More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_02410 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_02410  Major Facilitator Superfamily transporter  100 
 
 		 467 aa  918    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.277787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5058  major facilitator superfamily MFS_1  76.82 
 
 		 468 aa  676    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.181226  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1002  major facilitator superfamily MFS_1  72.1 
 
 		 468 aa  664    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.101841 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3276  major facilitator superfamily MFS_1  70.39 
 
 		 460 aa  632  1e-180  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2130  major facilitator superfamily MFS_1  72.69 
 
 		 464 aa  607  9.999999999999999e-173  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1038  major facilitator superfamily MFS_1  59.28 
 
 		 457 aa  540  9.999999999999999e-153  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0804  major facilitator superfamily MFS_1  60.26 
 
 		 457 aa  536  1e-151  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.319544  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1621  inner membrane metabolite transport protein ydfJ  57.55 
 
 		 455 aa  536  1e-151  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00533306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1934  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  57.86 
 
 		 459 aa  533  1e-150  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.307592  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1268  major facilitator superfamily MFS_1  57.51 
 
 		 473 aa  521  1e-146  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1677  inner membrane metabolite transport protein YdfJ  58.31 
 
 		 446 aa  506  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.905645 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1609  inner membrane metabolite transport protein YdfJ  58.31 
 
 		 446 aa  506  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1618  inner membrane metabolite transport protein YdfJ  58.31 
 
 		 446 aa  506  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1665  inner membrane metabolite transport protein YdfJ  58.31 
 
 		 446 aa  506  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.044252  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1831  inner membrane metabolite transport protein YdfJ  58.09 
 
 		 446 aa  503  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2637  major facilitator superfamily MFS_1  56.68 
 
 		 473 aa  502  1e-141  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01502  predicted transporter  56.94 
 
 		 427 aa  499  1e-140  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0297029  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1752  inner membrane metabolite transport protein ydfJ  56.94 
 
 		 427 aa  499  1e-140  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000473238  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2102  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  56.94 
 
 		 427 aa  499  1e-140  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000410847  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2115  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  56.94 
 
 		 427 aa  499  1e-140  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0135318  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2159  inner membrane metabolite transport protein ydfJ  56.94 
 
 		 427 aa  498  1e-140  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0943239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1633  inner membrane metabolite transport protein ydfJ  56.94 
 
 		 427 aa  499  1e-140  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000157893  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01513  hypothetical protein  56.94 
 
 		 427 aa  499  1e-140  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0227529  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1342  major facilitator superfamily transporter  45.75 
 
 		 450 aa  402  1e-111  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0384  major facilitator family transporter  44.27 
 
 		 453 aa  395  1e-109  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4465  major facilitator transporter  43.7 
 
 		 460 aa  385  1e-105  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1103  major facilitator family transporter  43.13 
 
 		 464 aa  381  1e-104  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.338347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0650  major facilitator superfamily MFS_1  40.65 
 
 		 466 aa  318  1e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4783  major facilitator superfamily MFS_1  37.9 
 
 		 474 aa  292  1e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3917  major facilitator superfamily MFS_1  35.4 
 
 		 446 aa  288  2e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.981496  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4107  General substrate transporter  34.96 
 
 		 447 aa  282  1e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0216  major facilitator superfamily MFS_1  37.63 
 
 		 449 aa  281  2e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4431  putative transmembrane transport protein (general substrate transporter)  38.44 
 
 		 468 aa  276  7e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.90441  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2586  major facilitator superfamily MFS_1  36.61 
 
 		 435 aa  275  9e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.900551  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5300  major facilitator superfamily transporter  38.92 
 
 		 456 aa  273  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363353 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3115  major facilitator transporter  38.82 
 
 		 462 aa  273  7e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2458  major facilitator transporter  37.84 
 
 		 449 aa  272  1e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.263129  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10040  nitrate/nitrite transporter  37.22 
 
 		 439 aa  267  2.9999999999999995e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5087  general substrate transporter  37.36 
 
 		 461 aa  266  5e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.829473 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4702  general substrate transporter  37.36 
 
 		 461 aa  266  5e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.57172  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4788  general substrate transporter  37.36 
 
 		 461 aa  266  5e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1471  general substrate transporter  37.64 
 
 		 447 aa  265  2e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.360609  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2798  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  37.05 
 
 		 437 aa  262  6.999999999999999e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606232  normal  0.0553764 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3726  major facilitator transporter  39.39 
 
 		 482 aa  262  1e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.787651  normal  0.27837 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5329  major facilitator superfamily MFS_1  36.53 
 
 		 440 aa  261  2e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1047  major facilitator transporter  35.42 
 
 		 451 aa  260  3e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2344  major facilitator transporter  36.94 
 
 		 461 aa  261  3e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1587  major facilitator transporter  33.56 
 
 		 450 aa  260  4e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.891359  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0325  major facilitator transporter  34.99 
 
