209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_23990 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_23990  hydrogenase accessory protein HypB  100 
 
 		 230 aa  474  1e-133  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17110  hydrogenase accessory protein HypB  71.37 
 
 		 223 aa  334  5e-91  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1563  hydrogenase accessory protein HypB  44.39 
 
 		 224 aa  201  9e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0444465  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1933  hydrogenase nickel incorporation protein  42.22 
 
 		 223 aa  195  4.0000000000000005e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.125072  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2829  hydrogenase accessory protein HypB  44.09 
 
 		 216 aa  183  2.0000000000000003e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2165  hydrogenase accessory protein HypB  42.6 
 
 		 220 aa  178  5.999999999999999e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.303898  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1212  GTP hydrolase, accessory liganding Ni into hydrogenases, HypB  37.78 
 
 		 264 aa  175  5e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.113745 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11720  hydrogenase accessory protein HypB  42.01 
 
 		 217 aa  175  6e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.708429  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1431  hydrogenase accessory protein HypB  44.9 
 
 		 217 aa  174  8e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1096  hydrogenase accessory protein HypB  41.15 
 
 		 270 aa  174  9.999999999999999e-43  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.445318  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50480  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  41.41 
 
 		 303 aa  173  1.9999999999999998e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0494141  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1239  hydrogenase accessory protein HypB  45.13 
 
 		 217 aa  173  2.9999999999999996e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1213  hydrogenase accessory protein HypB  43.88 
 
 		 218 aa  172  3.9999999999999995e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0929883  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1274  hydrogenase accessory protein HypB  41.1 
 
 		 277 aa  170  2e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.388022  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0933  hydrogenase accessory protein HypB  39.38 
 
 		 262 aa  170  2e-41  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1129  hydrogenase accessory protein HypB  42.22 
 
 		 273 aa  167  1e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0120  hydrogenase accessory protein HypB  42.98 
 
 		 244 aa  167  1e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000574081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3761  hydrogenase accessory protein HypB  38.5 
 
 		 307 aa  167  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4012  hydrogenase accessory protein HypB  42.47 
 
 		 225 aa  167  1e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.411512 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1893  hydrogenase accessory protein HypB  38.5 
 
 		 295 aa  166  2e-40  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2010  hydrogenase accessory protein HypB  43.52 
 
 		 226 aa  167  2e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1046  hydrogenase accessory protein HypB  40.81 
 
 		 246 aa  165  4e-40  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.432152  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2180  hydrogenase accessory protein HypB  41.12 
 
 		 217 aa  165  5e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.352538 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3017  hydrogenase accessory protein HypB  40 
 
 		 217 aa  165  5.9999999999999996e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3978  hydrogenase accessory protein HypB  36.71 
 
 		 352 aa  164  9e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0305  hydrogenase accessory protein HypB  40.35 
 
 		 254 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0726  hydrogenase accessory protein HypB  40.36 
 
 		 247 aa  164  1.0000000000000001e-39  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.932617  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1169  hydrogenase accessory protein HypB  39.91 
 
 		 268 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0580173  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3133  hydrogenase accessory protein HypB  41.63 
 
 		 282 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0652  hydrogenase accessory protein HypB  40.36 
 
 		 247 aa  163  2.0000000000000002e-39  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03880  hydrogenase accessory protein HypB  37.27 
 
 		 215 aa  163  2.0000000000000002e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2744  hydrogenase accessory protein HypB  39.11 
 
 		 293 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0756  hydrogenase accessory protein HypB  38.29 
 
 		 218 aa  162  5.0000000000000005e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.901261  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0791  hydrogenase accessory protein HypB  39.82 
 
 		 244 aa  162  5.0000000000000005e-39  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.557711  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1648  hydrogenase accessory protein HypB  42.52 
 
 		 223 aa  162  5.0000000000000005e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1383  hydrogenase accessory protein HypB  40.54 
 
 		 268 aa  162  6e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0873622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1497  hydrogenase accessory protein HypB  40.72 
 
 		 222 aa  162  6e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0637666  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0448  hydrogenase accessory protein HypB  38.71 
 
 		 220 aa  161  7e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1737  hydrogenase accessory protein HypB  39.11 
 
 		 216 aa  161  7e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1602  hydrogenase accessory protein HypB  37.9 
 
 		 283 aa  160  1e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2781  hydrogenase accessory protein HypB  38.05 
 
 		 276 aa  160  1e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3807  hydrogenase accessory protein HypB  35.84 
 
 		 231 aa  160  1e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0929  hydrogenase accessory protein HypB  38.07 
 
 		 224 aa  160  1e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.367308 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2043  hydrogenase accessory protein HypB  38.33 
 
 		 253 aa  160  2e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0302  hydrogenase accessory protein HypB  38.39 
 
 		 296 aa  160  2e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0469  hydrogenase accessory protein HypB  38.01 
 
 		 230 aa  160  2e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.590808  normal  0.0381022 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0972  hydrogenase accessory protein HypB  34.78 
 
 		 235 aa  159  2e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.423618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1902  hydrogenase accessory protein HypB  38.05 
 
