More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2068 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_1475  integrase catalytic subunit  99.71 
 
 		 342 aa  709    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2068  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 342 aa  710    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2168  integrase catalytic subunit  99.71 
 
 		 342 aa  709    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2624  integrase catalytic subunit  84.5 
 
 		 349 aa  609  1e-173  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1932  integrase catalytic subunit  84.5 
 
 		 349 aa  609  1e-173  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3063  integrase catalytic subunit  84.5 
 
 		 349 aa  609  1e-173  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.517823  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2091  integrase catalytic subunit  84.5 
 
 		 349 aa  609  1e-173  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2334  integrase catalytic subunit  84.5 
 
 		 349 aa  609  1e-173  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1263  integrase catalytic subunit  84.5 
 
 		 349 aa  609  1e-173  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3683  integrase catalytic subunit  84.5 
 
 		 349 aa  609  1e-173  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4318  integrase catalytic subunit  84.5 
 
 		 349 aa  609  1e-173  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2586  integrase catalytic subunit  84.5 
 
 		 349 aa  609  1e-173  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0412118  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0455  integrase catalytic subunit  84.5 
 
 		 349 aa  609  1e-173  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0252  integrase catalytic subunit  84.5 
 
 		 349 aa  609  1e-173  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4443  integrase catalytic subunit  84.5 
 
 		 349 aa  609  1e-173  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.472308  normal  0.634079 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1143  integrase catalytic subunit  84.5 
 
 		 349 aa  609  1e-173  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0742479  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1097  integrase catalytic subunit  84.5 
 
 		 349 aa  609  1e-173  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1259  integrase catalytic subunit  84.5 
 
 		 349 aa  609  1e-173  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4311  integrase catalytic subunit  84.21 
 
 		 349 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3545  integrase catalytic subunit  86.05 
 
 		 317 aa  546  1e-154  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2047  integrase catalytic subunit  85.27 
 
 		 272 aa  463  1e-129  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04943  hypothetical protein  62.69 
 
 		 336 aa  459  9.999999999999999e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02882  hypothetical protein  62.69 
 
 		 336 aa  459  9.999999999999999e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05296  hypothetical protein  62.69 
 
 		 336 aa  459  9.999999999999999e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05476  hypothetical protein  62.69 
 
 		 336 aa  459  9.999999999999999e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05744  hypothetical protein  62.69 
 
 		 336 aa  459  9.999999999999999e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05755  hypothetical protein  62.69 
 
 		 336 aa  459  9.999999999999999e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06031  hypothetical protein  62.69 
 
 		 336 aa  459  9.999999999999999e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06978  hypothetical protein  62.69 
 
 		 336 aa  459  9.999999999999999e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07079  hypothetical protein  62.69 
 
 		 336 aa  459  9.999999999999999e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02043  hypothetical protein  62.69 
 
 		 336 aa  459  9.999999999999999e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01718  hypothetical protein  62.69 
 
 		 336 aa  459  9.999999999999999e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02798  hypothetical protein  62.39 
 
 		 336 aa  457  1e-127  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06489  hypothetical protein  62.39 
 
 		 336 aa  457  1e-127  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04732  hypothetical protein  62.39 
 
 		 336 aa  457  1e-127  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3143  integrase catalytic subunit  58.97 
 
 		 354 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.182234  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0130  integrase catalytic subunit  58.97 
 
 		 354 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1942  integrase catalytic subunit  58.97 
 
 		 354 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0818  integrase catalytic subunit  58.97 
 
 		 354 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0730  integrase catalytic subunit  58.97 
 
 		 354 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1254  integrase catalytic subunit  58.97 
 
 		 354 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4350  integrase catalytic subunit  58.97 
 
 		 354 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3392  Integrase catalytic region  58.02 
 
 		 327 aa  399  9.999999999999999e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3414  Integrase catalytic region  57.45 
 
 		 331 aa  401  9.999999999999999e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2063  transposase  57.41 
 
 		 319 aa  389  1e-107  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000046959  decreased coverage  0.0000244555 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2564  Integrase catalytic region  58.68 
 
 		 294 aa  371  1e-101  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0731  integrase catalytic subunit  55.11 
 
 		 375 aa  359  4e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2337  integrase catalytic subunit  52.57 
 
 		 354 aa  359  5e-98  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3832  hypothetical protein  54.49 
 
 		 375 aa  350  2e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.819891  normal  0.0624726 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1432  integrase catalytic subunit  54.49 
 
 		 375 aa  350  2e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.622939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2329  integrase catalytic subunit  51.36 
 
 		 352 aa  349  4e-95  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558623 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3130  integrase catalytic region  48.78 
 
 		 347 aa  343  2e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4151  integrase catalytic region  48.48 
 
 		 347 aa  340  2.9999999999999998e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01835  putative transposase  55.39 
 
