223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_05390 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_05390  exopolysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 
223 aa  445  1.0000000000000001e-124  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.111792  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2022  chromosome partitioning ATPase  49.27 
 
 
215 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1363  lipopolysaccharide biosynthesis  29.35 
 
 
464 aa  73.6  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000148306  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0547  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase, putative  30.22 
 
 
739 aa  72  0.000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0914  EpsB  30.22 
 
 
739 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.121592  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1420  capsular exopolysaccharide family  31.92 
 
 
229 aa  70.1  0.00000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0943338  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2481  chain length determinant protein  30.22 
 
 
739 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2619  chain length determinant protein  30.22 
 
 
739 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1657  non-specific protein-tyrosine kinase  26.86 
 
 
721 aa  68.9  0.00000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.779278  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4539  protein-tyrosine kinase  30.77 
 
 
741 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.267128  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3824  hypothetical protein  30.77 
 
 
741 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3700  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  30.77 
 
 
741 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3727  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  31.32 
 
 
741 aa  67  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.601241 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5550  hypothetical protein  31.32 
 
 
741 aa  67  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5368  exopolysaccharide transporter  30.17 
 
 
747 aa  66.2  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0465  capsular polysaccharide biosynthesis protein  24.47 
 
 
217 aa  65.9  0.0000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000141765  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1497  protein-tyrosine kinase  30.9 
 
 
753 aa  65.5  0.0000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.764592  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1816  protein-tyrosine kinase  27.75 
 
 
755 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6509  Non-specific protein-tyrosine kinase  30.27 
 
 
454 aa  63.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2272  protein-tyrosine kinase  29.67 
 
 
741 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.994718  normal  0.103014 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4915  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  30.6 
 
 
741 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00113292 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0453  capsule synthesis gene, putative  23.94 
 
 
217 aa  63.2  0.000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000667993  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02900  capsular exopolysaccharide biosynthesis protein  30.16 
 
 
453 aa  63.5  0.000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1662  capsular polysaccharide biosynthesis protein  31.94 
 
 
240 aa  62.4  0.000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.54254  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5453  tyrosine-protein kinase YwqD  26.03 
 
 
225 aa  62.4  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000155179  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1385  hypothetical protein  29.45 
 
 
756 aa  62  0.000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.444045  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5396  tyrosine-protein kinase YwqD  29.15 
 
 
233 aa  62  0.000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00190183  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0976  chromosome partitioning ATPase protein-like  27.47 
 
 
242 aa  62  0.000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.503924  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5552  tyrosine-protein kinase YwqD  26.41 
 
 
225 aa  61.6  0.000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000166595  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5554  tyrosine-protein kinase YwqD  28.86 
 
 
233 aa  61.6  0.000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000192889  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5398  capsular exopolysaccharide family protein  29.65 
 
 
233 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.466197  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5400  capsular exopolysaccharide family protein  25.57 
 
 
225 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00155134  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02477  putative Exopolysaccharide biosynthesis protein  27.22 
 
 
738 aa  61.2  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5483  chromosome partitioning ATPase  28.57 
 
 
213 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5398  tyrosine-protein kinase YwqD  26.32 
 
 
257 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00175996  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2715  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  26.49 
 
 
726 aa  60.1  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.088822  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0461  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  28.33 
 
 
737 aa  60.5  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3194  exopolysaccharide transport protein family  30 
 
 
747 aa  60.5  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0576306 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1490  protein-tyrosine kinase  26.67 
 
 
734 aa  60.1  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4958  protein-tyrosine kinase  29.65 
 
 
233 aa  59.7  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122806  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5075  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  26.07 
 
 
225 aa  59.7  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.064024  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3777  capsular exopolysaccharide family  29.26 
 
 
782 aa  59.3  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05204  exopolysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 
731 aa  59.3  0.00000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5451  tyrosine-protein kinase YwqD  28.5 
 
 
233 aa  58.5  0.00000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0440072  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5073  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  29.5 
 
 
234 aa  58.5  0.00000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1940  exopolysaccharide transport protein family  30.57 
 
 
755 aa  58.2  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1959  capsular exopolysaccharide family  28.02 
 
 
732 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.901256 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1844  uncharacterized protein involved in exopolysaccharide biosynthesis  24.48 
 
 
773 aa  58.2  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1983  polysaccharide biosynthesis protein, putative  27.13 
 
 
281 aa  57  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3472  protein-tyrosine kinase  32.16 
 
 
615 aa  57.4  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2235  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  26.6 
 
 
235 aa  57  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2242  protein-tyrosine kinase  28.65 
 
