More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3569 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_5325  Copper-exporting ATPase  44.12 
 
 		 823 aa  681    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0185531  normal  0.215692 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2482  Copper-exporting ATPase  46.02 
 
 		 799 aa  728    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.113169  normal  0.0738006 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3569  ATPase, P-type (transporting), HAD superfamily, subfamily IC  100 
 
 		 804 aa  1661    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.532443 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0679  E1-E2 ATPase-associated domain protein  44.25 
 
 		 797 aa  668    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.203098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2536  copper-exporting ATPase  43.32 
 
 		 795 aa  686    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1133  Cu(I)-translocating P-type ATPase  42.13 
 
 		 799 aa  658    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.710134  normal  0.817689 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02060  copper-translocating P-type ATPase  29.26 
 
 		 796 aa  338  1.9999999999999998e-91  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.600497  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1874  heavy metal translocating P-type ATPase  28.33 
 
 		 819 aa  329  1.0000000000000001e-88  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.439106  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0711  ATPase, E1-E2 type:copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  28.34 
 
 		 812 aa  328  3e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.139476  normal  0.239991 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1048  cation transporter E1-E2 family ATPase  29.28 
 
 		 790 aa  327  5e-88  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.582758  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1819  heavy metal translocating P-type ATPase  28.54 
 
 		 806 aa  327  8.000000000000001e-88  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.543484  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2068  heavy metal translocating P-type ATPase  28.5 
 
 		 791 aa  323  5e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2994  heavy metal translocating P-type ATPase  28.4 
 
 		 838 aa  323  8e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0164  heavy metal translocating P-type ATPase  28.62 
 
 		 846 aa  322  9.999999999999999e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.914587 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1960  heavy metal translocating P-type ATPase  28.71 
 
 		 828 aa  321  3.9999999999999996e-86  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2538  heavy metal translocating P-type ATPase  31.81 
 
 		 727 aa  318  2e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1790  heavy metal translocating P-type ATPase  28.23 
 
 		 815 aa  317  4e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003472  copper-translocating P-type ATPase  27.75 
 
 		 787 aa  317  5e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.154282  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1842  heavy metal translocating P-type ATPase  30.65 
 
 		 732 aa  316  9.999999999999999e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.21425  normal  0.57874 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02298  cation transport ATPase  27.66 
 
 		 787 aa  312  2e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3783  copper-translocating P-type ATPase  29.06 
 
 		 811 aa  311  2e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0413939  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1816  copper-translocating P-type ATPase  29.74 
 
 		 816 aa  310  9e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0267  copper-translocating P-type ATPase  28.5 
 
 		 797 aa  308  3e-82  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.594062  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19950  Copper-translocating P-type ATPase  28.61 
 
 		 800 aa  305  2.0000000000000002e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.677512  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1195  heavy metal translocating P-type ATPase  27.78 
 
 		 847 aa  305  2.0000000000000002e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1420  copper-translocating P-type ATPase  27.09 
 
 		 789 aa  305  3.0000000000000004e-81  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1990  heavy metal translocating P-type ATPase  27.17 
 
 		 807 aa  304  4.0000000000000003e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1102  heavy metal translocating P-type ATPase  27.83 
 
 		 847 aa  303  8.000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.165186  normal  0.905045 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5920  copper-translocating P-type ATPase  31.18 
 
 		 755 aa  303  9e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.509848 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1875  heavy metal translocating P-type ATPase  27.74 
 
 		 826 aa  303  1e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796141 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1275  heavy metal translocating P-type ATPase  28.76 
 
 		 839 aa  301  2e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1172  heavy metal translocating P-type ATPase  27.43 
 
 		 783 aa  302  2e-80  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2219  heavy metal translocating P-type ATPase  27.82 
 
 		 794 aa  301  3e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44440  putative cation-transporting P-type ATPase  28.11 
 
 		 811 aa  301  3e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.838322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2044  heavy metal translocating P-type ATPase  28.24 
 
 		 834 aa  301  4e-80  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000418772  normal  0.430312 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1274  cation-transporting ATPase lipoprotein transmembrane  27.97 
 
 		 851 aa  300  6e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3046  heavy metal translocating P-type ATPase  29.91 
 
 		 806 aa  300  6e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1231  heavy metal translocating P-type ATPase  29.58 
 
 		 806 aa  300  7e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1116  copper-translocating P-type ATPase  27.16 
 
 		 793 aa  299  1e-79  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0573  heavy metal translocating P-type ATPase  27.54 
 
 		 783 aa  298  2e-79  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.113758  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3826  heavy metal translocating P-type ATPase  29.43 
 
 		 824 aa  298  3e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1450  heavy metal translocating P-type ATPase  28.82 
 
 		 792 aa  298  3e-79  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0366901  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2081  heavy metal translocating P-type ATPase  28.07 
 
 		 808 aa  298  4e-79  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0785584  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0667  nitrogen fixation protein fixI  31.59 
 
 		 729 aa  298  4e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4261  heavy metal translocating P-type ATPase  29.56 
 
 		 882 aa  297  5e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0635  heavy metal translocating P-type ATPase  27.62 
 
 		 806 aa  296  8e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1369  heavy metal translocating P-type ATPase  27.85 
 
 		 814 aa  295  2e-78  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1607  heavy metal translocating P-type ATPase  29.31 
 
 		 824 aa  295  2e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.183906  normal  0.0233029 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2360  heavy metal translocating P-type ATPase  28.91 
 
 		 818 aa  294  4e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1291  heavy metal translocating P-type ATPase  27.2 
 
