More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1238 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_0318  integrase catalytic subunit  100 
 
 
341 aa  708    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4345  integrase catalytic subunit  100 
 
 
341 aa  708    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.862842  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1238  integrase catalytic subunit  100 
 
 
341 aa  708    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2204  integrase catalytic subunit  100 
 
 
341 aa  708    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3027  integrase catalytic subunit  100 
 
 
341 aa  708    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3318  integrase catalytic subunit  100 
 
 
341 aa  708    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3928  integrase catalytic subunit  100 
 
 
341 aa  708    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4367  integrase catalytic subunit  100 
 
 
341 aa  708    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0376  Integrase catalytic region  52.34 
 
 
325 aa  366  1e-100  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000454687  normal 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2536  Integrase catalytic region  52.02 
 
 
325 aa  364  1e-99  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000616979  normal  0.891736 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0369  Integrase catalytic region  47.94 
 
 
355 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.375547 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1475  integrase catalytic subunit  49.12 
 
 
342 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2168  integrase catalytic subunit  49.12 
 
 
342 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4311  integrase catalytic subunit  49.12 
 
 
349 aa  327  3e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4443  integrase catalytic subunit  49.12 
 
 
349 aa  325  7e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.472308  normal  0.634079 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0455  integrase catalytic subunit  49.12 
 
 
349 aa  325  7e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2586  integrase catalytic subunit  49.12 
 
 
349 aa  325  7e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0412118  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0252  integrase catalytic subunit  49.12 
 
 
349 aa  325  7e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3063  integrase catalytic subunit  49.12 
 
 
349 aa  325  7e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.517823  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1259  integrase catalytic subunit  49.12 
 
 
349 aa  325  7e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1263  integrase catalytic subunit  49.12 
 
 
349 aa  325  7e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1932  integrase catalytic subunit  49.12 
 
 
349 aa  325  7e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1143  integrase catalytic subunit  49.12 
 
 
349 aa  325  7e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0742479  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1097  integrase catalytic subunit  49.12 
 
 
349 aa  325  7e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2091  integrase catalytic subunit  49.12 
 
 
349 aa  325  7e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2334  integrase catalytic subunit  49.12 
 
 
349 aa  325  7e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4318  integrase catalytic subunit  49.12 
 
 
349 aa  325  7e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2624  integrase catalytic subunit  49.12 
 
 
349 aa  325  7e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3683  integrase catalytic subunit  49.12 
 
 
349 aa  325  7e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2068  integrase catalytic subunit  48.83 
 
 
342 aa  325  8.000000000000001e-88  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0130  integrase catalytic subunit  48.82 
 
 
354 aa  324  1e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0730  integrase catalytic subunit  48.82 
 
 
354 aa  324  1e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1254  integrase catalytic subunit  48.82 
 
 
354 aa  324  1e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1942  integrase catalytic subunit  48.82 
 
 
354 aa  324  1e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3143  integrase catalytic subunit  48.82 
 
 
354 aa  324  1e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.182234  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4350  integrase catalytic subunit  48.82 
 
 
354 aa  324  1e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0818  integrase catalytic subunit  48.82 
 
 
354 aa  324  1e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1541  integrase catalytic subunit  51.62 
 
 
318 aa  322  5e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3821  integrase catalytic subunit  51.62 
 
 
318 aa  322  5e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000253663  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0731  integrase catalytic subunit  52.17 
 
 
375 aa  322  7e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3001  integrase catalytic region  47.76 
 
 
362 aa  319  3e-86  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2306  integrase catalytic region  47.76 
 
 
362 aa  319  3e-86  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2875  integrase catalytic subunit  48.8 
 
 
364 aa  317  2e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.398245  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2135  integrase catalytic subunit  48.8 
 
 
364 aa  317  2e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.599497 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3792  integrase catalytic subunit  48.8 
 
 
364 aa  317  2e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3660  integrase catalytic subunit  48.8 
 
 
364 aa  317  2e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0720  integrase catalytic subunit  48.8 
 
 
364 aa  317  2e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2427  integrase catalytic subunit  48.8 
 
 
364 aa  317  2e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.8611  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1103  integrase catalytic subunit  48.8 
 
 
364 aa  317  2e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.225158  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3341  integrase catalytic subunit  48.8 
 
 
364 aa  317  2e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0694  integrase catalytic subunit  48.8 
 
 
364 aa  317  2e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1073  integrase catalytic subunit  48.8 
 
