More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_2056 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_2056  ABC transporter related  100 
 
 
580 aa  1188    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.344396  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3008  ABC transporter related  72.02 
 
 
576 aa  850    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.558778 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3513  ABC transporter related protein  38.59 
 
 
541 aa  371  1e-101  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.709638  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3403  ABC transporter related  38.81 
 
 
538 aa  367  1e-100  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1962  ABC transporter related protein  38.23 
 
 
573 aa  367  1e-100  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2819  ABC transporter related  37.08 
 
 
571 aa  363  4e-99  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.810211  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3273  acetamidase/formamidase  40.45 
 
 
592 aa  361  2e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5232  ABC transporter related  39.86 
 
 
552 aa  361  2e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01760  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  38.96 
 
 
584 aa  360  4e-98  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0916  glutathione transporter ATP-binding protein  38.29 
 
 
623 aa  360  5e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0889  glutathione transporter ATP-binding protein  38.29 
 
 
623 aa  360  6e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.448185  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0999  glutathione transporter ATP-binding protein  38.11 
 
 
623 aa  360  6e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.666718  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0978  glutathione transporter ATP-binding protein  38.29 
 
 
623 aa  359  6e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2563  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  36.91 
 
 
571 aa  359  7e-98  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000295279  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0423  ABC transporter related  38.52 
 
 
554 aa  357  1.9999999999999998e-97  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2813  ABC transporter related protein  37.46 
 
 
623 aa  357  2.9999999999999997e-97  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.666718  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0854  glutathione transporter ATP-binding protein  37.7 
 
 
623 aa  357  2.9999999999999997e-97  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00796  fused predicted peptide transport subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  37.52 
 
 
612 aa  356  5e-97  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.885832  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0887  glutathione transporter ATP-binding protein  37.7 
 
 
623 aa  356  5e-97  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2815  glutathione transporter ATP-binding protein  37.7 
 
 
623 aa  356  5e-97  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.990596  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00813  hypothetical protein  37.52 
 
 
612 aa  356  5e-97  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.991571  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3986  ABC transporter related  39.89 
 
 
592 aa  357  5e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11080  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  35.6 
 
 
643 aa  357  5e-97  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2519  glutathione transporter ATP-binding protein  37.46 
 
 
623 aa  356  5.999999999999999e-97  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.503965  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0949  glutathione transporter ATP-binding protein  38.11 
 
 
623 aa  356  5.999999999999999e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3252  peptide ABC transporter ATPase  39.7 
 
 
592 aa  356  5.999999999999999e-97  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0900  glutathione transporter ATP-binding protein  37.46 
 
 
623 aa  356  5.999999999999999e-97  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2537  ABC transporter related  37.43 
 
 
573 aa  355  1e-96  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000203549 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3377  ABC transporter related  36.67 
 
 
575 aa  354  2e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.169433  normal  0.0551648 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00492  ABC transporter ATPase component  36.65 
 
 
571 aa  354  2e-96  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001975  peptide ABC transporter ATP-binding protein  37.26 
 
 
571 aa  355  2e-96  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.175781  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4397  ABC transporter related protein  37.1 
 
 
623 aa  354  2e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0655491  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0980  glutathione transporter ATP-binding protein  37.28 
 
 
629 aa  355  2e-96  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0561  ABC transporter for peptide ATP-binding protein  36.91 
 
 
566 aa  353  4e-96  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1243  ABC transporter related  37.12 
 
 
575 aa  353  5.9999999999999994e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0028  ABC transporter related  36.78 
 
 
546 aa  352  7e-96  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0987785  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0147  ABC transporter related  37.04 
 
 
624 aa  352  8.999999999999999e-96  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.888744  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4108  ABC transporter related  36.75 
 
 
623 aa  351  3e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.486076  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2574  ABC transporter related  36.43 
 
 
552 aa  350  3e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6678  ABC transporter related  37.55 
 
 
562 aa  350  5e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.736042 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3912  ABC transporter related protein  36.28 
 
 
594 aa  350  5e-95  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1323  glutathione transporter ATP-binding protein  37.19 
 
 
623 aa  350  5e-95  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3988  ABC transporter related  38.63 
 
 
547 aa  348  1e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.704503  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4108  ABC transporter related  36.97 
 
 
612 aa  348  1e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0625  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  36.63 
 
 
623 aa  347  4e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1555  ABC transporter related protein  37.09 
 
 
593 aa  347  5e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.148644  normal  0.0147945 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2991  ABC transporter related  37.52 
 
 
611 aa  346  7e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4251  ABC transporter related  38.21 
 
 
558 aa  346  7e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.214566 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1379  ABC transporter ATP-binding protein  36.6 
 
 
627 aa  346  8e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5758  ABC transporter related  35.6 
 
 
611 aa  345  1e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06420  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  37.05 
 