 		 783 aa  294  5e-78  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2043  ATPase, E1-E2 type:copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  28.52 
 
 		 849 aa  294  5e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138758  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2112  heavy metal translocating P-type ATPase  25.94 
 
 		 803 aa  291  2e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.237749  normal  0.362751 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1796  cation transporter E1-E2 family ATPase  27.61 
 
 		 795 aa  290  6e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.135451 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0540  heavy metal translocating P-type ATPase  30.54 
 
 		 737 aa  290  1e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1576  heavy metal translocating P-type ATPase  28.57 
 
 		 807 aa  289  1e-76  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1996  copper-translocating P-type ATPase  28.48 
 
 		 823 aa  289  2e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.369514  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2216  heavy metal translocating P-type ATPase  26.08 
 
 		 792 aa  288  2.9999999999999996e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0357  nitrogen fixation protein FixI, putative  29.42 
 
 		 752 aa  288  4e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2359  cation transporter E1-E2 family ATPase  25.72 
 
 		 799 aa  287  5.999999999999999e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3579  heavy metal translocating P-type ATPase  29.27 
 
 		 814 aa  286  7e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1237  heavy metal translocating P-type ATPase  28.62 
 
 		 807 aa  287  7e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0451  heavy metal translocating P-type ATPase  28.76 
 
 		 811 aa  286  1.0000000000000001e-75  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0831309  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3851  heavy metal translocating P-type ATPase  29.82 
 
 		 731 aa  285  3.0000000000000004e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2015  heavy metal translocating P-type ATPase  26.31 
 
 		 797 aa  284  5.000000000000001e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.467794  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2420  heavy metal translocating P-type ATPase  26.68 
 
 		 792 aa  283  7.000000000000001e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000019165  hitchhiker  0.00000435833 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2011  heavy metal translocating P-type ATPase  25.44 
 
 		 803 aa  283  7.000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000954051 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1339  heavy metal translocating P-type ATPase  28.38 
 
 		 807 aa  283  8.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.527377  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0690  copper-translocating P-type ATPase, RdxI  29.21 
 
 		 737 aa  283  8.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.247145  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0472  heavy metal translocating P-type ATPase  25.83 
 
 		 781 aa  283  9e-75  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2046  heavy metal translocating P-type ATPase  28.31 
 
 		 861 aa  282  2e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00504527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1526  heavy metal translocating P-type ATPase  29.5 
 
 		 738 aa  281  3e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4492  hypothetical protein  25.63 
 
 		 799 aa  281  3e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1177  copper-translocating P-type ATPase  28.75 
 
 		 807 aa  281  3e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2345  heavy metal translocating P-type ATPase  29.49 
 
 		 737 aa  281  3e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.289685  normal  0.231434 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2610  heavy metal translocating P-type ATPase  27.41 
 
 		 802 aa  281  3e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.116821  normal  0.696286 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2206  heavy metal translocating P-type ATPase  25.63 
 
 		 799 aa  281  3e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.107808  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0576  copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  25.06 
 
 		 817 aa  281  4e-74  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.176053  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1964  heavy metal translocating P-type ATPase  25.44 
 
 		 803 aa  281  4e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0125075 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3324  copper-translocating P-type ATPase  28.95 
 
 		 809 aa  281  5e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2219  heavy metal translocating P-type ATPase  25.5 
 
 		 799 aa  279  2e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000412933  normal  0.369074 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1568  putative cation-transporting ATPase  25.64 
 
 		 791 aa  278  3e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.758768  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2215  heavy metal translocating P-type ATPase  25.38 
 
 		 799 aa  278  4e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.948139  normal  0.364632 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3421  copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  28.47 
 
 		 824 aa  276  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0860043 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2416  cation transport ATPase  26.83 
 
 		 794 aa  276  1.0000000000000001e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2165  heavy metal translocating P-type ATPase  25.38 
 
 		 799 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0742745  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0463  copper-translocating P-type ATPase  29.04 
 
 		 752 aa  275  2.0000000000000002e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1954  heavy metal translocating P-type ATPase  25 
 
 		 799 aa  274  4.0000000000000004e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1155  heavy metal translocating P-type ATPase  28.93 
 
 		 728 aa  274  4.0000000000000004e-72  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.302273  normal  0.0837932 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0934  heavy metal translocating P-type ATPase  26.16 
 
 		 802 aa  271  5e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.701132  normal  0.512838 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2255  heavy metal translocating P-type ATPase  28.53 
 
 		 746 aa  270  5.9999999999999995e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.980827  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1813  heavy metal translocating P-type ATPase  27.5 
 
 		 809 aa  270  7e-71  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2479  putative cation transport P-type ATPase  30.21 
 
 		 765 aa  267  5e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.354353  normal  0.180774 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1994  copper-translocating P-type ATPase  28.36 
 
 		 752 aa  266  2e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3784  heavy metal translocating P-type ATPase  28.97 
 
 		 775 aa  265  2e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0161451  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2816  heavy metal translocating P-type ATPase  28.81 
 
 		 777 aa  265  2e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.102701  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1796  heavy metal translocating P-type ATPase  30.26 
 
 		 724 aa  265  3e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0465  heavy metal translocating P-type ATPase  28.83 
 
 		 743 aa  261  5.0000000000000005e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0752433  normal  0.273207 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1365  heavy metal translocating P-type ATPase  27.72 
 
 		 810 aa  260  6e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.576345 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2773  heavy metal translocating P-type ATPase  27.56 
 
 		 824 aa  259  1e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2393  nitrogen fixation protein FixI  27.63 
 
 		 787 aa  258  3e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>