More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1544 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_1544  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
252 aa  514  1.0000000000000001e-145  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.835895  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1103  beta-lactamase domain-containing protein  63.49 
 
 
248 aa  310  2e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.690546 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0992  beta-lactamase domain-containing protein  62.3 
 
 
248 aa  291  5e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.122606 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2366  hypothetical protein  53.57 
 
 
268 aa  275  4e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0384  hypothetical protein  51.19 
 
 
250 aa  266  2e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0581145  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1733  Metal-dependent hydrolase of the beta-lactamase superfamily III-like protein  53.75 
 
 
250 aa  266  2e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.649744 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5649  beta-lactamase domain-containing protein  49.6 
 
 
248 aa  254  1.0000000000000001e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.704721  normal  0.90669 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0941  beta-lactamase domain-containing protein  50.39 
 
 
251 aa  248  9e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.504318 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3866  beta-lactamase domain protein  50.2 
 
 
249 aa  247  1e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0871  beta-lactamase-like  47.43 
 
 
270 aa  242  3.9999999999999997e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7555  beta-lactamase domain protein  52.12 
 
 
257 aa  235  6e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.731763  normal  0.770498 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1316  beta-lactamase domain-containing protein  46.3 
 
 
256 aa  230  2e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29130  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  45.14 
 
 
259 aa  217  2e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.837765 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25060  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  44.65 
 
 
267 aa  206  2e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1359  beta-lactamase domain protein  46.83 
 
 
246 aa  206  3e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3845  beta-lactamase-like protein  47.06 
 
 
257 aa  205  6e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3919  beta-lactamase domain-containing protein  47.06 
 
 
257 aa  205  6e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3831  beta-lactamase domain-containing protein  47.06 
 
 
257 aa  205  6e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.196272 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2357  beta-lactamase-like protein  46.27 
 
 
257 aa  204  1e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.047895  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1016  beta-lactamase domain protein  44.57 
 
 
270 aa  203  2e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11369  hypothetical protein  45.35 
 
 
273 aa  196  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0204718  normal  0.45111 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20060  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  44.22 
 
 
265 aa  194  2e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.204616  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1970  beta-lactamase domain protein  43.46 
 
 
253 aa  191  7e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4288  beta-lactamase-like protein  45.88 
 
 
257 aa  191  8e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.34656 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1324  hypothetical protein  42.11 
 
 
262 aa  191  1e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.588841  hitchhiker  0.00279452 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0886  hypothetical protein  41.61 
 
 
267 aa  185  7e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08360  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  43.64 
 
 
271 aa  182  6e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1012  beta-lactamase domain protein  38.91 
 
 
256 aa  177  1e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2582  hypothetical protein  43.49 
 
 
265 aa  176  4e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000119552  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2314  hypothetical protein  44.78 
 
 
265 aa  172  2.9999999999999996e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000980644 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2736  beta-lactamase domain protein  38.75 
 
 
265 aa  172  3.9999999999999995e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.234606  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1685  beta-lactamase domain-containing protein  38.4 
 
 
245 aa  166  4e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.0000313983  hitchhiker  0.00000630033 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1059  Metal-dependent hydrolase of the beta-lactamase superfamily III  38.27 
 
 
284 aa  162  4.0000000000000004e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.623679  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09930  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  37.25 
 
 
260 aa  155  7e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.65106  normal  0.185671 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3987  beta-lactamase domain-containing protein  38.61 
 
 
257 aa  152  4e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.706134  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0308  beta-lactamase domain-containing protein  36.58 
 
 
262 aa  148  7e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0371  beta-lactamase domain-containing protein  36.96 
 
 
256 aa  148  9e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.677057  normal  0.0150173 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0655  beta-lactamase domain protein  33.59 
 
 
244 aa  142  7e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000122219  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1471  beta-lactamase domain protein  35.29 
 
 
244 aa  138  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0761  beta-lactamase domain protein  32.31 
 
 
249 aa  136  4e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0838  beta-lactamase domain-containing protein  32.68 
 
 
244 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1166  metallo-beta-lactamase family protein  30.43 
 
 
244 aa  131  9e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2093  beta-lactamase domain-containing protein  38.5 
 
 
240 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000753461  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1016  hypothetical protein  30.04 
 
 
244 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1000  metal-dependant hydrolase  30.04 
 
 
244 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1003  metal-dependant hydrolase  30.04 
 
 
244 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1088  hypothetical protein  30.04 
 
 
244 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1247  metallo-beta-lactamase family protein  30.86 
 
 
244 aa  129  6e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1120  metallo-beta-lactamase family protein  30.04 
 
 
244 aa  129  6e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4186  metallo-beta-lactamase family protein  30.86 
 
 
244 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.167335  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1005  beta-lactamase domain-containing protein  30.47 
 
