276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0976 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0976  chromosome partitioning ATPase protein-like  100 
 
 		 242 aa  501  1e-141  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.503924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2878  chromosome partitioning ATPase protein-like protein  39.45 
 
 		 257 aa  192  5e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1072  chromosome partitioning ATPase  37.04 
 
 		 240 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.307133  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3189  chromosome partitioning ATPase  35.39 
 
 		 240 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5483  chromosome partitioning ATPase  29.71 
 
 		 213 aa  87.8  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1505  tyrosine-protein kinase  31.03 
 
 		 585 aa  84.3  0.000000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0194  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  31.1 
 
 		 575 aa  83.6  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.27748  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2235  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  31.67 
 
 		 235 aa  80.9  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02900  capsular exopolysaccharide biosynthesis protein  26.77 
 
 		 453 aa  80.5  0.00000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3224  protein-tyrosine kinase  27.45 
 
 		 733 aa  78.2  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2022  chromosome partitioning ATPase  35.79 
 
 		 215 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5400  capsular exopolysaccharide family protein  28.9 
 
 		 225 aa  76.3  0.0000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00155134  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0660  exopolysaccharide transport protein family  30.39 
 
 		 776 aa  76.3  0.0000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.491274  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3274  capsular exopolysaccharide family  27.27 
 
 		 232 aa  74.7  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000194984  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5924  exopolysaccharide polymerization/transport protein  26.92 
 
 		 778 aa  74.7  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5398  tyrosine-protein kinase YwqD  27.75 
 
 		 257 aa  72.8  0.000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00175996  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1180  capsular exopolysaccharide family  29.14 
 
 		 211 aa  73.2  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0081871 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1662  capsular polysaccharide biosynthesis protein  26.22 
 
 		 240 aa  72.8  0.000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.54254  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5552  tyrosine-protein kinase YwqD  27.17 
 
 		 225 aa  72  0.000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000166595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5368  exopolysaccharide transporter  26.02 
 
 		 747 aa  71.2  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2473  polysaccharide biosynthesis protein, putative  27.36 
 
 		 282 aa  71.2  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5453  tyrosine-protein kinase YwqD  27.75 
 
 		 225 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000155179  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1906  capsular exopolysaccharide family  26.94 
 
 		 795 aa  70.1  0.00000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1689  hypothetical protein  26.56 
 
 		 211 aa  69.7  0.00000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0157543  normal  0.0410819 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2220  capsular exopolysaccharide family  26.73 
 
 		 266 aa  68.9  0.00000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.105344  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0465  capsular polysaccharide biosynthesis protein  29.07 
 
 		 217 aa  67  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000141765  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0919  tyrosine-protein kinase protein  29.19 
 
 		 205 aa  67.8  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000101263  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0453  capsule synthesis gene, putative  29.65 
 
 		 217 aa  67.4  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000667993  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2653  hypothetical protein  27.61 
 
 		 249 aa  66.6  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1126  capsular exopolysaccharide family  23.5 
 
 		 790 aa  66.6  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0796389  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1413  capsular exopolysaccharide family  24.31 
 
 		 735 aa  66.6  0.0000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.44637  normal  0.40956 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3194  exopolysaccharide transport protein family  24.76 
 
 		 747 aa  67  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0576306 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4960  tyrosine-protein kinase  25.43 
 
 		 225 aa  65.9  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.94095e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1539  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  25.76 
 
 		 730 aa  66.2  0.0000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1363  lipopolysaccharide biosynthesis  26.55 
 
 		 464 aa  65.9  0.0000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000148306  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1670  non-specific protein-tyrosine kinase  22.58 
 
 		 790 aa  65.5  0.0000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511169  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1172  cpsD protein  27.22 
 
 		 229 aa  65.5  0.0000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.748604  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1530  hypothetical protein  26.91 
 
 		 233 aa  65.5  0.0000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.273256  normal  0.7082 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4042  non-specific protein-tyrosine kinase  28.05 
 
 		 224 aa  64.3  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.921911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1943  protein-tyrosine kinase  25.27 
 
 		 239 aa  64.7  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.641105  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5849  tyrosine-protein kinase  25.13 
 
 		 748 aa  63.9  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0461  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  28.22 
 
 		 737 aa  63.9  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3668  non-specific protein-tyrosine kinase  27.88 
 
 		 233 aa  63.9  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5075  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  25.43 
 
 		 225 aa  63.5  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.064024  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3056  protein-tyrosine kinase  26.48 
 
 		 772 aa  63.2  0.000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1127  capsular exopolysaccharide family  26.05 
 
 		 722 aa  63.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1068  tyrosine-protein kinase  25.53 
 
 		 246 aa  63.2  0.000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2514  lipopolysaccharide biosynthesis protein  30.99 
 
 		 735 aa  62.8  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1135  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.86 
 
 		 745 aa  62  0.000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3592  chromosome partitioning ATPase  30.99 
 
