261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_17110 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_17110  hydrogenase accessory protein HypB  100 
 
 		 223 aa  456  1e-127  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23990  hydrogenase accessory protein HypB  71.37 
 
 		 230 aa  334  5e-91  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1933  hydrogenase nickel incorporation protein  44.24 
 
 		 223 aa  201  7e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.125072  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1563  hydrogenase accessory protein HypB  43.93 
 
 		 224 aa  197  1.0000000000000001e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0444465  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2165  hydrogenase accessory protein HypB  47.53 
 
 		 220 aa  189  4e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.303898  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1239  hydrogenase accessory protein HypB  44.98 
 
 		 217 aa  188  4e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1431  hydrogenase accessory protein HypB  45.54 
 
 		 217 aa  188  5e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1213  hydrogenase accessory protein HypB  45.54 
 
 		 218 aa  188  5.999999999999999e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0929883  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2010  hydrogenase accessory protein HypB  45.89 
 
 		 226 aa  187  8e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2829  hydrogenase accessory protein HypB  44.08 
 
 		 216 aa  187  1e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50480  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  41.44 
 
 		 303 aa  184  7e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0494141  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2018  hydrogenase accessory protein HypB  43.06 
 
 		 315 aa  181  6e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.709474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1096  hydrogenase accessory protein HypB  42.2 
 
 		 270 aa  180  1e-44  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.445318  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11720  hydrogenase accessory protein HypB  44.86 
 
 		 217 aa  179  2.9999999999999997e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.708429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2744  hydrogenase accessory protein HypB  41.01 
 
 		 293 aa  178  4.999999999999999e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0933  hydrogenase accessory protein HypB  41.28 
 
 		 262 aa  178  5.999999999999999e-44  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3363  hydrogenase accessory protein HypB  41.83 
 
 		 220 aa  178  7e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2043  hydrogenase accessory protein HypB  40.83 
 
 		 253 aa  176  3e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1169  hydrogenase accessory protein HypB  41.01 
 
 		 268 aa  176  3e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0580173  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0448  hydrogenase accessory protein HypB  43.27 
 
 		 220 aa  175  5e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3761  hydrogenase accessory protein HypB  39.17 
 
 		 307 aa  175  6e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4012  hydrogenase accessory protein HypB  44.98 
 
 		 225 aa  175  6e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.411512 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1212  GTP hydrolase, accessory liganding Ni into hydrogenases, HypB  39.05 
 
 		 264 aa  174  6e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.113745 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4559  hydrogenase accessory protein HypB  43.32 
 
 		 301 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0044  hydrogenase accessory protein HypB  39.53 
 
 		 250 aa  174  9.999999999999999e-43  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2886  hydrogenase accessory protein HypB  40.74 
 
 		 267 aa  172  5e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.896709  normal  0.39572 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1893  hydrogenase accessory protein HypB  40.27 
 
 		 295 aa  172  5e-42  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3288  hydrogenase accessory protein HypB  40.74 
 
 		 266 aa  172  5e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4493  hydrogenase accessory protein HypB  40.91 
 
 		 300 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.166702 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3017  hydrogenase accessory protein HypB  40 
 
 		 217 aa  169  3e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3165  hydrogenase accessory protein HypB  41.94 
 
 		 218 aa  167  8e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0461052 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2007  hydrogenase nickel incorporation  37.44 
 
 		 321 aa  167  1e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.300196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0120  hydrogenase accessory protein HypB  42.53 
 
 		 244 aa  167  1e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000574081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1497  hydrogenase accessory protein HypB  42.33 
 
 		 222 aa  167  1e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0637666  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1046  hydrogenase accessory protein HypB  42.31 
 
 		 246 aa  167  1e-40  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.432152  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0756  hydrogenase accessory protein HypB  40.38 
 
 		 218 aa  166  2e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.901261  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1098  hydrogenase accessory protein HypB  39.73 
 
 		 278 aa  166  2e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0652  hydrogenase accessory protein HypB  41.83 
 
 		 247 aa  167  2e-40  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0972  hydrogenase accessory protein HypB  37.61 
 
 		 235 aa  167  2e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.423618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3881  hydrogenase accessory protein HypB  41.38 
 
 		 242 aa  167  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.785177 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0726  hydrogenase accessory protein HypB  41.83 
 
 		 247 aa  166  2.9999999999999998e-40  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.932617  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0791  hydrogenase accessory protein HypB  39.45 
 
 		 244 aa  166  2.9999999999999998e-40  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.557711  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1166  hydrogenase accessory protein HypB  39.35 
 
 		 318 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.153393  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3807  hydrogenase accessory protein HypB  38.46 
 
 		 231 aa  165  4e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2977  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  38.64 
 
 		 290 aa  165  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3044  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  38.64 
 
 		 290 aa  165  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00655441 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3133  hydrogenase accessory protein HypB  41.63 
 
 		 282 aa  165  4e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3978  hydrogenase accessory protein HypB  40.65 
 
 		 283 aa  166  4e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.83518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3060  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  38.64 
 
