29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1072 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1072  chromosome partitioning ATPase  100 
 
 		 240 aa  495  1e-139  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.307133  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3189  chromosome partitioning ATPase  96.67 
 
 		 240 aa  479  1e-134  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2878  chromosome partitioning ATPase protein-like protein  37.5 
 
 		 257 aa  150  2e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0976  chromosome partitioning ATPase protein-like  37.04 
 
 		 242 aa  134  1.9999999999999998e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.503924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5483  chromosome partitioning ATPase  27.75 
 
 		 213 aa  63.2  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3715  lipopolysaccharide biosynthesis  28.21 
 
 		 712 aa  61.6  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2022  chromosome partitioning ATPase  26.87 
 
 		 215 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0194  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  24.73 
 
 		 575 aa  55.1  0.0000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.27748  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1363  lipopolysaccharide biosynthesis  31.76 
 
 		 464 aa  55.1  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000148306  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2235  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  28.05 
 
 		 235 aa  52.4  0.000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0919  tyrosine-protein kinase protein  28.86 
 
 		 205 aa  51.2  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000101263  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1689  hypothetical protein  24.65 
 
 		 211 aa  50.8  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0157543  normal  0.0410819 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1960  lipopolysaccharide biosynthesis protein  32.53 
 
 		 704 aa  49.3  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.38724  normal  0.0240041 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0012  Non-specific protein-tyrosine kinase  27.97 
 
 		 463 aa  48.9  0.00006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.429064  hitchhiker  0.00275231 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3274  capsular exopolysaccharide family  22.61 
 
 		 232 aa  48.9  0.00007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000194984  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5304  capsular exopolysaccharide family  36.23 
 
 		 539 aa  48.9  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05390  exopolysaccharide biosynthesis protein  22.05 
 
 		 223 aa  48.5  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.111792  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1662  capsular polysaccharide biosynthesis protein  36.36 
 
 		 240 aa  46.6  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.54254  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3224  protein-tyrosine kinase  24.5 
 
 		 733 aa  45.8  0.0007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1505  tyrosine-protein kinase  26.44 
 
 		 585 aa  45.1  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5368  exopolysaccharide transporter  27.91 
 
 		 747 aa  44.3  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1180  capsular exopolysaccharide family  30.56 
 
 		 211 aa  44.3  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0081871 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1497  protein-tyrosine kinase  31.08 
 
 		 753 aa  44.3  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.764592  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1530  hypothetical protein  26.74 
 
 		 233 aa  43.1  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.273256  normal  0.7082 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1272  non-specific protein-tyrosine kinase  31.37 
 
 		 667 aa  42.7  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02900  capsular exopolysaccharide biosynthesis protein  26.74 
 
 		 453 aa  42.7  0.005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4958  protein-tyrosine kinase  27.03 
 
 		 233 aa  42.7  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122806  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3133  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.58 
 
 		 588 aa  42  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4006  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  33.85 
 
 		 215 aa  42  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>