More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2027 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_2027  heat shock protein Hsp20  100 
 
 
155 aa  320  4e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4951  heat shock protein Hsp20  34.04 
 
 
134 aa  78.6  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.260746  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0370  heat shock protein Hsp20  38.79 
 
 
140 aa  75.1  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.733353  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6221  heat shock protein Hsp20  38.53 
 
 
151 aa  72.4  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1127  heat shock protein Hsp20  41.28 
 
 
142 aa  70.9  0.000000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06090  small heat shock protein  35.42 
 
 
148 aa  70.1  0.00000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.473161  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3751  response regulator receiver protein  32.61 
 
 
150 aa  69.3  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.544355  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5151  heat shock protein Hsp20  35.07 
 
 
148 aa  67.4  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0184623  normal  0.32984 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3917  heat shock protein Hsp20  36.04 
 
 
142 aa  67  0.00000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0557  heat shock protein Hsp20  31.75 
 
 
147 aa  67  0.00000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0117197  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1892  HSP20 family protein  35.9 
 
 
132 aa  66.2  0.0000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.684879  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0543  heat shock protein Hsp20  30.95 
 
 
147 aa  66.2  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0340696  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3527  putative HspC2 heat shock protein  36.7 
 
 
173 aa  65.9  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0868338  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6319  heat shock protein Hsp20  31.3 
 
 
149 aa  63.9  0.0000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2938  heat shock protein Hsp20  40.86 
 
 
145 aa  63.5  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000491843  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3314  HSP20 family protein  30.77 
 
 
151 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.284188 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4395  heat shock protein Hsp20  31.67 
 
 
181 aa  61.6  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.481666  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2022  heat shock protein Hsp20  38.78 
 
 
141 aa  62  0.000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4528  heat shock protein Hsp20  31.67 
 
 
181 aa  61.6  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.550609  normal  0.0462291 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0924  heat shock protein  31.67 
 
 
180 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2899  heat shock protein Hsp20  34.86 
 
 
145 aa  61.2  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0174584 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0513  heat shock protein Hsp20  30.43 
 
 
147 aa  60.8  0.000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1373  small heat shock protein  38.1 
 
 
159 aa  60.8  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.272184 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1029  Hsp20/alpha crystallin family protein  30.83 
 
 
146 aa  60.8  0.000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00339514  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2316  heat shock protein Hsp20  32.26 
 
 
139 aa  60.8  0.000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0611291  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0610  heat shock protein Hsp20  32.79 
 
 
136 aa  60.8  0.000000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.335952  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0102  heat shock protein Hsp20  34.68 
 
 
142 aa  60.5  0.000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4859  heat shock protein Hsp20  31.58 
 
 
204 aa  60.5  0.000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2106  HSP20 family protein  30.43 
 
 
145 aa  60.1  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.291359  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2262  HSP20 family protein  30.43 
 
 
145 aa  60.1  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.378643  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1018  heat shock protein Hsp20  28.57 
 
 
177 aa  60.5  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.683731  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2159  heat shock protein Hsp20  35.48 
 
 
139 aa  60.1  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0146906  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1977  heat shock protein Hsp20  32.71 
 
 
139 aa  60.1  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.334288  normal  0.643075 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2746  heat shock protein Hsp20  38.1 
 
 
168 aa  59.7  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.145564  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0588  heat shock protein, molecular chaperone  35.14 
 
 
141 aa  60.1  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.648467  n/a   
 
 
-
 
NC_008501  STER_B1  molecular chaperone (small heat shock protein)  32.8 
 
 
142 aa  60.1  0.00000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1697  hypothetical protein  33.64 
 
 
145 aa  60.1  0.00000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4132  heat shock protein Hsp20  32.11 
 
 
144 aa  59.7  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2796  heat shock protein  33.61 
 
 
152 aa  59.3  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.300285  normal  0.746249 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4413  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
150 aa  59.3  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1660  heat shock protein Hsp20  30.37 
 
 
145 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.870911  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0836  heat shock protein Hsp20  30 
 
 
149 aa  59.7  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.414458 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2045  heat shock protein  30.43 
 
 
145 aa  58.9  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00409698  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2242  heat shock protein, Hsp20 family  30.58 
 
 
145 aa  58.9  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00889609  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2287  heat shock protein, Hsp20 family  30.43 
 
 
145 aa  58.9  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.58706e-24 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3394  heat shock protein Hsp20  29.09 
 
 
189 aa  58.5  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0219016  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2290  HSP20 family protein  30.43 
 
 
145 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.581771  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2043  heat shock protein  31.4 
 
 
145 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467829  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0762  heat shock protein Hsp20  37 
 
 
134 aa  58.2  0.00000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0233  small heat shock protein  38.78 
 
 
145 aa  58.2  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.818598  normal  0.0970629 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2372  heat shock protein, Hsp20 family  30.43 
 