 		 290 aa  165  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0585288 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0305  hydrogenase accessory protein HypB  41.63 
 
 		 254 aa  165  5e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3008  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  38.64 
 
 		 290 aa  165  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0101113 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0929  hydrogenase accessory protein HypB  41.83 
 
 		 224 aa  165  5.9999999999999996e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.367308 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0469  hydrogenase accessory protein HypB  39.44 
 
 		 230 aa  164  6.9999999999999995e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.590808  normal  0.0381022 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2145  hydrogenase accessory protein HypB  41.04 
 
 		 261 aa  164  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2191  hydrogenase accessory protein HypB  41.04 
 
 		 261 aa  164  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.23017 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2027  hydrogenase accessory protein HypB  38.64 
 
 		 253 aa  164  8e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3978  hydrogenase accessory protein HypB  37.21 
 
 		 352 aa  164  9e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1129  hydrogenase accessory protein HypB  40.93 
 
 		 273 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2180  hydrogenase accessory protein HypB  40.38 
 
 		 217 aa  164  1.0000000000000001e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.352538 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1737  hydrogenase accessory protein HypB  39.73 
 
 		 216 aa  164  1.0000000000000001e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1673  hydrogenase accessory protein HypB  40.09 
 
 		 258 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1759  hydrogenase accessory protein HypB  38.01 
 
 		 277 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3066  hydrogenase accessory protein HypB  40.85 
 
 		 286 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.13732  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7255  hydrogenase accessory protein HypB  39.05 
 
 		 292 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.634166  normal  0.351792 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2132  hydrogenase accessory protein HypB  40.57 
 
 		 263 aa  163  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00364389 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3015  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  38.64 
 
 		 290 aa  162  3e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1383  hydrogenase accessory protein HypB  41.55 
 
 		 268 aa  162  3e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0873622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3922  hydrogenase accessory protein HypB  40.74 
 
 		 322 aa  162  3e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.320935  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03880  hydrogenase accessory protein HypB  37.91 
 
 		 215 aa  162  3e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02577  GTP hydrolase involved in nickel liganding into hydrogenases  39.01 
 
 		 290 aa  162  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0962  hydrogenase accessory protein HypB  39.01 
 
 		 290 aa  162  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2864  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  39.01 
 
 		 290 aa  162  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2852  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  39.01 
 
 		 290 aa  162  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.484483 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0985  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  39.01 
 
 		 290 aa  162  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.225312 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1949  hydrogenase accessory protein HypB  40 
 
 		 253 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3150  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  39.01 
 
 		 290 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02542  hypothetical protein  39.01 
 
 		 290 aa  162  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1666  hydrogenase accessory protein HypB  41.01 
 
 		 268 aa  162  5.0000000000000005e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.742103  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0330  hydrogenase accessory protein HypB  39.01 
 
 		 294 aa  162  5.0000000000000005e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0164285  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3165  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  38.18 
 
 		 290 aa  161  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.591749 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3979  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  39.01 
 
 		 290 aa  161  7e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0924  hydrogenase accessory protein HypB  38.6 
 
 		 227 aa  161  8.000000000000001e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00107635 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1274  hydrogenase accessory protein HypB  39.9 
 
 		 277 aa  161  8.000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.388022  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1430  hydrogenase accessory protein HypB  38.6 
 
 		 266 aa  160  1e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0302  hydrogenase accessory protein HypB  38.71 
 
 		 296 aa  160  1e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1174  hydrogenase accessory protein HypB  40.19 
 
 		 312 aa  160  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.150463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2781  hydrogenase accessory protein HypB  38.79 
 
 		 276 aa  160  1e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2527  hydrogenase accessory protein HypB  39.44 
 
 		 407 aa  160  2e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.455957  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1902  hydrogenase accessory protein HypB  39.45 
 
 		 252 aa  160  2e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000389713 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1602  hydrogenase accessory protein HypB  39.81 
 
 		 283 aa  159  3e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1307  hydrogenase accessory protein HypB  40.87 
 
 		 219 aa  159  4e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00162338  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1648  hydrogenase accessory protein HypB  44.12 
 
 		 223 aa  159  4e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0506  NI2+-binding GTPase protein HypB  39.64 
 
 		 289 aa  158  5e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3365  hydrogenase expression/synthesis, HypA  38.29 
 
 		 263 aa  158  5e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.186715 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1536  hydrogenase accessory protein HypB  37.85 
 
 		 326 aa  158  7e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0107781  normal  0.0565242 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2109  hydrogenase accessory protein HypB  39.45 
 
 		 239 aa  158  8e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.432968  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2417  hydrogenase accessory protein HypB  38.14 
 
 		 267 aa  158  8e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0580161  normal  0.128777 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3200  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  38.64 
 
 		 287 aa  157  9e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.747467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1079  hydrogenase accessory protein HypB  39.62 
 
 		 297 aa  157  1e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0788642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2157  hydrogenase accessory protein HypB  39.19 
 
 		 289 aa  157  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.126874  normal  0.122693 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>