More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0560 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_0560  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
390 aa  790    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.747431 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3856  alpha/beta hydrolase fold  46.48 
 
 
364 aa  271  1e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.775297  normal  0.514851 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4246  alpha/beta hydrolase fold  46.18 
 
 
364 aa  265  1e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.146629  hitchhiker  0.00549727 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1174  alpha/beta hydrolase fold  43.69 
 
 
369 aa  238  2e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.326598  normal  0.0488033 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1147  alpha/beta hydrolase fold  43.69 
 
 
369 aa  238  2e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.255082  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1164  alpha/beta hydrolase fold  43.69 
 
 
369 aa  238  2e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.428268 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1142  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  39.18 
 
 
390 aa  236  4e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.152589  normal  0.697753 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0625  alpha/beta hydrolase fold  40.13 
 
 
423 aa  230  3e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.537293  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4266  alpha/beta hydrolase fold protein  42.28 
 
 
364 aa  229  5e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6010  alpha/beta hydrolase fold  42.32 
 
 
421 aa  225  1e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.773155  normal  0.16375 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0610  alpha/beta hydrolase fold protein  41.14 
 
 
350 aa  225  1e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.38332 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4933  alpha/beta hydrolase fold  41.4 
 
 
362 aa  222  8e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6555  alpha/beta hydrolase fold protein  38.96 
 
 
366 aa  216  4e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.381661  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4461  alpha/beta hydrolase fold protein  40.69 
 
 
397 aa  216  5e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1485  alpha/beta hydrolase fold  38.85 
 
 
362 aa  207  2e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.409347  normal  0.569371 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1712  alpha/beta hydrolase fold protein  34.38 
 
 
373 aa  201  3e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.641488  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1191  alpha/beta hydrolase fold protein  33.79 
 
 
400 aa  198  2.0000000000000003e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04600  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  37.74 
 
 
330 aa  191  2e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.374511 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0541  alpha/beta hydrolase fold protein  38.49 
 
 
344 aa  188  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.271487 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0991  alpha/beta hydrolase fold protein  35.34 
 
 
389 aa  177  4e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.750053  hitchhiker  0.00638838 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3466  alpha/beta hydrolase fold protein  39.14 
 
 
304 aa  171  1e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0288273  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0254  alpha/beta hydrolase fold protein  37 
 
 
348 aa  166  8e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.328235  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0901  alpha/beta hydrolase fold  36.33 
 
 
360 aa  165  2.0000000000000002e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1497  alpha/beta hydrolase fold protein  35.92 
 
 
325 aa  154  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3629  alpha/beta hydrolase fold  34.1 
 
 
306 aa  154  2e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.030304  hitchhiker  0.0000369585 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3387  alpha/beta hydrolase fold  34.06 
 
 
306 aa  152  7e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0879  alpha/beta hydrolase fold protein  33.23 
 
 
349 aa  149  1.0000000000000001e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0728  alpha/beta hydrolase fold  36.52 
 
 
336 aa  136  6.0000000000000005e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000117195  normal  0.409644 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6786  alpha/beta hydrolase fold  41.62 
 
 
297 aa  134  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06710  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  32.53 
 
 
296 aa  123  5e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5476  alpha/beta hydrolase fold  32.27 
 
 
333 aa  117  5e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.294136  normal  0.797092 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4827  alpha/beta hydrolase fold protein  33.08 
 
 
352 aa  103  5e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.692638  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07460  lysophospholipase  33.1 
 
 
300 aa  102  1e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0863462 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1699  putative hydrolase  34.98 
 
 
312 aa  100  6e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.272116  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0777  alpha/beta hydrolase fold protein  30.29 
 
 
347 aa  95.1  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.515072  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1525  alpha/beta hydrolase fold  29.47 
 
 
318 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0190867  normal  0.846778 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1555  alpha/beta hydrolase fold  29.47 
 
 
318 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.512381  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1579  alpha/beta hydrolase fold  29.47 
 
 
318 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3656  alpha/beta hydrolase fold protein  29.48 
 
 
347 aa  90.9  3e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.292184  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  26.71 
 
 
425 aa  87.4  4e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4502  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 
353 aa  83.6  0.000000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.297988  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0285  3-oxoadipate enol-lactonase, putative  27.14 
 
 
259 aa  83.2  0.000000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0385204 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29320  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  30.22 
 
 
248 aa  82.8  0.000000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2122  alpha/beta hydrolase fold  27.24 
 
 
263 aa  80.9  0.00000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  25.26 
 
 
277 aa  79.7  0.00000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  28.46 
 
 
266 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  30.36 
 
 
261 aa  79  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  28.77 
 
 
273 aa  77.8  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1865  alpha/beta hydrolase fold  26.67 
 
