More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1251 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_1251  phosphatidylserine decarboxylase  100 
 
 		 343 aa  699    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302501  normal  0.631326 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1252  phosphatidylserine decarboxylase  54.6 
 
 		 340 aa  375  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.277456  normal  0.603033 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2938  glycosyl transferase, group 1  35.71 
 
 		 351 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0577  glycosyl transferase, group 1  32.29 
 
 		 355 aa  169  7e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0769  glycosyl transferase, group 1  31.4 
 
 		 358 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.660032  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0264  phosphatidylserine decarboxylase  35.29 
 
 		 341 aa  150  3e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.290494  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2139  putative lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyl transferase protein  30.86 
 
 		 364 aa  136  5e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1437  glycosyl transferase group 1  30.38 
 
 		 353 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0838  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.33 
 
 		 419 aa  107  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  41.72 
 
 		 367 aa  105  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003535  glycosyltransferase  33.17 
 
 		 394 aa  104  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0407  glycosyl transferase group 1  40.22 
 
 		 750 aa  102  7e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0389  glycosyl transferase group 1  31.67 
 
 		 359 aa  102  9e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1357  glycosyl transferase, group 1  25.61 
 
 		 364 aa  101  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1839  glycosyl transferase group 1  40.49 
 
 		 362 aa  100  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02226  hypothetical protein  31.11 
 
 		 394 aa  99.8  7e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3212  glycosyl transferase group 1  32.63 
 
 		 374 aa  98.6  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.283031  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2692  glycosyl transferase, group 1  27.78 
 
 		 367 aa  98.6  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000235502  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3257  glycosyl transferase group 1  30.32 
 
 		 426 aa  97.1  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0348  glycosyl transferase group 1  35.6 
 
 		 739 aa  95.5  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  25.93 
 
 		 398 aa  95.5  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.09 
 
 		 407 aa  94  3e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.728152  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4708  glycosyl transferase group 1  30.34 
 
 		 374 aa  94  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.392081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0826  glycosyl transferase group 1  28.16 
 
 		 350 aa  94  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0185  glycosyl tranferase  27.63 
 
 		 343 aa  93.6  5e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.472574  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0183  glycosyl transferase group 1  28.87 
 
 		 406 aa  93.6  5e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0358  glycosyl transferase group 1  31.82 
 
 		 364 aa  93.6  5e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.662771 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0238  glycosyl tranferase  27.63 
 
 		 343 aa  93.6  5e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0185  glycosyl transferase, group 1  28.87 
 
 		 406 aa  93.6  5e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0720154  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  31.64 
 
 		 414 aa  92.8  8e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1181  glycosyl transferase group 1  31.72 
 
 		 419 aa  92.8  8e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1099  glycosyl transferase, group 1  33.18 
 
 		 380 aa  92.8  8e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.209796  normal  0.0258816 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0158  glycosyl transferase, group 1  31.64 
 
 		 398 aa  92  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1276  glycosyl transferase group 1  26.48 
 
 		 378 aa  92.4  1e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.680838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2765  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.95 
 
 		 365 aa  92  1e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.367187  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3119  group 1 glycosyl transferase  28.89 
 
 		 400 aa  91.3  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2001  glycosyl transferase, group 1  30.22 
 
 		 380 aa  91.3  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0283  glycosyl transferase group 1  28.9 
 
 		 360 aa  91.7  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1964  glycosyl transferase group 1  28.63 
 
 		 385 aa  91.3  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0014923 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1475  glycosyl transferase  27.75 
 
 		 357 aa  90.9  3e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.16503  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1124  glycosyl transferase group 1  27.14 
 
 		 371 aa  90.5  4e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4436  glycosyl transferase group 1  38.85 
 
 		 377 aa  90.1  5e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1812  glycosyl transferase, group 1  34.2 
 
 		 406 aa  90.1  5e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1281  glycosyl transferase group 1  24.32 
 
 		 372 aa  89.4  8e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.282786  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5066  glycosyl transferase group 1  34.22 
 
 		 375 aa  89.4  8e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  30.57 
 
 		 424 aa  89  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1362  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.5 
 
 		 392 aa  89  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.881597  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0792  Fis family transcriptional regulator  26.27 
 
 		 342 aa  89  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  32.12 
 
 		 371 aa  88.2  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1908  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.5 
 
 		 392 aa  87.8  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1202  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.5 
 