 
740 aa  57  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.551274 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0560  protein-tyrosine kinase  27.96 
 
 
492 aa  57  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.271143  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6487  hypothetical protein  28.5 
 
 
781 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.907329 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2878  chromosome partitioning ATPase protein-like protein  20.38 
 
 
257 aa  57.4  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3271  EpsB  30.05 
 
 
746 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3274  capsular exopolysaccharide family  26.2 
 
 
232 aa  56.6  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000194984  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0897  capsular exopolysaccharide family  28.11 
 
 
496 aa  56.6  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.240779  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3220  exopolysaccharide transport family protein  30.22 
 
 
746 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3276  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  28.98 
 
 
736 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.205435  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3258  exopolysaccharide transport family protein  30.05 
 
 
746 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4817  non-specific protein-tyrosine kinase  26.63 
 
 
727 aa  56.2  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.963107 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4960  tyrosine-protein kinase  26.03 
 
 
225 aa  56.2  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.94095e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4097  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  27.62 
 
 
760 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.139817  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1272  non-specific protein-tyrosine kinase  31.12 
 
 
667 aa  55.8  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1178  exopolysaccharide export protein, putative, interruption-C  27.78 
 
 
527 aa  55.5  0.0000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.704775  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1122  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  29.32 
 
 
780 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5116  exopolysaccharide transport protein family  30.05 
 
 
755 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0102406 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3056  protein-tyrosine kinase  29.59 
 
 
772 aa  55.5  0.0000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6733  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  28.33 
 
 
800 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1018  EPS I polysaccharide export transmembrane protein  27.37 
 
 
751 aa  54.7  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.646097  normal  0.76334 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1061  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  28.65 
 
 
730 aa  54.7  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0283  protein-tyrosine kinase  24.58 
 
 
306 aa  53.9  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6747  exopolysaccharide transport protein family  26.18 
 
 
740 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.417886  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4528  non-specific protein-tyrosine kinase  30.34 
 
 
710 aa  53.5  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.44176  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3404  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  24.44 
 
 
220 aa  53.5  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00848041  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2390  Non-specific protein-tyrosine kinase  29.71 
 
 
284 aa  54.3  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6175  exopolysaccharide transport protein family  28.57 
 
 
745 aa  53.5  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.412348  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001323  Capsular polysaccharide synthesis enzyme CpsD exopolysaccharide synthesis  25 
 
 
726 aa  53.1  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2583  protein-tyrosine kinase  27.32 
 
 
711 aa  53.5  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2727  non-specific protein-tyrosine kinase  27.68 
 
 
268 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0484786  normal  0.997452 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3132  exopolysaccharide transport protein family  28.89 
 
 
747 aa  53.1  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.995737 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2220  capsular exopolysaccharide family  27.22 
 
 
266 aa  52.8  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.105344  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2917  non-specific protein-tyrosine kinase  29.38 
 
 
268 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.513725 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5907  exopolysaccharide transport protein family  28.57 
 
 
745 aa  53.1  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.459127  normal  0.402865 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3796  capsular exopolysaccharide family  26.18 
 
 
741 aa  52.4  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.263361  normal  0.369673 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2587  non-specific protein-tyrosine kinase  27.87 
 
 
268 aa  52.4  0.000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3128  protein-tyrosine kinase  27.87 
 
 
268 aa  52.4  0.000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.86825  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3507  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  31.74 
 
 
305 aa  52.4  0.000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000503243 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1354  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase, putative  27.83 
 
 
746 aa  52.4  0.000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.845392  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7398  exopolysaccharide transporter  26.52 
 
 
745 aa  52  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.343885 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5844  protein-tyrosine kinase  27.23 
 
 
780 aa  52  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1155  tyrosine-protein kinase  25.5 
 
 
257 aa  52  0.000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000120781  hitchhiker  3.55737e-18 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1087  capsular exopolysaccharide family  28.65 
 
 
763 aa  52  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0136543  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2255  capsular polysaccharide biosynthesis protein  23.08 
 
 
215 aa  52  0.000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.182842  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0919  tyrosine-protein kinase protein  21.08 
 
 
205 aa  52  0.000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000101263  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0146  hypothetical protein  28.07 
 
 
318 aa  51.6  0.000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3622  hypothetical protein  27.07 
 
 
760 aa  51.6  0.000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.907329 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2866  exopolysaccharide transporter  32.37 
 
 
764 aa  51.6  0.000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3119  chromosome partitioning ATPase protein-like  31.18 
 
 
335 aa  51.6  0.000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.327271  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>