 
325 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0853648  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13192  non-heme haloperoxidase hpx  29.51 
 
 
299 aa  77.4  0.0000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.305997 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1637  alpha/beta hydrolase fold  27.95 
 
 
287 aa  77.4  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0457  alpha/beta hydrolase fold protein  29.45 
 
 
299 aa  76.3  0.0000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.168298 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3798  alpha/beta hydrolase fold protein  27.05 
 
 
258 aa  76.6  0.0000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1149  alpha/beta hydrolase fold protein  25.64 
 
 
265 aa  74.7  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2194  alpha/beta hydrolase fold protein  28.95 
 
 
350 aa  75.1  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.984262  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1401  3-oxoadipate enol-lactonase  30.58 
 
 
256 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.926851 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3897  alpha/beta hydrolase fold protein  28.42 
 
 
309 aa  75.1  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0275193  normal  0.323769 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2317  alpha/beta hydrolase fold  28.87 
 
 
270 aa  74.3  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0148017 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0874  3-oxoadipate enol-lactonase  29.21 
 
 
260 aa  73.9  0.000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.839441  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1367  3-oxoadipate enol-lactonase  30.58 
 
 
256 aa  73.9  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1385  3-oxoadipate enol-lactonase  30.58 
 
 
256 aa  73.9  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.279159  normal  0.947236 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0553  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  26.81 
 
 
368 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4165  3-oxoadipate enol-lactonase  27.4 
 
 
256 aa  72.4  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1900  alpha/beta hydrolase fold  30.17 
 
 
271 aa  72  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1992  alpha/beta hydrolase fold  29.63 
 
 
274 aa  70.9  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.45941  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2308  alpha/beta fold family hydrolase  25 
 
 
283 aa  71.2  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1565  alpha/beta hydrolase fold  29.61 
 
 
363 aa  71.2  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.461626  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  26.12 
 
 
290 aa  71.2  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0592  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  26.45 
 
 
368 aa  70.9  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2103  alpha/beta hydrolase fold  28.47 
 
 
352 aa  70.5  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.225702  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2691  3-oxoadipate enol-lactonase  30.45 
 
 
266 aa  70.5  0.00000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000109702  normal  0.164043 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2846  alpha/beta hydrolase  27.05 
 
 
263 aa  70.5  0.00000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.455911  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0598  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  26.09 
 
 
368 aa  70.1  0.00000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0447613 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0263  Alpha/beta hydrolase fold  28.42 
 
 
266 aa  70.1  0.00000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.191481  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13040  3-oxoadipate enol-lactonase  26.72 
 
 
261 aa  70.1  0.00000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2061  alpha/beta hydrolase fold  29.76 
 
 
368 aa  70.1  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.112445  normal  0.60255 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  26.15 
 
 
264 aa  68.9  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5984  alpha/beta hydrolase fold  29.55 
 
 
300 aa  68.9  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0152397 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1491  alpha/beta hydrolase fold  26.85 
 
 
297 aa  68.6  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00412587  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4363  alpha/beta hydrolase fold protein  30.77 
 
 
239 aa  68.2  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594028  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  26.18 
 
 
264 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4206  3-oxoadipate enol-lactonase  26.16 
 
 
268 aa  67.8  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  25.64 
 
 
265 aa  68.2  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1348  3-oxoadipate enol-lactonase  27.76 
 
 
256 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.786206 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1662  alpha/beta hydrolase fold protein  29.41 
 
 
274 aa  67.4  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.665083  normal  0.0127757 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0507  alpha/beta hydrolase fold protein  27.44 
 
 
297 aa  66.6  0.0000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.837518  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0780  alpha/beta hydrolase fold  27.01 
 
 
276 aa  66.6  0.0000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0600224  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5072  alpha/beta hydrolase fold protein  28.24 
 
 
281 aa  66.6  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.157677 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0675  arylesterase  25.32 
 
 
272 aa  66.2  0.0000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2225  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 
273 aa  66.6  0.0000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1080  alpha/beta hydrolase fold  26.21 
 
 
296 aa  66.2  0.0000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3207  alpha/beta fold family hydrolase  27.42 
 
 
271 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.39974  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3988  alpha/beta hydrolase fold protein  26.78 
 
 
263 aa  65.5  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4474  3-oxoadipate enol-lactonase  28.67 
 
 
261 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5110  3-oxoadipate enol-lactonase  28.67 
 
 
261 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  25.75 
 
 
287 aa  65.9  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5749  3-oxoadipate enol-lactonase  28.67 
 
 
261 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.74876  normal  0.111233 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1573  alpha/beta hydrolase fold protein  27.36 
 
 
281 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4806  alpha/beta hydrolase fold  31.05 
 
 
321 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.786039  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4512  alpha/beta hydrolase fold  31.05 
 
 
321 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.999363 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>