More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_06420 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_06420  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  100 
 
 		 582 aa  1165    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.104627  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3403  ABC transporter related  49.39 
 
 		 538 aa  494  9.999999999999999e-139  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2656  ABC transporter related  39.27 
 
 		 552 aa  390  1e-107  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.474901 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0463  ABC transporter, ATP-binding protein  36.81 
 
 		 609 aa  377  1e-103  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2826  ABC transporter related  38.55 
 
 		 572 aa  375  1e-102  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0515832  normal  0.0638843 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0900  glutathione transporter ATP-binding protein  37.54 
 
 		 623 aa  369  1e-101  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0980  glutathione transporter ATP-binding protein  37.71 
 
 		 629 aa  370  1e-101  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00796  fused predicted peptide transport subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  37.61 
 
 		 612 aa  369  1e-100  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.885832  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2813  ABC transporter related protein  37.54 
 
 		 623 aa  369  1e-100  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.666718  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00813  hypothetical protein  37.61 
 
 		 612 aa  369  1e-100  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.991571  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2519  glutathione transporter ATP-binding protein  37.37 
 
 		 623 aa  366  1e-100  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.503965  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1407  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATP-binding protein-like protein  39.29 
 
 		 630 aa  369  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0243275  normal  0.190368 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4657  ABC transporter related  38.19 
 
 		 605 aa  366  1e-100  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.168066  normal  0.490255 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2815  glutathione transporter ATP-binding protein  37.44 
 
 		 623 aa  365  1e-99  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.990596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0887  glutathione transporter ATP-binding protein  37.44 
 
 		 623 aa  365  1e-99  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0854  glutathione transporter ATP-binding protein  37.26 
 
 		 623 aa  365  2e-99  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1323  glutathione transporter ATP-binding protein  37.35 
 
 		 623 aa  364  2e-99  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3002  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  38.75 
 
 		 625 aa  362  1e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0999  glutathione transporter ATP-binding protein  36.96 
 
 		 623 aa  361  2e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.666718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0978  glutathione transporter ATP-binding protein  36.96 
 
 		 623 aa  361  2e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4266  ABC transporter related  39.78 
 
 		 548 aa  361  2e-98  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2402  ABC transporter related  38.38 
 
 		 615 aa  361  2e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5697  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  38.78 
 
 		 568 aa  361  2e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.110547  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2456  ABC transporter related  41.54 
 
 		 566 aa  361  3e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0889  glutathione transporter ATP-binding protein  36.96 
 
 		 623 aa  360  3e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.448185  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1528  ABC transporter related  37.54 
 
 		 583 aa  360  3e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0916  glutathione transporter ATP-binding protein  36.96 
 
 		 623 aa  360  5e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0502  ABC transporter related  38.74 
 
 		 567 aa  359  7e-98  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.348202  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1490  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  37.37 
 
 		 633 aa  359  9e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.281538  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1646  ABC transporter-like protein protein  37.5 
 
 		 549 aa  359  9e-98  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.495994  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001975  peptide ABC transporter ATP-binding protein  38.28 
 
 		 571 aa  359  9e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.175781  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4326  ABC transporter related  39.78 
 
 		 548 aa  358  9.999999999999999e-98  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0444322  normal  0.0426067 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3513  ABC transporter related protein  38.78 
 
 		 541 aa  358  9.999999999999999e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.709638  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0561  ABC transporter for peptide ATP-binding protein  37.56 
 
 		 566 aa  357  2.9999999999999997e-97  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1631  ABC transporter related  35.86 
 
 		 578 aa  357  3.9999999999999996e-97  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0681506 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0949  glutathione transporter ATP-binding protein  36.79 
 
 		 623 aa  357  3.9999999999999996e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00492  ABC transporter ATPase component  37.93 
 
 		 571 aa  357  5e-97  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08440  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  38.04 
 
 		 599 aa  356  5.999999999999999e-97  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.508486  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4108  ABC transporter related  38.41 
 
 		 612 aa  356  5.999999999999999e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3912  ABC transporter related protein  38.73 
 
 		 594 aa  356  7.999999999999999e-97  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5362  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  36.35 
 
 		 611 aa  355  1e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2970  ABC transporter related  39.11 
 
 		 538 aa  355  1e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.382736  normal  0.018129 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1038  ABC transporter related  39.01 
 
 		 545 aa  355  1e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.448383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4052  ABC transporter related  37.6 
 
 		 612 aa  355  1e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0831351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3008  ABC transporter related  38.65 
 
 		 576 aa  354  2e-96  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.558778 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4377  ABC transporter related  38.39 
 
 		 534 aa  355  2e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1810  ABC transporter related  37.82 
 
 		 566 aa  355  2e-96  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.295405  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1562  ABC peptide transporter, duplicated ATPase subunits  40.72 
 
