212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_16850 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_16850  Helix-turn-helix protein  100 
 
 		 280 aa  555  1e-157  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.950659  normal  0.0208664 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2024  putative transcriptional regulator, XRE family  56.68 
 
 		 286 aa  275  4e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3112  helix-turn-helix domain protein  55.11 
 
 		 279 aa  270  2e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000518579 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4244  helix-turn-helix domain protein  53.55 
 
 		 287 aa  261  1e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.649143  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2575  helix-turn-helix domain protein  54.01 
 
 		 280 aa  258  6e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1333  transcriptional regulator, XRE family  51.44 
 
 		 279 aa  252  5.000000000000001e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4458  transcriptional regulator, XRE family  51.09 
 
 		 272 aa  251  6e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2366  transcriptional regulator, XRE family  52.19 
 
 		 279 aa  251  7e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.828638 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3785  helix-turn-helix domain-containing protein  52.88 
 
 		 285 aa  251  8.000000000000001e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.48754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1062  XRE family transcriptional regulator  54.44 
 
 		 289 aa  251  1e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0700  transcriptional regulator, XRE family  52.19 
 
 		 279 aa  250  2e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4662  helix-turn-helix domain protein  49.1 
 
 		 287 aa  250  2e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.232766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1305  XRE family transcriptional regulator  52.17 
 
 		 287 aa  243  1.9999999999999999e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.151615 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1995  helix-turn-helix domain protein  52.38 
 
 		 289 aa  238  9e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.43554  normal  0.235514 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4999  transcriptional regulator, XRE family  48.68 
 
 		 301 aa  233  4.0000000000000004e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.662496 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4040  helix-turn-helix domain protein  52.16 
 
 		 300 aa  231  9e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0557153  normal  0.034342 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6833  helix-turn-helix domain protein  46.07 
 
 		 292 aa  231  1e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4173  transcriptional regulator, XRE family  50.73 
 
 		 280 aa  229  5e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4188  transcriptional regulator, XRE family  50.78 
 
 		 298 aa  228  1e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3573  helix-turn-helix domain-containing protein  50 
 
 		 281 aa  224  1e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.75785 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2374  helix-turn-helix domain-containing protein  49.82 
 
 		 301 aa  221  8e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.171601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5566  helix-turn-helix domain protein  43.68 
 
 		 281 aa  186  3e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7620  putative transcriptional regulator, XRE family  42.45 
 
 		 278 aa  180  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.350779  normal  0.254497 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7046  helix-turn-helix domain protein  41.43 
 
 		 278 aa  175  9e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4578  transcriptional regulator, XRE family  41.25 
 
 		 293 aa  158  8e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.78291  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1893  helix-turn-helix domain protein  40.23 
 
 		 285 aa  157  1e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.72148  normal  0.792434 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0409  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 303 aa  154  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.481492 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7348  hypothetical protein  40.79 
 
 		 291 aa  151  8.999999999999999e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3948  hypothetical protein  35.53 
 
 		 287 aa  151  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00019593  normal  0.0172925 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5465  XRE family transcriptional regulator  42.7 
 
 		 285 aa  150  2e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.140263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5457  helix-turn-helix domain-containing protein  38.83 
 
 		 317 aa  150  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.669128 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4130  transcriptional regulator, XRE family  39.93 
 
 		 292 aa  150  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.32419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6984  helix-turn-helix domain protein  39.78 
 
 		 286 aa  149  5e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.118873  normal  0.27222 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2441  transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 		 275 aa  148  9e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2417  transcriptional regulator, XRE family  40.61 
 
 		 278 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.067854 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1970  transcriptional regulator, XRE family  39.15 
 
 		 302 aa  147  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.997663  normal  0.568144 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4035  transcriptional regulator, XRE family  40.15 
 
 		 326 aa  146  3e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.808008  normal  0.21338 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1361  XRE family transcriptional regulator  39.54 
 
 		 282 aa  146  3e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.108942  hitchhiker  0.000206797 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0492  helix-turn-helix domain protein  40.93 
 
 		 302 aa  145  5e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.107482 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4659  transcriptional regulator, XRE family  40.07 
 
 		 309 aa  145  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.14041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0524  hypothetical protein  30 
 
 		 276 aa  145  1e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3374  transcriptional regulator, XRE family  38.91 
 
 		 310 aa  144  1e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2460  transcriptional regulator, XRE family  36.3 
 
 		 313 aa  144  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4588  XRE family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 286 aa  144  2e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000221272 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3153  transcriptional regulator, XRE family  39.03 
 
 		 290 aa  144  2e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3227  helix-turn-helix domain protein  38.22 
 
 		 277 aa  142  4e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20270  hypothetical protein  39.76 
 
 		 277 aa  142  4e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.161196 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2377  transcriptional regulator, XRE family  38.63 
 
 		 283 aa  142  6e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000201287  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2649  helix-turn-helix domain-containing protein  34.33 
 
