221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0818 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013515  Smon_0818  ribonuclease BN  100 
 
 
405 aa  790    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0732  ribonuclease BN  31.7 
 
 
424 aa  221  9.999999999999999e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.119651  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0958  ribonuclease BN, putative  29.09 
 
 
411 aa  176  5e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.107096 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1819  putative ribonuclease BN  28.39 
 
 
442 aa  171  3e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.10172  normal  0.193645 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0014  putative ribonuclease BN  26.5 
 
 
450 aa  166  6.9999999999999995e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.113788  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0595  ribonuclease BN  25.51 
 
 
460 aa  147  4.0000000000000006e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2112  ribonuclease BN  26.5 
 
 
425 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.181145  normal  0.117227 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1979  hypothetical protein  26.82 
 
 
479 aa  133  6.999999999999999e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2779  ribonuclease BN  23.96 
 
 
453 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00809939  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0764  ribonuclease BN  26.01 
 
 
452 aa  129  9.000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2460  ribonuclease BN, putative  29.48 
 
 
397 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0638  putative ribonuclease BN  27.8 
 
 
449 aa  124  3e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00048226  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1636  ribonuclease BN  24.04 
 
 
447 aa  122  9.999999999999999e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2776  putative ribonuclease BN  28.52 
 
 
417 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2655  ribonuclease BN  24.69 
 
 
439 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3064  ribonuclease BN, putative  25.63 
 
 
473 aa  113  7.000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00183316  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0733  ribonuclease BN  21.86 
 
 
439 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0824671  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0732  ribonuclease BN  22.46 
 
 
439 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0697  ribonuclease BN, putative  22.84 
 
 
429 aa  111  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.47498  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1575  ribonuclease BN  24.66 
 
 
439 aa  107  5e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1830  ribonuclease BN, putative  27.24 
 
 
404 aa  106  7e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0291213 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1707  tRNA-processing ribonuclease BN  28.45 
 
 
437 aa  106  7e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0942  ribonuclease BN  28.45 
 
 
437 aa  106  9e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1862  ribonuclease BN  28.45 
 
 
437 aa  106  9e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.618695  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1475  ribonuclease BN  28.45 
 
 
437 aa  106  9e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1685  tRNA-processing ribonuclease BN  28.45 
 
 
437 aa  106  9e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.417952  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4086  putative ribonuclease BN  27.44 
 
 
487 aa  106  9e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.143901  normal  0.331874 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1514  ribonuclease BN  25 
 
 
472 aa  105  1e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.258349  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0581  ribonuclease BN  25.28 
 
 
446 aa  105  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000420999  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0594  ribonuclease BN  26.71 
 
 
446 aa  105  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000174757 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0739  putative ribonuclease BN  23.77 
 
 
434 aa  104  3e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0406  ribonuclease BN  28.45 
 
 
436 aa  103  6e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0756  tRNA-processing ribonuclease BN  28.45 
 
 
436 aa  103  6e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.902171  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2769  putative ribonuclease BN  27.69 
 
 
404 aa  102  8e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0433853 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2991  ribonuclease BN, putative  26.82 
 
 
416 aa  102  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3053  putative ribonuclease BN  22.55 
 
 
451 aa  102  1e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1131  tRNA-processing RNAse BN  22.1 
 
 
447 aa  100  4e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0120336  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5884  ribonuclease BN  23.86 
 
 
499 aa  100  4e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2618  YihY family protein  27.59 
 
 
437 aa  100  6e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0698  hypothetical protein  25.54 
 
 
412 aa  99.4  1e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1793  ribonuclease BN  27.42 
 
 
442 aa  98.2  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0680  hypothetical protein  25.54 
 
 
412 aa  97.8  3e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4601  ribonuclease BN  24.25 
 
 
443 aa  97.8  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.996518 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1434  ribonuclease BN  28.02 
 
 
442 aa  97.4  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.50654  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0974  ribonuclease BN, putative  28.02 
 
 
442 aa  97.4  4e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.315544  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1337  putative ribonuclease BN  27.02 
 
 
443 aa  97.4  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.500166  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1377  ribonuclease BN  27.02 
 
 
443 aa  97.1  5e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.763301  normal  0.704772 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1456  putative ribonuclease BN  28.02 
 
 
442 aa  97.1  5e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36810  Ribonuclease BN-like protein  26.49 
 
 
408 aa  97.1  6e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1670  ribonuclease BN  26.48 
 
 
403 aa  96.7  7e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.926786  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3482  ribonuclease BN  27.82 
 
