More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0196 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009092  Shew_0196  redoxin domain-containing protein  100 
 
 
195 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000417571  normal  0.0470366 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4281  redoxin domain-containing protein  69.31 
 
 
192 aa  283  1.0000000000000001e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000444464  normal  0.0383421 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0237  redoxin domain-containing protein  66.49 
 
 
193 aa  265  2.9999999999999995e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000132187  unclonable  0.000000000045327 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0221  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  64.32 
 
 
198 aa  262  2e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000103908  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3721  redoxin domain-containing protein  64.89 
 
 
195 aa  261  4e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000547051  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0237  redoxin domain-containing protein  63.92 
 
 
193 aa  258  4e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000458104  hitchhiker  0.00000000877704 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0232  redoxin domain-containing protein  63.92 
 
 
193 aa  258  4e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000057561  normal  0.0469952 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0269  thioredoxin, putative  62.89 
 
 
194 aa  256  1e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4653  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  63.64 
 
 
191 aa  253  1.0000000000000001e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000929627  normal  0.021972 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4018  Redoxin domain protein  61.86 
 
 
195 aa  246  2e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000656655  hitchhiker  0.00619092 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0234  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  61.34 
 
 
195 aa  243  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000290768  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0234  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  60.82 
 
 
195 aa  239  2e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000676147  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0237  redoxin domain-containing protein  60.82 
 
 
195 aa  239  2e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000304189  normal  0.555945 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0251  thioredoxin, putative  60.89 
 
 
193 aa  224  8e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000212412  normal  0.0823497 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0185  redoxin domain-containing protein  53.53 
 
 
179 aa  210  1e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000121029  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0479  thioredoxin, putative  42.45 
 
 
196 aa  136  2e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0476  thioredoxin, putative  39.01 
 
 
194 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4005  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  38.41 
 
 
194 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3880  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  37.68 
 
 
194 aa  125  3e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3367  redoxin domain-containing protein  38.41 
 
 
194 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0485  redoxin domain-containing protein  36.96 
 
 
194 aa  124  6e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3545  redoxin domain-containing protein  36.23 
 
 
194 aa  125  6e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.65179  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0486  redoxin domain-containing protein  36.96 
 
 
194 aa  123  2e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4480  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.46 
 
 
194 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0476  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.48 
 
 
177 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0345  redoxin domain-containing protein  34.27 
 
 
211 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2865  redoxin domain-containing protein  33.55 
 
 
170 aa  107  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.220691  normal  0.154484 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1603  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.87 
 
 
203 aa  99  4e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.673195  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0716  thioredoxin-like protein  32.12 
 
 
223 aa  97.4  1e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.620578 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0398  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like  34.45 
 
 
223 aa  97.1  1e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0641884  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2023  redoxin domain-containing protein  31.76 
 
 
161 aa  97.1  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.388068 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0746  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30 
 
 
200 aa  95.5  5e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.204935  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3502  hypothetical protein  31.37 
 
 
223 aa  95.1  5e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.460677 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3857  Redoxin domain protein  32.37 
 
 
220 aa  94.4  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0709217 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1401  redoxin domain-containing protein  27.6 
 
 
191 aa  94.4  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.774278  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2452  thioredoxin family protein  33.08 
 
 
170 aa  93.6  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000374764  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4876  thioredoxin-like  32.35 
 
 
224 aa  93.2  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.608782  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4503  redoxin domain-containing protein  27.67 
 
 
213 aa  92.8  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2535  redoxin domain-containing protein  33.11 
 
 
224 aa  92.4  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.772759 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3478  thioredoxin-like protein  27.53 
 
 
223 aa  91.7  7e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2006  redoxin domain-containing protein  29.2 
 
 
176 aa  91.3  7e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0112011  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1737  redoxin domain-containing protein  29.33 
 
 
210 aa  91.3  8e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.958182  normal  0.712311 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1239  thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like protein  29.08 
 
 
422 aa  91.3  8e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.502856  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1321  thioredoxin family protein  33.59 
 
 
168 aa  90.9  9e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3564  Redoxin domain protein  30.94 
 
 
220 aa  90.5  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.365622 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2276  Redoxin domain protein  29.27 
 
 
171 aa  90.1  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2678  thioredoxin family protein  29.67 
 
 
183 aa  90.1  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3733  redoxin  27.22 
 
 
187 aa  90.1  2e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.78163 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3037  redoxin  29.41 
 
 
221 aa  90.5  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1144  Thiol disulfide interchange protein tlpA (cytochrome c biogenesis protein tlpA)  32.35 
 
 
229 aa  89.7  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.243856  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1905  putative thiol:disulfide interchange protein  30.37 
 
 
238 aa  89  4e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1980  thiol:disulfide interchange protein, putative  30.37 
 
 
238 aa  88.6  6e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3288  redoxin domain-containing protein  27.46 
 
