More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3458 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_3458  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 153 aa  306  5e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000764325 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0598  NUDIX hydrolase  46.67 
 
 		 162 aa  125  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1350  NUDIX hydrolase  45 
 
 		 146 aa  125  3e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2529  NUDIX hydrolase  41.22 
 
 		 143 aa  117  3.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.412332  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1757  NUDIX hydrolase  41.04 
 
 		 144 aa  114  5e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.207601  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1203  NUDIX hydrolase  39.39 
 
 		 149 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1532  NUDIX hydrolase  39.29 
 
 		 154 aa  105  2e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3984  NUDIX hydrolase  38.13 
 
 		 167 aa  101  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.99462  decreased coverage  0.00100111 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0096  NUDIX hydrolase  37.68 
 
 		 141 aa  96.7  1e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0757202  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2004  NUDIX hydrolase  38.78 
 
 		 162 aa  95.5  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4299  NUDIX hydrolase  38.13 
 
 		 165 aa  95.1  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.687324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6097  NUDIX hydrolase  38.1 
 
 		 167 aa  95.1  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.347749  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1980  NUDIX hydrolase  38.1 
 
 		 167 aa  95.1  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5292  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 		 163 aa  94.7  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0621231 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1291  NUDIX hydrolase  37.4 
 
 		 161 aa  94  6e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.327149 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4668  NUDIX hydrolase  37.41 
 
 		 161 aa  94  6e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.271048 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1065  NUDIX hydrolase  35.21 
 
 		 151 aa  93.6  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.595183  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4483  NUDIX hydrolase  36.96 
 
 		 153 aa  92  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1089  NUDIX hydrolase  36.96 
 
 		 155 aa  92  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4817  NUDIX hydrolase  36.17 
 
 		 159 aa  91.7  4e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.688995  normal  0.147337 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1768  NUDIX hydrolase  39.53 
 
 		 136 aa  90.9  5e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0716  NUDIX hydrolase  34.67 
 
 		 196 aa  89.7  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.343449 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3935  NUDIX hydrolase  38 
 
 		 180 aa  88.2  4e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.445815  hitchhiker  0.00928201 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1476  NUDIX hydrolase  34.33 
 
 		 155 aa  87.4  7e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2076  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 141 aa  86.7  1e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.963545 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1301  MutT/nudix family protein  41.53 
 
 		 163 aa  85.5  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.308038  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2310  NUDIX hydrolase  35.38 
 
 		 138 aa  81.6  0.000000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.288899 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2097  NUDIX hydrolase  31.91 
 
 		 151 aa  81.3  0.000000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0651329  normal  0.043835 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0824  NUDIX hydrolase  38.93 
 
 		 156 aa  81.3  0.000000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.612559  hitchhiker  0.000224465 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1656  NUDIX hydrolase  37.7 
 
 		 152 aa  81.3  0.000000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.632067  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0884  NUDIX hydrolase  39.2 
 
 		 137 aa  80.5  0.000000000000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2616  NUDIX hydrolase  32.76 
 
 		 146 aa  79  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0783  NUDIX hydrolase  39.32 
 
 		 139 aa  79  0.00000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0156175  normal  0.134596 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1565  ADP-ribose pyrophosphatase  38.52 
 
 		 158 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0066  NUDIX family hydrolase  38.52 
 
 		 158 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.156967  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1477  ADP-ribose pyrophosphatase  38.52 
 
 		 158 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0154  mutT/nudix family protein  37.8 
 
 		 147 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1261  NUDIX hydrolase  34.81 
 
 		 147 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.394929  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2116  NUDIX hydrolase  37.8 
 
 		 136 aa  77.8  0.00000000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3147  NUDIX hydrolase  37.01 
 
 		 144 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.232456  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0207  NUDIX hydrolase  37.8 
 
 		 147 aa  76.3  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000107343 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1128  NUDIX hydrolase  35.43 
 
 		 141 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0349929  normal  0.45534 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1243  NUDIX hydrolase  34.09 
 
 		 141 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3639  NUDIX hydrolase  34.65 
 
 		 142 aa  73.9  0.0000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3746  NUDIX hydrolase  34.65 
 
 		 142 aa  72.8  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13970  NUDIX hydrolase  31.67 
 
 		 146 aa  73.6  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0294014  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0380  NUDIX hydrolase  32.28 
 
 		 199 aa  71.6  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000301987  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2381  putative Nudix hydrolase family protein  41.41 
 
 		 139 aa  72  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.489337 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2044  NUDIX hydrolase  34.17 
 
 		 147 aa  71.2  0.000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490099 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2700  NUDIX hydrolase  31.82 
 
