More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1890 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1890  Integrase catalytic region  100 
 
 		 278 aa  580  1e-164  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0649  Integrase catalytic region  93.53 
 
 		 327 aa  548  1e-155  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.387806  normal  0.285781 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1698  integrase catalytic subunit  93.53 
 
 		 327 aa  543  1e-153  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000748356  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1855  putative transposase  81.65 
 
 		 327 aa  487  1e-137  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000000952934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2098  Integrase catalytic region  78.06 
 
 		 327 aa  467  1.0000000000000001e-131  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2221  integrase catalytic subunit  62.59 
 
 		 310 aa  383  1e-105  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000300486  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1100  conserved hypothetical transposase  78.21 
 
 		 259 aa  300  1e-80  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00213813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0645  conserved hypothetical transposase  78.21 
 
 		 259 aa  301  1e-80  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0437717  normal  0.451912 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07079  hypothetical protein  44.48 
 
 		 336 aa  246  3e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01718  hypothetical protein  44.48 
 
 		 336 aa  246  3e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05755  hypothetical protein  44.48 
 
 		 336 aa  246  3e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05744  hypothetical protein  44.48 
 
 		 336 aa  246  3e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06031  hypothetical protein  44.48 
 
 		 336 aa  246  3e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06978  hypothetical protein  44.48 
 
 		 336 aa  246  3e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02043  hypothetical protein  44.48 
 
 		 336 aa  246  3e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02882  hypothetical protein  44.48 
 
 		 336 aa  246  3e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04943  hypothetical protein  44.48 
 
 		 336 aa  246  3e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05296  hypothetical protein  44.48 
 
 		 336 aa  246  3e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05476  hypothetical protein  44.48 
 
 		 336 aa  246  3e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1254  integrase catalytic subunit  43.21 
 
 		 354 aa  245  6.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1942  integrase catalytic subunit  43.21 
 
 		 354 aa  245  6.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4350  integrase catalytic subunit  43.21 
 
 		 354 aa  245  6.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3143  integrase catalytic subunit  43.21 
 
 		 354 aa  245  6.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.182234  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0730  integrase catalytic subunit  43.21 
 
 		 354 aa  245  6.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0130  integrase catalytic subunit  43.21 
 
 		 354 aa  245  6.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0818  integrase catalytic subunit  43.21 
 
 		 354 aa  245  6.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02798  hypothetical protein  44.13 
 
 		 336 aa  244  9.999999999999999e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06489  hypothetical protein  44.13 
 
 		 336 aa  244  9.999999999999999e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04732  hypothetical protein  44.13 
 
 		 336 aa  244  9.999999999999999e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1541  integrase catalytic subunit  45.32 
 
 		 318 aa  241  7.999999999999999e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3821  integrase catalytic subunit  45.32 
 
 		 318 aa  241  7.999999999999999e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000253663  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2068  integrase catalytic subunit  44.36 
 
 		 342 aa  240  2e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1475  integrase catalytic subunit  44.36 
 
 		 342 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2168  integrase catalytic subunit  44.36 
 
 		 342 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2063  transposase  44.77 
 
 		 319 aa  234  2.0000000000000002e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000046959  decreased coverage  0.0000244555 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1259  integrase catalytic subunit  42.91 
 
 		 349 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1932  integrase catalytic subunit  42.91 
 
 		 349 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1263  integrase catalytic subunit  42.91 
 
 		 349 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4318  integrase catalytic subunit  42.91 
 
 		 349 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3063  integrase catalytic subunit  42.91 
 
 		 349 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.517823  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2586  integrase catalytic subunit  42.91 
 
 		 349 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0412118  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3683  integrase catalytic subunit  42.91 
 
 		 349 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4311  integrase catalytic subunit  42.91 
 
 		 349 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2624  integrase catalytic subunit  42.91 
 
 		 349 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1097  integrase catalytic subunit  42.91 
 
 		 349 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1143  integrase catalytic subunit  42.91 
 
 		 349 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0742479  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2091  integrase catalytic subunit  42.91 
 
 		 349 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4443  integrase catalytic subunit  42.91 
 
 		 349 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.472308  normal  0.634079 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0252  integrase catalytic subunit  42.91 
 
 		 349 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0455  integrase catalytic subunit  42.91 
 
 		 349 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2334  integrase catalytic subunit  42.91 
 
 		 349 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2564  Integrase catalytic region  43.37 
 
