More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1958 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1958  integrase  100 
 
 		 350 aa  721    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0058  integrase catalytic subunit  56.69 
 
 		 332 aa  359  5e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1232  integrase catalytic subunit  56.69 
 
 		 332 aa  359  5e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1848  integrase catalytic subunit  56.69 
 
 		 332 aa  359  5e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13466  transposase  53.45 
 
 		 387 aa  344  1e-93  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00499866  hitchhiker  0.000220656 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3168  Integrase catalytic region  59.14 
 
 		 350 aa  341  1e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2069  integrase catalytic region  52.25 
 
 		 334 aa  306  2.0000000000000002e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.291135  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2536  Integrase catalytic region  40.73 
 
 		 325 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000616979  normal  0.891736 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0376  Integrase catalytic region  41.25 
 
 		 325 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000454687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2334  integrase catalytic subunit  38.71 
 
 		 349 aa  202  7e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1263  integrase catalytic subunit  38.71 
 
 		 349 aa  202  7e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2091  integrase catalytic subunit  38.71 
 
 		 349 aa  202  7e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1259  integrase catalytic subunit  38.71 
 
 		 349 aa  202  7e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4443  integrase catalytic subunit  38.71 
 
 		 349 aa  202  7e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.472308  normal  0.634079 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0252  integrase catalytic subunit  38.71 
 
 		 349 aa  202  7e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2624  integrase catalytic subunit  38.71 
 
 		 349 aa  202  7e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1097  integrase catalytic subunit  38.71 
 
 		 349 aa  202  7e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4318  integrase catalytic subunit  38.71 
 
 		 349 aa  202  7e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1932  integrase catalytic subunit  38.71 
 
 		 349 aa  202  7e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1143  integrase catalytic subunit  38.71 
 
 		 349 aa  202  7e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0742479  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3063  integrase catalytic subunit  38.71 
 
 		 349 aa  202  7e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.517823  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0455  integrase catalytic subunit  38.71 
 
 		 349 aa  202  7e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2586  integrase catalytic subunit  38.71 
 
 		 349 aa  202  7e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0412118  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4311  integrase catalytic subunit  38.71 
 
 		 349 aa  202  7e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3683  integrase catalytic subunit  38.71 
 
 		 349 aa  202  7e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02882  hypothetical protein  40 
 
 		 336 aa  202  8e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07079  hypothetical protein  40 
 
 		 336 aa  202  8e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04943  hypothetical protein  40 
 
 		 336 aa  202  8e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05755  hypothetical protein  40 
 
 		 336 aa  202  8e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06031  hypothetical protein  40 
 
 		 336 aa  202  8e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05744  hypothetical protein  40 
 
 		 336 aa  202  8e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02043  hypothetical protein  40 
 
 		 336 aa  202  8e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01718  hypothetical protein  40 
 
 		 336 aa  202  8e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05476  hypothetical protein  40 
 
 		 336 aa  202  8e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05296  hypothetical protein  40 
 
 		 336 aa  202  8e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06978  hypothetical protein  40 
 
 		 336 aa  202  8e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04732  hypothetical protein  40 
 
 		 336 aa  202  9e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02798  hypothetical protein  40 
 
 		 336 aa  202  9e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06489  hypothetical protein  40 
 
 		 336 aa  202  9e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4356  Integrase catalytic region  39.67 
 
 		 438 aa  200  3e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.699845  normal  0.344395 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1698  integrase catalytic subunit  38.74 
 
 		 327 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000748356  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2306  integrase catalytic region  40.52 
 
 		 362 aa  197  3e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3001  integrase catalytic region  40.52 
 
 		 362 aa  197  3e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2098  Integrase catalytic region  38.06 
 
 		 327 aa  196  6e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0384  integrase catalytic subunit  36.76 
 
 		 334 aa  196  7e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0329218 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4078  integrase catalytic subunit  36.76 
 
 		 334 aa  196  7e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.461367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1742  integrase catalytic subunit  36.76 
 
 		 334 aa  196  7e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.663756 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3545  integrase catalytic subunit  38.59 
 
 		 317 aa  194  1e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1855  putative transposase  37.2 
 
 		 327 aa  194  2e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000000952934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2068  integrase catalytic subunit  38.61 
 
 		 342 aa  194  3e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1475  integrase catalytic subunit  38.61 
 
