59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3099 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3099  integrase family protein  100 
 
 		 441 aa  899    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.979662 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1729  hypothetical protein  35.97 
 
 		 404 aa  280  2e-74  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000763037 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1462  Tn5520-like integrase (transfer factor)  34.08 
 
 		 402 aa  224  2e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.174557  normal  0.0965208 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5173  integrase family protein  28.57 
 
 		 411 aa  162  2e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.54702 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03935  integrase  26.51 
 
 		 406 aa  122  9.999999999999999e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.439206  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00445  tyrosine type site-specific recombinase  26.68 
 
 		 405 aa  114  4.0000000000000004e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.459489  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6168  integrase family protein  27.52 
 
 		 411 aa  111  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1953  integrase family protein  25.73 
 
 		 405 aa  109  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.247559  normal  0.500213 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4202  integrase family protein  27.65 
 
 		 406 aa  105  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5531  integrase family protein  26.91 
 
 		 461 aa  101  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000000725821  normal  0.462507 
 
 
-
 
NC_002950  PG1454  integrase  24.49 
 
 		 409 aa  83.6  0.000000000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0952  integrase family protein  24.07 
 
 		 412 aa  83.6  0.000000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.571908  normal  0.0199815 
 
 
-
 
NC_002950  PG0819  integrase  24.49 
 
 		 409 aa  83.6  0.000000000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5219  integrase family protein  23.98 
 
 		 406 aa  82.8  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.759008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1768  hypothetical protein  25.53 
 
 		 433 aa  78.2  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00932927 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0145  integrase family protein  24.48 
 
 		 411 aa  76.3  0.0000000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.468231  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4345  phage integrase family protein  25.26 
 
 		 435 aa  74.7  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1600  phage integrase family protein  27.34 
 
 		 404 aa  72.4  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2366  integrase family protein  23.32 
 
 		 415 aa  69.3  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1113  integrase  24.65 
 
 		 407 aa  65.9  0.000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11843  putative transposase  23.09 
 
 		 416 aa  60.5  0.00000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.383494  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4262  integrase family protein  26.17 
 
 		 379 aa  57  0.0000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2018  integrase family protein  27.33 
 
 		 452 aa  53.9  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0660  integrase family protein  26.83 
 
 		 284 aa  53.5  0.000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3291  integrase family protein  24.86 
 
 		 450 aa  53.1  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.671392  normal  0.608056 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0539  integrase family protein  22 
 
 		 436 aa  53.1  0.000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.19804 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0890  integrase family protein  23.19 
 
 		 436 aa  52.8  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.304857  normal  0.483711 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0211  integrase family protein  25 
 
 		 384 aa  52  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000967186 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04051  site-specific recombinase, phage integrase family protein  26.83 
 
 		 415 aa  51.2  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2633  phage integrase family protein  27.74 
 
 		 419 aa  51.2  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04122  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.11 
 
 		 305 aa  50.8  0.00005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3592  phage integrase family protein  29.68 
 
 		 419 aa  50.4  0.00006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3474  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.47 
 
 		 296 aa  50.1  0.00009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.486058 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0173  tyrosine recombinase XerD  29.14 
 
 		 309 aa  48.1  0.0003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.861385  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1435  integrase  22.69 
 
 		 408 aa  47.8  0.0004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.102507 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5143  phage integrase family site specific recombinase  24.32 
 
 		 404 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0463539  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0820  integrase  20.24 
 
 		 400 aa  47  0.0007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1453  integrase  20.24 
 
 		 400 aa  47  0.0007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0974  integrase family protein  21.03 
 
 		 430 aa  46.6  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0711773  normal  0.0223597 
 
 
-
 
NC_011760  Mchl_5760  integrase family protein  25.31 
 
 		 291 aa  46.2  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0169  phage integrase family protein  26.74 
 
 		 282 aa  45.8  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0558238  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5872  integrase family protein  22.92 
 
 		 433 aa  45.8  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0884  integrase  26.47 
 
 		 302 aa  46.2  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.161871  hitchhiker  0.000000000000894527 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4851  integrase family protein  23.75 
 
 		 294 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1026  integrase family protein  26.16 
 
 		 283 aa  45.4  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000319361  normal  0.791294 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0218  integrase family protein  24 
 
 		 191 aa  45.4  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0399465 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2069  phage integrase family protein  21.75 
 
 		 419 aa  45.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0530977  n/a   
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5548  integrase family protein  26.28 
 
 		 289 aa  44.3  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3096  tyrosine recombinase XerD subunit  24.61 
 
 		 311 aa  44.3  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00033868  normal  0.385268 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1179  phage integrase family protein  24.16 
 
 		 398 aa  44.3  0.004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0294292  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0143  integrase IntI1 for transposon Tn21  27.27 
 
 		 337 aa  43.9  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4832  phage integrase  24.7 
 
 		 291 aa  43.9  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0120  integrase/recombinase  27.27 
 
 		 337 aa  43.9  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.400978 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0067  integrase/recombinase  27.27 
 
 		 337 aa  43.9  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.325485 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0092  integrase family protein  26.62 
 
 		 270 aa  43.5  0.007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.554655  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1780  phage integrase family protein  34.78 
 
 		 256 aa  43.5  0.008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000232909  n/a   
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_0617  phage integrase family site specific recombinase  24.32 
 
 		 329 aa  43.5  0.008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.0000798153  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1823  integrase family protein  34.78 
 
 		 253 aa  43.5  0.008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.987007  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_4000  phage integrase family protein  23.16 
 
 		 389 aa  43.1  0.009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>