More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_2855 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_2855  phage integrase family protein  100 
 
 		 412 aa  847    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.866183 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2953  phage integrase family protein  73.15 
 
 		 408 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.887066  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1471  phage integrase family site specific recombinase  71 
 
 		 415 aa  594  1e-169  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2777  phage integrase family protein  64.02 
 
 		 414 aa  549  1e-155  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.179227 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004301  phage integrase  62.62 
 
 		 415 aa  535  1e-151  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0372  phage family integrase  62.13 
 
 		 422 aa  530  1e-149  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4740  integrase family protein  59.45 
 
 		 418 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1267  phage integrase family protein  58.81 
 
 		 409 aa  511  1e-144  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0699075 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4605  phage integrase family protein  60.05 
 
 		 418 aa  514  1e-144  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.801465  normal  0.0167588 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0747  Phage integrase  59.55 
 
 		 418 aa  508  1e-143  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.236649  normal  0.444279 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1188  phage integrase family protein  59.6 
 
 		 419 aa  510  1e-143  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2480  integrase, phage family  60.7 
 
 		 413 aa  504  9.999999999999999e-143  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00704938  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1601  phage integrase family protein  59.09 
 
 		 416 aa  497  1e-139  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.634793  normal  0.83663 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1281  integrase family protein  56.78 
 
 		 410 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.250481  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2743  phage integrase  54.25 
 
 		 417 aa  453  1.0000000000000001e-126  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0469991  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2917  phage integrase family site specific recombinase  53.58 
 
 		 415 aa  447  1.0000000000000001e-124  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.121366  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1357  phage family integrase  53.69 
 
 		 411 aa  445  1.0000000000000001e-124  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.183355  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1721  phage integrase  54.25 
 
 		 413 aa  447  1.0000000000000001e-124  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.749059  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1686  phage integrase family protein  52.74 
 
 		 411 aa  429  1e-119  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.034435  normal  0.0441759 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1053  integrase family protein  53.4 
 
 		 413 aa  426  1e-118  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3101  phage integrase family protein  52.04 
 
 		 395 aa  425  1e-118  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.241472 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1791  phage integrase family protein  52.63 
 
 		 411 aa  426  1e-118  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.275952  normal  0.224939 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1631  integrase family protein  51 
 
 		 409 aa  421  1e-117  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1761  phage integrase family protein  52.13 
 
 		 411 aa  424  1e-117  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0148676  normal  0.285781 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1902  integrase family protein  53.3 
 
 		 416 aa  424  1e-117  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.41933  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2362  integrase family protein  52.25 
 
 		 416 aa  418  1e-116  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.965631  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2952  phage integrase family protein  51.53 
 
 		 397 aa  419  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.20289e-17 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1063  integrase family protein  51.41 
 
 		 398 aa  421  1e-116  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2463  phage integrase family protein  52.38 
 
 		 414 aa  416  9.999999999999999e-116  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.384114  normal  0.0605266 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2496  phage integrase family protein  53.88 
 
 		 408 aa  415  9.999999999999999e-116  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0214559 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0723  integrase family protein  52.67 
 
 		 402 aa  412  1e-114  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0958  integrase family protein  50.9 
 
 		 403 aa  409  1e-113  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01122  integrase  47.36 
 
 		 410 aa  409  1e-113  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0767  prophage integrase  50.5 
 
 		 413 aa  402  1e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.496617  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1370  prophage CP4-57 integrase  49.75 
 
 		 399 aa  398  9.999999999999999e-111  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000288538  normal  0.0147519 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0234  phage integrase family protein  48.88 
 
 		 416 aa  396  1e-109  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3223  integrase  50.13 
 
 		 413 aa  387  1e-106  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02509  Fels-2 prophage protein  47.72 
 
 		 409 aa  368  1e-100  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.291445  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02473  hypothetical protein  47.72 
 
 		 409 aa  368  1e-100  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.36664  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2892  phage integrase family protein  46.95 
 
 		 423 aa  366  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.196545 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2905  phage integrase family protein  47.72 
 
 		 436 aa  367  1e-100  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1337  integrase  45.09 
 
 		 418 aa  348  1e-94  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1425  integrase  40.71 
 
 		 413 aa  316  4e-85  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.468676  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0968  cp4-like integrase protein  42.49 
 
 		 391 aa  309  5e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2365  Phage integrase  41.49 
 
 		 404 aa  305  8.000000000000001e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0928  phage integrase family site specific recombinase  40.15 
 
 		 438 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0249275  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02085  prophage CP4-like integrase  39.75 
 
 		 412 aa  284  2.0000000000000002e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00159504  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0306  site-specific recombinase, phage integrase family  36.76 
 
