More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2306 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2306  integrase catalytic region  100 
 
 		 362 aa  740    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3001  integrase catalytic region  100 
 
 		 362 aa  740    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2427  integrase catalytic subunit  72.25 
 
 		 364 aa  546  1e-154  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.8611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2135  integrase catalytic subunit  72.25 
 
 		 364 aa  546  1e-154  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.599497 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1907  integrase catalytic subunit  71.98 
 
 		 364 aa  545  1e-154  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.247282  decreased coverage  0.000309488 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3660  integrase catalytic subunit  72.25 
 
 		 364 aa  546  1e-154  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3341  integrase catalytic subunit  72.25 
 
 		 364 aa  546  1e-154  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2875  integrase catalytic subunit  72.25 
 
 		 364 aa  546  1e-154  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.398245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0694  integrase catalytic subunit  72.25 
 
 		 364 aa  546  1e-154  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3792  integrase catalytic subunit  72.25 
 
 		 364 aa  546  1e-154  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0720  integrase catalytic subunit  72.25 
 
 		 364 aa  546  1e-154  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1073  integrase catalytic subunit  72.25 
 
 		 364 aa  546  1e-154  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1103  integrase catalytic subunit  72.25 
 
 		 364 aa  546  1e-154  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.225158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1517  integrase catalytic subunit  71.98 
 
 		 364 aa  545  1e-154  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.37516  normal  0.381442 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4357  integrase catalytic subunit  71.98 
 
 		 364 aa  542  1e-153  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3798  integrase catalytic subunit  71.7 
 
 		 364 aa  543  1e-153  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2773  integrase catalytic subunit  71.98 
 
 		 364 aa  542  1e-153  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3763  integrase catalytic subunit  71.98 
 
 		 364 aa  542  1e-153  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4153  integrase catalytic region  73.83 
 
 		 363 aa  535  1e-151  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0369  Integrase catalytic region  69.58 
 
 		 355 aa  513  1e-144  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.375547 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3130  integrase catalytic region  54.39 
 
 		 347 aa  365  1e-100  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4151  integrase catalytic region  53.8 
 
 		 347 aa  359  3e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3392  Integrase catalytic region  52.91 
 
 		 327 aa  348  6e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3414  Integrase catalytic region  52.58 
 
 		 331 aa  348  1e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2337  integrase catalytic subunit  51.58 
 
 		 354 aa  348  1e-94  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3143  integrase catalytic subunit  49.71 
 
 		 354 aa  347  2e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.182234  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1942  integrase catalytic subunit  49.71 
 
 		 354 aa  347  2e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0818  integrase catalytic subunit  49.71 
 
 		 354 aa  347  2e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0730  integrase catalytic subunit  49.71 
 
 		 354 aa  347  2e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0130  integrase catalytic subunit  49.71 
 
 		 354 aa  347  2e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4350  integrase catalytic subunit  49.71 
 
 		 354 aa  347  2e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1254  integrase catalytic subunit  49.71 
 
 		 354 aa  347  2e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2329  integrase catalytic subunit  52.74 
 
 		 352 aa  346  4e-94  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558623 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2063  transposase  53.29 
 
 		 319 aa  341  1e-92  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000046959  decreased coverage  0.0000244555 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1475  integrase catalytic subunit  48.68 
 
 		 342 aa  333  3e-90  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2168  integrase catalytic subunit  48.68 
 
 		 342 aa  333  3e-90  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4311  integrase catalytic subunit  47.29 
 
 		 349 aa  331  1e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2068  integrase catalytic subunit  48.39 
 
 		 342 aa  331  1e-89  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2091  integrase catalytic subunit  47.01 
 
 		 349 aa  328  9e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2586  integrase catalytic subunit  47.01 
 
 		 349 aa  328  9e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0412118  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2624  integrase catalytic subunit  47.01 
 
 		 349 aa  328  9e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4318  integrase catalytic subunit  47.01 
 
 		 349 aa  328  9e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1932  integrase catalytic subunit  47.01 
 
 		 349 aa  328  9e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2334  integrase catalytic subunit  47.01 
 
 		 349 aa  328  9e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0455  integrase catalytic subunit  47.01 
 
 		 349 aa  328  9e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0252  integrase catalytic subunit  47.01 
 
 		 349 aa  328  9e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1143  integrase catalytic subunit  47.01 
 
 		 349 aa  328  9e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0742479  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1097  integrase catalytic subunit  47.01 
 
 		 349 aa  328  9e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4443  integrase catalytic subunit  47.01 
 
 		 349 aa  328  9e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.472308  normal  0.634079 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3683  integrase catalytic subunit  47.01 
 
