More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2168 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007954  Sden_1475  integrase catalytic subunit  100 
 
 
342 aa  710    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2068  integrase catalytic subunit  99.71 
 
 
342 aa  709    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2168  integrase catalytic subunit  100 
 
 
342 aa  710    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3683  integrase catalytic subunit  84.8 
 
 
349 aa  611  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4318  integrase catalytic subunit  84.8 
 
 
349 aa  611  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0455  integrase catalytic subunit  84.8 
 
 
349 aa  611  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2334  integrase catalytic subunit  84.8 
 
 
349 aa  611  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2586  integrase catalytic subunit  84.8 
 
 
349 aa  611  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0412118  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2624  integrase catalytic subunit  84.8 
 
 
349 aa  611  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3063  integrase catalytic subunit  84.8 
 
 
349 aa  611  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.517823  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4443  integrase catalytic subunit  84.8 
 
 
349 aa  611  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.472308  normal  0.634079 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0252  integrase catalytic subunit  84.8 
 
 
349 aa  611  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1097  integrase catalytic subunit  84.8 
 
 
349 aa  611  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1143  integrase catalytic subunit  84.8 
 
 
349 aa  611  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0742479  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1259  integrase catalytic subunit  84.8 
 
 
349 aa  611  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1263  integrase catalytic subunit  84.8 
 
 
349 aa  611  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1932  integrase catalytic subunit  84.8 
 
 
349 aa  611  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2091  integrase catalytic subunit  84.8 
 
 
349 aa  611  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4311  integrase catalytic subunit  84.5 
 
 
349 aa  609  1e-173  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3545  integrase catalytic subunit  86.38 
 
 
317 aa  548  1e-155  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2047  integrase catalytic subunit  85.66 
 
 
272 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05755  hypothetical protein  62.99 
 
 
336 aa  461  1e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06978  hypothetical protein  62.99 
 
 
336 aa  461  1e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05744  hypothetical protein  62.99 
 
 
336 aa  461  1e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05296  hypothetical protein  62.99 
 
 
336 aa  461  1e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01718  hypothetical protein  62.99 
 
 
336 aa  461  1e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02882  hypothetical protein  62.99 
 
 
336 aa  461  1e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02043  hypothetical protein  62.99 
 
 
336 aa  461  1e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04943  hypothetical protein  62.99 
 
 
336 aa  461  1e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05476  hypothetical protein  62.99 
 
 
336 aa  461  1e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06031  hypothetical protein  62.99 
 
 
336 aa  461  1e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07079  hypothetical protein  62.99 
 
 
336 aa  461  1e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02798  hypothetical protein  62.69 
 
 
336 aa  459  9.999999999999999e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06489  hypothetical protein  62.69 
 
 
336 aa  459  9.999999999999999e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04732  hypothetical protein  62.69 
 
 
336 aa  459  9.999999999999999e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4350  integrase catalytic subunit  59.27 
 
 
354 aa  410  1e-113  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3143  integrase catalytic subunit  59.27 
 
 
354 aa  410  1e-113  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.182234  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0730  integrase catalytic subunit  59.27 
 
 
354 aa  410  1e-113  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0130  integrase catalytic subunit  59.27 
 
 
354 aa  410  1e-113  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0818  integrase catalytic subunit  59.27 
 
 
354 aa  410  1e-113  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1254  integrase catalytic subunit  59.27 
 
 
354 aa  410  1e-113  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1942  integrase catalytic subunit  59.27 
 
 
354 aa  410  1e-113  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3392  Integrase catalytic region  58.02 
 
 
327 aa  399  9.999999999999999e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3414  Integrase catalytic region  57.45 
 
 
331 aa  400  9.999999999999999e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2063  transposase  57.41 
 
 
319 aa  388  1e-107  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000046959  decreased coverage  0.0000244555 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2564  Integrase catalytic region  58.68 
 
 
294 aa  370  1e-101  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0731  integrase catalytic subunit  55.42 
 
 
375 aa  361  9e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2337  integrase catalytic subunit  52.87 
 
 
354 aa  361  1e-98  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1432  integrase catalytic subunit  54.8 
 
 
375 aa  352  4e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.622939  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3832  hypothetical protein  54.8 
 
 
375 aa  352  4e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.819891  normal  0.0624726 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2329  integrase catalytic subunit  51.66 
 
 
352 aa  351  1e-95  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.558623 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3130  integrase catalytic region  49.09 
 
 
347 aa  345  5e-94  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4151  integrase catalytic region  48.78 
 
