77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_2190 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_2190  hypothetical protein  100 
 
 		 297 aa  621  1e-177  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.315226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1442  hypothetical protein  32.73 
 
 		 304 aa  142  5e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.37014  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6931  hypothetical protein  33.81 
 
 		 313 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2028  hypothetical protein  31.01 
 
 		 290 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000322678  normal  0.839611 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01226  hypothetical protein  31.21 
 
 		 295 aa  128  1.0000000000000001e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.594173  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0289  hypothetical protein  29.68 
 
 		 295 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2674  hypothetical protein  28.42 
 
 		 290 aa  127  3e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00152058  normal  0.0371695 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0112  hypothetical protein  30.18 
 
 		 304 aa  127  3e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3596  hypothetical protein  31.91 
 
 		 288 aa  125  7e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1781  hypothetical protein  31.29 
 
 		 293 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.294731 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4208  hypothetical protein  30.1 
 
 		 302 aa  120  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0455716 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0660  hypothetical protein  29.58 
 
 		 301 aa  120  3e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.125949  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2419  hypothetical protein  29.29 
 
 		 299 aa  119  4.9999999999999996e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.79837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3177  hypothetical protein  29.27 
 
 		 305 aa  115  7.999999999999999e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2140  hypothetical protein  29.89 
 
 		 290 aa  113  3e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000023466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2014  hypothetical protein  25.61 
 
 		 302 aa  106  4e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597575 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0419  hypothetical protein  29.43 
 
 		 294 aa  105  7e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3185  transcriptional regulator-like  32.56 
 
 		 254 aa  92  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4196  transcriptional regulator  27.17 
 
 		 298 aa  80.1  0.00000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1370  hypothetical protein  26.5 
 
 		 286 aa  79  0.00000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2196  hypothetical protein  24.65 
 
 		 296 aa  79  0.00000000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00000000497244  hitchhiker  0.00000469474 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2063  transcriptional regulator  26.02 
 
 		 290 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.754064  normal  0.900722 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1262  hypothetical protein  27.06 
 
 		 287 aa  76.6  0.0000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3550  hypothetical protein  22 
 
 		 275 aa  74.3  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.103965 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0988  hypothetical protein  26.79 
 
 		 301 aa  73.2  0.000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01687  hypothetical protein  25.72 
 
 		 284 aa  72.8  0.000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4623  transcriptional regulator-like protein  24.61 
 
 		 291 aa  72.4  0.000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.2844  decreased coverage  0.00000000441914 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2604  hypothetical protein  25.54 
 
 		 300 aa  71.6  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.668358 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2742  hypothetical protein  25.54 
 
 		 300 aa  71.6  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1284  hypothetical protein  23.88 
 
 		 301 aa  71.2  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218684 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3042  hypothetical protein  24.64 
 
 		 300 aa  70.9  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.384395 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4760  transcriptional regulator  24.61 
 
 		 291 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003231  hypothetical protein  24.63 
 
 		 284 aa  68.6  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2465  hypothetical protein  26.3 
 
 		 298 aa  67.8  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.107107  normal  0.276307 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4284  hypothetical protein  24.46 
 
 		 289 aa  67  0.0000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0111  hypothetical protein  25.17 
 
 		 326 aa  66.2  0.0000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4605  hypothetical protein  24.46 
 
 		 294 aa  64.7  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0159  hypothetical protein  23.67 
 
 		 283 aa  63.9  0.000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.233345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3737  hypothetical protein  23.61 
 
 		 290 aa  63.5  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1529  hypothetical protein  24.4 
 
 		 295 aa  62.8  0.000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0455905 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2478  hypothetical protein  22.46 
 
 		 285 aa  62.8  0.000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.452915  normal  0.259065 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1239  hypothetical protein  23.94 
 
 		 285 aa  60.8  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3103  hypothetical protein  25.2 
 
 		 282 aa  60.1  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.716933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1844  hypothetical protein  23.32 
 
 		 295 aa  59.7  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1356  hypothetical protein  22.35 
 
 		 298 aa  60.1  0.00000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2716  hypothetical protein  22.35 
 
 		 298 aa  59.7  0.00000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00189563 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6538  hypothetical protein  23.56 
 
 		 268 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2094  hypothetical protein  26.64 
 
 		 303 aa  59.7  0.00000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100358 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2085  hypothetical protein  23.17 
 
 		 302 aa  59.7  0.00000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.069658 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2091  hypothetical protein  24.76 
 
 		 276 aa  58.9  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00864  predicted transcriptional regulator i A1501  24.34 
 
 		 278 aa  57.8  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0679  hypothetical protein  26.94 
 
 		 287 aa  57.4  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.11701  normal  0.340076 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0195  hypothetical protein  22.03 
 
 		 287 aa  55.5  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.342058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0550  transcriptional regulator  23.44 
 
 		 292 aa  55.1  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0122  hypothetical protein  20.21 
 
 		 312 aa  53.9  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2987  hypothetical protein  26.03 
 
 		 294 aa  53.1  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.387576  normal  0.124084 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0913  hypothetical protein  23.41 
 
 		 279 aa  51.2  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0977  DeoR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 360 aa  49.3  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.226699  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0560  transcriptional regulator  28 
 
 		 317 aa  48.5  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00184479  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4323  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  24.79 
 
 		 327 aa  47.8  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.807083  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0777  hypothetical protein  28.57 
 
 		 317 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.845326  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0684  hypothetical protein  27.73 
 
 		 317 aa  47  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0732899  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0562  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  28.81 
 
 		 317 aa  46.6  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.349747  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0327  Helix-turn-helix type 11 domain protein  25.39 
 
 		 339 aa  46.6  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489263  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0615  hypothetical protein  26.98 
 
 		 317 aa  46.2  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.759398  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0648  hypothetical protein  26.98 
 
 		 317 aa  46.2  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0266881  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0705  hypothetical protein  26.98 
 
 		 317 aa  46.2  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0716  hypothetical protein  26.89 
 
 		 348 aa  45.8  0.0008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.129876  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2058  hypothetical protein  28.57 
 
 		 336 aa  45.1  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.160915  normal  0.181699 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4654  hypothetical protein  26.19 
 
 		 317 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000770885  unclonable  9.19298e-26 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0282  hypothetical protein  21.26 
 
 		 283 aa  45.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1870  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  24.74 
 
 		 337 aa  45.8  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.199317 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0559  transcriptional regulator  26.89 
 
 		 317 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4054  Helix-turn-helix type 11 domain protein  30.88 
 
 		 324 aa  43.9  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.135242  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2181  transcriptional regulator-like protein  33.85 
 
 		 663 aa  43.9  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.117971  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3867  Helix-turn-helix type 11 domain protein  32.84 
 
 		 335 aa  43.9  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4095  DeoR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 333 aa  42.4  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>