More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3169 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_3169  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  100 
 
 		 852 aa  1705    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.486845  hitchhiker  0.0000002594 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1157  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  53.92 
 
 		 869 aa  872    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3057  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  38.04 
 
 		 811 aa  506  9.999999999999999e-143  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0118124  decreased coverage  0.000000211627 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2899  phosphoenolpyruvate synthase  28.86 
 
 		 868 aa  315  1.9999999999999998e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.407068  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3116  phosphoenolpyruvate synthase  28.86 
 
 		 868 aa  315  1.9999999999999998e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0349  phosphoenolpyruvate synthase, putative  29.3 
 
 		 825 aa  302  2e-80  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1622  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  29.54 
 
 		 891 aa  301  4e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1951  phosphoenolpyruvate synthase  28.24 
 
 		 871 aa  274  6e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2649  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  28.08 
 
 		 884 aa  265  3e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0751  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  37.77 
 
 		 887 aa  264  6e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0402174 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3615  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  46.57 
 
 		 902 aa  254  4.0000000000000004e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3844  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  28.79 
 
 		 889 aa  254  5.000000000000001e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.193358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2857  phosphoenolpyruvate synthase  46.94 
 
 		 892 aa  248  4.9999999999999997e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.321665  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3294  phosphoenolpyruvate synthase  28.3 
 
 		 837 aa  247  6.999999999999999e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0419  phosphoenolpyruvate synthase  41.87 
 
 		 757 aa  246  1.9999999999999999e-63  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.603284  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0592  phosphoenolpyruvate synthase  47.62 
 
 		 788 aa  242  2e-62  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.245818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2960  phosphoenolpyruvate synthase  39.01 
 
 		 866 aa  240  9e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000180391 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1730  phosphoenolpyruvate synthase  45.93 
 
 		 781 aa  239  1e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1573  phosphoenolpyruvate synthase  43.38 
 
 		 758 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1849  phosphoenolpyruvate synthase  44.69 
 
 		 762 aa  235  3e-60  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0508  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  39.2 
 
 		 903 aa  234  5e-60  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.93502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3805  Pyruvate, water dikinase  31.07 
 
 		 842 aa  233  1e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.294309 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3918  Pyruvate, water dikinase  31.07 
 
 		 842 aa  233  1e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0346  phosphoenolpyruvate synthase  43.05 
 
 		 758 aa  231  5e-59  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000716638 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2466  phosphoenolpyruvate synthase  41.49 
 
 		 782 aa  229  1e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.407223  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0490  phosphoenolpyruvate synthase  41.72 
 
 		 758 aa  229  2e-58  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1117  phosphoenolpyruvate synthase  37.38 
 
 		 891 aa  229  2e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0588  phosphoenolpyruvate synthase  43.37 
 
 		 824 aa  229  2e-58  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1894  Phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase-like protein  45.89 
 
 		 971 aa  228  4e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3119  phosphoenolpyruvate synthase  37.23 
 
 		 869 aa  227  9e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2997  phosphoenolpyruvate synthase  46.1 
 
 		 760 aa  227  9e-58  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.804311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1544  phosphoenolpyruvate synthase  42.17 
 
 		 758 aa  226  1e-57  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00247245  hitchhiker  0.0000582812 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2825  phosphoenolpyruvate synthase  36.96 
 
 		 869 aa  225  3e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0271  phosphoenolpyruvate synthase  44.12 
 
 		 769 aa  225  3e-57  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.187508  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2598  phosphoenolpyruvate synthase  46.33 
 
 		 785 aa  225  3e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4402  phosphoenolpyruvate synthase  45.29 
 
 		 799 aa  223  9e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5062  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  42.15 
 
 		 840 aa  223  9.999999999999999e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0801  phosphoenolpyruvate synthase  45.69 
 
 		 780 aa  222  1.9999999999999999e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5613  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  46.64 
 
 		 873 aa  222  1.9999999999999999e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.650843  normal  0.554799 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2868  phosphoenolpyruvate synthase  36.86 
 
 		 868 aa  221  3.9999999999999997e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.424665  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1818  pyruvate, water dikinase  27.98 
 
 		 788 aa  221  6e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0545713 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2610  phosphoenolpyruvate synthase  41.8 
 
 		 762 aa  220  7.999999999999999e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2165  phosphoenolpyruvate synthase  43.31 
 
 		 761 aa  220  7.999999999999999e-56  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0644  phosphoenolpyruvate synthase  44.19 
 
 		 870 aa  220  1e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0824821 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2079  phosphoenolpyruvate synthase  43.4 
 
 		 761 aa  219  2e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0493  pyruvate, water dikinase  28.13 
 
 		 791 aa  218  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.326718 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0384  phosphoenolpyruvate synthase  42.56 
 
 		 907 aa  219  2.9999999999999998e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3137  phosphoenolpyruvate synthase  36.12 
 
 		 868 aa  218  4e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2894  phosphoenolpyruvate synthase  39.62 
 
 		 868 aa  217  8e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.497322  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1204  phosphoenolpyruvate synthase  41.88 
 
 		 810 aa  216  9.999999999999999e-55  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.490144 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3108  phosphoenolpyruvate synthase  34.82 
 
