79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2529 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_2529  putative signal transduction protein with Nacht domain  100 
 
 
1174 aa  2362    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.250967  normal  0.208659 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1465  signal transduction protein  30.56 
 
 
570 aa  171  7e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.137269 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4437  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  22.72 
 
 
725 aa  117  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5325  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  23.77 
 
 
805 aa  115  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4811  putative signal transduction protein with Nacht domain  27.63 
 
 
1067 aa  103  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.382069  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5141  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  26.53 
 
 
951 aa  100  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.224088  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2563  putative signal transduction protein with Nacht domain  30.7 
 
 
997 aa  99.8  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.238788  normal  0.0710109 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2449  putative signal transduction protein with Nacht domain  24.25 
 
 
888 aa  97.8  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.152058  normal  0.158989 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2751  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  27.88 
 
 
942 aa  97.4  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3032  putative signal transduction protein with Nacht domain  26.21 
 
 
1004 aa  96.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00461923  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3508  signal transduction protein  24.06 
 
 
1148 aa  95.1  7e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.139224 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3088  putative signal transduction protein with Nacht domain  25.75 
 
 
798 aa  92.8  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1826  hypothetical protein  24 
 
 
1094 aa  90.9  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0067  signal transduction protein  23.03 
 
 
773 aa  91.3  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.571466  normal  0.0199052 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3214  putative signal transduction protein with Nacht domain  26.72 
 
 
649 aa  90.1  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.614434  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4476  signal transduction protein  28.07 
 
 
1237 aa  89.4  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.62278  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0457  signal transduction protein  26.75 
 
 
1049 aa  89.7  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1392  putative signal transduction protein with Nacht domain  25.79 
 
 
1091 aa  89.4  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2638  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  24.04 
 
 
852 aa  85.5  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.637289 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3090  putative signal transduction protein with Nacht domain  27.86 
 
 
908 aa  84  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.624689  normal  0.76371 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0049  HEAT repeat-containing PBS lyase  25.81 
 
 
944 aa  80.5  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.229879  normal  0.368167 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3244  signal transduction protein  23.2 
 
 
799 aa  79  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0094323  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1893  hypothetical protein  27.54 
 
 
1581 aa  78.6  0.0000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3570  signal transduction protein  24.36 
 
 
783 aa  77.8  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3181  NTPase (NACHT family)-like protein  27.48 
 
 
1150 aa  77  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00494273  normal  0.197936 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3298  NACHT family-like NTPase  22.63 
 
 
625 aa  75.1  0.000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1642  putative signal transduction protein with Nacht domain  28.77 
 
 
911 aa  75.1  0.000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.409211 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3131  GUN4 domain protein  24.27 
 
 
818 aa  72.8  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1916  signal transduction protein  24.29 
 
 
766 aa  72.4  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.394463 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0856  hypothetical protein  25.12 
 
 
923 aa  72  0.00000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1587  protein of unknown function DUF323  26.11 
 
 
1064 aa  72  0.00000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1048  signal transduction protein  24.1 
 
 
1216 aa  70.9  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.958943  normal  0.02885 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4586  putative signal transduction protein with Nacht domain  26.82 
 
 
1086 aa  70.9  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0650  signal transduction protein  23.41 
 
 
801 aa  70.5  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.190918 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1452  protein of unknown function DUF323  23.71 
 
 
1053 aa  70.5  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5124  hypothetical protein  25 
 
 
951 aa  67.4  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3050  NTPase (NACHT family)-like protein  27.11 
 
 
2216 aa  67  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.512729 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1763  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  23.36 
 
 
1475 aa  67.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.923912 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2349  protein of unknown function DUF323  25.63 
 
 
1186 aa  67.4  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.719002  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1500  putative signal transduction protein with Nacht domain  23.08 
 
 
762 aa  65.9  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0622  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  25.62 
 
 
872 aa  66.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1473  putative signal transduction protein with Nacht domain  23.08 
 
 
762 aa  65.9  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4765  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  20.74 
 
 
887 aa  65.5  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2498  signal transduction protein  25.39 
 
 
1349 aa  65.9  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4985  signal transduction protein  25.7 
 
 
1345 aa  64.7  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.266997  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1047  putative signal transduction protein with Nacht domain  25.86 
 
 
1183 aa  64.3  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.598608  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2427  putative signal transduction protein with Nacht domain  24.94 
 
 
1044 aa  63.5  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.509479  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1562  putative signal transduction protein with Nacht domain  25.16 
 
 
1044 aa  63.2  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0735  protein of unknown function DUF323  25.12 
 
 
1201 aa  62  0.00000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2192  protein of unknown function DUF323  26.7 
 
 
1049 aa  60.8  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1553  putative signal transduction protein with Nacht domain  24.95 
 
 
1023 aa  60.1  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0972336  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0460  hypothetical protein  25.58 
 
 
965 aa  59.7  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0102271  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2344  protein of unknown function DUF323  22.84 
 
 
1190 aa  59.3  0.0000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1565  putative signal transduction protein with Nacht domain  27.79 
 
 
1041 aa  57  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1605  hypothetical protein  20.3 
 
 
1065 aa  57.4  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0129457  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1602  signal transduction protein  28.36 
 
 
1002 aa  56.2  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2632  signal transduction protein  25.28 
 
 
1742 aa  55.5  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1133  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  24.77 
 
 
951 aa  55.5  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2496  signal transduction protein  25.06 
 
 
1339 aa  55.1  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5163  signal transduction protein  25.74 
 
 
969 aa  54.7  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5750  putative signal transduction protein with Nacht domain  26.25 
 
 
1330 aa  53.9  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3571  signal transduction protein  25.23 
 
 
2194 aa  53.5  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0411  hypothetical protein  21.98 
 
 
637 aa  52.8  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0440311  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0364  signal transduction protein  24.27 
 
 
960 aa  52.4  0.00005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2919  hypothetical protein  27.34 
 
 
1080 aa  52.4  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5122  signal transduction protein  24.71 
 
 
953 aa  52  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0676  signal transduction protein  23.31 
 
 
1073 aa  51.6  0.00008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.224513  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5123  hypothetical protein  23.83 
 
 
949 aa  50.1  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2296  NACHT family-like NTPase  31.61 
 
 
1267 aa  49.3  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.38 
 
 
1343 aa  49.3  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7397  NTPase (NACHT family)-like protein  23.72 
 
 
1106 aa  49.3  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676249  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1185  hypothetical protein  20.71 
 
 
647 aa  48.5  0.0007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.132787  decreased coverage  0.00946214 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1736  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.59 
 
 
1438 aa  46.2  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.198352  normal  0.401891 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1482  NTPase (NACHT family)-like protein  24.36 
 
 
1051 aa  46.6  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2430  putative signal transduction protein with Nacht domain  27.16 
 
 
911 aa  46.2  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3129  NACHT family-like NTPase  26.9 
 
 
402 aa  45.4  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.554855  hitchhiker  0.000164305 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3286  NACHT family-like NTPase  25 
 
 
1335 aa  45.4  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.149878 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  23.58 
 
 
1807 aa  45.4  0.007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2186  protein of unknown function DUF323  23.29 
 
 
1007 aa  44.7  0.009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000553602  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>