 
292 aa  96.3  8e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.384798 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0331  ribonuclease BN  23.64 
 
 
320 aa  95.9  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.533981  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2773  ribonuclease BN  28.46 
 
 
437 aa  95.5  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1354  ribonuclease BN  28.46 
 
 
436 aa  94  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.875268  normal  0.303489 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3782  putative ribonuclease BN  27.03 
 
 
417 aa  93.6  6e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.747411  normal  0.886826 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3545  ribonuclease BN  23.1 
 
 
285 aa  93.2  8e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.109526  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0704  putative ribonuclease BN  22.87 
 
 
451 aa  92.8  9e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.71296  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1119  ribonuclease BN  26.64 
 
 
429 aa  91.7  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.695932  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1200  putative ribonuclease BN  26.64 
 
 
429 aa  92  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.530131  normal  0.510939 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2988  tRNA-processing RNAse BN  28.24 
 
 
405 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0115566 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3909  ribonuclease BN  26.03 
 
 
340 aa  90.9  4e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0536  ribonuclease BN, putative  24.09 
 
 
525 aa  90.1  6e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.031655 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4092  ribonuclease BN  22.91 
 
 
290 aa  90.1  6e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0314  ribonuclease BN  25.87 
 
 
323 aa  89.7  8e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.321317  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0319  ribonuclease BN  25.87 
 
 
323 aa  89.7  8e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0315  ribonuclease BN  25.87 
 
 
323 aa  89.7  8e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0548  tRNA-processing RNAse BN  25.91 
 
 
525 aa  89.7  9e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0931  putative ribonuclease BN  20.35 
 
 
459 aa  89.7  9e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.810596 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2681  ribonuclease BN  25.76 
 
 
561 aa  89.7  9e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.267088 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0320  ribonuclease BN  25.87 
 
 
323 aa  89.4  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0302  ribonuclease BN  25.19 
 
 
298 aa  89.4  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.223678  hitchhiker  0.000000133239 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4618  ribonuclease BN  24.42 
 
 
336 aa  89.4  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.331921  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3448  ribonuclease BN  24.12 
 
 
313 aa  89  1e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.016816  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1559  putative ribonuclease BN transmembrane protein  23.55 
 
 
441 aa  88.2  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.837363 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0935  ribonuclease BN  22.47 
 
 
432 aa  88.6  2e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0316  ribonuclease BN  23.62 
 
 
337 aa  89  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.293845  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3708  ribonuclease BN  24.22 
 
 
337 aa  88.2  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.153225 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0311  ribonuclease BN  24.22 
 
 
337 aa  88.6  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.415793 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0711  ribonuclease BN, putative  23.1 
 
 
422 aa  87.8  3e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0788126  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4878  ribonuclease BN  21.92 
 
 
296 aa  88.2  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000922798 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0630  putative ribonuclease BN  26.29 
 
 
538 aa  87.8  3e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.883121 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4401  ribonuclease BN  24.28 
 
 
295 aa  87.4  4e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1250  tRNA-processing RNAse BN  22.66 
 
 
444 aa  87.4  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4966  ribonuclease BN  24.15 
 
 
448 aa  87.4  4e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03771  ribonuclease BN  22.84 
 
 
290 aa  87  6e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.841593  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4100  ribonuclease BN  22.84 
 
 
290 aa  87  6e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4271  ribonuclease BN  22.84 
 
 
290 aa  87  6e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5333  ribonuclease BN  22.84 
 
 
290 aa  87  6e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.247154 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4364  ribonuclease BN  22.84 
 
 
290 aa  87  6e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03720  hypothetical protein  22.84 
 
 
290 aa  87  6e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.664641  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4132  ribonuclease BN  22.84 
 
 
290 aa  87  6e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4111  ribonuclease BN  22.84 
 
 
290 aa  87  6e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.235548  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4409  ribonuclease BN  22.84 
 
 
290 aa  87  6e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0521  putative ribonuclease BN  26.62 
 
 
445 aa  86.7  7e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.623769 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1422  putative ribonuclease BN transmembrane protein  22.64 
 
 
416 aa  86.7  7e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00924301 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1454  putative ribonuclease BN  26.79 
 
 
446 aa  85.9  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0609  ribonuclease BN  24.75 
 
 
303 aa  85.1  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0138634  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4238  ribonuclease BN  21.66 
 
 
290 aa  85.1  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.89383  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4351  ribonuclease BN  21.66 
 
 
290 aa  85.1  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4305  ribonuclease BN  21.66 
 
 
290 aa  85.1  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.269266  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>