 		 294 aa  230  2e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0376  Integrase catalytic region  42.65 
 
 		 325 aa  230  2e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000454687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01835  putative transposase  43.33 
 
 		 275 aa  229  5e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.129668  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02257  putative transposase  43.33 
 
 		 275 aa  229  5e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01833  putative transposase  43.33 
 
 		 275 aa  229  5e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2536  Integrase catalytic region  42.28 
 
 		 325 aa  228  7e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000616979  normal  0.891736 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3130  integrase catalytic region  43.8 
 
 		 347 aa  226  3e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4151  integrase catalytic region  43.8 
 
 		 347 aa  224  8e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1432  integrase catalytic subunit  42.5 
 
 		 375 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.622939  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3392  Integrase catalytic region  39.86 
 
 		 327 aa  220  1.9999999999999999e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3832  hypothetical protein  42.5 
 
 		 375 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.819891  normal  0.0624726 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3928  integrase catalytic subunit  42.7 
 
 		 341 aa  219  3e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3001  integrase catalytic region  41.88 
 
 		 362 aa  219  3e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2306  integrase catalytic region  41.88 
 
 		 362 aa  219  3e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2204  integrase catalytic subunit  42.7 
 
 		 341 aa  219  3e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4367  integrase catalytic subunit  42.7 
 
 		 341 aa  219  3e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3027  integrase catalytic subunit  42.7 
 
 		 341 aa  219  3e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0318  integrase catalytic subunit  42.7 
 
 		 341 aa  219  3e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3318  integrase catalytic subunit  42.7 
 
 		 341 aa  219  3e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1238  integrase catalytic subunit  42.7 
 
 		 341 aa  219  3e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4345  integrase catalytic subunit  42.7 
 
 		 341 aa  219  3e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.862842  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3414  Integrase catalytic region  39.5 
 
 		 331 aa  216  2.9999999999999998e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3545  integrase catalytic subunit  43.75 
 
 		 317 aa  215  5e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0731  integrase catalytic subunit  41.07 
 
 		 375 aa  215  7e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1103  integrase catalytic subunit  40.65 
 
 		 364 aa  211  1e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.225158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1073  integrase catalytic subunit  40.65 
 
 		 364 aa  211  1e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2427  integrase catalytic subunit  40.65 
 
 		 364 aa  211  1e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.8611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2875  integrase catalytic subunit  40.65 
 
 		 364 aa  211  1e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.398245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3660  integrase catalytic subunit  40.65 
 
 		 364 aa  211  1e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3341  integrase catalytic subunit  40.65 
 
 		 364 aa  211  1e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2135  integrase catalytic subunit  40.65 
 
 		 364 aa  211  1e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.599497 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0720  integrase catalytic subunit  40.65 
 
 		 364 aa  211  1e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3792  integrase catalytic subunit  40.65 
 
 		 364 aa  211  1e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0694  integrase catalytic subunit  40.65 
 
 		 364 aa  211  1e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1907  integrase catalytic subunit  40.29 
 
 		 364 aa  209  4e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.247282  decreased coverage  0.000309488 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3798  integrase catalytic subunit  40.29 
 
 		 364 aa  209  4e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1517  integrase catalytic subunit  40.29 
 
 		 364 aa  209  4e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.37516  normal  0.381442 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0369  Integrase catalytic region  39.21 
 
 		 355 aa  207  2e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.375547 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02618  putative transposase  42.86 
 
 		 256 aa  207  2e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2773  integrase catalytic subunit  40.29 
 
 		 364 aa  207  2e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3763  integrase catalytic subunit  40.29 
 
 		 364 aa  207  2e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4357  integrase catalytic subunit  40.29 
 
 		 364 aa  207  2e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2337  integrase catalytic subunit  39.71 
 
 		 354 aa  205  9e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2329  integrase catalytic subunit  40.43 
 
 		 352 aa  199  3e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558623 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1848  integrase catalytic subunit  39.77 
 
 		 332 aa  199  5e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0058  integrase catalytic subunit  39.77 
 
 		 332 aa  199  5e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1232  integrase catalytic subunit  39.77 
 
 		 332 aa  199  5e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2069  integrase catalytic region  41.79 
 
 		 334 aa  197  1.0000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.291135  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13466  transposase  43.68 
 
 		 387 aa  196  5.000000000000001e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00499866  hitchhiker  0.000220656 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>