 		 457 aa  257  3e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0335  major facilitator transporter  34.99 
 
 		 457 aa  257  3e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.280682 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0314  major facilitator transporter  35.25 
 
 		 457 aa  257  3e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4290  major facilitator superfamily MFS_1  38.03 
 
 		 468 aa  256  8e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.720009 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1912  major facilitator superfamily MFS_1  37.58 
 
 		 475 aa  254  2.0000000000000002e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.162096 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1319  general substrate transporter  34.93 
 
 		 484 aa  254  3e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2383  major facilitator transporter  35.92 
 
 		 441 aa  253  3e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01893  shikimate transporter  33.03 
 
 		 438 aa  253  7e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1672  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  33.03 
 
 		 438 aa  253  7e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01882  hypothetical protein  33.03 
 
 		 438 aa  253  7e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0076  major facilitator transporter  36.02 
 
 		 450 aa  253  7e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4694  major facilitator transporter  35.83 
 
 		 439 aa  252  9.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3580  major facilitator transporter  35.6 
 
 		 435 aa  252  1e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6035  shikimate transporter  34.42 
 
 		 439 aa  251  1e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.503054 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5496  major facilitator transporter  35.6 
 
 		 435 aa  252  1e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499469  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5928  major facilitator transporter  36.12 
 
 		 442 aa  252  1e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0996299  normal  0.185357 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4787  major facilitator transporter  35.6 
 
 		 435 aa  252  1e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.991397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1111  General substrate transporter  36.05 
 
 		 460 aa  251  2e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3446  major facilitator superfamily MFS_1  37.29 
 
 		 435 aa  250  3e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.195476  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1662  shikimate transporter  32.81 
 
 		 438 aa  251  3e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.520984  normal  0.0496454 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5098  putative MFS superfamily transport protein  33.91 
 
 		 459 aa  251  3e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.393625 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1144  shikimate transporter  32.81 
 
 		 438 aa  251  3e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000733491  hitchhiker  0.000000475287 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2571  shikimate transporter  33.18 
 
 		 437 aa  250  3e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.168346 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46710  Major facilitator superfamily transporter  37.91 
 
 		 472 aa  250  4e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.689171  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2263  shikimate transporter  32.81 
 
 		 438 aa  250  5e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000638742  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2104  shikimate transporter  32.81 
 
 		 438 aa  249  6e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000181469  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2823  shikimate transporter  32.81 
 
 		 438 aa  249  6e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.347269  normal  0.535086 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0627  major facilitator transporter  36.24 
 
 		 478 aa  249  8e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.475758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2269  shikimate transporter  34.24 
 
 		 439 aa  248  1e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4172  major facilitator transporter  35.6 
 
 		 439 aa  249  1e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.756648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0925  major facilitator transporter  35.6 
 
 		 439 aa  248  2e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.291991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5092  major facilitator superfamily MFS_1  37.81 
 
 		 493 aa  248  2e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.274415 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0207  shikimate transporter  33.48 
 
 		 465 aa  247  3e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0212  shikimate transporter  34.68 
 
 		 465 aa  247  3e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0772  General substrate transporter  35.33 
 
 		 450 aa  247  3e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4438  major facilitator transporter  35.9 
 
 		 464 aa  246  4e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.357208  normal  0.925745 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0374  major facilitator transporter  37.26 
 
 		 433 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5743  major facilitator superfamily MFS_1  36.51 
 
 		 461 aa  246  8e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0804971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4754  major facilitator transporter  34.54 
 
 		 467 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.108309  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2608  major facilitator superfamily protein  35.87 
 
 		 441 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.495276 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4108  major facilitator family transporter  36.21 
 
 		 449 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.073539  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4135  general substrate transporter  36.21 
 
 		 449 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4303  major facilitator superfamily MFS_1  35.68 
 
 		 461 aa  244  3e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.625349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19080  arabinose efflux permease family protein  36.11 
 
 		 443 aa  244  3e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.297545  normal  0.79631 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4273  shikimate transporter  33.64 
 
 		 435 aa  244  3e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.156206 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3805  shikimate transporter  33.64 
 
 		 435 aa  244  3e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.424485  normal  0.688015 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4830  major facilitator transporter  36.57 
 
 		 442 aa  244  3e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  unclonable  0.00000135827  hitchhiker  0.00785352 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4413  major facilitator superfamily MFS_1  35.68 
 
 		 461 aa  244  3e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.906196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1346  major facilitator superfamily MFS_1  36.62 
 
 		 472 aa  243  3.9999999999999997e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.63119  normal  0.345999 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5961  shikimate transporter  33.26 
 
 		 434 aa  242  7.999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1626  shikimate transporter  33.49 
 
 		 435 aa  242  1e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0419838  normal  0.501762 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5797  major facilitator transporter  34.69 
 
 		 477 aa  242  1e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>