More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2127 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2127  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 88 aa  182  1.0000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.38765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0945  two component LuxR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 232 aa  55.1  0.0000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_934  DNA-binding response regulator, LuxR family  47.27 
 
 		 232 aa  54.7  0.0000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.717523  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1063  LuxR family DNA-binding response regulator  45.45 
 
 		 232 aa  53.5  0.0000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.815436  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2437  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.4 
 
 		 218 aa  53.1  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1706  transcriptional regulator, LuxR family  42.11 
 
 		 913 aa  52.8  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3832  regulatory protein, LuxR  43.86 
 
 		 1336 aa  51.2  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.196603  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2635  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.4 
 
 		 217 aa  50.8  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000528497  hitchhiker  0.00476816 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2190  LuxR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 298 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.429309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4682  putative PAS/PAC sensor protein  41.79 
 
 		 192 aa  50.1  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.706561 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2047  LuxR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 301 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.909025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2916  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  45 
 
 		 905 aa  48.9  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.725762  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3717  LuxR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 299 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.314676 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1444  LuxR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 154 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.853985  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30580  LuxR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 268 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.706127 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2416  transcriptional regulator, LuxR family  35.38 
 
 		 115 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6085  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.85 
 
 		 217 aa  48.1  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2503  transcriptional regulator, LuxR family  35.38 
 
 		 115 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.176665  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3824  response regulator receiver  40.91 
 
 		 228 aa  47.8  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.206519  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33010  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  45.9 
 
 		 223 aa  47.8  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.163463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0288  LuxR family transcriptional regulator  42 
 
 		 114 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.408966  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4214  two component LuxR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 228 aa  47.8  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0601429  normal  0.0532868 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0314  regulatory protein LuxR  42 
 
 		 113 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0310  transcriptional regulator, LuxR family  42 
 
 		 114 aa  47.8  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.223489  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0299  transcriptional regulator, LuxR family  42 
 
 		 114 aa  47.8  0.00006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2244  transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 446 aa  47.8  0.00006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.793377  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0707  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.92 
 
 		 270 aa  47.4  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2911  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.14 
 
 		 209 aa  47  0.00008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63520  putative transcriptional regulator  40 
 
 		 227 aa  47  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.498884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4226  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.86 
 
 		 210 aa  47  0.00009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3596  transcriptional regulator, LuxR family  42.11 
 
 		 178 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.445896  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1205  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.36 
 
 		 212 aa  46.2  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3528  transcriptional regulator, LuxR family  42.11 
 
 		 178 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.993919  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3447  LuxR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 175 aa  46.2  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1568  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.42 
 
 		 211 aa  46.6  0.0001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0590  two component LuxR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 215 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5515  response regulator receiver protein  35.59 
 
 		 879 aa  46.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0430285  normal  0.701277 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0581  two component LuxR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 215 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1851  two component LuxR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 262 aa  46.6  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.467917  normal  0.53175 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1664  two component LuxR family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 218 aa  47  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.49018  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0603  two component LuxR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 215 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1584  regulatory protein, LuxR  43.55 
 
 		 916 aa  46.6  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0340  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.3 
 
 		 217 aa  45.4  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00614189  hitchhiker  0.00317709 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0098  transcriptional regulator, LuxR family  46.3 
 
 		 253 aa  45.4  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00697344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1772  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.86 
 
 		 262 aa  45.8  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2941  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.51 
 
 		 219 aa  45.8  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.911135  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3842  putative transcriptional regulator  36.36 
 
 		 268 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3531  LuxR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 257 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.272328  normal  0.49506 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1319  two component LuxR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 216 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0542522  decreased coverage  0.000972679 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3824  LuxR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 267 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00247699  normal  0.327982 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1129  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.29 
 
 		 231 aa  45.4  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1241  two component LuxR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 216 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000399601  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3796  two component LuxR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 209 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2812  transcriptional regulator, LuxR family  39.29 
 
 		 522 aa  46.2  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000674561  hitchhiker  0.0000653029 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3555  response regulator receiver protein  42.11 
 
 		 176 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0548987 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0062  LuxR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 275 aa  45.8  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4123  regulatory protein LuxR  30.43 
 
 		 111 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.736465  normal  0.0264155 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45250  putative transcriptional regulator  36.36 
 
 		 268 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3070  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.31 
 
 		 216 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000689776  unclonable  0.00000000000283062 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1285  two component LuxR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 216 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000337392  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2608  LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 269 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.237341  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1148  regulatory protein LuxR  34.78 
 
 		 921 aa  45.4  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.108504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0612  LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 252 aa  45.4  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3104  LuxR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 163 aa  45.4  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.218126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4514  LuxR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 263 aa  45.4  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0333975  normal  0.669249 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1878  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.8 
 
 		 208 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5384  two component response regulator  45.9 
 
 		 216 aa  45.1  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0027  DNA-binding transcriptional activator UhpA  39.06 
 
 		 197 aa  45.1  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2534  ATP-dependent transcription regulator LuxR  44.83 
 
 		 925 aa  45.1  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.41261  normal  0.169149 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1626  two component LuxR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 194 aa  45.1  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.947018 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1552  response regulator receiver protein  35.09 
 
 		 199 aa  45.1  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0154  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.51 
 
 		 244 aa  45.1  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5557  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.36 
 
 		 223 aa  45.1  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.496641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5726  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.07 
 
 		 228 aa  45.1  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.451347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1881  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.8 
 
 		 218 aa  44.7  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0160211  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1966  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.8 
 
 		 218 aa  44.7  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1229  response regulator receiver protein  41.07 
 
 		 212 aa  44.7  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.643884  hitchhiker  0.00799583 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4220  response regulator receiver protein  36.51 
 
 		 251 aa  44.7  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2791  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.44 
 
 		 213 aa  44.7  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0590322  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4209  LuxR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 266 aa  44.7  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.602642  normal  0.235438 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4346  ATP-dependent transcription regulator LuxR  41.38 
 
 		 921 aa  45.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.815962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1997  two component LuxR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 218 aa  44.7  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0211  two component LuxR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 228 aa  45.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.664514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4208  ATP-dependent transcription regulator LuxR  37.29 
 
 		 894 aa  44.7  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1854  transcriptional regulator, LuxR family  37.7 
 
 		 75 aa  44.7  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3105  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.22 
 
 		 223 aa  44.7  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5027  ATP-dependent transcription regulator LuxR  41.38 
 
 		 921 aa  45.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.381332  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11580  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  32.2 
 
 		 515 aa  44.7  0.0004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.937657  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12543  Transcriptional regulator  43.4 
 
 		 207 aa  44.7  0.0004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.204025  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5833  ATP-dependent transcription regulator LuxR  41.38 
 
 		 921 aa  45.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1936  regulatory protein LuxR  44.07 
 
 		 218 aa  44.3  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.548655  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1385  two component LuxR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 212 aa  44.7  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0180  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.64 
 
 		 216 aa  44.7  0.0005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.245465  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1700  two component LuxR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 213 aa  44.7  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226192 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4254  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.35 
 
 		 225 aa  44.7  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.867992  normal  0.287586 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0649  LuxR family two component transcriptional regulator  41.07 
 
 		 212 aa  44.7  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.93281  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2582  LuxR response regulator receiver  39.29 
 
 		 233 aa  44.3  0.0006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1345  putative transcriptional regulator  35.71 
 
 		 325 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.795893  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01320  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  39.34 
 
 		 261 aa  44.3  0.0006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1929  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.1 
 
 		 209 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142226  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>