 
213 aa  87.8  8e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3488  Redoxin domain protein  28.29 
 
 
216 aa  87.8  9e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.207064 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3611  Redoxin domain protein  28.06 
 
 
213 aa  87.4  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.338922  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3412  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.06 
 
 
169 aa  86.3  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3474  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.3 
 
 
169 aa  85.9  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.163841 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1000  redoxin domain-containing protein  28.87 
 
 
238 aa  85.9  4e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4016  thiol:disulfide interchange protein  31.69 
 
 
220 aa  85.5  5e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0826  thioredoxin-like protein  31.11 
 
 
222 aa  85.5  5e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0388  redoxin domain-containing protein  32.87 
 
 
194 aa  85.5  5e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0017122 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0935  thioredoxin-like  30.15 
 
 
222 aa  85.5  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3739  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.59 
 
 
170 aa  85.1  6e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0260987  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3063  Thiol:disulfide interchange protein TlpA  25.52 
 
 
191 aa  85.1  6e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5226  Redoxin domain protein  31.11 
 
 
228 aa  85.1  7e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.387928  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3551  thiol:disulfide interchange protein DsbE, putative  31.58 
 
 
173 aa  84.3  9e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.571735 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5989  redoxin domain-containing protein  26.42 
 
 
217 aa  84  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.870389  normal  0.126817 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4643  putative thiol--disulfide interchange redox-active center transmembrane protein  26.17 
 
 
193 aa  84.3  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3616  redoxin domain-containing protein  28.85 
 
 
226 aa  83.2  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0668445  normal  0.0142654 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3382  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.77 
 
 
202 aa  83.2  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.305938 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0272  thioredoxin family protein  31.01 
 
 
182 aa  82.8  0.000000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.900103 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0496  thiol:disulfide interchange protein, putative  28.26 
 
 
184 aa  82.4  0.000000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0053  anti-oxidant AhpCTSA family protein  28.28 
 
 
232 aa  82  0.000000000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2370  redoxin domain-containing protein  29.77 
 
 
195 aa  82  0.000000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.36236 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2095  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  36.61 
 
 
288 aa  81.6  0.000000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.411423  normal  0.210806 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0181  alkyl hydroperoxide reductase  28.31 
 
 
183 aa  81.3  0.000000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0243778  normal  0.461108 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3210  redoxin domain-containing protein  31.51 
 
 
209 aa  81.3  0.000000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.541056 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1124  redoxin domain-containing protein  30.89 
 
 
181 aa  79.3  0.00000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.65139  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7297  Redoxin domain protein  25.9 
 
 
217 aa  79  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0540011  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3774  thiol-disulfide isomerase-like protein  28.12 
 
 
173 aa  79  0.00000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.166782  normal  0.0186728 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1146  thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like protein  28.57 
 
 
433 aa  79.3  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.299964  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1680  thioredoxin family protein  33.33 
 
 
173 aa  78.6  0.00000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0732573  normal  0.832163 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1187  Redoxin domain protein  27.12 
 
 
225 aa  78.2  0.00000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.151473 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3819  redoxin domain-containing protein  30.56 
 
 
155 aa  78.2  0.00000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0554152  hitchhiker  0.000365745 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2444  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.71 
 
 
183 aa  77.8  0.00000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.312621  normal  0.571857 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0725  thioredoxin, thioldisulfide interchange protein  25 
 
 
183 aa  77.4  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.409063  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1768  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  23.88 
 
 
446 aa  77.4  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.197214  normal  0.508736 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1435  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.4 
 
 
168 aa  77.4  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0354049 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2380  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25 
 
 
183 aa  77.4  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.632646 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0738  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.61 
 
 
170 aa  76.3  0.0000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.296036  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1923  redoxin domain-containing protein  29.91 
 
 
155 aa  75.5  0.0000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00232148  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2403  Redoxin domain protein  29.91 
 
 
155 aa  75.5  0.0000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000463478  hitchhiker  0.00393062 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1916  redoxin domain-containing protein  29.91 
 
 
155 aa  75.9  0.0000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000172621  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1890  redoxin domain-containing protein  29.91 
 
 
155 aa  75.9  0.0000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000501621  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3738  redoxin domain-containing protein  31.71 
 
 
268 aa  75.9  0.0000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1818  redoxin domain-containing protein  24.54 
 
 
165 aa  75.5  0.0000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.165387  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1823  redoxin domain-containing protein  30.84 
 
 
155 aa  75.5  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0149049  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1234  redoxin domain-containing protein  25.19 
 
 
167 aa  75.5  0.0000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2046  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like  27.41 
 
 
437 aa  75.1  0.0000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0189188  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2154  redoxin domain-containing protein  28.46 
 
 
160 aa  75.1  0.0000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00992138  normal  0.309785 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>