237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_2068 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_2068  integrase catalytic region  100 
 
 		 738 aa  1533    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00349038  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2115  integrase catalytic region  97.7 
 
 		 738 aa  1482    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.245855  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0643  transposase, putative  39.81 
 
 		 715 aa  519  1e-146  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3752  integrase catalytic subunit  28.88 
 
 		 772 aa  308  2.0000000000000002e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2955  prophage MuMc02, transposase protein A, putative  33.93 
 
 		 709 aa  262  2e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.456308  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0646  Integrase catalytic region  30.5 
 
 		 724 aa  258  2e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3365  Integrase catalytic region  29.17 
 
 		 718 aa  231  3e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.582921  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1264  Transposase-like Mu  25.8 
 
 		 728 aa  105  3e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000119608 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3350  bacteriophage transposase A protein, putative  23.75 
 
 		 708 aa  102  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4082  integrase catalytic region  24.66 
 
 		 497 aa  85.1  0.000000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0484563 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3875  integrase catalytic region  24.66 
 
 		 497 aa  85.1  0.000000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.936093 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3679  integrase catalytic region  24.66 
 
 		 497 aa  85.1  0.000000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.703248  normal  0.776463 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0977  Transposase-like Mu  24.94 
 
 		 561 aa  79.7  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.115724 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0270  bacteriophage DNA transposition protein A, putative  28.11 
 
 		 690 aa  77.4  0.0000000000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.513793  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0252  putative bacteriophage DNA transposition protein A  23.56 
 
 		 372 aa  72.4  0.00000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2186  integrase catalytic subunit  23.77 
 
 		 581 aa  72  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.347784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1342  integrase catalytic subunit  25.5 
 
 		 663 aa  70.5  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.139428 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2082  Transposase-like Mu  23.77 
 
 		 555 aa  69.7  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000413728 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0025  integrase catalytic subunit  23.65 
 
 		 810 aa  67.4  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4385  integrase catalytic subunit  21.48 
 
 		 468 aa  66.2  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0015  integrase catalytic region  22.22 
 
 		 653 aa  62.4  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3129  Transposase-like Mu  25.28 
 
 		 558 aa  60.8  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.509009 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2199  Transposase-like Mu  25.28 
 
 		 558 aa  60.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1894  Integrase catalytic region  24.64 
 
 		 666 aa  60.8  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.6802 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0496  integrase  26.52 
 
 		 523 aa  59.7  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.772953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4717  Integrase catalytic region  25 
 
 		 749 aa  58.9  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2981  Transposase-like Mu  23.64 
 
 		 567 aa  58.5  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1150  integrase catalytic subunit  24.13 
 
 		 560 aa  57.8  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.204343 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0713  Transposase-like Mu  23.6 
 
 		 732 aa  57.4  0.0000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2352  integrase catalytic region  22.8 
 
 		 721 aa  57  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109072 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5462  transposase  27.52 
 
 		 552 aa  54.3  0.000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4214  Transposase-like Mu  23.91 
 
 		 665 aa  54.3  0.000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.497688  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0729  transposase, putative  23.2 
 
 		 704 aa  53.5  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0648986  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2822  integrase catalytic region  22.46 
 
 		 480 aa  53.5  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2745  integrase catalytic subunit  22.46 
 
 		 480 aa  53.5  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0220  Integrase catalytic region  24 
 
 		 618 aa  53.5  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.611763  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0072  transposase  23.67 
 
 		 481 aa  53.1  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1859  integrase catalytic subunit  34.94 
 
 		 791 aa  52.8  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3222  integrase catalytic subunit  28.68 
 
 		 539 aa  52.4  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0196436  normal  0.424387 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0220  putative transposase  23.67 
 
 		 481 aa  52.4  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0145675 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3483  MuA-transposase/repressor protein CI DNA-binding  35.9 
 
 		 128 aa  52  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000503276  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0125  hypothetical protein  24 
 
 		 625 aa  51.6  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0663  transposase  34.4 
 
 		 279 aa  51.6  0.00005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0850  transposase  34.4 
 
 		 279 aa  51.6  0.00005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0138656  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0854  transposase  34.4 
 
 		 279 aa  51.6  0.00005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000400672  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0884  transposase  34.4 
 
 		 279 aa  51.6  0.00005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.341122  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1036  transposase  34.4 
 
 		 279 aa  51.6  0.00005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0036769  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1087  transposase  34.4 
 
 		 279 aa  51.6  0.00005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1671  transposase  34.4 
 
 		 279 aa  51.6  0.00005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1413  transposase  34.4 
 
 		 279 aa  51.6  0.00005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.143794  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3191  Integrase catalytic region  21.26 
 
 		 417 aa  51.6  0.00006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000157181  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2820  Integrase catalytic region  21.26 
 