 
145 aa  58.2  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0601479  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2326  heat shock protein Hsp20  35.45 
 
 
144 aa  58.2  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0663504 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2287  heat shock protein Hsp20  28.18 
 
 
189 aa  57  0.00000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3460  heat shock protein Hsp20  38.54 
 
 
137 aa  57  0.00000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.895888  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0410  heat shock protein Hsp20  35.51 
 
 
155 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.390221  normal  0.0922711 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25770  heat shock Hsp20 protein  30 
 
 
198 aa  56.6  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3125  heat shock protein Hsp20  32.73 
 
 
149 aa  56.6  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0369  HSP20 family protein  30.28 
 
 
153 aa  56.6  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.93231e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1509  heat shock protein Hsp20  33.02 
 
 
148 aa  56.6  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000196437  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2210  heat shock protein Hsp20  34.58 
 
 
139 aa  56.2  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0417447  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2281  heat shock protein Hsp20  26.77 
 
 
173 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.78764  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09080  molecular chaperone (small heat shock protein)  26.62 
 
 
145 aa  56.2  0.0000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.675828  normal  0.433955 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0719  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
137 aa  55.8  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00433386  normal  0.504335 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0756  heat shock protein Hsp20  38.3 
 
 
132 aa  55.8  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.16256 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3256  heat shock protein Hsp20  28 
 
 
153 aa  56.2  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3903  heat shock protein Hsp20  30.3 
 
 
194 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.534424 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2074  heat shock protein Hsp20  30.6 
 
 
173 aa  56.2  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.145284  normal  0.308358 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3468  heat shock protein Hsp20  32.2 
 
 
148 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.282569  normal  0.556723 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2635  heat shock protein Hsp20  32.2 
 
 
148 aa  56.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2132  heat shock protein Hsp20  35.42 
 
 
164 aa  56.2  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.585874 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0774  heat shock protein Hsp20  28.8 
 
 
139 aa  55.5  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0622  HSP20 family protein  35 
 
 
132 aa  55.1  0.0000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2522  heat shock protein Hsp20  32.67 
 
 
150 aa  55.1  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0445  heat shock protein Hsp20  35.43 
 
 
150 aa  55.1  0.0000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0343  HSP20 family protein  34.65 
 
 
146 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.439722  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0200  heat shock protein Hsp20  29.27 
 
 
176 aa  54.7  0.0000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.377048  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3389  HSP20 family protein  34.65 
 
 
146 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.134829  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1204  HSP20 family protein  34.65 
 
 
146 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2615  HSP20 family protein  34.65 
 
 
146 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.696707  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3428  HSP20 family protein  34.65 
 
 
146 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000574786  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3424  HSP20 family protein  34.65 
 
 
146 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1738  small HspC2 heat shock protein  28.36 
 
 
189 aa  54.3  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.267785  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2798  small HspC2 heat shock protein  28.36 
 
 
189 aa  54.3  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.159343  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2049  heat shock protein Hsp20  29.91 
 
 
164 aa  54.3  0.0000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.0000140473  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0865  heat shock protein Hsp20  36 
 
 
134 aa  54.7  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.303654  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1971  heat shock protein Hsp20  37.14 
 
 
154 aa  54.3  0.0000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2384  heat shock protein Hsp20  31.3 
 
 
164 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1171  heat shock protein Hsp20  26.36 
 
 
189 aa  54.3  0.0000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.726376  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3078  heat shock protein Hsp20  33.64 
 
 
145 aa  53.9  0.0000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000700712  normal  0.0754711 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2860  heat shock protein Hsp20  29.46 
 
 
184 aa  53.9  0.0000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.793853  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3805  heat shock protein Hsp20  31.03 
 
 
158 aa  53.9  0.0000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.232205  normal  0.564168 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3724  heat shock protein Hsp20  31.19 
 
 
185 aa  53.9  0.0000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0629  heat shock protein Hsp20  26.36 
 
 
189 aa  53.9  0.0000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.185609 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3680  heat shock protein Hsp20  31.19 
 
 
185 aa  53.9  0.0000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.626967 
 
 
-
 
NC_002936  DET0954  Hsp20/alpha crystallin family protein  32.11 
 
 
162 aa  53.5  0.0000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.154946  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3882  heat shock protein Hsp20  30.91 
 
 
158 aa  53.9  0.0000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.545217  normal  0.180827 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0982  HSP20 family protein  28.18 
 
 
176 aa  53.1  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19940  molecular chaperone (small heat shock protein)  32 
 
 
149 aa  53.1  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.618399  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2505  heat shock protein Hsp20  30.91 
 
 
138 aa  53.1  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.239492  normal  0.0462479 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2790  heat shock protein Hsp20  31.72 
 
 
149 aa  53.5  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000163808  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>