 		 138 aa  70.9  0.000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0600757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4327  NUDIX hydrolase  38.38 
 
 		 145 aa  70.9  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.356422 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0258  MutT/Nudix family protein  40 
 
 		 137 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3170  NUDIX hydrolase  31.21 
 
 		 179 aa  68.9  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0110  NUDIX hydrolase  33.85 
 
 		 136 aa  67.8  0.00000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1798  LacI family transcription regulator  37.59 
 
 		 473 aa  67.8  0.00000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.651793 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1799  NUDIX hydrolase  32.84 
 
 		 205 aa  66.2  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.000483875  normal  0.809218 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4015  NUDIX hydrolase  34.07 
 
 		 143 aa  66.6  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2121  NUDIX hydrolase  33.59 
 
 		 140 aa  65.5  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.575199  decreased coverage  0.00514227 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2930  NUDIX hydrolase  30.53 
 
 		 149 aa  66.2  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.292647 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1319  NUDIX hydrolase  32.06 
 
 		 143 aa  65.9  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3001  NUDIX hydrolase  38.98 
 
 		 134 aa  66.2  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.759496  normal  0.595772 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2716  MutT/NUDIX family protein  32.26 
 
 		 137 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1086  NUDIX hydrolase  33.63 
 
 		 236 aa  65.1  0.0000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.702437  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0700  NUDIX hydrolase  36.04 
 
 		 132 aa  64.7  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06029  ADP-ribose pyrophosphatase MutT  33.87 
 
 		 137 aa  65.1  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3998  NUDIX hydrolase  35.54 
 
 		 154 aa  64.7  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0404394  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0877  MutT-like protein  34.48 
 
 		 144 aa  64.3  0.0000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0613  NUDIX hydrolase  35.35 
 
 		 171 aa  64.3  0.0000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1335  NUDIX hydrolase  35.35 
 
 		 171 aa  63.9  0.0000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4063  mutT/nudix family protein  35.54 
 
 		 141 aa  63.9  0.0000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000339826  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1914  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 		 149 aa  63.9  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.592421  normal  0.977797 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0547  MutT/NUDIX family protein  35.64 
 
 		 136 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4380  mutT/nudix family protein  35.54 
 
 		 141 aa  63.9  0.0000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000407544  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0357  ADP-ribose pyrophosphatase  35.64 
 
 		 136 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0371  ADP-ribose pyrophosphatase  35.64 
 
 		 136 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4178  hydrolase, NUDIX family  35.54 
 
 		 154 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0036026 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3901  MutT/Nudix family protein  35.54 
 
 		 154 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000267829  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4287  hydrolase, NUDIX family  35.54 
 
 		 152 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000426319  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2852  NUDIX hydrolase  36.89 
 
 		 157 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000177474  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4229  mutT/nudix family protein  35.54 
 
 		 154 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000345145  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1467  NUDIX hydrolase  32.5 
 
 		 135 aa  62.8  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0519  MutT/nudix family protein  35 
 
 		 146 aa  61.6  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6153  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 185 aa  62  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.292779 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2105  mutT/nudix family protein  34.19 
 
 		 140 aa  61.6  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2042  MutT/Nudix family protein  34.19 
 
 		 149 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.585593  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0105  NUDIX hydrolase  33.04 
 
 		 154 aa  62  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3653  mutT/nudix family protein  33.79 
 
 		 147 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2289  mutT/nudix family protein  34.19 
 
 		 149 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.401788  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3416  mutT/nudix family protein  31.69 
 
 		 147 aa  61.2  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2044  MutT/Nudix family protein  34.19 
 
 		 149 aa  61.6  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00937843  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3909  MutT/Nudix family protein  34.71 
 
 		 154 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0016299  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1287  NUDIX hydrolase  36.47 
 
 		 154 aa  61.6  0.000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0960276  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3685  mutT/nudix family protein  31.69 
 
 		 147 aa  61.2  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.293788  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2286  mutT/nudix family protein  34.19 
 
 		 149 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.02194e-25 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3636  mutT/nudix family protein  31.69 
 
 		 147 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2119  NUDIX hydrolase  29.45 
 
 		 229 aa  61.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.461945 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1874  hypothetical protein  34.97 
 
 		 181 aa  61.2  0.000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0897889 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4263  NUDIX hydrolase  60 
 
 		 147 aa  61.2  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.143097  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2614  NUDIX hydrolase  33.06 
 
 		 152 aa  60.8  0.000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.349258  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3081  mutT/nudix family protein  35.9 
 
 		 149 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000075135 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>