 		 349 aa  328  9e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3063  integrase catalytic subunit  47.01 
 
 		 349 aa  328  9e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.517823  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1259  integrase catalytic subunit  47.01 
 
 		 349 aa  328  9e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1263  integrase catalytic subunit  47.01 
 
 		 349 aa  328  9e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0731  integrase catalytic subunit  51.88 
 
 		 375 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05755  hypothetical protein  47.6 
 
 		 336 aa  325  7e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06031  hypothetical protein  47.6 
 
 		 336 aa  325  7e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05296  hypothetical protein  47.6 
 
 		 336 aa  325  7e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05476  hypothetical protein  47.6 
 
 		 336 aa  325  7e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05744  hypothetical protein  47.6 
 
 		 336 aa  325  7e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02882  hypothetical protein  47.6 
 
 		 336 aa  325  7e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04943  hypothetical protein  47.6 
 
 		 336 aa  325  7e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07079  hypothetical protein  47.6 
 
 		 336 aa  325  7e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01718  hypothetical protein  47.6 
 
 		 336 aa  325  7e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06978  hypothetical protein  47.6 
 
 		 336 aa  325  7e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02043  hypothetical protein  47.6 
 
 		 336 aa  325  7e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04732  hypothetical protein  47.31 
 
 		 336 aa  323  4e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02798  hypothetical protein  47.31 
 
 		 336 aa  323  4e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06489  hypothetical protein  47.31 
 
 		 336 aa  323  4e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3832  hypothetical protein  51.59 
 
 		 375 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.819891  normal  0.0624726 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1432  integrase catalytic subunit  51.59 
 
 		 375 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.622939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3027  integrase catalytic subunit  47.76 
 
 		 341 aa  319  3.9999999999999996e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2204  integrase catalytic subunit  47.76 
 
 		 341 aa  319  3.9999999999999996e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3318  integrase catalytic subunit  47.76 
 
 		 341 aa  319  3.9999999999999996e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3928  integrase catalytic subunit  47.76 
 
 		 341 aa  319  3.9999999999999996e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4345  integrase catalytic subunit  47.76 
 
 		 341 aa  319  3.9999999999999996e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.862842  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4367  integrase catalytic subunit  47.76 
 
 		 341 aa  319  3.9999999999999996e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0318  integrase catalytic subunit  47.76 
 
 		 341 aa  319  3.9999999999999996e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1238  integrase catalytic subunit  47.76 
 
 		 341 aa  319  3.9999999999999996e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2564  Integrase catalytic region  54.11 
 
 		 294 aa  318  7.999999999999999e-86  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3821  integrase catalytic subunit  50.65 
 
 		 318 aa  315  7e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000253663  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1541  integrase catalytic subunit  50.65 
 
 		 318 aa  315  7e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0376  Integrase catalytic region  46.91 
 
 		 325 aa  313  3.9999999999999997e-84  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000454687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2536  Integrase catalytic region  46.6 
 
 		 325 aa  311  7.999999999999999e-84  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000616979  normal  0.891736 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3545  integrase catalytic subunit  47.91 
 
 		 317 aa  301  1e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01835  putative transposase  52.42 
 
 		 275 aa  301  1e-80  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.129668  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02257  putative transposase  52.42 
 
 		 275 aa  301  1e-80  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01833  putative transposase  52.42 
 
 		 275 aa  301  1e-80  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0305  integrase catalytic subunit  50.18 
 
 		 271 aa  278  9e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.667287  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2098  Integrase catalytic region  44.28 
 
 		 327 aa  278  1e-73  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02618  putative transposase  51.98 
 
 		 256 aa  276  4e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4356  Integrase catalytic region  45.59 
 
 		 438 aa  273  4.0000000000000004e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.699845  normal  0.344395 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1855  putative transposase  43.94 
 
 		 327 aa  271  9e-72  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000000952934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1698  integrase catalytic subunit  43.37 
 
 		 327 aa  271  1e-71  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000748356  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2221  integrase catalytic subunit  43.85 
 
 		 310 aa  265  1e-69  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000300486  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0649  Integrase catalytic region  43.37 
 
 		 327 aa  263  3e-69  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.387806  normal  0.285781 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2047  integrase catalytic subunit  46.67 
 
 		 272 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1890  Integrase catalytic region  41.88 
 
 		 278 aa  219  5e-56  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3124  hypothetical protein  48.58 
 
 		 232 aa  209  4e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.010026  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13466  transposase  45.49 
 
 		 387 aa  195  1e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00499866  hitchhiker  0.000220656 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1958  integrase  40.52 
 
 		 350 aa  192  8e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>