 		 410 aa  276  4e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.644103 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003253  phage integrase  36.47 
 
 		 448 aa  276  6e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3887  integrase family protein  35.49 
 
 		 404 aa  273  6e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3149  integrase family protein  35.16 
 
 		 402 aa  271  1e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0681  integrase family protein  36.41 
 
 		 401 aa  271  1e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2400  phage integrase family protein  39.59 
 
 		 404 aa  271  1e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0432428  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4836  integrase  36.09 
 
 		 421 aa  271  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.466297  normal  0.712135 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0329  site-specific recombinase, phage integrase family protein  34.88 
 
 		 402 aa  267  2e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0019463  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4153  phage integrase family site specific recombinase  37.73 
 
 		 397 aa  267  2e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.448481  normal  0.0214927 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1377  integrase family protein  35.75 
 
 		 404 aa  266  5.999999999999999e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.421262  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03516  Int  36.43 
 
 		 394 aa  265  8e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.465426  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03468  hypothetical protein  36.43 
 
 		 394 aa  265  8e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.457385  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3554  integrase family protein  37.34 
 
 		 419 aa  265  8e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5032  integrase  36.43 
 
 		 417 aa  265  8e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3717  integrase family protein  37.34 
 
 		 419 aa  265  8.999999999999999e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1403  integrase family protein  34.99 
 
 		 404 aa  263  3e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0374  site-specific recombinase, phage integrase family  36.98 
 
 		 396 aa  264  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.324346  normal  0.794104 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1354  phage integrase  38.14 
 
 		 404 aa  263  4e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226935  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0299  phage integrase family site specific recombinase  34.63 
 
 		 394 aa  262  6.999999999999999e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000127187 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3853  phage integrase family site specific recombinase  34.88 
 
 		 404 aa  262  8e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0234676 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1752  phage integrase  38.05 
 
 		 404 aa  261  1e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2364  phage integrase family protein  38.05 
 
 		 404 aa  261  1e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0884  phage integrase family site specific recombinase  34.63 
 
 		 404 aa  261  2e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1290  prophage CP4-like integrase  37.28 
 
 		 404 aa  261  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0925  integrase family protein  34.63 
 
 		 404 aa  261  2e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2870  integrase family protein  34.97 
 
 		 404 aa  261  2e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2233  integrase family protein  39.69 
 
 		 397 aa  260  3e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0126025 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0061  integrase family protein  35.08 
 
 		 396 aa  258  1e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2638  integrase  36.34 
 
 		 409 aa  256  4e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  9.23997e-16 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4738  integrase  36.39 
 
 		 396 aa  256  7e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.657187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4814  site-specific recombinase, phage integrase family protein  37.22 
 
 		 422 aa  255  8e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.751833  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0871  integrase family protein  39.55 
 
 		 419 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3112  site-specific recombinase, phage integrase family protein  35.9 
 
 		 394 aa  255  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0338398 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3377  site-specific recombinase, phage integrase family protein  35.9 
 
 		 394 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01627  integrase  47.33 
 
 		 290 aa  254  2.0000000000000002e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40500  Phage integrase  38.24 
 
 		 401 aa  253  4.0000000000000004e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0666  integrase  34.63 
 
 		 395 aa  253  4.0000000000000004e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.214947  hitchhiker  0.000000824162 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6353  P4-like integrase  38.35 
 
 		 407 aa  253  5.000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.276221  normal  0.142283 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2421  phage integrase family protein  36.76 
 
 		 404 aa  252  1e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.359769  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4051  phage integrase family site specific recombinase  37.97 
 
 		 419 aa  251  2e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.102635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4002  phage integrase family site specific recombinase  35.25 
 
 		 387 aa  251  2e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2828  integrase family protein  34.85 
 
 		 396 aa  251  2e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3540  phage integrase family site specific recombinase  38.5 
 
 		 411 aa  250  4e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000292707  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4773  integrase  35.34 
 
 		 449 aa  250  4e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.368119  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3444  integrase family protein  37.95 
 
 		 401 aa  249  4e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.950055  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3702  integrase family protein  36.48 
 
 		 418 aa  249  5e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3676  integrase family protein  38.25 
 
 		 421 aa  249  5e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.329272  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5344  site-specific recombinase, phage integrase family  37.19 
 
 		 402 aa  248  2e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.803856  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0718  integrase family protein  38.81 
 
 		 419 aa  248  2e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0108  integrase family protein  33.59 
 
 		 389 aa  247  3e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0053  integrase family protein  34.46 
 
 		 391 aa  246  6e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.613927 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3541  integrase family protein  36.39 
 
 		 418 aa  246  6.999999999999999e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3164  integrase family protein  34.92 
 
 		 428 aa  246  6.999999999999999e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>