 		 342 aa  193  4e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2168  integrase catalytic subunit  38.61 
 
 		 342 aa  193  4e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1541  integrase catalytic subunit  39.01 
 
 		 318 aa  192  1e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3821  integrase catalytic subunit  39.01 
 
 		 318 aa  192  1e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000253663  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0318  integrase catalytic subunit  37.45 
 
 		 341 aa  190  4e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1238  integrase catalytic subunit  37.45 
 
 		 341 aa  190  4e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3027  integrase catalytic subunit  37.45 
 
 		 341 aa  190  4e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2204  integrase catalytic subunit  37.45 
 
 		 341 aa  190  4e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3318  integrase catalytic subunit  37.45 
 
 		 341 aa  190  4e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3928  integrase catalytic subunit  37.45 
 
 		 341 aa  190  4e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4367  integrase catalytic subunit  37.45 
 
 		 341 aa  190  4e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4345  integrase catalytic subunit  37.45 
 
 		 341 aa  190  4e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.862842  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3392  Integrase catalytic region  39.92 
 
 		 327 aa  189  9e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2063  transposase  41.38 
 
 		 319 aa  188  1e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000046959  decreased coverage  0.0000244555 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0649  Integrase catalytic region  36.45 
 
 		 327 aa  186  4e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.387806  normal  0.285781 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3414  Integrase catalytic region  39.54 
 
 		 331 aa  186  7e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3130  integrase catalytic region  40.44 
 
 		 347 aa  185  8e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0694  integrase catalytic subunit  41.25 
 
 		 364 aa  185  8e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0720  integrase catalytic subunit  41.25 
 
 		 364 aa  185  8e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1073  integrase catalytic subunit  41.25 
 
 		 364 aa  185  8e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1103  integrase catalytic subunit  41.25 
 
 		 364 aa  185  8e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.225158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2135  integrase catalytic subunit  41.25 
 
 		 364 aa  185  8e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.599497 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2427  integrase catalytic subunit  41.25 
 
 		 364 aa  185  8e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.8611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2875  integrase catalytic subunit  41.25 
 
 		 364 aa  185  8e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.398245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3341  integrase catalytic subunit  41.25 
 
 		 364 aa  185  8e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3660  integrase catalytic subunit  41.25 
 
 		 364 aa  185  8e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3792  integrase catalytic subunit  41.25 
 
 		 364 aa  185  8e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1942  integrase catalytic subunit  36.84 
 
 		 354 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0130  integrase catalytic subunit  36.84 
 
 		 354 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3143  integrase catalytic subunit  36.84 
 
 		 354 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.182234  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1254  integrase catalytic subunit  36.84 
 
 		 354 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0730  integrase catalytic subunit  36.84 
 
 		 354 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0818  integrase catalytic subunit  36.84 
 
 		 354 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2564  Integrase catalytic region  40 
 
 		 294 aa  185  1.0000000000000001e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4350  integrase catalytic subunit  36.84 
 
 		 354 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1890  Integrase catalytic region  39.69 
 
 		 278 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1517  integrase catalytic subunit  40.83 
 
 		 364 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.37516  normal  0.381442 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1907  integrase catalytic subunit  40.83 
 
 		 364 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.247282  decreased coverage  0.000309488 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2337  integrase catalytic subunit  37.91 
 
 		 354 aa  183  3e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2221  integrase catalytic subunit  38.03 
 
 		 310 aa  184  3e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000300486  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0306  integrase catalytic subunit  36.45 
 
 		 320 aa  184  3e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0314438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3798  integrase catalytic subunit  40.83 
 
 		 364 aa  183  3e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2329  integrase catalytic subunit  39.03 
 
 		 352 aa  183  5.0000000000000004e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558623 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0369  Integrase catalytic region  37.79 
 
 		 355 aa  182  7e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.375547 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4151  integrase catalytic region  40.38 
 
 		 347 aa  181  1e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2773  integrase catalytic subunit  40.83 
 
 		 364 aa  181  1e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3763  integrase catalytic subunit  40.83 
 
 		 364 aa  181  1e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4357  integrase catalytic subunit  40.83 
 
 		 364 aa  181  1e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4153  integrase catalytic region  37.7 
 
 		 363 aa  178  1e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01835  putative transposase  37.05 
 
 		 275 aa  172  9e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.129668  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>