24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0556 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_0556  MuA-transposase/repressor protein CI DNA-binding  100 
 
 		 124 aa  254  2e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000035991  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0791  MuA-transposase/repressor protein CI DNA-binding protein  97.58 
 
 		 124 aa  249  8.000000000000001e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000168449  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3363  MuA-transposase/repressor protein CI DNA-binding  65.22 
 
 		 128 aa  150  7e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00000382153  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3483  MuA-transposase/repressor protein CI DNA-binding  64.66 
 
 		 128 aa  149  2e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000503276  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0790  MuA-transposase/repressor protein CI DNA-binding protein  65.22 
 
 		 128 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000163331  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0555  MuA-transposase/repressor protein CI DNA-binding  62.3 
 
 		 128 aa  145  3e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000390603  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3482  MuA-transposase/repressor protein CI DNA-binding  58.12 
 
 		 136 aa  144  5e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000591006  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3362  MuA-transposase/repressor protein CI DNA-binding  52.14 
 
 		 120 aa  120  9e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0000035442  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3972  hypothetical protein  47.41 
 
 		 115 aa  114  3e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000267115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3759  MuA-transposase/repressor protein CI DNA-binding  47.41 
 
 		 115 aa  114  3e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00050742  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3614  hypothetical protein  47.41 
 
 		 115 aa  114  3e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000219883  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3546  MuA-transposase/repressor protein CI DNA-binding  49.56 
 
 		 116 aa  110  5e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0471  hypothetical protein  40.45 
 
 		 90 aa  75.9  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000925994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1049  bacteriophage Mu transposase MuA  36.51 
 
 		 662 aa  58.2  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4367  hypothetical protein  37.7 
 
 		 216 aa  55.1  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.21984  normal  0.0748532 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1050  putative repressor protein  42.37 
 
 		 174 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.678331  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1665  transposase A  37.7 
 
 		 671 aa  50.8  0.000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0643  transposase, putative  38.89 
 
 		 715 aa  50.4  0.000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2068  integrase catalytic region  43.75 
 
 		 738 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00349038  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2115  integrase catalytic region  41.18 
 
 		 738 aa  47.8  0.00005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.245855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3365  Integrase catalytic region  38.71 
 
 		 718 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.582921  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3752  integrase catalytic subunit  33.9 
 
 		 772 aa  44.7  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2603  putative cytoplasmic protein  28.1 
 
 		 124 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.715844 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2615  hypothetical protein  28.1 
 
 		 124 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00121614 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>