 
347 aa  342  5.999999999999999e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02257  putative transposase  55.76 
 
 
275 aa  339  5e-92  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01833  putative transposase  55.76 
 
 
275 aa  339  5e-92  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01835  putative transposase  55.76 
 
 
275 aa  339  5e-92  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.129668  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3001  integrase catalytic region  48.68 
 
 
362 aa  333  2e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2306  integrase catalytic region  48.68 
 
 
362 aa  333  2e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2427  integrase catalytic subunit  48.84 
 
 
364 aa  329  5.0000000000000004e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.8611  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3792  integrase catalytic subunit  48.84 
 
 
364 aa  329  5.0000000000000004e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1103  integrase catalytic subunit  48.84 
 
 
364 aa  329  5.0000000000000004e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.225158  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1073  integrase catalytic subunit  48.84 
 
 
364 aa  329  5.0000000000000004e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0694  integrase catalytic subunit  48.84 
 
 
364 aa  329  5.0000000000000004e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2135  integrase catalytic subunit  48.84 
 
 
364 aa  329  5.0000000000000004e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.599497 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0720  integrase catalytic subunit  48.84 
 
 
364 aa  329  5.0000000000000004e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3341  integrase catalytic subunit  48.84 
 
 
364 aa  329  5.0000000000000004e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2875  integrase catalytic subunit  48.84 
 
 
364 aa  329  5.0000000000000004e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.398245  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3660  integrase catalytic subunit  48.84 
 
 
364 aa  329  5.0000000000000004e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0369  Integrase catalytic region  47.9 
 
 
355 aa  329  5.0000000000000004e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.375547 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1907  integrase catalytic subunit  48.55 
 
 
364 aa  327  2.0000000000000001e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.247282  decreased coverage  0.000309488 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3798  integrase catalytic subunit  48.55 
 
 
364 aa  327  2.0000000000000001e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3928  integrase catalytic subunit  49.12 
 
 
341 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4345  integrase catalytic subunit  49.12 
 
 
341 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.862842  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4367  integrase catalytic subunit  49.12 
 
 
341 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3318  integrase catalytic subunit  49.12 
 
 
341 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1517  integrase catalytic subunit  48.55 
 
 
364 aa  327  2.0000000000000001e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.37516  normal  0.381442 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2204  integrase catalytic subunit  49.12 
 
 
341 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3027  integrase catalytic subunit  49.12 
 
 
341 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0318  integrase catalytic subunit  49.12 
 
 
341 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1238  integrase catalytic subunit  49.12 
 
 
341 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2773  integrase catalytic subunit  48.55 
 
 
364 aa  325  9e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4357  integrase catalytic subunit  48.55 
 
 
364 aa  325  9e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3763  integrase catalytic subunit  48.55 
 
 
364 aa  325  9e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3821  integrase catalytic subunit  51.63 
 
 
318 aa  321  9.999999999999999e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000253663  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1541  integrase catalytic subunit  51.63 
 
 
318 aa  321  9.999999999999999e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4153  integrase catalytic region  46.97 
 
 
363 aa  310  2e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02618  putative transposase  55.02 
 
 
256 aa  309  4e-83  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0376  Integrase catalytic region  47.47 
 
 
325 aa  297  2e-79  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000454687  normal 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2536  Integrase catalytic region  47.15 
 
 
325 aa  296  4e-79  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000616979  normal  0.891736 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1698  integrase catalytic subunit  44.28 
 
 
327 aa  275  7e-73  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000748356  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1855  putative transposase  43.64 
 
 
327 aa  274  2.0000000000000002e-72  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000000952934  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0305  integrase catalytic subunit  51.72 
 
 
271 aa  271  2e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.667287  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4356  Integrase catalytic region  44.17 
 
 
438 aa  270  2e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.699845  normal  0.344395 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2098  Integrase catalytic region  41.87 
 
 
327 aa  266  5e-70  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0649  Integrase catalytic region  42.17 
 
 
327 aa  259  6e-68  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.387806  normal  0.285781 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1890  Integrase catalytic region  44.36 
 
 
278 aa  239  4e-62  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2221  integrase catalytic subunit  42.31 
 
 
310 aa  236  5.0000000000000005e-61  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000300486  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3413  putative transposase  55.31 
 
 
188 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3168  Integrase catalytic region  42.97 
 
 
350 aa  200  3e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13466  transposase  40.62 
 
 
387 aa  199  5e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00499866  hitchhiker  0.000220656 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>