothetical protein  34.76 
 
 		 167 aa  92  4e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1542  hypothetical protein  38.92 
 
 		 184 aa  89.7  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.272764  hitchhiker  0.00246606 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0915  hypothetical protein  29.67 
 
 		 197 aa  84  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.649673  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6625  hypothetical protein  34.78 
 
 		 189 aa  75.9  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2465  hypothetical protein  31.41 
 
 		 193 aa  69.7  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00930954  normal  0.0949599 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2526  hypothetical protein  33.51 
 
 		 202 aa  69.3  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.19758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2932  hypothetical protein  33.17 
 
 		 226 aa  68.2  0.00000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.260366 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1843  hypothetical protein  36.42 
 
 		 186 aa  67  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000379282  normal  0.068852 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3545  hypothetical protein  31.52 
 
 		 197 aa  67.4  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.266411  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4511  hypothetical protein  28.81 
 
 		 188 aa  65.5  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0916947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1377  hypothetical protein  38.75 
 
 		 194 aa  62.4  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13807  hypothetical protein  30.53 
 
 		 194 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.280753  normal  0.497634 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0824  hypothetical protein  32.12 
 
 		 198 aa  61.6  0.000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2137  hypothetical protein  28.28 
 
 		 206 aa  61.2  0.000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00112657 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7305  hypothetical protein  33.51 
 
 		 189 aa  59.7  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2150  hypothetical protein  27.78 
 
 		 206 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2196  hypothetical protein  27.78 
 
 		 206 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.582945  normal  0.0278946 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0059  hypothetical protein  26.98 
 
 		 192 aa  58.5  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11744  hypothetical protein  32.62 
 
 		 189 aa  57.8  0.00000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.213346  normal  0.501181 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3298  hypothetical protein  27.23 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.584526  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10586  ArsR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 437 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.4131599999999997e-27  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6121  hypothetical protein  28.5 
 
 		 202 aa  56.2  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.18336  normal  0.0364143 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0149  hypothetical protein  32.39 
 
 		 194 aa  55.8  0.0000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.214633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2112  hypothetical protein  32.14 
 
 		 177 aa  55.5  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4530  hypothetical protein  28.88 
 
 		 183 aa  54.7  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.635551 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0334  hypothetical protein  26.29 
 
 		 230 aa  54.7  0.0000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6375  hypothetical protein  25.94 
 
 		 220 aa  53.9  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.172776 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4984  hypothetical protein  27.98 
 
 		 194 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02890  conserved hypothetical protein TIGR03086  31.15 
 
 		 187 aa  53.1  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5072  hypothetical protein  27.98 
 
 		 194 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5365  hypothetical protein  27.98 
 
 		 194 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.561933 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4246  hypothetical protein  50 
 
 		 194 aa  51.2  0.000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0354747  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10752  hypothetical protein  28.65 
 
 		 182 aa  51.6  0.000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000019473  normal  0.221771 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22230  hypothetical protein  32.62 
 
 		 184 aa  51.6  0.000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0172  hypothetical protein  35.04 
 
 		 131 aa  49.7  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2519  hypothetical protein  30.57 
 
 		 186 aa  48.9  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.291648 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4594  hypothetical protein  25.41 
 
 		 187 aa  47  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.232846  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2350  hypothetical protein  25.75 
 
 		 187 aa  46.6  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.146654  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8890  hypothetical protein  25.71 
 
 		 199 aa  46.2  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1453  hypothetical protein  28.31 
 
 		 186 aa  45.1  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.313622  normal  0.465473 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0874  hypothetical protein  31.34 
 
 		 197 aa  44.7  0.0008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1384  hypothetical protein  29.68 
 
 		 184 aa  43.9  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.132892  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3649  hypothetical protein  25.65 
 
 		 238 aa  43.5  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0565628 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04730  conserved hypothetical protein TIGR03086  30.3 
 
 		 196 aa  43.5  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.217314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3542  hypothetical protein  40.62 
 
 		 157 aa  42.7  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.325273  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2270  hypothetical protein  26.55 
 
 		 198 aa  42.4  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.674256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3875  hypothetical protein  31.51 
 
 		 196 aa  42  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.171113 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3963  hypothetical protein  31.51 
 
 		 196 aa  42  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.73221  normal  0.396579 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3889  hypothetical protein  31.51 
 
 		 196 aa  42  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>