 		 303 aa  142  8e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.21777  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2389  helix-turn-helix domain protein  38.49 
 
 		 311 aa  141  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00160745  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0266  XRE family transcriptional regulator  39.38 
 
 		 301 aa  140  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0169  helix-turn-helix domain-containing protein  41.83 
 
 		 289 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.359668 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7725  helix-turn-helix domain protein  39.85 
 
 		 299 aa  140  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.998664 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3579  helix-turn-helix domain protein  36.06 
 
 		 280 aa  140  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.274459 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1403  helix-turn-helix domain-containing protein  39.38 
 
 		 282 aa  139  6e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.425851 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7747  helix-turn-helix domain protein  38.22 
 
 		 276 aa  137  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0180  XRE family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 288 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.3526  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0189  helix-turn-helix domain-containing protein  40.82 
 
 		 288 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.587332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1586  transcriptional regulator, XRE family  38.35 
 
 		 317 aa  135  6.0000000000000005e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3963  transcriptional regulator, XRE family  38.43 
 
 		 314 aa  135  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.588819  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1269  XRE family transcriptional regulator  40.93 
 
 		 264 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0313  XRE family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 299 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.292673  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1464  helix-turn-helix domain-containing protein  35.55 
 
 		 301 aa  134  9.999999999999999e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0367  helix-turn-helix domain protein  40.47 
 
 		 284 aa  133  3.9999999999999996e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.312267  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3985  XRE family transcriptional regulator  36.33 
 
 		 279 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0640193  normal  0.244933 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2784  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 284 aa  132  3.9999999999999996e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.583087  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6085  transcriptional regulator, XRE family  37.73 
 
 		 291 aa  132  5e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.126069 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3280  helix-turn-helix domain protein  36.06 
 
 		 280 aa  132  6e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0902  XRE family transcriptional regulator  39.1 
 
 		 284 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.477042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0289  transcriptional regulator, XRE family  36.59 
 
 		 318 aa  131  1.0000000000000001e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.604604  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3092  helix-turn-helix domain protein  37.59 
 
 		 287 aa  131  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3241  XRE family transcriptional regulator  38.58 
 
 		 299 aa  130  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3682  helix-turn-helix domain protein  36.46 
 
 		 307 aa  130  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3623  hypothetical protein  38.18 
 
 		 280 aa  130  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.325656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3277  helix-turn-helix domain protein  37.32 
 
 		 294 aa  129  4.0000000000000003e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2702  helix-turn-helix domain protein  37.93 
 
 		 284 aa  129  5.0000000000000004e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.590252 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31240  Helix-turn-helix protein  36.2 
 
 		 290 aa  129  7.000000000000001e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2521  helix-turn-helix domain protein  36.4 
 
 		 285 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.895975  hitchhiker  0.00158212 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4218  XRE family transcriptional regulator  38.4 
 
 		 289 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.53157  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4284  XRE family transcriptional regulator  38.4 
 
 		 289 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4445  XRE family transcriptional regulator  37.22 
 
 		 289 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.926883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3720  putative transcriptional regulator, XRE family  38.1 
 
 		 297 aa  128  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.813332  normal  0.425271 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0445  XRE family transcriptional regulator  36.57 
 
 		 296 aa  127  3e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1288  XRE family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 295 aa  126  3e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.153102  normal  0.2669 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1568  transcriptional regulator, XRE family  36.2 
 
 		 304 aa  125  7e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5666  putative transcriptional regulator, XRE family  35.93 
 
 		 273 aa  125  8.000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4080  XRE family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 312 aa  125  8.000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0766168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2101  helix-turn-helix domain protein  37.36 
 
 		 293 aa  125  9e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3008  helix-turn-helix domain protein  35.82 
 
 		 303 aa  124  1e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000207491 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2980  transcriptional regulator, XRE family  32.96 
 
 		 271 aa  124  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.239716  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1979  transcriptional regulator, XRE family  34.81 
 
 		 277 aa  124  2e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1690  transcriptional regulator, XRE family  38.97 
 
 		 305 aa  123  3e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.33559  normal  0.186529 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4719  XRE family transcriptional regulator  35.74 
 
 		 285 aa  123  4e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3644  XRE family transcriptional regulator  35.74 
 
 		 285 aa  123  4e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.560718 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4269  helix-turn-helix domain protein  37.69 
 
 		 279 aa  123  4e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0718578  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2137  helix-turn-helix domain protein  34.21 
 
 		 283 aa  122  5e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.291672  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4077  helix-turn-helix domain protein  34.7 
 
 		 275 aa  122  6e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.344536  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4317  helix-turn-helix domain protein  36.63 
 
 		 257 aa  122  6e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2467  XRE family transcriptional regulator  35.93 
 
 		 285 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.615257 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3065  helix-turn-helix domain protein  37.27 
 
 		 276 aa  121  9.999999999999999e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>