 		 735 aa  62  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.857292  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05390  exopolysaccharide biosynthesis protein  27.47 
 
 		 223 aa  62  0.000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.111792  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3132  exopolysaccharide transport protein family  24.62 
 
 		 747 aa  62  0.000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.995737 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1961  non-specific protein-tyrosine kinase  25.68 
 
 		 789 aa  61.6  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.601973 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3268  capsular exopolysaccharide family  25.73 
 
 		 221 aa  61.6  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.582826  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3133  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.34 
 
 		 588 aa  61.2  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3715  lipopolysaccharide biosynthesis  29.25 
 
 		 712 aa  61.6  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24630  capsular exopolysaccharide biosynthesis protein  27.59 
 
 		 492 aa  61.6  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1977  capsular exopolysaccharide family  25 
 
 		 803 aa  61.2  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0664452 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1925  protein-tyrosine kinase  27.72 
 
 		 801 aa  61.2  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.864288  normal  0.041415 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2908  lipopolysaccharide biosynthesis  26.67 
 
 		 727 aa  60.8  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000198552 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1353  non-specific protein-tyrosine kinase  27.71 
 
 		 624 aa  60.5  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0852  lipopolysaccharide biosynthesis  25 
 
 		 727 aa  60.5  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0448301 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0764  protein-tyrosine kinase  26.49 
 
 		 763 aa  60.5  0.00000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0280941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1681  lipopolysaccharide biosynthesis  27.22 
 
 		 505 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0141  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  23.78 
 
 		 228 aa  60.5  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0136  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  23.78 
 
 		 228 aa  60.5  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1191  exopolysaccharide transport protein family  26.11 
 
 		 750 aa  59.7  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.113829  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1340  tyrosine-protein kinase, putative  27.59 
 
 		 820 aa  59.7  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1545  capsular exopolysaccharide family  25.7 
 
 		 469 aa  59.7  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3405  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.15 
 
 		 588 aa  59.7  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.321233 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1155  tyrosine-protein kinase  26.55 
 
 		 257 aa  59.7  0.00000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000120781  hitchhiker  3.55737e-18 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4270  non-specific protein-tyrosine kinase  27.71 
 
 		 605 aa  59.3  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.198419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2363  non-specific protein-tyrosine kinase  25.29 
 
 		 275 aa  59.3  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2982  exopolysaccharide transport protein family  25.96 
 
 		 758 aa  59.3  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4107  capsular exopolysaccharide family  25.9 
 
 		 246 aa  58.9  0.00000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00517117 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3230  exopolysaccharide transport protein family  25.96 
 
 		 758 aa  58.5  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4771  lipopolysaccharide biosynthesis  24.74 
 
 		 508 aa  58.5  0.00000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1983  polysaccharide biosynthesis protein, putative  28.08 
 
 		 281 aa  58.2  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3796  capsular exopolysaccharide family  24.02 
 
 		 741 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.263361  normal  0.369673 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0964  lipopolysaccharide biosynthesis  25.39 
 
 		 497 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.722103  normal  0.488282 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1386  lipopolysaccharide biosynthesis  26.25 
 
 		 734 aa  57  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2744  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  25.31 
 
 		 230 aa  57.4  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5396  tyrosine-protein kinase YwqD  23.46 
 
 		 233 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00190183  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2687  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  25.31 
 
 		 230 aa  57.4  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1597  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  22.67 
 
 		 739 aa  57.8  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.149486 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0946  protein-tyrosine kinase  25.39 
 
 		 443 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.484543  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4006  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  26.09 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4449  capsular exopolysaccharide family  28.75 
 
 		 472 aa  57  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3195  lipopolysaccharide biosynthesis  28.4 
 
 		 503 aa  57.4  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5907  exopolysaccharide transport protein family  26.94 
 
 		 745 aa  57  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.459127  normal  0.402865 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3069  polysaccharide biosynthesis protein, putative  22.38 
 
 		 298 aa  56.6  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.436941  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1694  capsular exopolysaccharide family  26.22 
 
 		 779 aa  56.6  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.648011  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0358  capsular exopolysaccharide family  24.38 
 
 		 490 aa  56.6  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2688  lipopolysaccharide biosynthesis  28.1 
 
 		 731 aa  56.6  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0256055 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5554  tyrosine-protein kinase YwqD  23.46 
 
 		 233 aa  56.2  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000192889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0944  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  25 
 
 		 720 aa  55.8  0.0000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3321  lipopolysaccharide biosynthesis  26.67 
 
 		 772 aa  55.8  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.134805 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0828  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.46 
 
 		 726 aa  55.8  0.0000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.490846  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1960  lipopolysaccharide biosynthesis protein  36.36 
 
 		 704 aa  55.8  0.0000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.38724  normal  0.0240041 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0687  exopolysaccharide/PEPCTERM locus tyrosine autokinase  21.54 
 
 		 293 aa  55.5  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.432986 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>