 		 868 aa  216  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.721717  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0605  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  37.47 
 
 		 950 aa  215  2.9999999999999995e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00206316 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3580  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  32.81 
 
 		 887 aa  215  3.9999999999999995e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0554  phosphoenolpyruvate synthase  39.55 
 
 		 758 aa  214  5.999999999999999e-54  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.435689  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4720  phosphoenolpyruvate synthase  44.9 
 
 		 785 aa  214  5.999999999999999e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.878278  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3140  phosphoenolpyruvate synthase  39.43 
 
 		 868 aa  214  7.999999999999999e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.103594  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0529  phosphoenolpyruvate synthase  37.54 
 
 		 758 aa  213  1e-53  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000746686  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3264  phosphoenolpyruvate synthase  39.6 
 
 		 890 aa  213  1e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000174113  normal  0.320272 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1713  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  39.81 
 
 		 867 aa  211  7e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0623992  normal  0.0493713 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1637  phosphoenolpyruvate synthase  41.39 
 
 		 754 aa  210  8e-53  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1995  pyruvate, water dikinase  40.72 
 
 		 359 aa  210  1e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0783818  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2728  phosphoenolpyruvate synthase  37.24 
 
 		 874 aa  209  2e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.336193 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4939  phosphoenolpyruvate synthase  37.47 
 
 		 865 aa  208  3e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0930681 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2130  phosphoenolpyruvate synthase  38.41 
 
 		 868 aa  208  3e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1888  phosphoenolpyruvate synthase  40.72 
 
 		 809 aa  207  9e-52  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_494  phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase  37.54 
 
 		 758 aa  206  1e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000095153  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2573  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  46.46 
 
 		 835 aa  204  6e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2428  phosphoenolpyruvate synthase  40.91 
 
 		 786 aa  204  8e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2632  pyruvate, water dikinase  45.62 
 
 		 886 aa  201  3e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.514233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1445  phosphoenolpyruvate synthase  39.87 
 
 		 812 aa  201  5e-50  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.123077 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3009  phosphoenolpyruvate synthase  31.74 
 
 		 885 aa  201  5e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.963609  normal  0.276048 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1694  phosphoenolpyruvate synthase  39.87 
 
 		 779 aa  199  1.0000000000000001e-49  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.434121 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6941  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  40.26 
 
 		 810 aa  197  6e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.951528  normal  0.75146 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4143  phosphoenolpyruvate synthase  31.3 
 
 		 885 aa  196  2e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.917793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0313  phosphoenolpyruvate synthase  39.74 
 
 		 809 aa  196  2e-48  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0620  phosphoenolpyruvate synthase  38.4 
 
 		 842 aa  196  2e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4240  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  37.75 
 
 		 302 aa  195  3e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4990  phosphoenolpyruvate synthase  41.69 
 
 		 765 aa  193  1e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.82613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3829  phosphoenolpyruvate synthase  38.39 
 
 		 760 aa  190  1e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.424859  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5147  phosphoenolpyruvate synthase  42.62 
 
 		 414 aa  189  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12720  phosphoenolpyruvate synthase  35.48 
 
 		 764 aa  189  2e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1605  putative phosphoenolpyruvate synthase (pyruvate, water dikinase) (PEP synthase)  41.67 
 
 		 364 aa  187  8e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0220  phosphoenolpyruvate synthase  38.05 
 
 		 790 aa  186  1.0000000000000001e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.556806  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2435  phosphoenolpyruvate synthase  37.75 
 
 		 798 aa  186  2.0000000000000003e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1321  phosphoenolpyruvate synthase  38.73 
 
 		 801 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.134227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2101  pyruvate phosphate dikinase, PEP/pyruvate-binding  37.46 
 
 		 382 aa  185  4.0000000000000006e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3042  phosphoenolpyruvate synthase  38.94 
 
 		 799 aa  182  2e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0972  phosphoenolpyruvate synthase  35.87 
 
 		 790 aa  182  2e-44  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.687633  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1867  phosphoenolpyruvate synthase  36.88 
 
 		 794 aa  181  4e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2869  phosphoenolpyruvate synthase  36.42 
 
 		 810 aa  181  4e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1574  pyruvate,water dikinase  36.83 
 
 		 366 aa  181  4e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.328565  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1768  phosphoenolpyruvate synthase  36.67 
 
 		 791 aa  181  4.999999999999999e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.513341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2062  phosphoenolpyruvate synthase  38.44 
 
 		 796 aa  181  4.999999999999999e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.224612  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2046  phosphoenolpyruvate synthase  38.1 
 
 		 799 aa  181  7e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0453767  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1583  phosphoenolpyruvate synthase  36.51 
 
 		 805 aa  181  7e-44  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000580674  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3417  phosphoenolpyruvate synthase  36.96 
 
 		 798 aa  180  8e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0963728  normal  0.277431 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3406  phosphoenolpyruvate synthase  36.96 
 
 		 798 aa  180  8e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.568849  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0474  pyruvate, water dikinase  37.7 
 
 		 906 aa  180  8e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.247096  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3469  phosphoenolpyruvate synthase  36.96 
 
 		 798 aa  180  8e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.171038 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0121  phosphoenolpyruvate synthase  37.76 
 
 		 800 aa  180  9e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>