 
364 aa  317  2e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3832  hypothetical protein  51.24 
 
 
375 aa  317  3e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.819891  normal  0.0624726 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1432  integrase catalytic subunit  51.24 
 
 
375 aa  317  3e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.622939  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2329  integrase catalytic subunit  49.4 
 
 
352 aa  316  4e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.558623 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05476  hypothetical protein  47.45 
 
 
336 aa  315  5e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02882  hypothetical protein  47.45 
 
 
336 aa  315  5e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04943  hypothetical protein  47.45 
 
 
336 aa  315  5e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05296  hypothetical protein  47.45 
 
 
336 aa  315  5e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05744  hypothetical protein  47.45 
 
 
336 aa  315  5e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05755  hypothetical protein  47.45 
 
 
336 aa  315  5e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06031  hypothetical protein  47.45 
 
 
336 aa  315  5e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06978  hypothetical protein  47.45 
 
 
336 aa  315  5e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07079  hypothetical protein  47.45 
 
 
336 aa  315  5e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01718  hypothetical protein  47.45 
 
 
336 aa  315  5e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02043  hypothetical protein  47.45 
 
 
336 aa  315  5e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2337  integrase catalytic subunit  48.8 
 
 
354 aa  315  6e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1517  integrase catalytic subunit  48.49 
 
 
364 aa  315  9e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.37516  normal  0.381442 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3798  integrase catalytic subunit  48.49 
 
 
364 aa  315  9e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1907  integrase catalytic subunit  48.49 
 
 
364 aa  315  9e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.247282  decreased coverage  0.000309488 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02798  hypothetical protein  47.15 
 
 
336 aa  313  1.9999999999999998e-84  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04732  hypothetical protein  47.15 
 
 
336 aa  313  1.9999999999999998e-84  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06489  hypothetical protein  47.15 
 
 
336 aa  313  1.9999999999999998e-84  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4357  integrase catalytic subunit  48.49 
 
 
364 aa  313  2.9999999999999996e-84  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2773  integrase catalytic subunit  48.49 
 
 
364 aa  313  2.9999999999999996e-84  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3763  integrase catalytic subunit  48.49 
 
 
364 aa  313  2.9999999999999996e-84  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4356  Integrase catalytic region  48.46 
 
 
438 aa  312  3.9999999999999997e-84  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.699845  normal  0.344395 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3130  integrase catalytic region  47.58 
 
 
347 aa  313  3.9999999999999997e-84  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4151  integrase catalytic region  46.65 
 
 
347 aa  308  1.0000000000000001e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2063  transposase  46.5 
 
 
319 aa  296  4e-79  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000046959  decreased coverage  0.0000244555 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3545  integrase catalytic subunit  50.17 
 
 
317 aa  295  6e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01835  putative transposase  51.46 
 
 
275 aa  295  9e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.129668  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01833  putative transposase  51.46 
 
 
275 aa  295  9e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02257  putative transposase  51.46 
 
 
275 aa  295  9e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4153  integrase catalytic region  45.94 
 
 
363 aa  294  1e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3414  Integrase catalytic region  45.57 
 
 
331 aa  290  4e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3392  Integrase catalytic region  45.79 
 
 
327 aa  288  9e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2564  Integrase catalytic region  46.98 
 
 
294 aa  277  2e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02618  putative transposase  51.97 
 
 
256 aa  276  3e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1855  putative transposase  44.65 
 
 
327 aa  271  1e-71  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000000952934  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1698  integrase catalytic subunit  43.33 
 
 
327 aa  262  4.999999999999999e-69  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000748356  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2098  Integrase catalytic region  44.21 
 
 
327 aa  261  1e-68  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0305  integrase catalytic subunit  49.61 
 
 
271 aa  256  4e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.667287  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0649  Integrase catalytic region  42.12 
 
 
327 aa  250  3e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.387806  normal  0.285781 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2047  integrase catalytic subunit  50.78 
 
 
272 aa  248  8e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2221  integrase catalytic subunit  42.9 
 
 
310 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000300486  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1890  Integrase catalytic region  42.7 
 
 
278 aa  219  3.9999999999999997e-56  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1848  integrase catalytic subunit  35.9 
 
 
332 aa  206  6e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0058  integrase catalytic subunit  35.9 
 
 
332 aa  206  6e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1232  integrase catalytic subunit  35.9 
 
 
332 aa  206  6e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>