 		 275 aa  337  1.9999999999999998e-91  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.129668  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02257  putative transposase  55.39 
 
 		 275 aa  337  1.9999999999999998e-91  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01833  putative transposase  55.39 
 
 		 275 aa  337  1.9999999999999998e-91  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3001  integrase catalytic region  48.39 
 
 		 362 aa  331  1e-89  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2306  integrase catalytic region  48.39 
 
 		 362 aa  331  1e-89  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3660  integrase catalytic subunit  48.55 
 
 		 364 aa  327  2.0000000000000001e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2135  integrase catalytic subunit  48.55 
 
 		 364 aa  327  2.0000000000000001e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.599497 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2427  integrase catalytic subunit  48.55 
 
 		 364 aa  327  2.0000000000000001e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.8611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2875  integrase catalytic subunit  48.55 
 
 		 364 aa  327  2.0000000000000001e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.398245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3792  integrase catalytic subunit  48.55 
 
 		 364 aa  327  2.0000000000000001e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3341  integrase catalytic subunit  48.55 
 
 		 364 aa  327  2.0000000000000001e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1103  integrase catalytic subunit  48.55 
 
 		 364 aa  327  2.0000000000000001e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.225158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0694  integrase catalytic subunit  48.55 
 
 		 364 aa  327  2.0000000000000001e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0720  integrase catalytic subunit  48.55 
 
 		 364 aa  327  2.0000000000000001e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1073  integrase catalytic subunit  48.55 
 
 		 364 aa  327  2.0000000000000001e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0369  Integrase catalytic region  47.6 
 
 		 355 aa  326  3e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.375547 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1238  integrase catalytic subunit  48.83 
 
 		 341 aa  325  8.000000000000001e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3318  integrase catalytic subunit  48.83 
 
 		 341 aa  325  8.000000000000001e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1907  integrase catalytic subunit  48.26 
 
 		 364 aa  325  8.000000000000001e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.247282  decreased coverage  0.000309488 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3027  integrase catalytic subunit  48.83 
 
 		 341 aa  325  8.000000000000001e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1517  integrase catalytic subunit  48.26 
 
 		 364 aa  325  8.000000000000001e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.37516  normal  0.381442 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3798  integrase catalytic subunit  48.26 
 
 		 364 aa  325  8.000000000000001e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4367  integrase catalytic subunit  48.83 
 
 		 341 aa  325  8.000000000000001e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0318  integrase catalytic subunit  48.83 
 
 		 341 aa  325  8.000000000000001e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2204  integrase catalytic subunit  48.83 
 
 		 341 aa  325  8.000000000000001e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4345  integrase catalytic subunit  48.83 
 
 		 341 aa  325  8.000000000000001e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.862842  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3928  integrase catalytic subunit  48.83 
 
 		 341 aa  325  8.000000000000001e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4357  integrase catalytic subunit  48.26 
 
 		 364 aa  323  3e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2773  integrase catalytic subunit  48.26 
 
 		 364 aa  323  3e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3763  integrase catalytic subunit  48.26 
 
 		 364 aa  323  3e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1541  integrase catalytic subunit  51.31 
 
 		 318 aa  319  6e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3821  integrase catalytic subunit  51.31 
 
 		 318 aa  319  6e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000253663  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4153  integrase catalytic region  46.67 
 
 		 363 aa  308  9e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02618  putative transposase  54.62 
 
 		 256 aa  307  2.0000000000000002e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0376  Integrase catalytic region  47.15 
 
 		 325 aa  294  1e-78  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000454687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2536  Integrase catalytic region  46.84 
 
 		 325 aa  293  2e-78  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000616979  normal  0.891736 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1698  integrase catalytic subunit  44.28 
 
 		 327 aa  276  5e-73  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000748356  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1855  putative transposase  43.64 
 
 		 327 aa  274  1.0000000000000001e-72  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000000952934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0305  integrase catalytic subunit  51.34 
 
 		 271 aa  268  8.999999999999999e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.667287  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4356  Integrase catalytic region  43.87 
 
 		 438 aa  268  1e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.699845  normal  0.344395 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2098  Integrase catalytic region  41.87 
 
 		 327 aa  266  2.9999999999999995e-70  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0649  Integrase catalytic region  42.17 
 
 		 327 aa  259  3e-68  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.387806  normal  0.285781 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1890  Integrase catalytic region  44.36 
 
 		 278 aa  240  2.9999999999999997e-62  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2221  integrase catalytic subunit  42.31 
 
 		 310 aa  236  4e-61  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000300486  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3413  putative transposase  55.31 
 
 		 188 aa  214  9.999999999999999e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3168  Integrase catalytic region  42.97 
 
 		 350 aa  200  3e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1100  conserved hypothetical transposase  41.83 
 
 		 259 aa  199  6e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00213813  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>