 		 420 aa  88.6  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3096  glycosyl transferase group 1  23.86 
 
 		 361 aa  88.2  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4583  glycosyl transferase group 1  30.84 
 
 		 396 aa  88.6  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00660  glycosyltransferase  28.09 
 
 		 343 aa  88.6  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3055  glycosyl transferase, group 1  31.73 
 
 		 439 aa  88.6  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1433  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.31 
 
 		 409 aa  87.4  3e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.985375  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2547  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.81 
 
 		 396 aa  87.4  3e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.930254  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4999  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.51 
 
 		 367 aa  87.8  3e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1049  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.49 
 
 		 420 aa  87.4  3e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1696  glycosyl transferase group 1  26.23 
 
 		 406 aa  87.4  3e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0332  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.49 
 
 		 420 aa  87.4  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0265354  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0819  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.49 
 
 		 420 aa  87.4  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3364  glycosyl transferase, group 1  32.69 
 
 		 822 aa  87.8  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3930  glycosyl transferase group 1  30.34 
 
 		 412 aa  87  4e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0476116 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0624  glycosyl transferase group 1  31.25 
 
 		 379 aa  86.7  5e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.225322 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1604  glycosyl transferase group 1  24.86 
 
 		 362 aa  87  5e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000498756  normal  0.0753767 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1211  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.01 
 
 		 420 aa  86.3  6e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.417832  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3106  glycosyl transferase group 1  33.72 
 
 		 382 aa  86.3  8e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2072  glycosyl transferase group 1  28.44 
 
 		 374 aa  85.9  9e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1622  glycosyl transferase group 1  28.63 
 
 		 402 aa  85.1  0.000000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2180  glycosyl transferase group 1  33.74 
 
 		 376 aa  85.5  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4608  glycosyl transferase group 1  32.5 
 
 		 821 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0155  glycosyl transferase, group 1  23.22 
 
 		 361 aa  85.5  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1472  glycosyl transferase  25.41 
 
 		 363 aa  85.1  0.000000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.805759  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2519  putative lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyl transferase  30.77 
 
 		 384 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.050684 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0755  glycosyl transferase, group 1  33.67 
 
 		 420 aa  85.5  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00665755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2727  glycosyl transferase, group 1  28.07 
 
 		 401 aa  85.9  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2261  glycosyl transferase, group 1  36.11 
 
 		 410 aa  85.5  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0304  putative glycosyl transferase  26.51 
 
 		 426 aa  85.5  0.000000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2480  glycosyl transferase, group 1  34.48 
 
 		 346 aa  85.1  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.197524  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 		 376 aa  85.1  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2884  glycosyl transferase group 1  33.71 
 
 		 417 aa  84.7  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25641  glycosyl transferase, group 1  34.83 
 
 		 425 aa  84.7  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1976  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.3 
 
 		 373 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1310  group 1 glycosyl transferase  30.26 
 
 		 426 aa  84  0.000000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0388  glycosyl transferase group 1  27.01 
 
 		 350 aa  84.3  0.000000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2323  glycosyl transferase, group 1  25.09 
 
 		 378 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  28.73 
 
 		 387 aa  84.3  0.000000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3867  glycosyl transferase group 1  32.21 
 
 		 819 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.709637 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  27.03 
 
 		 378 aa  83.6  0.000000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1074  glycosyl transferase group 1  32.39 
 
 		 828 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.33543 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2492  glycosyl transferase, group 1  27.13 
 
 		 371 aa  83.2  0.000000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.637644  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1193  glycosyl transferase, group 1  24.32 
 
 		 371 aa  83.2  0.000000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66160  putative glycosyl transferase  35.03 
 
 		 378 aa  83.2  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.266324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0171  glycosyl transferase, group 1  27.34 
 
 		 419 aa  82.8  0.000000000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.7931  normal  0.13729 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2654  glycosyl transferase, group 1  27.03 
 
 		 388 aa  83.2  0.000000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0179694  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1751  glycosyl transferase group 1  32.28 
 
 		 453 aa  82.8  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2537  putative lipopolysaccharide biosynthesis- related glycosyltransferase  34.32 
 
 		 468 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.252035 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2808  glycosyl transferase group 1  29.2 
 
 		 424 aa  82.8  0.000000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0143  glycosyltransferase-like protein  28.65 
 
 		 371 aa  82.8  0.000000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>