 		 252 aa  160  2e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000389713 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1430  hydrogenase accessory protein HypB  37.78 
 
 		 266 aa  159  3e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3165  hydrogenase accessory protein HypB  38.46 
 
 		 218 aa  159  3e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0461052 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1536  hydrogenase accessory protein HypB  37.5 
 
 		 326 aa  158  5e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0107781  normal  0.0565242 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1949  hydrogenase accessory protein HypB  40.37 
 
 		 253 aa  158  5e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0044  hydrogenase accessory protein HypB  36.65 
 
 		 250 aa  158  8e-38  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2145  hydrogenase accessory protein HypB  40.64 
 
 		 261 aa  157  1e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2191  hydrogenase accessory protein HypB  40.64 
 
 		 261 aa  157  1e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.23017 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1816  hydrogenase accessory protein HypB  38.22 
 
 		 253 aa  156  2e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2018  hydrogenase accessory protein HypB  40.54 
 
 		 315 aa  157  2e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.709474  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1098  hydrogenase accessory protein HypB  37.89 
 
 		 278 aa  157  2e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2007  hydrogenase nickel incorporation  36 
 
 		 321 aa  157  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.300196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1666  hydrogenase accessory protein HypB  39.81 
 
 		 268 aa  156  3e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.742103  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3978  hydrogenase accessory protein HypB  37.39 
 
 		 283 aa  156  3e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.83518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2132  hydrogenase accessory protein HypB  40.18 
 
 		 263 aa  155  4e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00364389 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2093  hydrogenase accessory protein HypB  37.78 
 
 		 264 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2109  hydrogenase accessory protein HypB  36.28 
 
 		 239 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.432968  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00350  hydrogenase accessory protein HypB  37.16 
 
 		 248 aa  155  6e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1836  hydrogenase accessory protein HypB  36.89 
 
 		 260 aa  155  7e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1915  hydrogenase accessory protein HypB  37.33 
 
 		 281 aa  154  1e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.228802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1871  hydrogenase accessory protein HypB  37.33 
 
 		 253 aa  154  1e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3108  hydrogenase accessory protein HypB  40.36 
 
 		 306 aa  154  1e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3363  hydrogenase accessory protein HypB  35.65 
 
 		 220 aa  153  2e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2977  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  36.4 
 
 		 290 aa  153  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3060  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  36.4 
 
 		 290 aa  153  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0585288 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4096  hydrogenase accessory protein HypB  37.73 
 
 		 312 aa  153  2e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2161  hydrogenase accessory protein HypB  37.78 
 
 		 253 aa  153  2e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3044  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  36.4 
 
 		 290 aa  153  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00655441 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1908  hydrogenase accessory protein HypB  36.89 
 
 		 277 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.121577  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3008  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  36.4 
 
 		 290 aa  153  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0101113 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1883  hydrogenase accessory protein HypB  36.89 
 
 		 281 aa  153  2e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0330  hydrogenase accessory protein HypB  37.84 
 
 		 294 aa  153  2e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0164285  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0478  hydrogenase nickel incorporation  37.67 
 
 		 237 aa  153  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.278517  normal  0.249483 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4559  hydrogenase accessory protein HypB  40 
 
 		 301 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0438  hydrogenase accessory protein HypB  36.56 
 
 		 284 aa  152  4e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.408549 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2417  hydrogenase accessory protein HypB  37.67 
 
 		 267 aa  152  4e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0580161  normal  0.128777 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1079  hydrogenase accessory protein HypB  38.01 
 
 		 297 aa  152  5e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0788642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1759  hydrogenase accessory protein HypB  35.09 
 
 		 277 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2027  hydrogenase accessory protein HypB  35.68 
 
 		 253 aa  151  7e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2527  hydrogenase accessory protein HypB  39.55 
 
 		 407 aa  151  8e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.455957  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7255  hydrogenase accessory protein HypB  37.44 
 
 		 292 aa  151  8e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.634166  normal  0.351792 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2411  hydrogenase accessory protein HypB  36.89 
 
 		 285 aa  151  8.999999999999999e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0449174  decreased coverage  0.00000969961 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0427  hydrogenase accessory protein HypB  36.12 
 
 		 284 aa  150  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0506  NI2+-binding GTPase protein HypB  38.94 
 
 		 289 aa  149  2e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3015  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  35.96 
 
 		 290 aa  150  2e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1166  hydrogenase accessory protein HypB  36.94 
 
 		 318 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.153393  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4493  hydrogenase accessory protein HypB  36.73 
 
 		 300 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.166702 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3214  hydrogenase accessory protein HypB  36.65 
 
 		 303 aa  150  2e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3165  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  35.96 
 
 		 290 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.591749 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1673  hydrogenase accessory protein HypB  35.68 
 
 		 258 aa  150  2e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0985  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  35.96 
 
 		 290 aa  149  3e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.225312 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2864  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  35.96 
 
 		 290 aa  149  3e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02542  hypothetical protein  35.96 
 
 		 290 aa  149  3e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>