More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1742 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_0384  integrase catalytic subunit  100 
 
 
334 aa  682    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0329218 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4078  integrase catalytic subunit  100 
 
 
334 aa  682    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.461367  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1742  integrase catalytic subunit  100 
 
 
334 aa  682    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.663756 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0306  integrase catalytic subunit  78.19 
 
 
320 aa  522  1e-147  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0314438  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2069  integrase catalytic region  44.14 
 
 
334 aa  194  1e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.291135  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1848  integrase catalytic subunit  36.18 
 
 
332 aa  189  5e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0058  integrase catalytic subunit  36.18 
 
 
332 aa  189  5e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1232  integrase catalytic subunit  36.18 
 
 
332 aa  189  5e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3168  Integrase catalytic region  42.44 
 
 
350 aa  188  1e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1958  integrase  36.81 
 
 
350 aa  184  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2221  integrase catalytic subunit  40 
 
 
310 aa  177  3e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000300486  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02798  hypothetical protein  40 
 
 
336 aa  175  9.999999999999999e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04732  hypothetical protein  40 
 
 
336 aa  175  9.999999999999999e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06489  hypothetical protein  40 
 
 
336 aa  175  9.999999999999999e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05476  hypothetical protein  39.6 
 
 
336 aa  174  1.9999999999999998e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06978  hypothetical protein  39.6 
 
 
336 aa  174  1.9999999999999998e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02043  hypothetical protein  39.6 
 
 
336 aa  174  1.9999999999999998e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02882  hypothetical protein  39.6 
 
 
336 aa  174  1.9999999999999998e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05744  hypothetical protein  39.6 
 
 
336 aa  174  1.9999999999999998e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01718  hypothetical protein  39.6 
 
 
336 aa  174  1.9999999999999998e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05755  hypothetical protein  39.6 
 
 
336 aa  174  1.9999999999999998e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06031  hypothetical protein  39.6 
 
 
336 aa  174  1.9999999999999998e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04943  hypothetical protein  39.6 
 
 
336 aa  174  1.9999999999999998e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05296  hypothetical protein  39.6 
 
 
336 aa  174  1.9999999999999998e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07079  hypothetical protein  39.6 
 
 
336 aa  174  1.9999999999999998e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13466  transposase  35.92 
 
 
387 aa  172  5.999999999999999e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00499866  hitchhiker  0.000220656 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1698  integrase catalytic subunit  39.06 
 
 
327 aa  169  7e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000748356  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2068  integrase catalytic subunit  38.79 
 
 
342 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2337  integrase catalytic subunit  39.23 
 
 
354 aa  167  2.9999999999999998e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1475  integrase catalytic subunit  38.79 
 
 
342 aa  166  5e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2168  integrase catalytic subunit  38.79 
 
 
342 aa  166  5e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1890  Integrase catalytic region  37.93 
 
 
278 aa  166  5e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1263  integrase catalytic subunit  33.33 
 
 
349 aa  164  3e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1932  integrase catalytic subunit  33.33 
 
 
349 aa  164  3e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1259  integrase catalytic subunit  33.33 
 
 
349 aa  164  3e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2624  integrase catalytic subunit  33.33 
 
 
349 aa  164  3e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2091  integrase catalytic subunit  33.33 
 
 
349 aa  164  3e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4318  integrase catalytic subunit  33.33 
 
 
349 aa  164  3e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3130  integrase catalytic region  38 
 
 
347 aa  163  3e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0455  integrase catalytic subunit  33.33 
 
 
349 aa  164  3e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0252  integrase catalytic subunit  33.33 
 
 
349 aa  164  3e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1143  integrase catalytic subunit  33.33 
 
 
349 aa  164  3e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0742479  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1097  integrase catalytic subunit  33.33 
 
 
349 aa  164  3e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1432  integrase catalytic subunit  43.69 
 
 
375 aa  163  3e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.622939  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3683  integrase catalytic subunit  33.33 
 
 
349 aa  164  3e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4443  integrase catalytic subunit  33.33 
 
 
349 aa  164  3e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.472308  normal  0.634079 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3063  integrase catalytic subunit  33.33 
 
 
349 aa  164  3e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.517823  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2586  integrase catalytic subunit  33.33 
 
 
349 aa  164  3e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0412118  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2334  integrase catalytic subunit  33.33 
 
 
349 aa  164  3e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4311  integrase catalytic subunit  33.33 
 