 		 571 aa  355  2e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0668  ABC transporter related  40.56 
 
 		 534 aa  353  4e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4590  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  38.41 
 
 		 625 aa  353  4e-96  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0191447  normal  0.806618 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0625  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  37.44 
 
 		 623 aa  353  4e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1510  ABC transporter related  37.44 
 
 		 539 aa  353  5e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7555  ABC transporter, ATP-binding protein  39.01 
 
 		 544 aa  353  5.9999999999999994e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.665329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1510  ABC transporter related  39.79 
 
 		 534 aa  353  7e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.706226  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4397  ABC transporter related protein  38.01 
 
 		 623 aa  352  8e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0655491  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5077  ABC transporter related  36.64 
 
 		 549 aa  352  8e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.704503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1496  ABC transporter related  37.91 
 
 		 532 aa  352  1e-95  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0835  ABC oligopeptide/dipeptide transporter, duplicated ATPase subunits  37.92 
 
 		 640 aa  352  1e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.155262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3570  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  38.23 
 
 		 633 aa  352  1e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.15689 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3131  ABC transporter related  37.98 
 
 		 640 aa  352  1e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.022829  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2915  ABC transporter related  38.79 
 
 		 540 aa  352  1e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0265985  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3970  ABC transporter related  38.81 
 
 		 640 aa  352  1e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0719  putative dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter, ATP-binding protein  37.25 
 
 		 608 aa  351  2e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11080  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  38.26 
 
 		 643 aa  351  2e-95  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4108  ABC transporter related  37.84 
 
 		 623 aa  351  2e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.486076  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1550  ABC transporter-related protein  37.46 
 
 		 625 aa  351  2e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1648  ABC transporter related  38.62 
 
 		 538 aa  350  4e-95  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1310  ABC transporter related  39.29 
 
 		 544 aa  350  4e-95  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0559382  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4080  ABC transporter related  37.11 
 
 		 542 aa  350  5e-95  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4819  ABC transporter related  38.69 
 
 		 619 aa  349  7e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0993193 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4026  ABC transporter related  36.36 
 
 		 546 aa  349  7e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.393631  normal  0.697509 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2975  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  36.86 
 
 		 633 aa  349  9e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2537  ABC transporter related  38.37 
 
 		 573 aa  349  9e-95  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000203549 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4130  ABC transporter related  37.5 
 
 		 561 aa  348  1e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1868  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter ATPase  38.11 
 
 		 633 aa  348  1e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.425351  normal  0.360744 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4390  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  38.3 
 
 		 619 aa  348  1e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.394233 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6678  ABC transporter related  37.74 
 
 		 562 aa  348  2e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.736042 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1962  ABC transporter related protein  38.62 
 
 		 573 aa  348  2e-94  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1617  ABC transporter-related protein  37.8 
 
 		 547 aa  348  2e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.683358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1147  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  37.38 
 
 		 676 aa  348  2e-94  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2614  ABC transporter related  38.09 
 
 		 595 aa  348  2e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4251  ABC transporter related  37.91 
 
 		 558 aa  348  2e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.214566 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19880  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain protein  40.92 
 
 		 551 aa  347  3e-94  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00329982  hitchhiker  0.000556762 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1318  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  36.95 
 
 		 629 aa  347  4e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0144402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1149  ABC transporter related  39.06 
 
 		 546 aa  347  4e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.108293 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5559  ABC transporter related  36.59 
 
 		 570 aa  347  5e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.153225  normal  0.0799333 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1407  ABC transporter related  38.14 
 
 		 550 aa  347  5e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.288538  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3657  ABC transporter related  38.22 
 
 		 540 aa  347  5e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3632  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  36.64 
 
 		 691 aa  347  5e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.208084  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1656  ABC transporter related  38.24 
 
 		 613 aa  347  5e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.211709  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1195  Sulfate-transporting ATPase  38.82 
 
 		 552 aa  346  6e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0751  ABC transporter related  39.02 
 
 		 557 aa  346  8e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5294  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (peptide)  37.04 
 
 		 549 aa  345  1e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.26421  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2574  ABC transporter related  39.06 
 
 		 552 aa  345  1e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3871  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  36.63 
 
 		 617 aa  345  2e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2056  ABC transporter related  37.05 
 
 		 580 aa  344  2e-93  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.344396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1252  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  36.86 
 
 		 629 aa  344  2e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0894712  normal  0.866591 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3805  ABC transporter related  38.14 
 
 		 611 aa  344  2.9999999999999997e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.503567  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0423  ABC transporter related  38.16 
 
 		 554 aa  344  2.9999999999999997e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6641  ABC transporter related  37.44 
 
 		 542 aa  343  4e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.274459 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>