 		 417 aa  51.6  0.00006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0790  MuA-transposase/repressor protein CI DNA-binding protein  43.75 
 
 		 128 aa  51.2  0.00006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000163331  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2267  integrase catalytic region  24.35 
 
 		 626 aa  51.2  0.00007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.102456 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0732  transposase OrfAB, subunit B  27.36 
 
 		 290 aa  50.4  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0442  transposase OrfAB, subunit B  27.36 
 
 		 290 aa  50.4  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2359  transposase OrfAB, subunit B  27.36 
 
 		 290 aa  50.4  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4720  Integrase catalytic region  23.08 
 
 		 670 aa  50.4  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.086869 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1386  transposase OrfAB, subunit B  27.36 
 
 		 290 aa  50.4  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5417  integrase catalytic subunit  27.27 
 
 		 715 aa  50.8  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.751819 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3363  MuA-transposase/repressor protein CI DNA-binding  40.58 
 
 		 128 aa  50.4  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00000382153  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0738  transposase OrfAB, subunit B  27.36 
 
 		 290 aa  50.4  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4356  Integrase catalytic region  25.86 
 
 		 438 aa  50.1  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.699845  normal  0.344395 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0028  transposase  22.79 
 
 		 651 aa  50.4  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.680566  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1682  Integrase catalytic region  21.28 
 
 		 417 aa  50.4  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3392  Integrase catalytic region  28.93 
 
 		 327 aa  50.8  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3414  Integrase catalytic region  28.93 
 
 		 331 aa  50.8  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5591  integrase catalytic subunit  27.27 
 
 		 715 aa  50.8  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5778  integrase catalytic region  22.9 
 
 		 662 aa  50.4  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.13282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0006  integrase catalytic subunit  21.45 
 
 		 652 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0485417  normal  0.154735 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0008  integrase catalytic region  21.45 
 
 		 652 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.171023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3183  integrase catalytic subunit  23.34 
 
 		 634 aa  49.7  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0522653  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0556  MuA-transposase/repressor protein CI DNA-binding  43.75 
 
 		 124 aa  50.1  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000035991  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0006  integrase catalytic region  21.45 
 
 		 652 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.418357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0613  integrase catalytic subunit  23.34 
 
 		 634 aa  49.7  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.514295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0791  MuA-transposase/repressor protein CI DNA-binding protein  43.75 
 
 		 124 aa  50.1  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000168449  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2505  transposon transposition protein B, putative  26.61 
 
 		 626 aa  49.3  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0117  integrase catalytic subunit  21.45 
 
 		 614 aa  49.3  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.145881  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0243  integrase catalytic subunit  21.45 
 
 		 614 aa  49.3  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00837519  hitchhiker  0.00531569 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2451  integrase catalytic subunit  21.45 
 
 		 614 aa  49.3  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0255149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6543  hypothetical protein  24.88 
 
 		 649 aa  49.3  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06969  hypothetical protein  21.84 
 
 		 487 aa  49.3  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0014  transposase, putative  21.45 
 
 		 677 aa  48.5  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.285018  unclonable  0.000000281565 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0312  Integrase catalytic region  22.48 
 
 		 416 aa  48.5  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1958  integrase  28.81 
 
 		 350 aa  48.9  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0555  MuA-transposase/repressor protein CI DNA-binding  40.62 
 
 		 128 aa  48.5  0.0005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000390603  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4401  transposase IS3/IS911 family protein  27.05 
 
 		 346 aa  47.8  0.0007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  0.518435 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4192  transposase IS3/IS911 family protein  27.05 
 
 		 386 aa  47.8  0.0008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4274  transposase IS3/IS911 family protein  27.05 
 
 		 386 aa  47.8  0.0008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2097  transposase IS3/IS911 family protein  27.05 
 
 		 386 aa  47.8  0.0008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.253953  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0993  transposase IS3/IS911 family protein  27.05 
 
 		 386 aa  47.8  0.0008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.184705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4392  transposase IS3/IS911 family protein  27.05 
 
 		 386 aa  47.8  0.0008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2540  transposase IS3/IS911 family protein  27.05 
 
 		 386 aa  47.8  0.0008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1840  transposase IS3/IS911 family protein  27.05 
 
 		 386 aa  47.8  0.0008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0397967  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4413  transposase IS3/IS911 family protein  27.05 
 
 		 386 aa  47.8  0.0008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000737696  normal  0.0155639 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4413  transposase IS3/IS911 family protein  27.05 
 
 		 386 aa  47.8  0.0008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0882  hypothetical protein  26.78 
 
 		 628 aa  47.8  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4278  transposase IS3/IS911 family protein  27.05 
 
 		 386 aa  47.8  0.0008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1665  transposase A  21.98 
 
 		 671 aa  47.4  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1761  Integrase catalytic region  22.22 
 
 		 407 aa  47  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>