 
349 aa  164  3e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3832  hypothetical protein  43.69 
 
 
375 aa  163  3e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.819891  normal  0.0624726 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2536  Integrase catalytic region  36.36 
 
 
325 aa  163  5.0000000000000005e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000616979  normal  0.891736 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0649  Integrase catalytic region  37.07 
 
 
327 aa  162  6e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.387806  normal  0.285781 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2564  Integrase catalytic region  40.42 
 
 
294 aa  162  7e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0376  Integrase catalytic region  36.14 
 
 
325 aa  161  1e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000454687  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4151  integrase catalytic region  37.6 
 
 
347 aa  161  2e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3928  integrase catalytic subunit  38.02 
 
 
341 aa  160  3e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4345  integrase catalytic subunit  38.02 
 
 
341 aa  160  3e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.862842  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4367  integrase catalytic subunit  38.02 
 
 
341 aa  160  3e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3027  integrase catalytic subunit  38.02 
 
 
341 aa  160  3e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3318  integrase catalytic subunit  38.02 
 
 
341 aa  160  3e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2204  integrase catalytic subunit  38.02 
 
 
341 aa  160  3e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0318  integrase catalytic subunit  38.02 
 
 
341 aa  160  3e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1238  integrase catalytic subunit  38.02 
 
 
341 aa  160  3e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3392  Integrase catalytic region  39.36 
 
 
327 aa  159  4e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1855  putative transposase  36.64 
 
 
327 aa  159  6e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000000952934  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2098  Integrase catalytic region  36.48 
 
 
327 aa  159  6e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2063  transposase  38.8 
 
 
319 aa  159  7e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000046959  decreased coverage  0.0000244555 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0731  integrase catalytic subunit  38.71 
 
 
375 aa  159  7e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2329  integrase catalytic subunit  39.44 
 
 
352 aa  158  1e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.558623 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3545  integrase catalytic subunit  35.46 
 
 
317 aa  158  1e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1942  integrase catalytic subunit  36.29 
 
 
354 aa  157  3e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1254  integrase catalytic subunit  36.29 
 
 
354 aa  157  3e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0818  integrase catalytic subunit  36.29 
 
 
354 aa  157  3e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4350  integrase catalytic subunit  36.29 
 
 
354 aa  157  3e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0130  integrase catalytic subunit  36.29 
 
 
354 aa  157  3e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0730  integrase catalytic subunit  36.29 
 
 
354 aa  157  3e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3143  integrase catalytic subunit  36.29 
 
 
354 aa  157  3e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.182234  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4356  Integrase catalytic region  37.15 
 
 
438 aa  156  5.0000000000000005e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.699845  normal  0.344395 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3414  Integrase catalytic region  39.75 
 
 
331 aa  156  5.0000000000000005e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3821  integrase catalytic subunit  34.27 
 
 
318 aa  154  2e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000253663  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1541  integrase catalytic subunit  34.27 
 
 
318 aa  154  2e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2306  integrase catalytic region  39.06 
 
 
362 aa  150  2e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3001  integrase catalytic region  39.06 
 
 
362 aa  150  2e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01833  putative transposase  36.55 
 
 
275 aa  150  3e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01835  putative transposase  36.55 
 
 
275 aa  150  3e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.129668  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02257  putative transposase  36.55 
 
 
275 aa  150  3e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02618  putative transposase  36.55 
 
 
256 aa  150  4e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0369  Integrase catalytic region  37.01 
 
 
355 aa  150  4e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.375547 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0694  integrase catalytic subunit  36.65 
 
 
364 aa  149  5e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0720  integrase catalytic subunit  36.65 
 
 
364 aa  149  5e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1073  integrase catalytic subunit  36.65 
 
 
364 aa  149  5e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1103  integrase catalytic subunit  36.65 
 
 
364 aa  149  5e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.225158  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2135  integrase catalytic subunit  36.65 
 
 
364 aa  149  5e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.599497 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2427  integrase catalytic subunit  36.65 
 
 
364 aa  149  5e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.8611  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2875  integrase catalytic subunit  36.65 
 
 
364 aa  149  5e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.398245  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3341  integrase catalytic subunit  36.65 
 
 
364 aa  149  5e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3660  integrase catalytic subunit  36.65 
 
 
364 aa  149  5e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3792  integrase catalytic subunit  36.65 
 
 
364 aa  149  5e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4153  integrase catalytic region  33.75 
 
 
363 aa  148  1.0000000000000001e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>