66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_0613 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009052  Sbal_3752  porin  97.75 
 
 		 355 aa  704    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000389124  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0635  outer membrane insertion C-terminal signal  98.59 
 
 		 355 aa  711    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0640  porin  99.15 
 
 		 355 aa  717    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0613  porin  100 
 
 		 355 aa  724    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0677  porin  79.15 
 
 		 350 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.127595  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3847  porin  50.69 
 
 		 354 aa  348  1e-94  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2472  porin  47.38 
 
 		 358 aa  298  1e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0827968  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0238  porin  36.26 
 
 		 362 aa  230  3e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2545  porin  37.98 
 
 		 373 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000114495  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4215  porin  38.23 
 
 		 352 aa  220  3.9999999999999997e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.489674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2365  porin  34.44 
 
 		 361 aa  205  1e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.132494  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1360  porin  35.16 
 
 		 383 aa  199  7.999999999999999e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.646468  hitchhiker  0.000832338 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3663  porin  36.33 
 
 		 348 aa  197  3e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0282  porin  36.33 
 
 		 348 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1259  porin  38.78 
 
 		 386 aa  192  9e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.042009 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0230  putative outer membrane protein  26.64 
 
 		 331 aa  68.9  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2569  porin  24.93 
 
 		 365 aa  62.8  0.000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  unclonable  0.0000000237522  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2010  porin  29.78 
 
 		 347 aa  59.7  0.00000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3127  porin Gram-negative type  29.48 
 
 		 333 aa  59.7  0.00000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.970335  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0024  porin Gram-negative type  32.89 
 
 		 350 aa  58.9  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.133917 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05099  porin  27.02 
 
 		 321 aa  54.7  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06287  hypothetical protein  24.36 
 
 		 322 aa  54.7  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1206  putative outer membrane porin  25.74 
 
 		 340 aa  54.3  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0427  putative outer membrane pore protein  27.05 
 
 		 340 aa  54.3  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1069  porin Gram-negative type  24.78 
 
 		 372 aa  53.9  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.992947  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002599  outer membrane protein OmpU  25 
 
 		 336 aa  52.8  0.000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0233564  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2769  porin  26.15 
 
 		 314 aa  52  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0218371  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1474  porin  24.14 
 
 		 311 aa  52.4  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.989546 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0464  porin  39.77 
 
 		 345 aa  52  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000937994  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001232  outer membrane protein OmpU  25.26 
 
 		 319 aa  52  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0870457  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0162  outer membrane protein OmpU  31.86 
 
 		 350 aa  50.4  0.00004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000502396  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3750  outer membrane protein (porin)  27.71 
 
 		 302 aa  50.4  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.817752 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06741  hypothetical protein  24.92 
 
 		 330 aa  50.1  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1073  porin  30.54 
 
 		 308 aa  49.7  0.00008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0147353  normal  0.297004 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0484  outer membrane porin protein precursor  31.18 
 
 		 377 aa  48.9  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1084  porin Gram-negative type  38 
 
 		 370 aa  48.9  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0141489  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0588  major outer membrane protein OmpU  36.04 
 
 		 333 aa  48.9  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0116995  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0260  porin  30.99 
 
 		 378 aa  48.9  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0302  outer membrane porin  31.18 
 
 		 377 aa  48.9  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0289  outer membrane porin  31.18 
 
 		 377 aa  48.9  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3333  porin  32.26 
 
 		 377 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3014  porin  32.26 
 
 		 377 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2079  porin  32.26 
 
 		 377 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3345  outer membrane porin, putative  32.26 
 
 		 377 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3632  porin  28 
 
 		 362 aa  47.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4735  porin  28 
 
 		 362 aa  47.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00659366 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5547  porin  28 
 
 		 362 aa  47.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4871  porin  27.3 
 
 		 371 aa  47.8  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.0000247804  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1557  outer membrane porin, putative  30.66 
 
 		 321 aa  47.8  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2781  hypothetical protein  37.14 
 
 		 355 aa  47.4  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.000000711113  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0448  outer membrane protein (porin)  32.35 
 
 		 362 aa  46.6  0.0006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.0000207768  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6332  porin  25.09 
 
 		 365 aa  46.6  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00191281  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2690  porin  29.79 
 
 		 317 aa  46.6  0.0007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000491313  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03408  hypothetical protein  35 
 
 		 337 aa  46.6  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2282  porin  29.53 
 
 		 357 aa  46.2  0.0009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3410  porin Gram-negative type  29.13 
 
 		 386 aa  45.4  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.670382 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2059  porin Gram-negative type  29.7 
 
 		 351 aa  44.7  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.806422 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2970  porin  29.06 
 
 		 316 aa  44.3  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00088463  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04813  hypothetical protein  23.57 
 
 		 365 aa  44.3  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0682  porin  23.26 
 
 		 362 aa  44.3  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.821761  normal  0.272491 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3613  porin  23.51 
 
 		 310 aa  44.7  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.479442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3905  porin  27.86 
 
 		 413 aa  43.5  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3304  porin  24.32 
 
 		 314 aa  43.1  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000871207  hitchhiker  0.00000130468 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0301  porin  25.44 
 
 		 353 aa  43.1  0.007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0419349  normal  0.206748 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001436  non-specific porin  23.55 
 
 		 323 aa  43.1  0.008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.154506  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2778  porin  31.34 
 
 		 314 aa  42.7  0.01  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000203454  decreased coverage  0.000224903 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>