More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1202 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_1202  ATPase central domain-containing protein  100 
 
 		 627 aa  1254    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0870142  normal  0.869838 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1566  AAA ATPase central domain protein  39.41 
 
 		 625 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.20815  hitchhiker  0.00245284 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1816  ATPase central domain-containing protein  35.58 
 
 		 590 aa  234  5e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1422  ATPase central domain-containing protein  38.08 
 
 		 715 aa  233  1e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5669  AAA ATPase central domain protein  40.78 
 
 		 699 aa  231  3e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.658199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0808  ATPase central domain-containing protein  38.35 
 
 		 715 aa  227  4e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0194  AAA ATPase central domain protein  31.25 
 
 		 619 aa  224  4e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.223838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0020  AAA ATPase, central region  33.39 
 
 		 697 aa  219  8.999999999999998e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.25118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0985  AAA ATPase central domain protein  34.67 
 
 		 683 aa  216  9e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0130271 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4675  ATPase central domain-containing protein  40.17 
 
 		 720 aa  212  2e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.760219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1361  AAA ATPase, central region  32.87 
 
 		 704 aa  205  2e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.252526  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1317  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.45 
 
 		 638 aa  197  7e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1115  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34 
 
 		 638 aa  195  2e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.48117  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1818  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.98 
 
 		 638 aa  195  2e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.192895  normal  0.442759 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4141  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.21 
 
 		 638 aa  195  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1034  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.93 
 
 		 510 aa  193  9e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2710  peptidase M41, FtsH  34.74 
 
 		 640 aa  191  5e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3506  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.93 
 
 		 638 aa  191  5e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4743  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.74 
 
 		 638 aa  190  7e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2059  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.82 
 
 		 639 aa  189  2e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6874  cell division protein FtsH  35.5 
 
 		 638 aa  187  7e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0972491 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0062  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.19 
 
 		 632 aa  184  6e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3083  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.27 
 
 		 640 aa  183  6e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.169453  normal  0.477403 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3638  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.83 
 
 		 640 aa  184  6e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.229892 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0793  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.78 
 
 		 611 aa  183  7e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000170708  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2412  membrane protease FtsH catalytic subunit  34.51 
 
 		 628 aa  183  1e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.278023  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0780  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.64 
 
 		 643 aa  182  1e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0715854 
 
 
-
 
NC_004310  BR1691  cell division protein FtsH  33.02 
 
 		 644 aa  182  2e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4509  membrane protease FtsH catalytic subunit  33.26 
 
 		 652 aa  182  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.112611 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4840  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.67 
 
 		 642 aa  182  2e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.199013  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0064  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.37 
 
 		 635 aa  182  2e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000323168  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1635  cell division protein FtsH  33.02 
 
 		 649 aa  182  2e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.771629  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5308  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.67 
 
 		 642 aa  182  2e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.496993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1223  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.79 
 
 		 651 aa  182  2e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.514183  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2636  cell division protein FtsH  32.22 
 
 		 641 aa  181  2.9999999999999997e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.235612  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2262  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.22 
 
 		 641 aa  181  2.9999999999999997e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.000000538209  hitchhiker  0.0000000171199 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2234  FtsH-2 peptidase  33.49 
 
 		 645 aa  181  4e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0163354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2318  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.22 
 
 		 633 aa  180  4.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0771513  normal  0.541776 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0665  membrane protease FtsH catalytic subunit  34.22 
 
 		 633 aa  180  4.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.735845  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4335  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.35 
 
 		 640 aa  181  4.999999999999999e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0962233 
 
 
-
 
NC_002978  WD1253  cell division protein FtsH  30.6 
 
 		 613 aa  180  5.999999999999999e-44  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0060  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.33 
 
 		 639 aa  180  7e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0063  cell division protein FtsH  33.33 
 
 		 633 aa  180  8e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4275  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.96 
 
 		 667 aa  180  8e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3167  membrane protease FtsH catalytic subunit  33.96 
 
 		 645 aa  180  8e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0347357  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5386  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.43 
 
 		 642 aa  180  8e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.853585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3196  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.72 
 
 		 643 aa  179  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.766379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0126  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.37 
 
 		 615 aa  179  1e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0860215  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3491  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.72 
 
 		 648 aa  179  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.202032  normal  0.0464003 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0642  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.36 
 
