More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_4095 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_4095  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  100 
 
 
555 aa  1140    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.711821 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1249  L-aspartate oxidase  58.69 
 
 
532 aa  601  1e-170  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00428614  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2665  L-aspartate oxidase  55.29 
 
 
538 aa  580  1e-164  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1746  L-aspartate oxidase  53.43 
 
 
553 aa  569  1e-161  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0359487 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0982  L-aspartate oxidase  54.59 
 
 
565 aa  559  1e-158  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.00000000000258616  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2911  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  44.63 
 
 
531 aa  437  1e-121  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0644438 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3933  L-aspartate oxidase  46.97 
 
 
544 aa  398  1e-109  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4301  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like protein  46.02 
 
 
549 aa  397  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0346412  decreased coverage  0.00817014 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4589  L-aspartate oxidase  44.49 
 
 
549 aa  389  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0011  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.97 
 
 
589 aa  262  1e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0394  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.89 
 
 
644 aa  256  6e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.134767  normal  0.884636 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27750  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.97 
 
 
638 aa  248  2e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0951337 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2214  Succinate dehydrogenase  38.79 
 
 
646 aa  244  1.9999999999999999e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10251  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.42 
 
 
646 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.177698 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1384  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.24 
 
 
608 aa  243  7e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0637899 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0243  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  34.77 
 
 
648 aa  242  1e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0253  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  34.76 
 
 
648 aa  241  2e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.128459  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0263  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  34.76 
 
 
648 aa  241  2e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.115771 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3565  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.61 
 
 
644 aa  241  2.9999999999999997e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.606678  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0140  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.12 
 
 
542 aa  241  4e-62  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0284  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.59 
 
 
627 aa  238  3e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0402  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.73 
 
 
562 aa  237  5.0000000000000005e-61  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.309781 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4026  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.86 
 
 
646 aa  237  5.0000000000000005e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.941346  normal  0.159045 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0221  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.43 
 
 
543 aa  233  6e-60  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.143686  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12591  succinate dehydrogenase  36.56 
 
 
584 aa  232  1e-59  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0949259  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2530  Succinate dehydrogenase (ubiquinone)  36.51 
 
 
609 aa  231  4e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.279488 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3053  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.92 
 
 
540 aa  230  5e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12651  succinate dehydrogenase/fumarate reductase, flavoprotein subunit  35.78 
 
 
570 aa  226  8e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3453  succinate dehydrogenase  35.8 
 
 
576 aa  226  1e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0086  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.32 
 
 
542 aa  225  1e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.970646  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3548  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.2 
 
 
621 aa  225  2e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.364565  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1116  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  37.78 
 
 
643 aa  223  9.999999999999999e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0245  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.79 
 
 
552 aa  221  3.9999999999999997e-56  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0760  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  35.97 
 
 
592 aa  220  5e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1426  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  34.77 
 
 
623 aa  220  5e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1799  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  36.61 
 
 
601 aa  219  7.999999999999999e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0747  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  38.17 
 
 
681 aa  218  2e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.533277  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0588  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.98 
 
 
546 aa  218  2e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2202  succinate dehydrogenase subunit A  35.03 
 
 
602 aa  218  2e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.443729  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1061  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  34.71 
 
 
592 aa  216  7e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.760541  normal  0.0367901 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0522  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.03 
 
 
539 aa  216  8e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2323  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.34 
 
 
592 aa  216  9.999999999999999e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2285  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  35.56 
 
 
601 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2795  succinate dehydrogenase subunit A  35.56 
 
 
601 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0609564 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1397  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.19 
 
 
539 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0401599  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2484  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.36 
 
 
592 aa  213  7e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.076646 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1825  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.89 
 
 
592 aa  212  1e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.231317  normal  0.587479 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1354  succinate dehydrogenase  35.11 
 
 
582 aa  212  1e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0715068  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1994  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.91 
 
 
592 aa  212  2e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.398561  normal  0.821237 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2425  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  35.44 
 
 
601 aa  211  2e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1428  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  35.23 
 
 
602 aa  211  2e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4491  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.67 
 
 
592 aa  211  3e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00238917 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0315  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.27 
 
 
539 aa  211  3e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4358  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.67 
 
 
592 aa  211  3e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2149  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.67 
 
 
592 aa  211  3e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.44337  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2168  succinate dehydrogenase subunit A  34.91 
 
 
596 aa  210  7e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.274751 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4150  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.81 
 
 
637 aa  209  9e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.052342  normal  0.010572 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0210  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  35.25 
 
 
579 aa  209  9e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2474  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  34.89 
 
 
575 aa  209  9e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00000557801  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5284  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  37.32 
 
 
563 aa  209  9e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1865  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35 
 
 
598 aa  208  2e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.710471 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1587  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.82 
 
 
584 aa  206  6e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.243588  normal  0.596865 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4352  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  33.93 
 
 
601 aa  207  6e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.602613  normal  0.276031 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1873  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.49 
 
 
612 aa  206  8e-52  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.864322  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1687  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.88 
 
 
575 aa  205  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0263858 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0430  succinate dehydrogenase subunit A  33.03 
 
 
568 aa  205  1e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3768  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.59 
 
 
637 aa  206  1e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0873813 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2863  succinate dehydrogenase subunit A  34.01 
 
 
594 aa  205  2e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6854  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  34.54 
 
 
591 aa  205  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.232059 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1206  succinate dehydrogenase or fumarate reductase flavoprotein subunit  34.89 
 
 
596 aa  204  3e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4363  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.21 
 
 
591 aa  204  4e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5838  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.67 
 
 
591 aa  204  4e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4646  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.67 
 
 
591 aa  204  4e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.303055  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5588  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.21 
 
 
591 aa  204  4e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4846  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.11 
 
 
584 aa  204  4e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.892416  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13349  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.59 
 
 
590 aa  203  7e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.287952 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0662  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  34.8 
 
 
591 aa  203  7e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.536777  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3602  succinate dehydrogenase subunit A  35.53 
 
 
598 aa  202  9.999999999999999e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.229588 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2893  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  34.54 
 
 
591 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4431  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  34.8 
 
 
591 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3936  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  34.8 
 
 
591 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.373287  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00131  fumarate reductase flavoprotein subunit  33.63 
 
 
606 aa  202  9.999999999999999e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3592  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  34.8 
 
 
591 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.322313  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2332  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  34.76 
 
 
591 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.790132  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1747  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  34.76 
 
 
591 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0936  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  34.33 
 
 
578 aa  202  1.9999999999999998e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0791  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  34.76 
 
 
591 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.127831  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2470  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  34.76 
 
 
591 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.328563  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1623  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  34.76 
 
 
591 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.829702  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0501  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  34.76 
 
 
591 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.426579  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1831  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  34.76 
 
 
591 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.385612  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3829  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  34.76 
 
 
591 aa  201  3e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.726427  normal  0.325233 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3313  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  34.76 
 
 
591 aa  201  3e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.775913 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2150  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  34.51 
 
 
592 aa  201  3.9999999999999996e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1537  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  32.75 
 
 
596 aa  201  3.9999999999999996e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3034  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  34.71 
 
 
597 aa  201  3.9999999999999996e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1254  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.86 
 
 
584 aa  200  6e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1228  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.86 
 
 
584 aa  200  6e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.394279  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1245  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.86 
 
 
584 aa  200  6e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.193625  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4278  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  32.13 
 
 
605 aa  200  7e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.954448 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>