 
244 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1188  hypothetical protein  30.47 
 
 
244 aa  125  9e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1909  beta-lactamase domain-containing protein  34.35 
 
 
259 aa  124  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0640394  normal  0.612036 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0757  beta-lactamase superfamily hydrolase  32.94 
 
 
250 aa  124  2e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00514678  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5275  beta-lactamase domain protein  31.92 
 
 
263 aa  122  8e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3155  beta-lactamase-like protein  29.73 
 
 
244 aa  115  8.999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000166272  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0399  AtsA/ElaC family protein  31.89 
 
 
258 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000165635  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2205  beta-lactamase domain protein  33.73 
 
 
246 aa  114  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2251  beta-lactamase-like  33.82 
 
 
273 aa  112  5e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.174345  normal  0.0139422 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2686  beta-lactamase domain-containing protein  32.57 
 
 
248 aa  102  5e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0241987  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3623  beta-lactamase domain protein  29.56 
 
 
253 aa  98.2  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00997339  normal  0.648861 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3325  beta-lactamase domain-containing protein  30.87 
 
 
247 aa  93.6  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.257531  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3962  beta-lactamase domain-containing protein  31.64 
 
 
285 aa  91.3  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.17682  normal  0.145859 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1126  beta-lactamase domain protein  28.05 
 
 
240 aa  90.1  3e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0125591  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3235  beta-lactamase domain-containing protein  30.24 
 
 
263 aa  88.2  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00328629  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12435  ribonuclease Z  30.11 
 
 
280 aa  83.2  0.000000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0772968  normal  0.994389 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0681  beta-lactamase-like protein  26.85 
 
 
250 aa  82.4  0.000000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.142415  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2187  ribonuclease Z  24.75 
 
 
307 aa  80.5  0.00000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0679584  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0652  beta-lactamase domain-containing protein  27.27 
 
 
247 aa  79  0.00000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1184  hypothetical protein  26.13 
 
 
312 aa  78.6  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.454462  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1219  hypothetical protein  26.13 
 
 
312 aa  78.6  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.206552  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1204  hypothetical protein  26.13 
 
 
312 aa  78.6  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.448383 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1173  putative periplasmic protein  26.13 
 
 
312 aa  78.6  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1068  putative periplasmic protein  26.13 
 
 
312 aa  78.6  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1526  ribonuclease Z  25.86 
 
 
318 aa  78.6  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00811682  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1506  beta-lactamase domain-containing protein  29.74 
 
 
253 aa  76.6  0.0000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3908  ribonuclease Z  30.08 
 
 
300 aa  76.6  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.686381  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1070  beta-lactamase domain protein  26.94 
 
 
316 aa  75.9  0.0000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1563  Ribonuclease Z  29.45 
 
 
323 aa  75.9  0.0000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0588  beta-lactamase domain-containing protein  28.84 
 
 
254 aa  74.7  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280528  normal  0.0107204 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1641  Ribonuclease Z  28.72 
 
 
322 aa  73.9  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0754  beta-lactamase-like  29.96 
 
 
244 aa  73.9  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0374984  normal  0.146735 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1949  beta-lactamase domain protein  26.52 
 
 
247 aa  73.6  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.170959 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1789  ribonuclease Z  24.23 
 
 
305 aa  73.2  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.785437 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2921  beta-lactamase domain protein  28.25 
 
 
251 aa  73.2  0.000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0261886  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2229  ribonuclease Z  24.84 
 
 
324 aa  72.4  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.859333 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1229  beta-lactamase-like protein  27.59 
 
 
251 aa  72.4  0.000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0415  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 
237 aa  72  0.000000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0441  beta-lactamase domain protein  26.52 
 
 
259 aa  71.6  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0789  beta-lactamase-like  29.87 
 
 
244 aa  71.6  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.514573 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1159  beta-lactamase domain-containing protein  29.15 
 
 
255 aa  71.6  0.00000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2542  ribonuclease Z  25.08 
 
 
341 aa  70.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.144505  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1994  beta-lactamase domain-containing protein  26.96 
 
 
243 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0401  ribonuclease Z  26.32 
 
 
305 aa  70.1  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0941  beta-lactamase domain-containing protein  28.14 
 
 
251 aa  70.5  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0158649 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2424  ribonuclease Z  26.35 
 
 
311 aa  70.1  0.00000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.94801  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3410  ribonuclease Z  26.27 
 
 
311 aa  69.3  0.00000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.109803  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1380  ribonuclease Z  26.35 
 
 
305 aa  69.3  0.00000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.867836 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2414  ribonuclease Z  26.35 
 
 
305 aa  69.3  0.00000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.36621  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02154  hypothetical protein  26.35 
 
 
305 aa  69.3  0.00000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.871793  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>