 		 616 aa  179  1e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05588  intermembrane space AAA protease IAP-1 (AFU_orthologue; AFUA_4G11530)  31.75 
 
 		 784 aa  178  2e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0276  ATP-dependent Zn protease  33.41 
 
 		 708 aa  179  2e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00629107  normal  0.162688 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0438  membrane protease FtsH catalytic subunit  33.57 
 
 		 673 aa  179  2e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000747191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0566  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.77 
 
 		 633 aa  178  3e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0842  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.89 
 
 		 644 aa  178  3e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0456572 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0423  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.84 
 
 		 636 aa  177  4e-43  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0072  cell division protein FtsH  32.89 
 
 		 633 aa  177  4e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.12055  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4937  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.69 
 
 		 623 aa  177  5e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.206394  normal  0.640617 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3627  metalloprotease  33.72 
 
 		 681 aa  177  6e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.840583  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0113  ATP-dependent zinc metallopeptidase - cell division protein  28.74 
 
 		 715 aa  177  7e-43  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0690  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.11 
 
 		 631 aa  177  7e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.827702  normal  0.407783 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1848  cell division protein FtsH  32.43 
 
 		 638 aa  176  8e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0064  cell division protein FtsH  32.89 
 
 		 633 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.651636  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0060  cell division protein  32.89 
 
 		 633 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0060  cell division protein  32.89 
 
 		 633 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.527958  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5244  cell division protein FtsH  32.89 
 
 		 633 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.293032 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4814  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.38 
 
 		 625 aa  176  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.726318 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0997  ATP-dependent zinc protease/ cell division protein  33.33 
 
 		 616 aa  176  9.999999999999999e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000353226  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0064  cell division protein FtsH  32.89 
 
 		 633 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.550597  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0076  cell division protein FtsH  32.89 
 
 		 633 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0454651  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2804  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.87 
 
 		 645 aa  176  9.999999999999999e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0073  cell division protein FtsH  32.89 
 
 		 633 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.755624 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2361  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.12 
 
 		 637 aa  176  9.999999999999999e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.698046  normal  0.908613 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1599  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.97 
 
 		 647 aa  176  9.999999999999999e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.238697 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2472  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.09 
 
 		 601 aa  176  9.999999999999999e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0060  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.11 
 
 		 633 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0879  FtsH peptidase  31.8 
 
 		 611 aa  175  1.9999999999999998e-42  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3548  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.33 
 
 		 682 aa  175  1.9999999999999998e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0555196  normal  0.0513542 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1098  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.17 
 
 		 610 aa  175  1.9999999999999998e-42  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0627303  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0470  cell division protein FtsH  31.96 
 
 		 658 aa  174  2.9999999999999996e-42  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0533  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.73 
 
 		 697 aa  174  2.9999999999999996e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.37995  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2733  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.66 
 
 		 671 aa  175  2.9999999999999996e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.622725  normal  0.113259 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1168  FtsH-2 peptidase  37.85 
 
 		 605 aa  175  2.9999999999999996e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.747317  normal  0.986179 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0624  ATP-dependent metalloprotease FtsH  37.85 
 
 		 605 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.365345 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2786  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.85 
 
 		 601 aa  175  2.9999999999999996e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0546  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.73 
 
 		 697 aa  174  2.9999999999999996e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0283  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.54 
 
 		 640 aa  174  5e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0191984 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1098  membrane protease FtsH catalytic subunit  32.62 
 
 		 640 aa  174  5.999999999999999e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.13074  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0150  cell division protein FtsH, putative  33.04 
 
 		 700 aa  173  6.999999999999999e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0064  FtsH peptidase  34.12 
 
 		 637 aa  173  6.999999999999999e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5491  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.54 
 
 		 640 aa  173  7.999999999999999e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.610912  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2020  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.62 
 
 		 628 aa  173  7.999999999999999e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.185769 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0200  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.49 
 
 		 602 aa  173  7.999999999999999e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0400462  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0087  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.11 
 
 		 620 aa  173  1e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1020  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.29 
 
 		 659 aa  173  1e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000208375  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3415  FtsH-2 peptidase  35.68 
 
 		 627 aa  172  1e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0278  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.92 
 
 		 616 aa  172  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0278  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.92 
 
 		 616 aa  172  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3656  AAA ATPase, central region  31.48 
 
 		 694 aa  172  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2623  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.55 
 
 		 645 aa  172  1e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>