 
582 aa  344  2e-93  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.104627  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2031  ABC transporter ATP-binding protein  37.36 
 
 
539 aa  345  2e-93  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00115375  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3805  ABC transporter related  36.73 
 
 
611 aa  344  2.9999999999999997e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.503567  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4177  ABC transporter related  35.93 
 
 
561 aa  344  2.9999999999999997e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1617  ABC transporter-related protein  38.48 
 
 
547 aa  344  2.9999999999999997e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.683358  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3317  ABC transporter related  37.11 
 
 
545 aa  344  2.9999999999999997e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0279839  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2656  ABC transporter related  33.93 
 
 
552 aa  343  4e-93  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.474901 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1446  ABC transporter related  37.1 
 
 
597 aa  343  5.999999999999999e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3970  ABC transporter related  35.95 
 
 
640 aa  343  5.999999999999999e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2452  ABC transporter related  36.89 
 
 
571 aa  343  7e-93  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000520728 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2826  ABC transporter related  35.89 
 
 
572 aa  342  8e-93  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0515832  normal  0.0638843 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2402  ABC transporter related  36.89 
 
 
615 aa  342  8e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1819  ATPase components of various ABC-type transport systems contain duplicated ATPase  36.68 
 
 
593 aa  342  9e-93  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0376212  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1656  ABC transporter related  35.73 
 
 
613 aa  342  9e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.211709  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5450  ABC transporter related  36.83 
 
 
583 aa  342  1e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0152019 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001228  ABC transporter ATP-binding protein  36.55 
 
 
543 aa  342  1e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34300  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  36.89 
 
 
661 aa  342  1e-92  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.183589 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1927  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein, C-terminal  37.02 
 
 
629 aa  341  2e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.831202  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1310  ABC transporter related  37.06 
 
 
544 aa  342  2e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0559382  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5559  ABC transporter related  35.3 
 
 
570 aa  341  2.9999999999999998e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.153225  normal  0.0799333 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3131  ABC transporter related  36.86 
 
 
640 aa  340  4e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.022829  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13693  dipeptide-transport ATP-binding protein ABC transporter dppD  37.57 
 
 
548 aa  340  5e-92  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.373881  normal  0.206528 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4390  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  36.79 
 
 
619 aa  340  5e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.394233 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2425  ABC transporter-like protein  37.41 
 
 
568 aa  340  5.9999999999999996e-92  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1824  ABC transporter related  36.45 
 
 
542 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.160839  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3002  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  36.3 
 
 
625 aa  338  1.9999999999999998e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1749  ABC transporter related  37.72 
 
 
599 aa  338  1.9999999999999998e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.84058  normal  0.153665 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3646  ABC transporter related  36.41 
 
 
609 aa  338  1.9999999999999998e-91  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4226  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  36.87 
 
 
632 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1550  ABC transporter-related protein  36.64 
 
 
625 aa  338  1.9999999999999998e-91  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1490  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  36.51 
 
 
633 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.281538  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7329  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  37.91 
 
 
626 aa  337  2.9999999999999997e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.148864  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0835  ABC oligopeptide/dipeptide transporter, duplicated ATPase subunits  37.03 
 
 
640 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.155262  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2194  ABC transporter related  36.54 
 
 
600 aa  337  2.9999999999999997e-91  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.966605  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1252  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  35.6 
 
 
629 aa  337  2.9999999999999997e-91  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0894712  normal  0.866591 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1128  ABC transporter related  35.23 
 
 
588 aa  337  3.9999999999999995e-91  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.716333  normal  0.0608285 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05094  hypothetical protein  36.13 
 
 
543 aa  336  5.999999999999999e-91  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0719  putative dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter, ATP-binding protein  34.93 
 
 
608 aa  336  5.999999999999999e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1528  ABC transporter related  34.54 
 
 
583 aa  336  5.999999999999999e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4454  ABC transporter related  35.36 
 
 
619 aa  336  5.999999999999999e-91  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00023315 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0463  ABC transporter, ATP-binding protein  33.79 
 
 
609 aa  336  9e-91  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2011  ABC transporter component  37.73 
 
 
560 aa  335  1e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0560  ABC transporter related  37.36 
 
 
542 aa  335  1e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000861738  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2576  ABC transporter related protein  35.65 
 
 
601 aa  335  1e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0615694 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4590  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  36.3 
 
 
625 aa  335  1e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0191447  normal  0.806618 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3220  ABC transporter, ATP-binding protein  37.45 
 
 
539 aa  334  2e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.94364  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2746  ABC transporter related  37.63 
 
 
575 aa  335  2e-90  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.212206  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2286  ABC transporter related  33.71 
 
 
617 aa  334  2e-90  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.411723 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2651  ABC transporter related  36.77 
 
 
593 aa  334  3e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0447316  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5181  ABC transporter related  36.35 
 
 
573 aa  333  4e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.141279  normal  0.292066 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>